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The map label for this gene is 209695498

Identifier: 209695498

GI number: 209695498

Start: 2195378

End: 2197738

Strand: Reverse

Name: 209695498

Synonym: VSAL_I2050

Alternate gene names: NA

Gene position: 2197738-2195378 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209695499

Following gene: 209695497

Centisome position: 66.09

GC content: 39.31

Gene sequence:

>2361_bases
ATGGTAATTATGAAACGATTCTCTCATTTCTTATTTCTTGCTTTCACTTTACTGCTCTCTCCGGTTAGCTACGCGAGTTG
GGGCCTAACAAATGATCAACCGATTGAGATCAGTAAACCCGCTCAAGAAATTGATACCGAGGTTCAAGCTCTTCCTGAAC
AGCATTTTTTCTCAAACAACAATTACGCTCAGGTTAAGCGACTTTTATCTAACACCATGCTTCAACAAAGTAAGCATACT
GAAAAACTAAGAGAAGCACTGACTGCGTATAAAAATGACTCTACAGAAAACAATTGGTTAACCGTAGAAGAAAATCATCA
ATCATTAAATTCATTAAACTTAAGTAAACAACAGTTACTTCAATTAACGGACAATACAACGCGAGAGCAACTGACCGGAT
TCGGTCCTTACGGTGTAACTCAGTTTTATTCAGAGCTCAGCATAACTCGGCTCAACATTGAATATTACTTACACTACCAA
ATTCGTAGTTTCAAAAATTTACTTCGTGATTTAACGATTTCGCCAGTACCCGCGATTAGCGTCATATTTAAAGTATTGTG
TGTATTTTTTGTTTTTAATTGGTGGATGCGAAATAACGCTCGCTTAATTAGTGACTTTAAAAAATTAAAATTAGAAGGCG
CGACAAAACCAAACCTTCTTATCCGTACTATTTGGTATTTTAGCCGAGCACAGAAAGCGATTGCTTGGTTATTACTTATC
ACGGTCACTCTTCGAATTATTTCGACCTTACCAAGCTTACAACACCTTATATTCTTAGAGATCTTTACATGGTGGATCTT
AGGCGGTTCTATTGCGGTAAGTTTGATTCTTGAATTTGCGTATCGAAACAGCAAACACAATAAAAAAGAAACTATCGCAC
TTCGTTTATCTACCATCCGTCGCTATATTTGGGGTGCCATTTTTGCTGGCGTAATTCTCCAAATTTCATCGCGAACGTTA
GGAGAAGGAACGATTTATGCGTGGATTAATTCTGCGGTGTATTTATTCTTTATCTTGTTAACAATCATTACTCTAAGGCA
GTGGAAAGCAACGATTTTTGAACGCATTCATAATTTAGACCCATTACCTTTATCCATTCATTGGGCTGTCAGAAATAAAA
ATACATTCTTAATCTCAATTATCGCGACGGCTTGTGGTTCTGCATGGTTAGTTTGGCGATCGATTCAGCACGTCATCGTA
TCGACGTTATCTCAATACACAGCGTTCAGCCATGCACTCGCCTATTTGTTCCGAATTGAAGTTGCAAAACAAACGGAAGT
CTCACGCGAACAATCAAATCTAGTAAGGATCAAGGGCGGACTCGCTTTTGATTTTATTTCTCCGGGCTCTGAAGACTCTG
AACTTATCGAAGATTACGCTAAAGAAGAAATGACGGCACTTTCTCGTTATTTACTCACAGAAAGCCCTGCGGTGTGTGTT
CTATCTGGTGAGCGTGGCGTGGGCACAACAGCCCTACTCAACCGTATTTTAAATAAAGTAAAAAACGCCCAACCACTTTA
CCTAAATTGCCCTTATGACGGTTATTCAGCTCTACTTCCTGAATTAGCAAGACAACTTGGACTATCAGAAGAATCGAGTG
AAAGAGACATTCTTCAACACCTGAGAAACAGTGACACATGCTATTTGCTTGCTTTTGATAATGCTCAACGTTTGGTGAAA
CCTAAAGTCAATGGGTTAGCTGATTTAATGAAGCTCACAAATCTATTAAGACGAGCAAGAAAAAGCCATCGTGTTGTATT
GGCTATTGAGAAATCAAGTTGGCGTTTTATTGACCGAGCTCGTGGAGAAAGATTGTTATTTGATTTGGTCACTTTTATGC
CTAAGTGGACTGAGAAACAAATTGGCAGCTTATTAGAAAGCCGAATTGTAAAAACAAATGAGCAACAACTCTCTTTTGAT
GGCTTAGTTTTACCTAGACAATGGGATGAAGAGACCTTAACAGAAGAAGAACGAGCTAAGAATGGCTTTTACCGCATTCT
ATGGGATTATTCTGATGGTAACCCAACGGTTGCTTTGCGTTTCTTTAGATTGTCTCTGCACCGTGATAAAGATACTGATG
CCATTTTGGTTCGTTTATTTAGAGCCCCGCACTCTGATGACCTAGAAACCATGCCAAAACCCATGCTGGCCGTATTGCGA
TCCATCGTACAATTGGAAATCGCATCTCCAGCGGATGTATGTGAATGCAGTCGGTTAAGTATGGCTGAAGTGATCAGTAC
ACTCCGCTACTTCCAAAGTCGTGGGTACATTGAATGGAGTGATGATAAAGCTCGAATTTCAGATCATTGGTTCCGACACA
TTACTAACGTACTTCATCGTCAACATTTATTGGTGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCATGACCATACCTCACTTTTATTGCTCATTCCTACCTTTGTTACTGGTTTTTTCTATTAATTTAGCTAATGTAATAAG
TAATTAAATCATTATATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGCTTCGTTTATTTATTCTCGTACTTACATTAAGCTTTGGATCGAGTGCTTTTGCTGAAGATCCTCAATCTATCGGCA
ACCTGCATCAATTCGCGAGC

