Definition Methanosarcina mazei Go1 chromosome, complete genome.
Accession NC_003901
Length 4,096,345

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The map label for this gene is 21227248

Identifier: 21227248

GI number: 21227248

Start: 1360795

End: 1362756

Strand: Reverse

Name: 21227248

Synonym: MM_1146

Alternate gene names: NA

Gene position: 1362756-1360795 (Counterclockwise)

Preceding gene: 21227249

Following gene: 21227247

Centisome position: 33.27

GC content: 35.07

Gene sequence:

>1962_bases
TTGAATGAAATTGAGGAGTTAAAACCTGCTAATAACAGGTGGATGAAACTTATCTACTCTTTATTTCCATTATGCGTGAT
TATTGCTGTATTATTTGCATTCTTATGGATGTTTGCTATTGGAAAAGTAGCTTTTGTGATTAAAGGGATATTCACTGGAG
TCCCTGCAGTCATCTCCTGTATTTTTTTATTATTTATTTATAAAAGAGATGTAGCATTAAATGATATTCGCGTTTTTCTT
TCCATCAGTCAAAATTCCTTAACCTATTTGTTTGGAATTCTCTACCTCAGTTCAGTCACTGTACTTTTATTGTTCCCAGG
AGCCAGGACCTGGCATTATTTTGCGCTGATTGTGCTGCTTTACATTTCTGTTTTGCTGCAAATATTATCCGAAAACTCCA
ACCCCTCTGTTATTCTAGTTGAGATTTTTTTAATTCTGCTGAATCTTACTTATAGTGTTACTTTAAATTACGATCTTTAT
TTTGGGACTACTGACATTATGCCTCATATTTTACTCTCTGAAATGACTGCAGCATCAGGACATGTTATTTCAACCTCTTT
GACCGATTATGCATTCTTCCCTCTATATCACATAATGGTCGCTTCAGCTTCCAATTTATTGAACATAGACGTAAAATCAG
CTCTCTTTTTAATAGCCGCACCTATTTTTGCAATAACTATCTTTTTTGTTTACTACCTTTCACAGTATGTATCTAATAAT
CGCCAGATTTCTCTGCTTTCTTCCTTACTGTTTTCTTCGAGTGCAATTGTGCTTTATTACGGTGCATATATGATTACTCG
AACAATATCTTTTGTAATGTTTGTTGTATTACTGTATTTGATTTATAGTGTCAATTTCAAAGAGGATAAATTTCCTCTAA
AAGTTCTTTCCGTTATTGCCACTATTTTTTTAATACTGGTGCACAATGTTTCTTTACCCCAATTTATCTTGTTAATGGCC
ATTCTTCTTGTTTGTGAATATCTGGTTAATGTTGGCAAACATATAAGCAGGCCTTTTTTTGTTTTCTTAAGCGTTGCATT
TGTATCCTACTGGTTTTTCGTAGCATATCTGTTTCTTCAGAGGAGTATATCCGTACGTCTACAGAGCCGGTTCTATGACT
CAATGATTTTGACACTTGAGGGAGCAGAAAGTGTTAATGAACATCTGATTAATCTAGTAGGATCCCTGGATAACTCGGTT
TTTCTGTTTTTTGCTTTAATTGGAATTGGTTTTCTTCTGAAAAAATACAGAAACAACTATGCTGCGGTATTTGGACTGTT
CGCCCTGATTACTCTCGTATTTTATATCCCTAACCCCCTCAATACTATCTGGCAGTTGCAGGTTTTATTCAGGATTGATA
GATTCAAGCTTTTTGTCAGTCCCTTTATGGCTTTTGTTATGAGCTACGGCATTTATGTATTCTGGAATTATCTGTCAAAA
TCTCCCTCTAAAAAGAGTTATCCTTTAGTTATAATTCTCTTATTATTCTCTACCTTTGTGTTTATTTCTTCTGTCTACAG
TATCTCGGATTCTGAAAGTCTTGTTGTCGAGTCCGCGCATCCATACTTTACAGCTCAGGAACTGAAAGGATTTGAGCATG
TTAAAGACTATATTCCCGCTGGCTCTCATATTTACTCTGACTATTACACGGCACGGTACTTTGAATTCCCTGGGTCAACA
GGGGCATCAGAGAATAAGGACCTTTTGATTTACCGGAGCTATAGAGTCGATAATGTGAGTAATTTCGATCAGTATAAAGG
TTACATTGTGATCAGAACTAGCGAATTCCTCCGAGCCGGTTTATATTTTAGCAAAGGAGGAACTAATGCGGAAAGTGCTA
ATTATTTTTATAAAGGAACTGCCGAAAATAAACTGGAAATGGAAAATAATCTGAAAAAAATAAGTAAAATTTATTCAAGT
CCGGTAGAATCTATATTCATTGGTGGCTATGGAGTTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGATTTTTAAAAAAATCTACAATTTAACTTAAACCGATTGTCAGTGAATATAATCTGAATTTTATGAAGCTAAGGATA
ACAGGGATATTATGTCTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACACCTATCAGTTCTCTTGTATGATAAATCTGATAATATCCAGATACGTTAAAATTTTTTAATATTTACTCCGGGAATAT
GTGAGCTATTTTTCTCACAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 653

Protein sequence:

>653_residues
MNEIEELKPANNRWMKLIYSLFPLCVIIAVLFAFLWMFAIGKVAFVIKGIFTGVPAVISCIFLLFIYKRDVALNDIRVFL
SISQNSLTYLFGILYLSSVTVLLLFPGARTWHYFALIVLLYISVLLQILSENSNPSVILVEIFLILLNLTYSVTLNYDLY
FGTTDIMPHILLSEMTAASGHVISTSLTDYAFFPLYHIMVASASNLLNIDVKSALFLIAAPIFAITIFFVYYLSQYVSNN
RQISLLSSLLFSSSAIVLYYGAYMITRTISFVMFVVLLYLIYSVNFKEDKFPLKVLSVIATIFLILVHNVSLPQFILLMA
ILLVCEYLVNVGKHISRPFFVFLSVAFVSYWFFVAYLFLQRSISVRLQSRFYDSMILTLEGAESVNEHLINLVGSLDNSV
FLFFALIGIGFLLKKYRNNYAAVFGLFALITLVFYIPNPLNTIWQLQVLFRIDRFKLFVSPFMAFVMSYGIYVFWNYLSK
SPSKKSYPLVIILLLFSTFVFISSVYSISDSESLVVESAHPYFTAQELKGFEHVKDYIPAGSHIYSDYYTARYFEFPGST
GASENKDLLIYRSYRVDNVSNFDQYKGYIVIRTSEFLRAGLYFSKGGTNAESANYFYKGTAENKLEMENNLKKISKIYSS
PVESIFIGGYGVN

Sequences:

>Translated_653_residues
MNEIEELKPANNRWMKLIYSLFPLCVIIAVLFAFLWMFAIGKVAFVIKGIFTGVPAVISCIFLLFIYKRDVALNDIRVFL
SISQNSLTYLFGILYLSSVTVLLLFPGARTWHYFALIVLLYISVLLQILSENSNPSVILVEIFLILLNLTYSVTLNYDLY
FGTTDIMPHILLSEMTAASGHVISTSLTDYAFFPLYHIMVASASNLLNIDVKSALFLIAAPIFAITIFFVYYLSQYVSNN
RQISLLSSLLFSSSAIVLYYGAYMITRTISFVMFVVLLYLIYSVNFKEDKFPLKVLSVIATIFLILVHNVSLPQFILLMA
ILLVCEYLVNVGKHISRPFFVFLSVAFVSYWFFVAYLFLQRSISVRLQSRFYDSMILTLEGAESVNEHLINLVGSLDNSV
FLFFALIGIGFLLKKYRNNYAAVFGLFALITLVFYIPNPLNTIWQLQVLFRIDRFKLFVSPFMAFVMSYGIYVFWNYLSK
SPSKKSYPLVIILLLFSTFVFISSVYSISDSESLVVESAHPYFTAQELKGFEHVKDYIPAGSHIYSDYYTARYFEFPGST
GASENKDLLIYRSYRVDNVSNFDQYKGYIVIRTSEFLRAGLYFSKGGTNAESANYFYKGTAENKLEMENNLKKISKIYSS
PVESIFIGGYGVN
>Mature_653_residues
MNEIEELKPANNRWMKLIYSLFPLCVIIAVLFAFLWMFAIGKVAFVIKGIFTGVPAVISCIFLLFIYKRDVALNDIRVFL
SISQNSLTYLFGILYLSSVTVLLLFPGARTWHYFALIVLLYISVLLQILSENSNPSVILVEIFLILLNLTYSVTLNYDLY
FGTTDIMPHILLSEMTAASGHVISTSLTDYAFFPLYHIMVASASNLLNIDVKSALFLIAAPIFAITIFFVYYLSQYVSNN
RQISLLSSLLFSSSAIVLYYGAYMITRTISFVMFVVLLYLIYSVNFKEDKFPLKVLSVIATIFLILVHNVSLPQFILLMA
ILLVCEYLVNVGKHISRPFFVFLSVAFVSYWFFVAYLFLQRSISVRLQSRFYDSMILTLEGAESVNEHLINLVGSLDNSV
FLFFALIGIGFLLKKYRNNYAAVFGLFALITLVFYIPNPLNTIWQLQVLFRIDRFKLFVSPFMAFVMSYGIYVFWNYLSK
SPSKKSYPLVIILLLFSTFVFISSVYSISDSESLVVESAHPYFTAQELKGFEHVKDYIPAGSHIYSDYYTARYFEFPGST
GASENKDLLIYRSYRVDNVSNFDQYKGYIVIRTSEFLRAGLYFSKGGTNAESANYFYKGTAENKLEMENNLKKISKIYSS
PVESIFIGGYGVN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74544; Mature: 74544

Theoretical pI: Translated: 8.80; Mature: 8.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNEIEELKPANNRWMKLIYSLFPLCVIIAVLFAFLWMFAIGKVAFVIKGIFTGVPAVISC
CCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IFLLFIYKRDVALNDIRVFLSISQNSLTYLFGILYLSSVTVLLLFPGARTWHYFALIVLL
HHHHHHHHCCCCHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHH
YISVLLQILSENSNPSVILVEIFLILLNLTYSVTLNYDLYFGTTDIMPHILLSEMTAASG
HHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCC
HVISTSLTDYAFFPLYHIMVASASNLLNIDVKSALFLIAAPIFAITIFFVYYLSQYVSNN
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RQISLLSSLLFSSSAIVLYYGAYMITRTISFVMFVVLLYLIYSVNFKEDKFPLKVLSVIA
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
TIFLILVHNVSLPQFILLMAILLVCEYLVNVGKHISRPFFVFLSVAFVSYWFFVAYLFLQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSISVRLQSRFYDSMILTLEGAESVNEHLINLVGSLDNSVFLFFALIGIGFLLKKYRNNY
HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
AAVFGLFALITLVFYIPNPLNTIWQLQVLFRIDRFKLFVSPFMAFVMSYGIYVFWNYLSK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SPSKKSYPLVIILLLFSTFVFISSVYSISDSESLVVESAHPYFTAQELKGFEHVKDYIPA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHCHHHHHHHHCCC
GSHIYSDYYTARYFEFPGSTGASENKDLLIYRSYRVDNVSNFDQYKGYIVIRTSEFLRAG
CCHHHHCCHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHCCEEEEEEHHHHHHC
LYFSKGGTNAESANYFYKGTAENKLEMENNLKKISKIYSSPVESIFIGGYGVN
CEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNEIEELKPANNRWMKLIYSLFPLCVIIAVLFAFLWMFAIGKVAFVIKGIFTGVPAVISC
CCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IFLLFIYKRDVALNDIRVFLSISQNSLTYLFGILYLSSVTVLLLFPGARTWHYFALIVLL
HHHHHHHHCCCCHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHH
YISVLLQILSENSNPSVILVEIFLILLNLTYSVTLNYDLYFGTTDIMPHILLSEMTAASG
HHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCC
HVISTSLTDYAFFPLYHIMVASASNLLNIDVKSALFLIAAPIFAITIFFVYYLSQYVSNN
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RQISLLSSLLFSSSAIVLYYGAYMITRTISFVMFVVLLYLIYSVNFKEDKFPLKVLSVIA
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TIFLILVHNVSLPQFILLMAILLVCEYLVNVGKHISRPFFVFLSVAFVSYWFFVAYLFLQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSISVRLQSRFYDSMILTLEGAESVNEHLINLVGSLDNSVFLFFALIGIGFLLKKYRNNY
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AAVFGLFALITLVFYIPNPLNTIWQLQVLFRIDRFKLFVSPFMAFVMSYGIYVFWNYLSK
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SPSKKSYPLVIILLLFSTFVFISSVYSISDSESLVVESAHPYFTAQELKGFEHVKDYIPA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHCHHHHHHHHCCC
GSHIYSDYYTARYFEFPGSTGASENKDLLIYRSYRVDNVSNFDQYKGYIVIRTSEFLRAG
CCHHHHCCHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHCCEEEEEEHHHHHHC
LYFSKGGTNAESANYFYKGTAENKLEMENNLKKISKIYSSPVESIFIGGYGVN
CEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA