| Definition | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011369 |
| Length | 4,537,948 |
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The map label for this gene is 209549569
Identifier: 209549569
GI number: 209549569
Start: 2021762
End: 2028769
Strand: Direct
Name: 209549569
Synonym: Rleg2_1975
Alternate gene names: NA
Gene position: 2021762-2028769 (Clockwise)
Preceding gene: 209549566
Following gene: 209549570
Centisome position: 44.55
GC content: 65.88
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GTTCGCCGATCTGAATTGACGTTGAGGAAAAGCCGCTTGAACCTGTGTCAGGCGGCTTTTCTCGTAAGATGCCTGCGCGA CGAAGACCTCTCTGGCGTTG
Product: Apolipoprotein A1/A4/E
Products: NA
Alternate protein names: Chemotaxis Sensory Transducer; Transmembrane Protein; Methyl-Accepting Chemotaxis Protein; Kinesin-Like Protein; ATPase
Number of amino acids: Translated: 2335; Mature: 2334
Protein sequence:
>2335_residues MANNKYNESIEDKAFKALDEALQIDFGKDNVPSRRGDAPEAPEANVSDPSNARNQQAQEEAQRRNRRSAGAEQASRGPAF TPANDASRNTPASILKSFDGASSRSAVRTATLFSVLWVMGGLGLMSLLYAPQIWQIRSLADLVALPGVIAGLVGIIIPVM MFYAFAIMIARAQDMRNAARSMAEVALRLAEPETIASERIMTVGQAVRREVSAMNEGIERTIARASELETLVHSEVNALE RSYADNELRVRGLVHELGSEREAIVNHADRIRTSIGSVHDQLKEELSLATEEIAVRLSTSGEAFASLIDTRAATILEKSD NALQSIGSLLAAKTDSLLQTLNASGFALATEFDNRLEALSVNLNDHGEKLLSQFETRASTMDSSTEKLNAALHERTQQLS EILIARTREINESLTSGERTIGGTLDDVLSKLNSALDEKGASFRQSLQSTADDAVMDLDVRSGFFEERLQTTVAQLSTAF DERVAEFTSAFDKRTGSLDTKLMESLARINETLTGGSDSIDGILSSGIERLSSSMTDQSLALATALSTGHEVLEGAIGTR ADEITAALTSRTGELTSALQSATSEIALTLASGTSDLQNNLQARSAEFRDTLRTTTSDLTTAVAAGTEQVTAAFGGRGEE LSGMLTARAAEISEALGTAHGRIDSVMAERGGALVDALTTHHGRFEEALTSRADAIIDAVSGTHDRLAETLDEKAIALAI SLNESQARIEDTLETRSEALLSAVSGTHDRLSETLDEKAMALAISLNENQARIEDTLETRSAALLNAVSGTHDRLSETLD SKAAALTTSLDERHARIDNALGTRAEALLNTVSGTRDRLAETLDEKAAAFAISLNESQARIEETLQTRSAALLNAVSSTH DRLSETLEGKVEAFATSLSEGQARIDETLESRSAALLNAVSGTHERLSETLDEKAMTLAISLNESQSRIEDTLEARSEAF LKAVSGTHERLSETLDEKSAALAASLNEGQSRLQDTLDSRSESFLSAVSTTHDRLSETLDDRAMALAISLNESQSRLEEA LTSGADAITQAVSGTHDGLNGVLDRKAAAIASSLNEGQARLEEALVHRTAAIIGAVTATHDRLTDTLDEKTMALAISLDD NQSRFDSVLEARSNAIMEAVSGAESRVAGAFTDKTDAIRAAYTDNQQRLENALSEHSAALSGVLDAGGARFEDLVGGLTG RIEGRLSDAHARLGGLADEAAARIEGGLTSAHERIRTTLEDRANAIDLSLNQAHALINDTLTEHATSIGTSVATSVSMLE MSLEDREASIRQAIDASAQTLEERMHAGAGQIAGRFQEAANAISTSTQNFSAQLDQSVESLTGRFEETGSRVESGLAAIE TRISNGVGGVAEKVEAASGQLSGVLADGISRIGALSDDANRRISATLEGSAANLTQAIDSRAANLAETLDSRATTLTGAI DGRTVSLGETLDRGNERIEERLSTMDRALTVGLDAVNRTIEGKAAGLASTLRSAVAEAAQGMEGEATRTTELLGKTGQQF AVDLNAKSDEFTRTMDERSSQIVTRVAEAQSRLASQAAAVAQTFSEAGNAIVNKVAEAETIVGTQVNAISKALSDAGQSL ETRGDAIRSTLSRAGSEISATMADVDRALEARSNAIRSNLEERAREIDTTFSGIDRALEARGNSIRATLDERTRDLNSML AGRSVELTRILDETARPIIDRYTDAGEQAAARITAAANLSADRLRAENEALASAVAARTENVANAVSAIENSLVGNVNGL VERMSESSAAMAMMMNRAVEQLTSVDSRLGETTTRFADSTTKAAEMVNASTRLLEGKVDRLSDISGQTLSQVGGIIGRFD EHSKVLTQASQLLGAAQSNLASTLEEREGALQTLSVSLVQRSDEIEKTMRGLGGMIETVFERAEQRSSQVTGNLRQGVQS SFADIGRILTETEKRAQEAAETMREAITRAGDEANTTIDGTFANVERRSGDLSNRIRGGLTASLSEVERMLGEAGRASDG AAQHMREALREAIDDAVGRFSGATDDIRRSAADIRNELDATRAELKRGAFDLPEEAKESASAMRRAVAEQIKALQDISQL VGRSSQQLEISEPVARTLAQAQPAPRAAQPIASQPIASQPVAPPPPQPAAPAPIEATGLRGTIAPTAPAAAPQRAAPQPA PTRQEPSRQEPARAESGGWISDLLRGASREEAADEAPARAPARSAETAAPAARSSDIRNPRHVVESLNSLSVDIARAIDH DASVDLWRRYQRGERDVFTRRLYTLKGQQTFDEIKRKYDREPEFRTAVDRYIGDFEKLLADVARTDPNQIVSQSYLTSDT GKVYTMLAHAAGRLS
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 248833; Mature: 248702
Theoretical pI: Translated: 4.59; Mature: 4.59
Prosite motif: PS00789 CHORISMATE_SYNTHASE_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MANNKYNESIEDKAFKALDEALQIDFGKDNVPSRRGDAPEAPEANVSDPSNARNQQAQEE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH AQRRNRRSAGAEQASRGPAFTPANDASRNTPASILKSFDGASSRSAVRTATLFSVLWVMG HHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GLGLMSLLYAPQIWQIRSLADLVALPGVIAGLVGIIIPVMMFYAFAIMIARAQDMRNAAR HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SMAEVALRLAEPETIASERIMTVGQAVRREVSAMNEGIERTIARASELETLVHSEVNALE HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSYADNELRVRGLVHELGSEREAIVNHADRIRTSIGSVHDQLKEELSLATEEIAVRLSTS HHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC GEAFASLIDTRAATILEKSDNALQSIGSLLAAKTDSLLQTLNASGFALATEFDNRLEALS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHEE VNLNDHGEKLLSQFETRASTMDSSTEKLNAALHERTQQLSEILIARTREINESLTSGERT CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC IGGTLDDVLSKLNSALDEKGASFRQSLQSTADDAVMDLDVRSGFFEERLQTTVAQLSTAF 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