Definition Methanosarcina mazei Go1 chromosome, complete genome.
Accession NC_003901
Length 4,096,345

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 21228201

Identifier: 21228201

GI number: 21228201

Start: 2507953

End: 2509110

Strand: Reverse

Name: 21228201

Synonym: MM_2099

Alternate gene names: NA

Gene position: 2509110-2507953 (Counterclockwise)

Preceding gene: 21228202

Following gene: 21228200

Centisome position: 61.25

GC content: 27.12

Gene sequence:

>1158_bases
GTGGCAGTTAAAAATCGTGTAGTATATATGGATATTGTAAAAGCTTTTGCAATTATTGCTGTAGTTATTGGTCATTCAGG
ATCTCCATTTACCCCAATTGTATATTTATATCACGTACCTTTATTTTTCTTCATCTCAGGTTATTTTTTTAGCGATTATT
ACTCAAAAGCACCTTTTCTTTTACTAAAAAGAAGATTAAAAACTTTGTACATACCTTTCATTGGGTATGAATTATTTTTT
TTAATATTGCACAATGTGTTTTTTACATTAAACATATATAGTGATAAAGTGGGGTATGAGGATACTGTTAGTCATCTCTA
TACAACACAAGATTTTTCAATAAATGCCATGAAAATTCTAGCTTTTATTGGAACAGAACAATTAGCAGGACCACTTTGGT
TTATTTTGAGTTTATTCACAGTAAATCTACTTTTTGTGTTCATTAGTTATCTTACAACAAAATATATAAGAGAAAATCCT
GAATATTTCAGATTTTTTTTTATATTCCTTGCTTTTTTAATTGGTAATATTACTACACATTATGGCTTTAAAAATTATTA
TAATTTAAATACTTCTTTAGTTGCCCTCTTGATATTTTATATGGGATACACATTTAGAAAATTAGAACATAAAACCTTTT
TTAACTTATATCTTCTCATTATCTCTTCGCTATTTTTAGTTATGAGTTCTTTATATGGGCCCATAGATATGGCAAGTAAT
ACTTATCTAAGCCCTTCATTTTTGATTGTTAATTCACTTGCAGGAGTATATATAAATATACATTTGGCTAAAATAATTGT
ATCTAAAAAAATAAATTATACAATTTTAGAATATATAGGAAAAAACACATTTGCTATAATGGCTCTACATTTCCTTTCTT
TTAAGCTAATTAATTTAATTCAGGTAAAATTAAATAATTTGCCTATTTATATGGTGGCTAAATATCCAGTTATAGATGGA
ACAAATGGGTGGTGGATATTATACTCAGTATGTGGAGTACTTCTACCTTTAGTTGTCACATACATCAGCGATAAGTTGAT
TCAGAAATTCAAAAACAAAAGTGTAACTATTCCGCCTATGCAAAGTCAGTCTATTGAGTTTGATTTCAAAGTAATTGATA
AGTGTAAGTATCAACCAGTGAAAAATGAAAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGAAATTCCATTGTTTTTTAAAATTGGAGAAAAACCAGAAAAGATTAAAAAGACTCGAAAATTAAGAATACTTAAATAT
AGCTAGCCCAATAAGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAACAGTCAACGATTTAAGAAAATATAATTAGAGAAATTTTCGTATCCTCTTCAAATTGAGTGGAAAGCTTTCTTCTTT
CCACTAATTGCACTTTTATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 385; Mature: 384

Protein sequence:

>385_residues
MAVKNRVVYMDIVKAFAIIAVVIGHSGSPFTPIVYLYHVPLFFFISGYFFSDYYSKAPFLLLKRRLKTLYIPFIGYELFF
LILHNVFFTLNIYSDKVGYEDTVSHLYTTQDFSINAMKILAFIGTEQLAGPLWFILSLFTVNLLFVFISYLTTKYIRENP
EYFRFFFIFLAFLIGNITTHYGFKNYYNLNTSLVALLIFYMGYTFRKLEHKTFFNLYLLIISSLFLVMSSLYGPIDMASN
TYLSPSFLIVNSLAGVYINIHLAKIIVSKKINYTILEYIGKNTFAIMALHFLSFKLINLIQVKLNNLPIYMVAKYPVIDG
TNGWWILYSVCGVLLPLVVTYISDKLIQKFKNKSVTIPPMQSQSIEFDFKVIDKCKYQPVKNEKK

Sequences:

>Translated_385_residues
MAVKNRVVYMDIVKAFAIIAVVIGHSGSPFTPIVYLYHVPLFFFISGYFFSDYYSKAPFLLLKRRLKTLYIPFIGYELFF
LILHNVFFTLNIYSDKVGYEDTVSHLYTTQDFSINAMKILAFIGTEQLAGPLWFILSLFTVNLLFVFISYLTTKYIRENP
EYFRFFFIFLAFLIGNITTHYGFKNYYNLNTSLVALLIFYMGYTFRKLEHKTFFNLYLLIISSLFLVMSSLYGPIDMASN
TYLSPSFLIVNSLAGVYINIHLAKIIVSKKINYTILEYIGKNTFAIMALHFLSFKLINLIQVKLNNLPIYMVAKYPVIDG
TNGWWILYSVCGVLLPLVVTYISDKLIQKFKNKSVTIPPMQSQSIEFDFKVIDKCKYQPVKNEKK
>Mature_384_residues
AVKNRVVYMDIVKAFAIIAVVIGHSGSPFTPIVYLYHVPLFFFISGYFFSDYYSKAPFLLLKRRLKTLYIPFIGYELFFL
ILHNVFFTLNIYSDKVGYEDTVSHLYTTQDFSINAMKILAFIGTEQLAGPLWFILSLFTVNLLFVFISYLTTKYIRENPE
YFRFFFIFLAFLIGNITTHYGFKNYYNLNTSLVALLIFYMGYTFRKLEHKTFFNLYLLIISSLFLVMSSLYGPIDMASNT
YLSPSFLIVNSLAGVYINIHLAKIIVSKKINYTILEYIGKNTFAIMALHFLSFKLINLIQVKLNNLPIYMVAKYPVIDGT
NGWWILYSVCGVLLPLVVTYISDKLIQKFKNKSVTIPPMQSQSIEFDFKVIDKCKYQPVKNEKK

Specific function: Unknown

COG id: COG3594

COG function: function code G; Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44763; Mature: 44632

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AVKNRVVYMDIVKAFAIIAVVIGHSGSPFTPIVYLYHVPLFFFISGYFFSDYYSKAPFL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LLKRRLKTLYIPFIGYELFFLILHNVFFTLNIYSDKVGYEDTVSHLYTTQDFSINAMKIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH
AFIGTEQLAGPLWFILSLFTVNLLFVFISYLTTKYIRENPEYFRFFFIFLAFLIGNITTH
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGFKNYYNLNTSLVALLIFYMGYTFRKLEHKTFFNLYLLIISSLFLVMSSLYGPIDMASN
CCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCC
TYLSPSFLIVNSLAGVYINIHLAKIIVSKKINYTILEYIGKNTFAIMALHFLSFKLINLI
CCCCCHHHHHHHHCHHEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVKLNNLPIYMVAKYPVIDGTNGWWILYSVCGVLLPLVVTYISDKLIQKFKNKSVTIPPM
HHHHCCCCEEEEEECCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCC
QSQSIEFDFKVIDKCKYQPVKNEKK
CCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA