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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 218231197

GI number: 218231197

Start: 1659240

End: 1660508

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: BCB4264_A1749

Alternate gene names: 218231197

Gene position: 1659240-1660508 (Clockwise)

Preceding gene: 218231913

Following gene: 218231809

Centisome position: 30.62

GC content: 35.07

Gene sequence:

>1269_bases
ATGGAAGATATAAGTATAGGACAACATGATTCAAGAATGAAGATTGCAACGAGAAATATCATTTTAATGATGATTGGAAA
AATGACGTCTTTATTAGGCGCAGGTATTTATACGTTCGCAATGGGGTTATATGTATTAAAGACTACTGGTTCAGGGATGG
GGTTTGCAACTACGCTCGTTTGCGGATCACTTCCAAGGATGATCTGTGGCCCAATTGCTGGTGCTGTAGCAGACCGTGTG
AATCGAAAATGGCTTGTCATTGGTACTGATTTATTAAGTAGTTTAACGATGCTTAGTATGTTTATTCTTGCTACTATATT
TGGACCGTCACTTCTTTTTATTTATATTTCAGCAGCATTATTATCAATTTGTGCAAGTTTTTATTCTGTTGCATTAACTT
CGTCTATTCCGAGTTTAGTAGATGAAGGACGTATTCAAAAAGCGAGTGCTTTAAATCAAACGGCGGCTTCTTTATCAAAT
ATTTTAGGACCGATTATTGGCGGAGTTGTATATGGTTTCTTTTCAATTAAATCGTTTTTCCTATTAAATAGTATTACGTT
CTTTTTAGCGGTTATTTTGCAATTATTTATCGTATTTGATTTATATAAAAAAGAAGTGGCTGAGAGTACAGAGCATTTCT
TGACGAGTATAAAAGAAGGTTTTTTATATGTAAAAAGACAACATGAAATATATGGTTTAATGAAAATAGCATTGTGGGTA
AACTTTTTTGCGTGTGGTCTAACAGTTGCACTTCCTTACATTATCGTCCATACATTGCATTTATCTTCAAAGCAACTCGG
TACTGTAGAAGGAATGTTAGCAGTCGGGATGCTAATGGGAGCGATTGCTTTATCAGTGCGTAAAGAAGTGAATACTCCGT
TTCGTTCTATTTATACTGGACTGTTTTTGTTTGCAGGTTTAAGTTTATGTACAGTCTTTCCGTTGTTAGTTATCATTCCA
AAAGTAGCAAGTTTTATTTACTATATTGCTTTTATGATGTTAACTGGTATAGCAATTATGATTGTAAACATTCCAATGCA
AGTACATATGCAAAAAACGACAGATCCGAGCTACCTAGGGCGTGTGTTTGGCCTACTTGAAACAATTGCGACTGCAATCG
CACCACTTGGTATGATTGTATATGGACTACTATTAGATATGTTGCCAACTAGCATTGTTATGATGACAATAGGCGGAGGT
TTATTGTTAGTTGTATTAGTTGGAGTAAAGCAACATATGGTGAAAAAACAAGTAGATGTGTCCGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAGTTTAATTGTATTTAACTTTTTGTTGTGAAAATTGGAAAGTTGATTATATAATAAGTTTAACACAATTTAACTT
TTAAGGGGAGAGAGTCAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGAAAATAATGAAAATTCGACTTATCATTATAAAAATGACCGAATTAGTATTTTAGTTTTTGAAACTCTTTTTCA
TGTATGTTAAAGTAAAGTGA

Product: putative permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 422; Mature: 422

Protein sequence:

>422_residues
MEDISIGQHDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
NRKWLVIGTDLLSSLTMLSMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPSLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVYGFFSIKSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESTEHFLTSIKEGFLYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAIALSVRKEVNTPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVIIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVKQHMVKKQVDVSA

Sequences:

>Translated_422_residues
MEDISIGQHDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
NRKWLVIGTDLLSSLTMLSMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPSLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVYGFFSIKSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESTEHFLTSIKEGFLYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAIALSVRKEVNTPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVIIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVKQHMVKKQVDVSA
>Mature_422_residues
MEDISIGQHDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
NRKWLVIGTDLLSSLTMLSMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPSLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVYGFFSIKSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESTEHFLTSIKEGFLYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAIALSVRKEVNTPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVIIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVKQHMVKKQVDVSA

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45790; Mature: 45790

Theoretical pI: Translated: 9.49; Mature: 9.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
5.7 %Met     (Translated Protein)
6.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
5.7 %Met     (Mature Protein)
6.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEDISIGQHDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLV
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHH
CGSLPRMICGPIAGAVADRVNRKWLVIGTDLLSSLTMLSMFILATIFGPSLLFIYISAAL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSICASFYSVALTSSIPSLVDEGRIQKASALNQTAASLSNILGPIIGGVVYGFFSIKSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESTEHFLTSIKEGFLYVKRQHEIYGLMKIALWV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAIALSVRKEVNTPFRSIYTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LFLFAGLSLCTVFPLLVIIPKVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCCHHHHH
RVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGGLLLVVLVGVKQHMVKKQVDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SA
CC
>Mature Secondary Structure
MEDISIGQHDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLV
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHH
CGSLPRMICGPIAGAVADRVNRKWLVIGTDLLSSLTMLSMFILATIFGPSLLFIYISAAL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSICASFYSVALTSSIPSLVDEGRIQKASALNQTAASLSNILGPIIGGVVYGFFSIKSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESTEHFLTSIKEGFLYVKRQHEIYGLMKIALWV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAIALSVRKEVNTPFRSIYTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LFLFAGLSLCTVFPLLVIIPKVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCCHHHHH
RVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGGLLLVVLVGVKQHMVKKQVDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SA
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]