| Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011374 |
| Length | 874,478 |
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The map label for this gene is 209554013
Identifier: 209554013
GI number: 209554013
Start: 11997
End: 14207
Strand: Reverse
Name: 209554013
Synonym: UUR10_0014
Alternate gene names: NA
Gene position: 14207-11997 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554231
Following gene: 209554171
Centisome position: 1.62
GC content: 25.87
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCCTTCTTTATCATTAATTAACGATGCCTCTATCTATGCTGCTATTTTAATTTTAGGTGCATTAAGTGGTTTCTTTTGT GAACGCGTTGGGATTGCTAA
Product: ribose/galactose ABC transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 736; Mature: 736
Protein sequence:
>736_residues MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTKWVGSPDIYLTKVAILGIAA LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS ILLNWIMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIWIILKYTVFGHKVL SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVYWIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNWLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDWLTTA YQKAITNQQNMKEVIS
Sequences:
>Translated_736_residues MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTK*VGSPDIYLTKVAILGIAA LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS ILLN*IMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIII*IILKYTVFGHKVL SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNN*LKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLED*LTTA YQKAITNQQNMKEVIS >Mature_736_residues MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTK*VGSPDIYLTKVAILGIAA LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS ILLN*IMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIII*IILKYTVFGHKVL SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNN*LKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLED*LTTA YQKAITNQQNMKEVIS
Specific function: Unknown
COG id: COG4603
COG function: function code R; ABC-type uncharacterized transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001851 [H]
Pfam domain/function: PF02653 BPD_transp_2 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 83119; Mature: 83119
Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFT CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQGKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIIILKYTVFGHKVLSVG CCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDG CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCH IAMGLISLTHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIYIEINKKRNQYLQELKELRKELDKF CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERATLVYYP HCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC EINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLK CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH YLLQQYENNDSILTIDLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYI HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNPNDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDLTTAYQKAIT HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NQQNMKEVIS CHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFT CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQGKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIIILKYTVFGHKVLSVG CCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDG CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCH IAMGLISLTHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIYIEINKKRNQYLQELKELRKELDKF CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERATLVYYP HCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC EINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLK CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH YLLQQYENNDSILTIDLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYI HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNPNDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDLTTAYQKAIT HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NQQNMKEVIS CHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7569993; 8253680 [H]