| Definition | Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003869 |
| Length | 2,689,445 |
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The map label for this gene is blaR1 [H]
Identifier: 20807550
GI number: 20807550
Start: 1078880
End: 1081468
Strand: Direct
Name: blaR1 [H]
Synonym: TTE1079
Alternate gene names: 20807550
Gene position: 1078880-1081468 (Clockwise)
Preceding gene: 20807549
Following gene: 20807552
Centisome position: 40.12
GC content: 33.87
Gene sequence:
>2589_bases ATGGAAAAGATTTTTTATACCGTATTTTTAATTTCTATTCAGGCTTCTATAGTTGGGCTTTTTATTGTTCTTGTAAAACG AATTTTAAACAACAAAATTAGTCCGGAATGGCATTATGCTTTGTGGGTCGTGCTTATTTTAAAACTGATTTTACCGTTTG GTCCGGAAAGTGCCTTAAGTTTTTTCAATTTAATGCCCCAAGTTGAACAAAGTGTTGATTTTTTGCATTATCAATCATAT CAGGAAAATATTTATAATAGGCCTGTTATTAATGATCGATTTGAAAAAGATAATATTTCAATAGTGGATGAATCGACAAG ACTTTCTGATTCAAAAAATGAGGTAAAGATCTTGGCCTATATTTGGATTACTGTTGCAATGATATTTTTTACATTTATTA TATTATCCAGTTTTGTATTCCACAAAAAAATTAAGAGACGCGGAAAATCCGCACCCGATTCATTATATAGTATTCTGGAA AAATGTAAAGAAAGGATGTATATGAAAAATAATATCAAAATAGTTGTTCAGGATGTGATAAAAGTACCCGCCATTTTTGG AATTTTTAAGCCGTACATATTGATATCACCAGAAATTTTAAAGCTGAATGAAGAAGAAATATCGTATATTTTCATTCATG AACTTGCCCACTTGAAGAGAAAAGACCTTCTTGTAAATTATCTGTTACTGGTACTGCAAATACTGCATTGGTTCAATCCT TTTATATGGTATTTTTTTAAAAAAATTCGTCAGGACATGGAGGTAGCAGCCGATTGGAAAGTACTTGATATTTTGGAGAA TAATGAACGAAAGAAATACGGGAGAACTCTAATAACAGTGCTGGAAGGTTTAAATACTCCGCATATATCTTTTAAGCTGG TTGGGATGATGGACGATAAAAGTAATATAGAAAGGAGGATAGAAATGATAAAGATAATGGATATTTTTAAAAATAGAAAG AGATTTTTTGTTATCACGGGTTTAATTGTGTTTATAATCCTTACCGTTTTCTTATTAACCAATCCAACATCAAAAACTTT ACTACAGATAGGGTATTACACTATTGAAATACCTACCGATTGGAAGGTAAAAACAGACACACCTGGTTTAATTACAGAAA AAAACACTATTTTAAAAATTATTACCACTACGAGAATAATATCAAGCGGGGAACTCGTATTTGAAAAGGATAACGTTCCT GTCGGAGGAGTTCAGATAATAGGTTATGAGCCGAATCAACTTTTGTTTTTGCCTAACCATTCGGAGGTCAAGAGTAAAAA GGAGATAGAAGGATTAATTACAAAGGCGGTTTTGGTAAACCTTGATATAACTCCTCCTGCAGCAACCGGAGATAACTCAA TAAAAAACGAGAATCATATATATTTAATTTTTGAAGAAGATGGGATTGCTTATGATATTTACGCTGATGCAAAATACGTC AACGAATCTCAACTCATTAAGATTGCTAAGAGTTTTAAACCAGCTCCGGATTACGAAGTAAAAAAAGTTGTGGAGGGGTT TGGTAAAAGGTTGAAGAATGTAGATAAACTTGCTCCTAAAGAAGGTTGTCGAGAGCTCATAAAAGAGAATTATAGTCAGT ATGTTTCGCAGGATTTACTTGCCGAATGGATTAGAGATCCATCAAAGGCTCCAGGGAAATATGTTTCAAGTCCGTGGCCG GACAGGATTGATATAAAGGATATTACTAAGATCGGCCAAGCTAAATTTTTAGTAACAGGAGATATTGTAGAAATAACGAG CGTTCCTGGTGAGGAATGGAGGACGGGGGTCACGCTGACAGTGGAAAAATTGGAAGGAAAGTGGTTGATTACAGGGATTG ATTTTGGTTCACAGCTACAGACTCAAAAAATTGAAAATTTAGATGAGGCGGTAAGTTATGCTATAAAATCTAGAAGGCTT GCATATAATGAAGGAGAGGCAGCAACGGAGGGACACATTATCCTTGATGTAGAGGAAAAAGATGGAATTATTAAGGTTTA TACCATAGCGAGTTTTGGAGCTTTTGGTTTTGAGAACGGTATTTTTACTAAGATCAGCGGGAGTGGTGCTATTCCAACTG TTATAACATTTTCCAAAAATGAAAAAGGTGTGTACTCTTTGCTTGAATATAAGGAGCCAATGGATGGAGCGTTCTACATA GATTCACTAAAAAAGATGTTTCCTGAGAAACTATACGATAAAGTCATTTCTGCAGATAAATATTATCCAGAGCTTGCAAA GCAGCAGGAAGCACAAGCAGCAGAATATTTAAAGAATATTGGAAGAACAGCAAAGGTAAGTGCAGCCTATGTAGAAAAGA AGCTTGTAAATATAAATGTAGAGGCATCAAATAAATTGTTTGGCGGAACAGAATTTCCTTTTCTTAATGATTATCCGTGG TGGATTGGAACGAGAGAACGAATCGAAAATGGTATTAGATACATTTATGAAACTTCTCAAAGTAAAACTAATGACGGCTA CGACCTTGTAATTTTTAGGAAAACAAAAGAAGATGGGACTATAGTTAAAGAATATAGATATAAAATTGTCGATAGTGAGC CACAGCTCATATACAAAAATACAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGTCTTTAAGCTTGATGCTTGCAAGTTTTATAAAAGAACAAAAGGTCTCCAAGGAAGAAATCGAAAAGTTGAAAAAACTT CTGGATGAGGAAGTGTGAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCATATAGATTATGCCTTACTGCCTCCTCATCGTGTAAAATTGAATGTTAATCATTGCTATCCAGTCTGACCCAATTCC AAAAGACTTAGCGGCAAGTG
Product: beta-lactamase regulatory protein 1
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 862; Mature: 862
Protein sequence:
>862_residues MEKIFYTVFLISIQASIVGLFIVLVKRILNNKISPEWHYALWVVLILKLILPFGPESALSFFNLMPQVEQSVDFLHYQSY QENIYNRPVINDRFEKDNISIVDESTRLSDSKNEVKILAYIWITVAMIFFTFIILSSFVFHKKIKRRGKSAPDSLYSILE KCKERMYMKNNIKIVVQDVIKVPAIFGIFKPYILISPEILKLNEEEISYIFIHELAHLKRKDLLVNYLLLVLQILHWFNP FIWYFFKKIRQDMEVAADWKVLDILENNERKKYGRTLITVLEGLNTPHISFKLVGMMDDKSNIERRIEMIKIMDIFKNRK RFFVITGLIVFIILTVFLLTNPTSKTLLQIGYYTIEIPTDWKVKTDTPGLITEKNTILKIITTTRIISSGELVFEKDNVP VGGVQIIGYEPNQLLFLPNHSEVKSKKEIEGLITKAVLVNLDITPPAATGDNSIKNENHIYLIFEEDGIAYDIYADAKYV NESQLIKIAKSFKPAPDYEVKKVVEGFGKRLKNVDKLAPKEGCRELIKENYSQYVSQDLLAEWIRDPSKAPGKYVSSPWP DRIDIKDITKIGQAKFLVTGDIVEITSVPGEEWRTGVTLTVEKLEGKWLITGIDFGSQLQTQKIENLDEAVSYAIKSRRL AYNEGEAATEGHIILDVEEKDGIIKVYTIASFGAFGFENGIFTKISGSGAIPTVITFSKNEKGVYSLLEYKEPMDGAFYI DSLKKMFPEKLYDKVISADKYYPELAKQQEAQAAEYLKNIGRTAKVSAAYVEKKLVNINVEASNKLFGGTEFPFLNDYPW WIGTRERIENGIRYIYETSQSKTNDGYDLVIFRKTKEDGTIVKEYRYKIVDSEPQLIYKNTK
Sequences:
>Translated_862_residues MEKIFYTVFLISIQASIVGLFIVLVKRILNNKISPEWHYALWVVLILKLILPFGPESALSFFNLMPQVEQSVDFLHYQSY QENIYNRPVINDRFEKDNISIVDESTRLSDSKNEVKILAYIWITVAMIFFTFIILSSFVFHKKIKRRGKSAPDSLYSILE KCKERMYMKNNIKIVVQDVIKVPAIFGIFKPYILISPEILKLNEEEISYIFIHELAHLKRKDLLVNYLLLVLQILHWFNP FIWYFFKKIRQDMEVAADWKVLDILENNERKKYGRTLITVLEGLNTPHISFKLVGMMDDKSNIERRIEMIKIMDIFKNRK RFFVITGLIVFIILTVFLLTNPTSKTLLQIGYYTIEIPTDWKVKTDTPGLITEKNTILKIITTTRIISSGELVFEKDNVP VGGVQIIGYEPNQLLFLPNHSEVKSKKEIEGLITKAVLVNLDITPPAATGDNSIKNENHIYLIFEEDGIAYDIYADAKYV NESQLIKIAKSFKPAPDYEVKKVVEGFGKRLKNVDKLAPKEGCRELIKENYSQYVSQDLLAEWIRDPSKAPGKYVSSPWP DRIDIKDITKIGQAKFLVTGDIVEITSVPGEEWRTGVTLTVEKLEGKWLITGIDFGSQLQTQKIENLDEAVSYAIKSRRL AYNEGEAATEGHIILDVEEKDGIIKVYTIASFGAFGFENGIFTKISGSGAIPTVITFSKNEKGVYSLLEYKEPMDGAFYI DSLKKMFPEKLYDKVISADKYYPELAKQQEAQAAEYLKNIGRTAKVSAAYVEKKLVNINVEASNKLFGGTEFPFLNDYPW WIGTRERIENGIRYIYETSQSKTNDGYDLVIFRKTKEDGTIVKEYRYKIVDSEPQLIYKNTK >Mature_862_residues MEKIFYTVFLISIQASIVGLFIVLVKRILNNKISPEWHYALWVVLILKLILPFGPESALSFFNLMPQVEQSVDFLHYQSY QENIYNRPVINDRFEKDNISIVDESTRLSDSKNEVKILAYIWITVAMIFFTFIILSSFVFHKKIKRRGKSAPDSLYSILE KCKERMYMKNNIKIVVQDVIKVPAIFGIFKPYILISPEILKLNEEEISYIFIHELAHLKRKDLLVNYLLLVLQILHWFNP FIWYFFKKIRQDMEVAADWKVLDILENNERKKYGRTLITVLEGLNTPHISFKLVGMMDDKSNIERRIEMIKIMDIFKNRK RFFVITGLIVFIILTVFLLTNPTSKTLLQIGYYTIEIPTDWKVKTDTPGLITEKNTILKIITTTRIISSGELVFEKDNVP VGGVQIIGYEPNQLLFLPNHSEVKSKKEIEGLITKAVLVNLDITPPAATGDNSIKNENHIYLIFEEDGIAYDIYADAKYV NESQLIKIAKSFKPAPDYEVKKVVEGFGKRLKNVDKLAPKEGCRELIKENYSQYVSQDLLAEWIRDPSKAPGKYVSSPWP DRIDIKDITKIGQAKFLVTGDIVEITSVPGEEWRTGVTLTVEKLEGKWLITGIDFGSQLQTQKIENLDEAVSYAIKSRRL AYNEGEAATEGHIILDVEEKDGIIKVYTIASFGAFGFENGIFTKISGSGAIPTVITFSKNEKGVYSLLEYKEPMDGAFYI DSLKKMFPEKLYDKVISADKYYPELAKQQEAQAAEYLKNIGRTAKVSAAYVEKKLVNINVEASNKLFGGTEFPFLNDYPW WIGTRERIENGIRYIYETSQSKTNDGYDLVIFRKTKEDGTIVKEYRYKIVDSEPQLIYKNTK
Specific function: BlaR1 is a potential penicillin-binding protein required for induction of beta-lactamase in Bacillus licheniformis [H]
COG id: COG4219
COG function: function code KT; Antirepressor regulating drug resistance, predicted signal transduction N-terminal membrane component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the peptidase M56 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR012338 - InterPro: IPR001460 - InterPro: IPR008756 [H]
Pfam domain/function: PF05569 Peptidase_M56; PF00905 Transpeptidase [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99220; Mature: 99220
Theoretical pI: Translated: 8.54; Mature: 8.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEKIFYTVFLISIQASIVGLFIVLVKRILNNKISPEWHYALWVVLILKLILPFGPESALS CCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH FFNLMPQVEQSVDFLHYQSYQENIYNRPVINDRFEKDNISIVDESTRLSDSKNEVKILAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEHHH IWITVAMIFFTFIILSSFVFHKKIKRRGKSAPDSLYSILEKCKERMYMKNNIKIVVQDVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHH KVPAIFGIFKPYILISPEILKLNEEEISYIFIHELAHLKRKDLLVNYLLLVLQILHWFNP HHHHHHHHHCCCEEECCHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIWYFFKKIRQDMEVAADWKVLDILENNERKKYGRTLITVLEGLNTPHISFKLVGMMDDK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCH SNIERRIEMIKIMDIFKNRKRFFVITGLIVFIILTVFLLTNPTSKTLLQIGYYTIEIPTD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECEEEEECCCC WKVKTDTPGLITEKNTILKIITTTRIISSGELVFEKDNVPVGGVQIIGYEPNQLLFLPNH CEEECCCCCCEECCCCEEEEEEEHHEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCEEEECCCC SEVKSKKEIEGLITKAVLVNLDITPPAATGDNSIKNENHIYLIFEEDGIAYDIYADAKYV HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCHHC NESQLIKIAKSFKPAPDYEVKKVVEGFGKRLKNVDKLAPKEGCRELIKENYSQYVSQDLL CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AEWIRDPSKAPGKYVSSPWPDRIDIKDITKIGQAKFLVTGDIVEITSVPGEEWRTGVTLT HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCCCHHHCCCEEEE VEKLEGKWLITGIDFGSQLQTQKIENLDEAVSYAIKSRRLAYNEGEAATEGHIILDVEEK EEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCEEEEEEECC DGIIKVYTIASFGAFGFENGIFTKISGSGAIPTVITFSKNEKGVYSLLEYKEPMDGAFYI CCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH DSLKKMFPEKLYDKVISADKYYPELAKQQEAQAAEYLKNIGRTAKVSAAYVEKKLVNINV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEEEEEE EASNKLFGGTEFPFLNDYPWWIGTRERIENGIRYIYETSQSKTNDGYDLVIFRKTKEDGT EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCC IVKEYRYKIVDSEPQLIYKNTK EEEEHHHEEECCCCCEEEECCC >Mature Secondary Structure MEKIFYTVFLISIQASIVGLFIVLVKRILNNKISPEWHYALWVVLILKLILPFGPESALS CCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH FFNLMPQVEQSVDFLHYQSYQENIYNRPVINDRFEKDNISIVDESTRLSDSKNEVKILAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEHHH IWITVAMIFFTFIILSSFVFHKKIKRRGKSAPDSLYSILEKCKERMYMKNNIKIVVQDVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHH KVPAIFGIFKPYILISPEILKLNEEEISYIFIHELAHLKRKDLLVNYLLLVLQILHWFNP HHHHHHHHHCCCEEECCHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIWYFFKKIRQDMEVAADWKVLDILENNERKKYGRTLITVLEGLNTPHISFKLVGMMDDK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCH SNIERRIEMIKIMDIFKNRKRFFVITGLIVFIILTVFLLTNPTSKTLLQIGYYTIEIPTD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECEEEEECCCC WKVKTDTPGLITEKNTILKIITTTRIISSGELVFEKDNVPVGGVQIIGYEPNQLLFLPNH CEEECCCCCCEECCCCEEEEEEEHHEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCEEEECCCC SEVKSKKEIEGLITKAVLVNLDITPPAATGDNSIKNENHIYLIFEEDGIAYDIYADAKYV HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCHHC NESQLIKIAKSFKPAPDYEVKKVVEGFGKRLKNVDKLAPKEGCRELIKENYSQYVSQDLL CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AEWIRDPSKAPGKYVSSPWPDRIDIKDITKIGQAKFLVTGDIVEITSVPGEEWRTGVTLT HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCCCHHHCCCEEEE VEKLEGKWLITGIDFGSQLQTQKIENLDEAVSYAIKSRRLAYNEGEAATEGHIILDVEEK EEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCEEEEEEECC DGIIKVYTIASFGAFGFENGIFTKISGSGAIPTVITFSKNEKGVYSLLEYKEPMDGAFYI CCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH DSLKKMFPEKLYDKVISADKYYPELAKQQEAQAAEYLKNIGRTAKVSAAYVEKKLVNINV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEEEEEE EASNKLFGGTEFPFLNDYPWWIGTRERIENGIRYIYETSQSKTNDGYDLVIFRKTKEDGT EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCC IVKEYRYKIVDSEPQLIYKNTK EEEEHHHEEECCCCCEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 3040663; 3260234; 2404938 [H]