Definition Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome.
Accession NC_011374
Length 874,478

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 209554013

Identifier: 209554013

GI number: 209554013

Start: 11997

End: 14207

Strand: Reverse

Name: 209554013

Synonym: UUR10_0014

Alternate gene names: NA

Gene position: 14207-11997 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554231

Following gene: 209554171

Centisome position: 1.62

GC content: 25.87

Gene sequence:

>2211_bases
ATGCTAAAATTTAAAACAGTTTTGACCTGTGATAACCTTTTTAAAGGTCAAGAACGAAAAACAATCACTAAAAAATTCTT
ATCAACAGTTTTTGCTATTTTTGTAGCTATAGTTGTCTCTGCTATTTTGGTTGGGATATTAGGATATGATATACGCGATT
TCTTTATAAGATTATTTACTAAGTGAGTAGGTTCGCCAGATATTTATTTGACAAAAGTAGCAATTTTAGGGATTGCCGCA
CTATCATTCATTTTTGCTTTTAAAGCAGGATTATTTAATATTGGAATTTCTGGACAAATGTTAGGTTCAGGACTAATTAT
GTTATTAGTTGTTAAAAATATGCAAATTGCTAATATTAATATGCCCAATGTCTTGGGACAATTTTTCTTATTAATTATTG
CAATGTTAGCAGGGGCAATGTTTGCAGTTTTTATAGGAATTTTAAAAGTATTTTTAAAAATTAATGAAGTTGTTAGTTCA
ATTTTATTAAATTGAATTATGTTCTATATTACACGTTATGTTGTATTTACAGCGCAAGGTAAAATGTATAATCCAACACC
AGATCAAGTTGGATCAAGATCAATTCCTTTTGCAGATAATTATTCCTTATTTCATTTAGCATCTGGATACGGCTATTTAT
TTGCCTTGCTAATATTTATTTCGTTGGCTATTATCATTTGAATAATTTTAAAATATACAGTTTTTGGCCATAAAGTTTTA
TCTGTTGGTAAATCATTTGATGCCGCAAAATATGCTGGATATAGAACAAAGATTATTTCGTTAGCTACATTTGCAATTTC
TGGCGCATTAGCAGGCGCATTAGCAATGGTTAATTATACTTCGACAACAACAAATGCAATTGTTATCAGTCAAGCATCTG
ATGCTTTACCCACACAAGGATATGATGGAATTGCAATGGGTTTGATCTCATTAACACATCCGTTAGCAACAATTCCTGTG
TCTTTCTTAATGGGTTTATTACAACAATCAGCCGATAACTTAGGAGGAAGCTTTCCACAAGATTTATCTGGAATTATTAT
CTCATTTGTAATGTTAGGGGCTGCAATGTTCATCTTATTTGAACGAATTAGTCCTGTTTATTGAATTTATCATCTAATCT
ATACTTATAAAGGTAAAGATTATTATCGTGATTATGAAAATAAAAATAATAATACCATTTCTGAATACAAAGCAATTTAT
ATAGAAATTAATAAGAAACGAAATCAATATTTACAAGAATTAAAAGAATTGCGTAAAGAATTAGATAAATTTAAGAATCA
AAAACAATATAATGGAGTTAATGAACAATATCAACACACTGTTAACTACATTAAAACAACGTACAATAATTGATTAAAAG
TTGAATATAGTAAATATTTAGAACAAATGAAAAATAATGTAATGCAACTTAAAAAACACTTAATTATTGAAAGAGCAACA
CTTGTTTATTATCCAGAAATTAATACAACAAGAAAAGTTAAAAACAAACTAAAACATTTTGAAAATATAAGTGCTAAAAA
ATTAAGTCGTATTAAAGATAAAATTCATAATGAAGATTTCTTAATTAAAAATTTAGTTGCTAAGGAAATTGGTAAATACG
CTCAATCAAAATCATTTGATTATAATAAATTAAAGTATTTACTACAACAATATGAAAACAATGATTCAATTTTAACAATT
GATTTGATTGATGAATTATCATTGATTCTAAAAGATGAACAAGTGCAAGTGATGTTTAATGAATTTAAACAAGCAAGTAA
TGAGAATAATTTAGAACATATTAGTAGTTTAAAAAATGAAATTATGTCATATATCAATTCTTTATTAGATTCTCGATTAG
AACAACTATCATCGATTCTAAAATCAAAAAATTTAGTTCATGATGAACAAATGGATGCCATTATTTCATTATTAAATCCA
AACGATAAAATCTTTAATAAAATTATTGTATCACGCAATAAACATTTAGAAAATTATGCTAAAGAAATTACAAAATTAGA
AACAAAAACCACTTCACAAAGTGATGAAATTGAAAAAAATACAAAGCAACATTCAACATCATACTTAACAAAATATTATC
AAAAAACTAAACAACACATTAATAAAATTAAGTTAGATCAAAAACAAAAATTATTATTAGAAGATTGATTAACAACAGCT
TATCAAAAAGCAATTACAAATCAACAAAATATGAAAGAGGTGATTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTGTAATCCATAATGGTTATTTTATTAGCGTTGGTGATCGTTTTGTAATGACAAGACAAAAAATTGGTGAATTAATG
GCAGGTGAAAAAATATAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCCTTCTTTATCATTAATTAACGATGCCTCTATCTATGCTGCTATTTTAATTTTAGGTGCATTAAGTGGTTTCTTTTGT
GAACGCGTTGGGATTGCTAA

Product: ribose/galactose ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 736; Mature: 736

Protein sequence:

>736_residues
MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTKWVGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLNWIMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIWIILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVYWIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY
IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNWLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI
DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP
NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDWLTTA
YQKAITNQQNMKEVIS

Sequences:

>Translated_736_residues
MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTK*VGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLN*IMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIII*IILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY
IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNN*LKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI
DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP
NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLED*LTTA
YQKAITNQQNMKEVIS
>Mature_736_residues
MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFTK*VGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLN*IMFYITRYVVFTAQGKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIII*IILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDGIAMGLISLTHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIY
IEINKKRNQYLQELKELRKELDKFKNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNN*LKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLKYLLQQYENNDSILTI
DLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYINSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNP
NDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITKLETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLED*LTTA
YQKAITNQQNMKEVIS

Specific function: Unknown

COG id: COG4603

COG function: function code R; ABC-type uncharacterized transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001851 [H]

Pfam domain/function: PF02653 BPD_transp_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83119; Mature: 83119

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFT
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC
PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQGKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIIILKYTVFGHKVLSVG
CCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDG
CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCH
IAMGLISLTHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIYIEINKKRNQYLQELKELRKELDKF
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERATLVYYP
HCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC
EINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLK
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
YLLQQYENNDSILTIDLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYI
HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNPNDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDLTTAYQKAIT
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NQQNMKEVIS
CHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MLKFKTVLTCDNLFKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYDIRDFFIRLFT
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC
PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQGKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLAIIIIILKYTVFGHKVLSVG
CCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQASDALPTQGYDG
CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCH
IAMGLISLTHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNTISEYKAIYIEINKKRNQYLQELKELRKELDKF
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNQKQYNGVNEQYQHTVNYIKTTYNNLKVEYSKYLEQMKNNVMQLKKHLIIERATLVYYP
HCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC
EINTTRKVKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEIGKYAQSKSFDYNKLK
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
YLLQQYENNDSILTIDLIDELSLILKDEQVQVMFNEFKQASNENNLEHISSLKNEIMSYI
HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NSLLDSRLEQLSSILKSKNLVHDEQMDAIISLLNPNDKIFNKIIVSRNKHLENYAKEITK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LETKTTSQSDEIEKNTKQHSTSYLTKYYQKTKQHINKIKLDQKQKLLLEDLTTAYQKAIT
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NQQNMKEVIS
CHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7569993; 8253680 [H]