Product: membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 786; Mature: 786

Protein sequence:

>786_residues
MVIMKRFSHFLFLAFTLLLSPVSYASWGLTNDQPIEISKPAQEIDTEVQALPEQHFFSNNNYAQVKRLLSNTMLQQSKHT
EKLREALTAYKNDSTENNWLTVEENHQSLNSLNLSKQQLLQLTDNTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITRLNIEYYLHYQ
IRSFKNLLRDLTISPVPAISVIFKVLCVFFVFNWWMRNNARLISDFKKLKLEGATKPNLLIRTIWYFSRAQKAIAWLLLI
TVTLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSLILEFAYRNSKHNKKETIALRLSTIRRYIWGAIFAGVILQISSRTL
GEGTIYAWINSAVYLFFILLTIITLRQWKATIFERIHNLDPLPLSIHWAVRNKNTFLISIIATACGSAWLVWRSIQHVIV
STLSQYTAFSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRIKGGLAFDFISPGSEDSELIEDYAKEEMTALSRYLLTESPAVCV
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PKVNGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKQIGSLLESRIVKTNEQQLSFD
GLVLPRQWDEETLTEEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLR
SIVQLEIASPADVCECSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK

Sequences:

>Translated_786_residues
MVIMKRFSHFLFLAFTLLLSPVSYASWGLTNDQPIEISKPAQEIDTEVQALPEQHFFSNNNYAQVKRLLSNTMLQQSKHT
EKLREALTAYKNDSTENNWLTVEENHQSLNSLNLSKQQLLQLTDNTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITRLNIEYYLHYQ
IRSFKNLLRDLTISPVPAISVIFKVLCVFFVFNWWMRNNARLISDFKKLKLEGATKPNLLIRTIWYFSRAQKAIAWLLLI
TVTLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSLILEFAYRNSKHNKKETIALRLSTIRRYIWGAIFAGVILQISSRTL
GEGTIYAWINSAVYLFFILLTIITLRQWKATIFERIHNLDPLPLSIHWAVRNKNTFLISIIATACGSAWLVWRSIQHVIV
STLSQYTAFSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRIKGGLAFDFISPGSEDSELIEDYAKEEMTALSRYLLTESPAVCV
LSGERGVGTTALLNRILNKVKNAQPLYLNCPYDGYSALLPELARQLGLSEESSERDILQHLRNSDTCYLLAFDNAQRLVK
PKVNGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKQIGSLLESRIVKTNEQQLSFD
GLVLPRQWDEETLTEEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLR
SIVQLEIASPADVCECSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK
>Mature_786_residues
MVIMKRFSHFLFLAFTLLLSPVSYASWGLTNDQPIEISKPAQEIDTEVQALPEQHFFSNNNYAQVKRLLSNTMLQQSKHT
EKLREALTAYKNDSTENNWLTVEENHQSLNSLNLSKQQLLQLTDNTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITRLNIEYYLHYQ
IRSFKNLLRDLTISPVPAISVIFKVLCVFFVFNWWMRNNARLISDFKKLKLEGATKPNLLIRTIWYFSRAQKAIAWLLLI
TVTLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSLILEFAYRNSKHNKKETIALRLSTIRRYIWGAIFAGVILQISSRTL
GEGTIYAWINSAVYLFFILLTIITLRQWKATIFERIHNLDPLPLSIHWAVRNKNTFLISIIATACGSAWLVWRSIQHVIV
STLSQYTAFSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRIKGGLAFDFISPGSEDSELIEDYAKEEMTALSRYLLTESPAVCV
LSGERGVGTTALLNRILNKVKNAQPLYLNCPYDGYSALLPELARQLGLSEESSERDILQHLRNSDTCYLLAFDNAQRLVK
PKVNGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKQIGSLLESRIVKTNEQQLSFD
GLVLPRQWDEETLTEEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLR
SIVQLEIASPADVCECSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90842; Mature: 90842

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVIMKRFSHFLFLAFTLLLSPVSYASWGLTNDQPIEISKPAQEIDTEVQALPEQHFFSNN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCC
NYAQVKRLLSNTMLQQSKHTEKLREALTAYKNDSTENNWLTVEENHQSLNSLNLSKQQLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHH
QLTDNTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITRLNIEYYLHYQIRSFKNLLRDLTISPVPAIS
HHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VIFKVLCVFFVFNWWMRNNARLISDFKKLKLEGATKPNLLIRTIWYFSRAQKAIAWLLLI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVTLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSLILEFAYRNSKHNKKETIALRLSTIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
RYIWGAIFAGVILQISSRTLGEGTIYAWINSAVYLFFILLTIITLRQWKATIFERIHNLD
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLPLSIHWAVRNKNTFLISIIATACGSAWLVWRSIQHVIVSTLSQYTAFSHALAYLFRIE
CCCEEEEEEEECCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAKQTEVSREQSNLVRIKGGLAFDFISPGSEDSELIEDYAKEEMTALSRYLLTESPAVCV
HHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LSGERGVGTTALLNRILNKVKNAQPLYLNCPYDGYSALLPELARQLGLSEESSERDILQH
EECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
LRNSDTCYLLAFDNAQRLVKPKVNGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSSWRFIDRA
HCCCCCEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHH
RGERLLFDLVTFMPKWTEKQIGSLLESRIVKTNEQQLSFDGLVLPRQWDEETLTEEERAK
CCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHCHHHHHC
NGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLR
CCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHH
SIVQLEIASPADVCECSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHR
HHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHLLVK
HHHCCC
>Mature Secondary Structure
MVIMKRFSHFLFLAFTLLLSPVSYASWGLTNDQPIEISKPAQEIDTEVQALPEQHFFSNN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCC
NYAQVKRLLSNTMLQQSKHTEKLREALTAYKNDSTENNWLTVEENHQSLNSLNLSKQQLL
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QLTDNTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITRLNIEYYLHYQIRSFKNLLRDLTISPVPAIS
HHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VIFKVLCVFFVFNWWMRNNARLISDFKKLKLEGATKPNLLIRTIWYFSRAQKAIAWLLLI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVTLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSLILEFAYRNSKHNKKETIALRLSTIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
RYIWGAIFAGVILQISSRTLGEGTIYAWINSAVYLFFILLTIITLRQWKATIFERIHNLD
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PLPLSIHWAVRNKNTFLISIIATACGSAWLVWRSIQHVIVSTLSQYTAFSHALAYLFRIE
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VAKQTEVSREQSNLVRIKGGLAFDFISPGSEDSELIEDYAKEEMTALSRYLLTESPAVCV
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LSGERGVGTTALLNRILNKVKNAQPLYLNCPYDGYSALLPELARQLGLSEESSERDILQH
EECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
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SIVQLEIASPADVCECSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHR
HHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHLLVK
HHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA