Definition Borrelia duttonii Ly, complete genome.
Accession NC_011229
Length 931,674

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The map label for this gene is 203284495

Identifier: 203284495

GI number: 203284495

Start: 624584

End: 625861

Strand: Reverse

Name: 203284495

Synonym: BDU_592

Alternate gene names: NA

Gene position: 625861-624584 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203284498

Following gene: 203284494

Centisome position: 67.18

GC content: 20.66

Gene sequence:

>1278_bases
GTGATTTTTTTATTTATAATCAGTGCATTAAGTTTATCAATAAGATATTATCTAAAATTAAATTTAATATACTTAAATAT
AATTCTAATATTAATCTTTATAATCAAAAAAAATGCTCATCTCTCATTAACATTCATAATCAACACAAGTTTACTTATAA
TTTTTGAAATTAGTTTAATTTTTAATATACTTGAAAACAATTATTACCAAATAACAAACATCACTATCTATATCTCTAAA
TATAAAAATGTCAAAATTGAAGCAATAGATGGATTTGGACAAAATTACAAATTTATATTTAAAAATATTGAAAATGAATA
CAATATAGGAGATATCGTCAAAATTCAAAATAATAAAATTCAATGCATCAAAAAACCACTACTGGTAAAACTTAGAGAAA
AATATAATAAACTCATCAATAAATTTTTAAATTCGATTAGTATTAAATATTCTCATTTTTTAAAAGCAATTCTTACAAAT
AATAAATCAGAAATAACAACATATGAAAAACATTTATTTCAAAAAGCAGGATTATCACATATACTAGTGATATCTGGTCT
ACATTTTTATTTGATTTACATTATTTTAAATTACTTACTAAGCATAATTATAAATTACAAACTAAAATATACAATCATAA
GCATAATATTACTCAATTATTTAATCTTAACAGGCTTATCACCATCTGCATTAAGGGCATTTATAATGTTAAAAACTTTT
ATAATTTATAAATTAATATACGGAAAAATTAACTTATTTAGCACATTATCAATTAGTTTTATAATAAACGCCATCATTTT
CCCATACACATTAAATTCAATAAGTTTTCAGTTATCTTATCTCTCAGTAATTGGAATATGCATTTCTATTGCACTTAATA
AAAGATACAACTTAAATAAAATTATATACCCAATGCTTACAACTTTTTTAATTCAAATACTAACAGCTCCTATTCTTTAT
ATAAATGATCTCAATATTCAACCAATATCAATACTATCAAATATAATAGTTACTCCTCTAATTTTAATATTTTTAATAAT
AACAATATTTAGTCTATTAACTTATGCAACTAGCACAAATCTATTTCTATTTTTTGATCTAATTAATAGTTATATATTCA
GAACAATAAAAAACACAATCACTATTTTTAGCAAAGTTGAGGTAATTAACAATTCAAATATAGGCATATTTTTAATATTA
AGCACTATGATACTATCTTACCTAATCTACAGGCTAGAACAAGAAAAATACTATAGAGAAAACATAAAAAACTCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATACACGATTGTCAAACTTTATAATACTTAATACAAAAATGATCTAACATATTAATGATCTGATATATTTAAAACATA
CTTTCAAAAAGAGATTTCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATAGCTATGTGATATTATTTTATTATCTATGAATATAAATTATAACAGCATAAACAGCATAAAGAATGTGTTAAAAAA
TAAAAATATAGCACCAAGAA

Product: competence locus E, putative

Products: NA

Alternate protein names: COME Operon

Number of amino acids: Translated: 425; Mature: 425

Protein sequence:

>425_residues
MIFLFIISALSLSIRYYLKLNLIYLNIILILIFIIKKNAHLSLTFIINTSLLIIFEISLIFNILENNYYQITNITIYISK
YKNVKIEAIDGFGQNYKFIFKNIENEYNIGDIVKIQNNKIQCIKKPLLVKLREKYNKLINKFLNSISIKYSHFLKAILTN
NKSEITTYEKHLFQKAGLSHILVISGLHFYLIYIILNYLLSIIINYKLKYTIISIILLNYLILTGLSPSALRAFIMLKTF
IIYKLIYGKINLFSTLSISFIINAIIFPYTLNSISFQLSYLSVIGICISIALNKRYNLNKIIYPMLTTFLIQILTAPILY
INDLNIQPISILSNIIVTPLILIFLIITIFSLLTYATSTNLFLFFDLINSYIFRTIKNTITIFSKVEVINNSNIGIFLIL
STMILSYLIYRLEQEKYYRENIKNS

Sequences:

>Translated_425_residues
MIFLFIISALSLSIRYYLKLNLIYLNIILILIFIIKKNAHLSLTFIINTSLLIIFEISLIFNILENNYYQITNITIYISK
YKNVKIEAIDGFGQNYKFIFKNIENEYNIGDIVKIQNNKIQCIKKPLLVKLREKYNKLINKFLNSISIKYSHFLKAILTN
NKSEITTYEKHLFQKAGLSHILVISGLHFYLIYIILNYLLSIIINYKLKYTIISIILLNYLILTGLSPSALRAFIMLKTF
IIYKLIYGKINLFSTLSISFIINAIIFPYTLNSISFQLSYLSVIGICISIALNKRYNLNKIIYPMLTTFLIQILTAPILY
INDLNIQPISILSNIIVTPLILIFLIITIFSLLTYATSTNLFLFFDLINSYIFRTIKNTITIFSKVEVINNSNIGIFLIL
STMILSYLIYRLEQEKYYRENIKNS
>Mature_425_residues
MIFLFIISALSLSIRYYLKLNLIYLNIILILIFIIKKNAHLSLTFIINTSLLIIFEISLIFNILENNYYQITNITIYISK
YKNVKIEAIDGFGQNYKFIFKNIENEYNIGDIVKIQNNKIQCIKKPLLVKLREKYNKLINKFLNSISIKYSHFLKAILTN
NKSEITTYEKHLFQKAGLSHILVISGLHFYLIYIILNYLLSIIINYKLKYTIISIILLNYLILTGLSPSALRAFIMLKTF
IIYKLIYGKINLFSTLSISFIINAIIFPYTLNSISFQLSYLSVIGICISIALNKRYNLNKIIYPMLTTFLIQILTAPILY
INDLNIQPISILSNIIVTPLILIFLIITIFSLLTYATSTNLFLFFDLINSYIFRTIKNTITIFSKVEVINNSNIGIFLIL
STMILSYLIYRLEQEKYYRENIKNS

Specific function: Unknown

COG id: COG0658

COG function: function code R; Predicted membrane metal-binding protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49546; Mature: 49546

Theoretical pI: Translated: 10.07; Mature: 10.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIFLFIISALSLSIRYYLKLNLIYLNIILILIFIIKKNAHLSLTFIINTSLLIIFEISLI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHH
FNILENNYYQITNITIYISKYKNVKIEAIDGFGQNYKFIFKNIENEYNIGDIVKIQNNKI
HHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCH
QCIKKPLLVKLREKYNKLINKFLNSISIKYSHFLKAILTNNKSEITTYEKHLFQKAGLSH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH
ILVISGLHFYLIYIILNYLLSIIINYKLKYTIISIILLNYLILTGLSPSALRAFIMLKTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IIYKLIYGKINLFSTLSISFIINAIIFPYTLNSISFQLSYLSVIGICISIALNKRYNLNK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
IIYPMLTTFLIQILTAPILYINDLNIQPISILSNIIVTPLILIFLIITIFSLLTYATSTN
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LFLFFDLINSYIFRTIKNTITIFSKVEVINNSNIGIFLILSTMILSYLIYRLEQEKYYRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKNS
HCCCC
>Mature Secondary Structure
MIFLFIISALSLSIRYYLKLNLIYLNIILILIFIIKKNAHLSLTFIINTSLLIIFEISLI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHH
FNILENNYYQITNITIYISKYKNVKIEAIDGFGQNYKFIFKNIENEYNIGDIVKIQNNKI
HHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCH
QCIKKPLLVKLREKYNKLINKFLNSISIKYSHFLKAILTNNKSEITTYEKHLFQKAGLSH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH
ILVISGLHFYLIYIILNYLLSIIINYKLKYTIISIILLNYLILTGLSPSALRAFIMLKTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IIYKLIYGKINLFSTLSISFIINAIIFPYTLNSISFQLSYLSVIGICISIALNKRYNLNK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
IIYPMLTTFLIQILTAPILYINDLNIQPISILSNIIVTPLILIFLIITIFSLLTYATSTN
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LFLFFDLINSYIFRTIKNTITIFSKVEVINNSNIGIFLILSTMILSYLIYRLEQEKYYRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKNS
HCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA