Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 218690096

Identifier: 218690096

GI number: 218690096

Start: 2317089

End: 2318390

Strand: Reverse

Name: 218690096

Synonym: ECED1_2384

Alternate gene names: NA

Gene position: 2318390-2317089 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218690097

Following gene: 218690095

Centisome position: 44.5

GC content: 29.57

Gene sequence:

>1302_bases
ATGACGTCATGTAATAACTTTAAAAAGTATAAAACATTATCTTTATTATCCGTGTGTTTATCCTCTATTCGTGTCTTTTT
GGGGCCAATAACATTACTTGTACTAGCCAAAAACCTTTCCACTGAGGAACTAGGATTTTATTATGCTTTTTTTTCGTTAA
CAGCAATGGCACAGTTGCTGGAAGTTGGGATGTCTAGCGTATTGAAACAGTATTATAGCCATTCTTATGCTATTCATGAT
ATCAGTGAAAAAAATATAAAAATATCGAACTATTTTAACTTTTCAATCTATTGGTATTTAATATTATCAATACTTTTTTT
TATATTGGGAGGGGGGGTGTCATATGTTATGTTTAATGATTATAACGGAATAGTTAACTGGAAATTACCATGGTTTTTTT
TGCTTTTTGTTTCATGTACTAATTTATTAGTATTGCCCTTAAATGCAATGCTTGATGGAACACAAAGGCAACAATTATTG
ATGAAAGCTAATATTGTTAGTCAGTTAATGATAGCGATATCATTATGGCTGACAATTTATTTAGGCTTGGGGCTATATTC
TCTTGGTCTATCACAATTGGTAGGAATATTATTTTTTTTACTGTCAGTTTTTATATTTAATAAATGTAGATTCCAGTTCA
TAGAAATACATAAAAAAAACTTTTCATTTAAAACAGTATTTAATGAGTTGTGGCCGTTATTGAAAAAAACTAGTATCGTA
TGGTTTCTTGGTTATTTCTACTGGAACGGTTTTAATATAATATCATTTAAATATCTTGGTGCAGAGATCGCAGGCTTCGT
TGGTATGTCGATGTCAATTATGCGAGCGGGACAGAATATAGCAATATCTATTTTGAATTCTCAGATGACATTGTATGCAA
GCAATATTGCGATGGGAAAGATTGATGAAGCAAGAAGAGTATTTAAGAAATATTTTATCATTTCATTTTTGTTATTAATT
TCTGGTTACTCAATATTTTATATTTTCTATTATGTTAAGCCTGATTTTTTCTTGTTTAAGAAGGTCCTGCCCTTAGAACA
AATGATTTATGTGTCAATATTTTTTGCCTTTACATTTATAATATCAGGAACTGAAACTTTTATTCGTTGTTTTAAAGTGG
AGAAGTTCGTTATCACTCAGACAATCAATTCAATTTTAACTCCATTCTTATTTGTTTTGGGGCTTAACTTGCATTATCAA
TATTTTTGTTTACCAATAATATCTGTACTGATAGTGTCAATCTTAACGTTATATATAAGTCGACGTTTTTACACGGGGTA
TTCGAATGCAAAAAATACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATAGAAATTGTCCGGAGAATAAAATGATAACTCATTTGTTGATAGTGATTTATATTGTATAATTAATATTATGTAAAAT
GATATATATGGCAAATACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATATAATGAAATTAATGATGTGGAGTATTTATCCTATCGGTTTTTTAATTAAAAGGGATAAAAGCATTTGGCTTTTCG
GTAGTTATAGCGGTTTTACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 432

Protein sequence:

>433_residues
MTSCNNFKKYKTLSLLSVCLSSIRVFLGPITLLVLAKNLSTEELGFYYAFFSLTAMAQLLEVGMSSVLKQYYSHSYAIHD
ISEKNIKISNYFNFSIYWYLILSILFFILGGGVSYVMFNDYNGIVNWKLPWFFLLFVSCTNLLVLPLNAMLDGTQRQQLL
MKANIVSQLMIAISLWLTIYLGLGLYSLGLSQLVGILFFLLSVFIFNKCRFQFIEIHKKNFSFKTVFNELWPLLKKTSIV
WFLGYFYWNGFNIISFKYLGAEIAGFVGMSMSIMRAGQNIAISILNSQMTLYASNIAMGKIDEARRVFKKYFIISFLLLI
SGYSIFYIFYYVKPDFFLFKKVLPLEQMIYVSIFFAFTFIISGTETFIRCFKVEKFVITQTINSILTPFLFVLGLNLHYQ
YFCLPIISVLIVSILTLYISRRFYTGYSNAKNT

Sequences:

>Translated_433_residues
MTSCNNFKKYKTLSLLSVCLSSIRVFLGPITLLVLAKNLSTEELGFYYAFFSLTAMAQLLEVGMSSVLKQYYSHSYAIHD
ISEKNIKISNYFNFSIYWYLILSILFFILGGGVSYVMFNDYNGIVNWKLPWFFLLFVSCTNLLVLPLNAMLDGTQRQQLL
MKANIVSQLMIAISLWLTIYLGLGLYSLGLSQLVGILFFLLSVFIFNKCRFQFIEIHKKNFSFKTVFNELWPLLKKTSIV
WFLGYFYWNGFNIISFKYLGAEIAGFVGMSMSIMRAGQNIAISILNSQMTLYASNIAMGKIDEARRVFKKYFIISFLLLI
SGYSIFYIFYYVKPDFFLFKKVLPLEQMIYVSIFFAFTFIISGTETFIRCFKVEKFVITQTINSILTPFLFVLGLNLHYQ
YFCLPIISVLIVSILTLYISRRFYTGYSNAKNT
>Mature_432_residues
TSCNNFKKYKTLSLLSVCLSSIRVFLGPITLLVLAKNLSTEELGFYYAFFSLTAMAQLLEVGMSSVLKQYYSHSYAIHDI
SEKNIKISNYFNFSIYWYLILSILFFILGGGVSYVMFNDYNGIVNWKLPWFFLLFVSCTNLLVLPLNAMLDGTQRQQLLM
KANIVSQLMIAISLWLTIYLGLGLYSLGLSQLVGILFFLLSVFIFNKCRFQFIEIHKKNFSFKTVFNELWPLLKKTSIVW
FLGYFYWNGFNIISFKYLGAEIAGFVGMSMSIMRAGQNIAISILNSQMTLYASNIAMGKIDEARRVFKKYFIISFLLLIS
GYSIFYIFYYVKPDFFLFKKVLPLEQMIYVSIFFAFTFIISGTETFIRCFKVEKFVITQTINSILTPFLFVLGLNLHYQY
FCLPIISVLIVSILTLYISRRFYTGYSNAKNT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50159; Mature: 50028

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSCNNFKKYKTLSLLSVCLSSIRVFLGPITLLVLAKNLSTEELGFYYAFFSLTAMAQLL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVGMSSVLKQYYSHSYAIHDISEKNIKISNYFNFSIYWYLILSILFFILGGGVSYVMFND
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
YNGIVNWKLPWFFLLFVSCTNLLVLPLNAMLDGTQRQQLLMKANIVSQLMIAISLWLTIY
CCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLGLYSLGLSQLVGILFFLLSVFIFNKCRFQFIEIHKKNFSFKTVFNELWPLLKKTSIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WFLGYFYWNGFNIISFKYLGAEIAGFVGMSMSIMRAGQNIAISILNSQMTLYASNIAMGK
HHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCC
IDEARRVFKKYFIISFLLLISGYSIFYIFYYVKPDFFLFKKVLPLEQMIYVSIFFAFTFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGTETFIRCFKVEKFVITQTINSILTPFLFVLGLNLHYQYFCLPIISVLIVSILTLYIS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRFYTGYSNAKNT
HHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TSCNNFKKYKTLSLLSVCLSSIRVFLGPITLLVLAKNLSTEELGFYYAFFSLTAMAQLL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVGMSSVLKQYYSHSYAIHDISEKNIKISNYFNFSIYWYLILSILFFILGGGVSYVMFND
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
YNGIVNWKLPWFFLLFVSCTNLLVLPLNAMLDGTQRQQLLMKANIVSQLMIAISLWLTIY
CCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLGLYSLGLSQLVGILFFLLSVFIFNKCRFQFIEIHKKNFSFKTVFNELWPLLKKTSIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WFLGYFYWNGFNIISFKYLGAEIAGFVGMSMSIMRAGQNIAISILNSQMTLYASNIAMGK
HHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCC
IDEARRVFKKYFIISFLLLISGYSIFYIFYYVKPDFFLFKKVLPLEQMIYVSIFFAFTFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGTETFIRCFKVEKFVITQTINSILTPFLFVLGLNLHYQYFCLPIISVLIVSILTLYIS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRFYTGYSNAKNT
HHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA