Definition Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome, complete genome.
Accession NC_011729
Length 5,942,652

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 218438058

GI number:

Start: 1164434

End: 1169386

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: PCC7424_1065

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 218438057

Following gene: 218438062

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4953_bases
ATGAGGATTACTTTAACTGGGTTACTTGCTGTTGGTGTTGGATTAATGCTAAATCAACCGATGCAAGGACAATCTATTAC
TCCCGCTAATGATGGCACAGGAACAATCATTAATCGACAAGGGAATCAATATAATATTGAAGGGGGTACATTATCAGAAG
ATGGAAGAAATTTATTTCATAGTCTTGAGAAATTTGGGTTAACTCAAGCAGAAATTGCTAACTTTCTCTCTAATCCTCAA
ATCCGCAATATTTTAACCCGAATAGTCGGGGGAAATCCCTCAGTGATTAATGGGTTAATTCAGGTTCTTAATGGGAATTC
TAATCTATACATTATGAATCCCGCCGGTATAATATTCGGCCCGAATGCGCGAATCAATGTACCGGCTGATTTTGTAGTAA
CAACAGCGACTCGAATCGGGTTTGATAATAATTTATGGTTTAATGCTTTCGAGAGTAATGACTATGCTCAATTAATGGGA
AATCCTTCTCAATTTGCTTTTGATTTAGCTAAATCCGGCACGATTACTAATTTGGGTAATTTAACGGTGACAGAAGGACA
TCATTTAATGTTGTTGGGAAAAACTGTCAATAATAGTGGCACATTAAACGCGCCAGAAGGAAATATTACTATTGCTGCTG
TTGCCGGTACTAACCGAATTAAAATATCTCAAGAAAATAATTTAGTGAGTTTAGAAATTGAACGACCTGACACCAATGTC
AACTCAAATCTTTCTGCTTTAGATTTACCCACTTTATTGACAGAAGGAAAAGTTAGTAATTCTGCCTCTATTAGTCCTTT
ACAACCGGGGACGGTGATTATTTCTGGGAATTTATCAGTCTCTAATGCTGCCAATTCCCCTCTTCAACAAGGAGGACAAG
TCAATATAATAGGGGATCAAATTAGCTTAATTAATGCTAATATTAACGCGACTGGAACTCGTGGGGGAGGAATTGTTCAA
ATAGGAGCAAATAGTCAAGGTCAGGATATAACAACCACTGCTTCCCGTATTGCTATTAATGGAAATTCATCTATTGACGT
GAGTGCTATTGATACAGGAGAAGGGGGTCAAGTTATTATTTCTGGGAACACTTACACAAATGTTGTTGGTCAAATTCGTT
CTCGTGGTGGTCAAGAAGAGGGGAATGGAGGATATATTAAAATTGTTGGTGTAAATGGGTTAGATTTTCAAGGAACTGTA
GATACTTCTGCTTTGCAAGGGGATTTTGGGGTTTTAGTTCTCAATTCAAATAATTTAACTATAGAAAATTCTCAGGGATT
TTCCTCTCCTAAAATTAGACCGTCTTCTCTTAATACGTTGTCTAGTAATCTGATTTTAGAAGCTTCTAATAAAATCACGT
TTAATGATCCGATTAATCTGCAAAATAGTCCATCAGGCTTGACAGTAATTGCTGATAAAACTATTCAAGTTAATGATAAT
ATTAATACTCAAAAGGGTTCAATTATTTTACAAGCAAATGAAACTATTAATATTAATAATAGTCAGGTAACAACTCAAGA
TGGCTCAATTATTTTAGAACCTATTTTACCCGATTTAAATTCTCTACTTATTTCTCTTGATAATAGTTTTATTGAAACGG
TTAATCCCACAGAAAATATTCGTTTAACGGCTCAAGAAATCGATCTTAATGGGTCAACCGAAATTCTAGGACAAAATCAG
CTTGAAATCAAACCCCCAACAGATGATAAAAATATTATTCTGGGAGGAGATAATAATAATCCATCAGCTTTAAATTTGAC
GGGATCAGAACTAGAAAAAATTAATGGTTTTGAGTCGGTTATCATTGGCAATAACAACGGACTTGGAAGGATTGAGATAG
GCAATGATACTACTGAAGTCAATTTAAATAATCAAGATTATAATTTAATTTTGCAAGGTAAAGATATTAAATTTAATAAT
TCTTTGATATTAGCAGATGATAAAACTTTAACCTTAAATACTCAAACAGTCACTAGCGCGAATTCCCCCCCCTTCAGAGA
TATCAAAATTGAGGGAGAACAAGGTCAATTAATCCTCAATACCTCTGGTTCGGTAGGAACTTTAGATAATCCTTTAGATA
CAGAGGTAAGTTACCTGACAATTTCCTCTACTTTAGGGGATAATTTTATTTATAATCATTCAGATATAAGCTTAGGAAAA
ATTTCGATTGCTGATAATTTAGATCTTAATGTTGATGGGAATATTAGAGATAATGATAGGGTAGTGATAGGAGGAATTCT
TACTCTCAGGGGACAAGATATTATTTTAGATAATAATAATGACTTGAATACAGTAGCAGTAACAGAAGCAGAAAATCTGA
CCCTGAATGATACTAATGAATTAGACCTAGCTAATCTGCAAATTAACAATGATTTAAACCTAACTACCAATGGAGATATT
ACTCATAGTGGGAGTATTCAAGTCTTAGGAATAACTAATTTAAATACCAATGGAAACGATATAATTTTAAATAGTTCCAA
TACTGATTTAAATATTGTTAATATTTTTAACAGTAAAAATGTTTTTTTAAAAGATATTAATGATATTATTTTAAATAACC
CTCTAACAGCGAACAGTCTGACTATTGAGGCCACGGGAAATATTACAACGAATGATATTAATACAAGTTCTACTCTAATT
TCTGGAGGGAATGTTAATTTAATCTCTGATAATGGAAAGATAACTACAGGCGGAATTAATACCAGTAGTCCTATAAATAA
TGCAGGTAATGTGACGTTAAAAGCTCAGGGAGATATAGAAACTGCCTATATTAATGCTCAAGGAATAAGCAATACTATAG
GAGGTGACGTTGCAATTATTACCAACAATTTTATCAGAATAACCGACTTTTTCATTGACAGTAATAATACATTAGCTAGT
ATCTCAACTGTGGGGGAAAATGGAGGAGGAAATATTATTATCCAACATGGAGGACAAGGAATTACCCAGTTTAAAATAGG
TGATCCTACGGTTAATGGAACATCACAAGCAATTACGACGGGTAGTAGCACAATTAATAATGAATCTTTGTCATACACAA
CAACCAGAGGAAATATTCAACTGATTTCTGTTAATGAACTCTCTCCAGAACCTTCCCCAGAACCTTCTCCAAGTCCGAAT
CCTAACCCGAATCCGATTATTAATATCAATCCTGAACCTAATCCTAACCCGAATCCGATTACTAATATTAATCCTGAACC
TAATCCTACCCCCAATCCGAATACTAATATTAATCCTGAACCTAATCCTAACCCCAATCCGAATACTAATATTAATCCTG
AACCTAATCCTAACCCCAATCCGATTACTAATATCAATCCTGACCCGAATCCGAATCCGATTACTCATATTAATCCTGAA
CCTAATCCTAACCCGAATCCGATTACTAATATCAATTTCAACCCAAATCCGAATCCCATTACTAATACTAATTCCGACAT
TCCTGTAGATACAAAAATTGACCCTATTTTTACCAATAGCATCGAAAATTTATCAACCATTGAGGAAATTGATCCCATAA
GACAAAGCCTATTTGTAGATACAAATCAACCCAGTTTGAGCTTGCAATCCAACAGGGACATTGTAGGAATAGTTCCTACA
GGGTTTCTTTCTATTTTTGGAGGGACAGCAACGGCTGAAGTCGGAAATGTAGAAAGTAATTTTACTGATGCTTTTGAAAA
TTATTTAGGAATTAACAAAGCGTCTACCTTAAGCTTAAAAGAAAAACAAATTATTCTCAATAATATTGAAGAAAAGTCAG
GTTATAAATCAGCATTTGTTTATATATATTTTAAACCCAACTCTACAACAACAGCCCAGGAAAAACAGGAACAACAAGAA
ATCTTATGGAGGTATCGCGGAGGTAAACCATCTTCTCAAAAAAATCTAGCTTCTGAAGGTCAAGGAACAGATCAATTAGA
AATAATTGTTATCACCTCTACCGGAGATGTAATTCAAGAAAAAATAGAAGGAATCACACGAGATCAGGTCATGTCGGTCG
TGAAAAAATTTCAACAGACAGTGACAAATCCTCGAAGACCTACTGCTTATCTCCAGCCATCTCAACAACTTTATCAATGG
TTTATTGCTTCTATTGAACAGGATTTACAAGCGCAAAATATTGATACTCTTGTCTTTATTCTTGATGCTGGTTTACGGTC
AGTTCCAATGGCGGCTCTTAATGATGGGCAACAATTTTTGATTGAAAAATATAGTATGGGTTTGATGCCAAGTGTTGCCT
TAACAGATACCCGTTATGTTAATGTTCAAAATTCCCAAGTTTTAGCAATGGGTGCATCTACATTTAGGGATCAAAATCCC
TTACCATCAGTTCCTATTGAATTATCACTCATTACCGATCAACTTTGGCAAGGACGATCTTATATTAATGAAAGTTTTAC
CCTTAATAATCTTAAAAAAGCACATCAATCTGAGCAATTTAGAATCGTCCATTTAGCGACTCATGCCAATTTTGAGGGAG
GGACTCTTGCTAATTCTTATATTCAATTATGGGATAATAAATTAACAATGGAGCAGTTAAAAGGATTAGGTTTAGATCGG
CCTCCCATAGATTTATTAGTGTTAAGTGCTTGTCGAACTGCTCTAGGTAATAGAGAGTCAGAATTAGGCTTTGCCGGAGC
GGCTGTATTAGCGAATGTCAAGACGGTTTTAGGGAGTCTTTGGGAAGTGAGTGATGAAGGAACTTTAGCATTAATGACCA
GTTTTTATCAGCAACTTAGAGGTGTTCCTCTCAAAGCTGAAGCACTGCGAAAAGCTCAGTTAAGTCTTCTTCGAGGTGAT
GTAAAAATGATTCAGGAAAACTCTAAACAAGCGGAACTTTTAATCGAAAATCAACGTTTACCCTTACCTCCTCAATTAGC
AGAATTAGGCGCTAAAGAATTTACTCATCCTTATTATTGGAGTAGTTTTACAGTGATTGGTAATCCTTGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCAACAATTGTAAAGCTTATATAAAGTTGTCATCGAGATTTTAAACAATCTTAAACCTTAGCGGAGTCAACAAAGAAC
AAAAAATGAAATCACTATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACCATTTCTGAAAAATAAAACTACAGTCTTGGGTGCGTCAGGTAACGCATCCTACAATTTGAGCGAGAAGATTGTGTAG
CTAAAATTTTTAGAATTGGT

Product: filamentous hemagglutinin family outer membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1650_residues
MRITLTGLLAVGVGLMLNQPMQGQSITPANDGTGTIINRQGNQYNIEGGTLSEDGRNLFHSLEKFGLTQAEIANFLSNPQ
IRNILTRIVGGNPSVINGLIQVLNGNSNLYIMNPAGIIFGPNARINVPADFVVTTATRIGFDNNLWFNAFESNDYAQLMG
NPSQFAFDLAKSGTITNLGNLTVTEGHHLMLLGKTVNNSGTLNAPEGNITIAAVAGTNRIKISQENNLVSLEIERPDTNV
NSNLSALDLPTLLTEGKVSNSASISPLQPGTVIISGNLSVSNAANSPLQQGGQVNIIGDQISLINANINATGTRGGGIVQ
IGANSQGQDITTTASRIAINGNSSIDVSAIDTGEGGQVIISGNTYTNVVGQIRSRGGQEEGNGGYIKIVGVNGLDFQGTV
DTSALQGDFGVLVLNSNNLTIENSQGFSSPKIRPSSLNTLSSNLILEASNKITFNDPINLQNSPSGLTVIADKTIQVNDN
INTQKGSIILQANETININNSQVTTQDGSIILEPILPDLNSLLISLDNSFIETVNPTENIRLTAQEIDLNGSTEILGQNQ
LEIKPPTDDKNIILGGDNNNPSALNLTGSELEKINGFESVIIGNNNGLGRIEIGNDTTEVNLNNQDYNLILQGKDIKFNN
SLILADDKTLTLNTQTVTSANSPPFRDIKIEGEQGQLILNTSGSVGTLDNPLDTEVSYLTISSTLGDNFIYNHSDISLGK
ISIADNLDLNVDGNIRDNDRVVIGGILTLRGQDIILDNNNDLNTVAVTEAENLTLNDTNELDLANLQINNDLNLTTNGDI
THSGSIQVLGITNLNTNGNDIILNSSNTDLNIVNIFNSKNVFLKDINDIILNNPLTANSLTIEATGNITTNDINTSSTLI
SGGNVNLISDNGKITTGGINTSSPINNAGNVTLKAQGDIETAYINAQGISNTIGGDVAIITNNFIRITDFFIDSNNTLAS
ISTVGENGGGNIIIQHGGQGITQFKIGDPTVNGTSQAITTGSSTINNESLSYTTTRGNIQLISVNELSPEPSPEPSPSPN
PNPNPIININPEPNPNPNPITNINPEPNPTPNPNTNINPEPNPNPNPNTNINPEPNPNPNPITNINPDPNPNPITHINPE
PNPNPNPITNINFNPNPNPITNTNSDIPVDTKIDPIFTNSIENLSTIEEIDPIRQSLFVDTNQPSLSLQSNRDIVGIVPT
GFLSIFGGTATAEVGNVESNFTDAFENYLGINKASTLSLKEKQIILNNIEEKSGYKSAFVYIYFKPNSTTTAQEKQEQQE
ILWRYRGGKPSSQKNLASEGQGTDQLEIIVITSTGDVIQEKIEGITRDQVMSVVKKFQQTVTNPRRPTAYLQPSQQLYQW
FIASIEQDLQAQNIDTLVFILDAGLRSVPMAALNDGQQFLIEKYSMGLMPSVALTDTRYVNVQNSQVLAMGASTFRDQNP
LPSVPIELSLITDQLWQGRSYINESFTLNNLKKAHQSEQFRIVHLATHANFEGGTLANSYIQLWDNKLTMEQLKGLGLDR
PPIDLLVLSACRTALGNRESELGFAGAAVLANVKTVLGSLWEVSDEGTLALMTSFYQQLRGVPLKAEALRKAQLSLLRGD
VKMIQENSKQAELLIENQRLPLPPQLAELGAKEFTHPYYWSSFTVIGNPW

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG3210

COG function: function code U; Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA