| Definition | Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003869 |
| Length | 2,689,445 |
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The map label for this gene is 20807331
Identifier: 20807331
GI number: 20807331
Start: 857613
End: 859322
Strand: Direct
Name: 20807331
Synonym: TTE0849
Alternate gene names: NA
Gene position: 857613-859322 (Clockwise)
Preceding gene: 20807330
Following gene: 20807332
Centisome position: 31.89
GC content: 34.97
Gene sequence:
>1710_bases ATGGGAGTCATTAGAAAAAATATTTCTGGAGCTGACGGAAAAATGAAGAAATTTATATCTCTTCTGAAAACGCAAATTAA CTCCTATTACGGAATTTCTGCGATAAAATACAAATATTTTGTAGAGAAAAAGCAGCGGTGGGAGTTGGACCTTGCTATAT TTGGAATTGTAGTAGGAGTAGCTGTCTTTTTGTTTATTTACGTGATGCAGCTAGAAGGATTATTTGCAGCAAGCATTGCT TTAAATCAGCCTCAGTTGATGCTCGCAATAGTGTTGTTTTTAGGGCAGATAGTCACTTTAATATTTGGCTTTTTCTGGGT TATATCTGTGTTTTACTTCTCCGATGATGTAAAAATTTTGCTCCCACTTCCACTGCAGCCTTATGAAATTTTGCTTTCTA AATATACAGTAATTCTTGTAAATGAATATGCTGTGCTGGCTTTGCTGTTACTCCCGGCAATAGGGATATACGGTATTGGG ACTGGTGCAGGGATTTTGTATTACTTGATTGCTCTGGTGGTGTTCTTATTTTCACCTGTAATACCTCTTTCCATAGATTC CATCATCGCTTTGTGGCTCATGAGATTCACAAATTTGAGGAAGAAAAAAGACTTTTTTACGGTTTTAATAAGCATATTAG CTTTGATGTTTTTCTTTGTTTTTCAGTATTTTGTAAACAGAAATCCTCAGTATACTGACAAAGATGCTGTAGTTGATTTT CTCATCAAAAATGCAGACCTCGCTAAAATGGCAACCAAAAGCTTTCCGCCATCTCTCTGGGGAGCTTATGCCATGTCAGA TTACCACAGTTTATACGGATTTTTCAACTTGCTTTTGTTTATAGCTGTTTCTTTGATATTTACTGGTTTTCTTGCGTTAT CTGCTCAAAAAGTGTATTTTAAAGCTTTAATGGCGGGTCAGGAAATTGGAGCAAAAAAGAAAACTGTGGCTTTGGAAAGG AGTATGAAAGCTTCTGGAGCTTTGAAAGCACTTATATTGAGAGAGTGGAAGCTTTTTATAAGGGTGCCAGTTTACGCCAT GAATGTGCTTCCTGTAGCTATAATAGTGCCTTTTATATTCTTTATCTCTTTTGTTGGCAATCCACAAATGGGGCTTGAAA AAGCTGTCCAGTATACTTCTTCTCCAACAAATTGGTTTTGGGTTTCAATTGTAGGGCTTTTGGTTTCACTATTTCTTGCG GGGAGTACTAGCCTTTCTTCTACAGCTTTTTCAAGAGAAGGCAAGATGTTTTATATTTCAAAAATTTTACCTATTTCTCC CTCTCTTCAGCTGAGAGCTAAACTAATTTTAGGGAGCCTTGTATCAATTTTTGTAATCTTACCGAGTTATATAATTGGCT GGTATATTTTTAAAATTCCGCTTGTGACTGTAGCTATAACTGTGTTTTTGAGCTTGCCAGGTGTTTTGCTGATAAATATA CTTGGACTTTTAATAGACTCTGCAAGGCCGTTTTTCGATTGGGATAACCCTCAAAAAGCCATGAAAGGCAATGTAAATGT GCTTTTTACTCTCGTTTTGACTCTTTTGTCTCTCCTAATTATTTTAACCATAATTTTCTTACTTAAAACTTTTAATGTGT CAGAAATATTAATTGCTATTTTGATAGAAATTTTGATAATACTGGCAGATTTAAAACTTTATTCTTTAACAAAGGATTTT GCAACAAAACTTTATTTTGAAAAAGAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TACTGGAAGTAGCAGAAAGGCTGTGTGACAGAATTGCGATAATAAATAAAGGGAAAATTGTAGCCTGCGGCACTATGGAG GAAATAAAGAAGCAGCATGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGGGTTTTTAAAAATGAGCAAAAAGGCATTAGGAGGAATTGTAATATTGGCTCTTGTGTTTGCAATAGTCCTTGCTTCTT TATTTTTAACCCAGCCTTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 568
Protein sequence:
>569_residues MGVIRKNISGADGKMKKFISLLKTQINSYYGISAIKYKYFVEKKQRWELDLAIFGIVVGVAVFLFIYVMQLEGLFAASIA LNQPQLMLAIVLFLGQIVTLIFGFFWVISVFYFSDDVKILLPLPLQPYEILLSKYTVILVNEYAVLALLLLPAIGIYGIG TGAGILYYLIALVVFLFSPVIPLSIDSIIALWLMRFTNLRKKKDFFTVLISILALMFFFVFQYFVNRNPQYTDKDAVVDF LIKNADLAKMATKSFPPSLWGAYAMSDYHSLYGFFNLLLFIAVSLIFTGFLALSAQKVYFKALMAGQEIGAKKKTVALER SMKASGALKALILREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIVPFIFFISFVGNPQMGLEKAVQYTSSPTNWFWVSIVGLLVSLFLA GSTSLSSTAFSREGKMFYISKILPISPSLQLRAKLILGSLVSIFVILPSYIIGWYIFKIPLVTVAITVFLSLPGVLLINI LGLLIDSARPFFDWDNPQKAMKGNVNVLFTLVLTLLSLLIILTIIFLLKTFNVSEILIAILIEILIILADLKLYSLTKDF ATKLYFEKE
Sequences:
>Translated_569_residues MGVIRKNISGADGKMKKFISLLKTQINSYYGISAIKYKYFVEKKQRWELDLAIFGIVVGVAVFLFIYVMQLEGLFAASIA LNQPQLMLAIVLFLGQIVTLIFGFFWVISVFYFSDDVKILLPLPLQPYEILLSKYTVILVNEYAVLALLLLPAIGIYGIG TGAGILYYLIALVVFLFSPVIPLSIDSIIALWLMRFTNLRKKKDFFTVLISILALMFFFVFQYFVNRNPQYTDKDAVVDF LIKNADLAKMATKSFPPSLWGAYAMSDYHSLYGFFNLLLFIAVSLIFTGFLALSAQKVYFKALMAGQEIGAKKKTVALER SMKASGALKALILREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIVPFIFFISFVGNPQMGLEKAVQYTSSPTNWFWVSIVGLLVSLFLA GSTSLSSTAFSREGKMFYISKILPISPSLQLRAKLILGSLVSIFVILPSYIIGWYIFKIPLVTVAITVFLSLPGVLLINI LGLLIDSARPFFDWDNPQKAMKGNVNVLFTLVLTLLSLLIILTIIFLLKTFNVSEILIAILIEILIILADLKLYSLTKDF ATKLYFEKE >Mature_568_residues GVIRKNISGADGKMKKFISLLKTQINSYYGISAIKYKYFVEKKQRWELDLAIFGIVVGVAVFLFIYVMQLEGLFAASIAL NQPQLMLAIVLFLGQIVTLIFGFFWVISVFYFSDDVKILLPLPLQPYEILLSKYTVILVNEYAVLALLLLPAIGIYGIGT GAGILYYLIALVVFLFSPVIPLSIDSIIALWLMRFTNLRKKKDFFTVLISILALMFFFVFQYFVNRNPQYTDKDAVVDFL IKNADLAKMATKSFPPSLWGAYAMSDYHSLYGFFNLLLFIAVSLIFTGFLALSAQKVYFKALMAGQEIGAKKKTVALERS MKASGALKALILREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIVPFIFFISFVGNPQMGLEKAVQYTSSPTNWFWVSIVGLLVSLFLAG STSLSSTAFSREGKMFYISKILPISPSLQLRAKLILGSLVSIFVILPSYIIGWYIFKIPLVTVAITVFLSLPGVLLINIL GLLIDSARPFFDWDNPQKAMKGNVNVLFTLVLTLLSLLIILTIIFLLKTFNVSEILIAILIEILIILADLKLYSLTKDFA TKLYFEKE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 63971; Mature: 63840
Theoretical pI: Translated: 10.07; Mature: 10.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGVIRKNISGADGKMKKFISLLKTQINSYYGISAIKYKYFVEKKQRWELDLAIFGIVVGV CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVFLFIYVMQLEGLFAASIALNQPQLMLAIVLFLGQIVTLIFGFFWVISVFYFSDDVKIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE LPLPLQPYEILLSKYTVILVNEYAVLALLLLPAIGIYGIGTGAGILYYLIALVVFLFSPV ECCCCCHHHHHHHCHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IPLSIDSIIALWLMRFTNLRKKKDFFTVLISILALMFFFVFQYFVNRNPQYTDKDAVVDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH LIKNADLAKMATKSFPPSLWGAYAMSDYHSLYGFFNLLLFIAVSLIFTGFLALSAQKVYF HHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KALMAGQEIGAKKKTVALERSMKASGALKALILREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIVPFIF HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISFVGNPQMGLEKAVQYTSSPTNWFWVSIVGLLVSLFLAGSTSLSSTAFSREGKMFYIS HHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE KILPISPSLQLRAKLILGSLVSIFVILPSYIIGWYIFKIPLVTVAITVFLSLPGVLLINI ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLLIDSARPFFDWDNPQKAMKGNVNVLFTLVLTLLSLLIILTIIFLLKTFNVSEILIAI HHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH LIEILIILADLKLYSLTKDFATKLYFEKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure GVIRKNISGADGKMKKFISLLKTQINSYYGISAIKYKYFVEKKQRWELDLAIFGIVVGV CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVFLFIYVMQLEGLFAASIALNQPQLMLAIVLFLGQIVTLIFGFFWVISVFYFSDDVKIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE LPLPLQPYEILLSKYTVILVNEYAVLALLLLPAIGIYGIGTGAGILYYLIALVVFLFSPV ECCCCCHHHHHHHCHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IPLSIDSIIALWLMRFTNLRKKKDFFTVLISILALMFFFVFQYFVNRNPQYTDKDAVVDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH LIKNADLAKMATKSFPPSLWGAYAMSDYHSLYGFFNLLLFIAVSLIFTGFLALSAQKVYF HHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KALMAGQEIGAKKKTVALERSMKASGALKALILREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIVPFIF HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISFVGNPQMGLEKAVQYTSSPTNWFWVSIVGLLVSLFLAGSTSLSSTAFSREGKMFYIS HHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE KILPISPSLQLRAKLILGSLVSIFVILPSYIIGWYIFKIPLVTVAITVFLSLPGVLLINI ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLLIDSARPFFDWDNPQKAMKGNVNVLFTLVLTLLSLLIILTIIFLLKTFNVSEILIAI HHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH LIEILIILADLKLYSLTKDFATKLYFEKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA