Definition Borrelia duttonii Ly, complete genome.
Accession NC_011229
Length 931,674

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The map label for this gene is 203284270

Identifier: 203284270

GI number: 203284270

Start: 378458

End: 379486

Strand: Reverse

Name: 203284270

Synonym: BDU_352

Alternate gene names: NA

Gene position: 379486-378458 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203284271

Following gene: 203284269

Centisome position: 40.73

GC content: 23.62

Gene sequence:

>1029_bases
TTGAAGAAGCCAAAGAAAAGATTAGAGAAGTTCTCTCTGGGGGGCAGTCTTAGATTAGATTGTTTATCACTTGTAGGAAC
ATATATGTTAAATATTGTAAGGTTTATATCCTTAATATCTTGTAGATTTATTTTTATGTTTTTTCTCTTTTCGTTTGTTT
TTGTTTGTACATCTTACTTGAAGTACACATTCCTACATGTAGATCTTTCTGTTTTAAGTTTTGAACTTTATTATGATGCT
TATCTTTATGCTTTTCCTTTATCTTTAGTTGTTACTTTTATGAGAATTGCTTATCCTTTTAGTATGACTACATTCAGAGT
TTCTGGGATTTTATATATTGTTGTCTTTATTTTTATATTGTTTTTGTCTTATTTTGGATTTTTAGCTTCTGTTAATTTTA
ATACTATCTTTTTTGATTTACATAACAGGGATGAGAAGATAATTAAAGATGATACTGTGCATTTTTTTGATGATCAAATA
GTTTTTTATAGTAATGATATTAAATCATTTGGGTTTAAAGGTGTTTTAAAAATTACAGATAATGAGTTTGATGATGAGGA
TTTTAAATCTTTTTCATATAATTCAGGATTTTCTGAATCTGATGTGGCGAATTTTAATGAAAATGCATTTTTTACTCAAA
AGCTTTATAGTAATTTAGTTGGTTATATTTTTAATGATTTAGACATTTTTAATAATTTTTTACTTTCTTTAGAATCTTTT
GGTTTGATATTGAATATATTTGGATTTGTTTTGCTTTTATTTTCGTTTTCTTATATTTTTAATTTTATATTTCTCAATAG
TTTGTCTTTATTCCTTTATCCTATTTTTGTCATACTGTTTTTTAAAGTTTATAATATTTATGCAATTGAATTTCCGGAGA
GTTTAGATTTAATTATGGGTGAAAATGTAATATCTAATTATCTTACTTTCATTTTTTGTGTACTTACATTTTGTTCTACT
TATTTGATTGGTTTTCTTTTTAAATATATTAAAGTGAATGAAGGATTTGATAATAATACGTTACATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATCTATGCAAAAAGAGTTGCCTTTTTATGAAAAGAGAATTTTAAATGATTTTGAATTAATTTTACAACATGAGATTAG
TTTAGCTTTGCAAATTAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTTGTTAGATATGAAAAAAGAATTGTTTACATTTTTAAGTAATTTTATTGTTTTTCTATTTTTATTTGTTGCTTTG
GTTTTTTGTTATACATATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 342; Mature: 342

Protein sequence:

>342_residues
MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA
YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI
VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF
GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST
YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH

Sequences:

>Translated_342_residues
MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA
YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI
VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF
GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST
YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH
>Mature_342_residues
MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA
YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI
VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF
GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST
YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 40223; Mature: 40223

Theoretical pI: Translated: 4.81; Mature: 4.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYL
CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYTFLHVDLSVLSFELYYDAYLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQIVFYSNDIKSFGFKGVLKITD
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCEEEECCEEEEEECCHHHCCCCEEEEECC
NEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF
CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHC
ENVISNYLTFIFCVLTFCSTYLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYL
CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYTFLHVDLSVLSFELYYDAYLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQIVFYSNDIKSFGFKGVLKITD
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCEEEECCEEEEEECCHHHCCCCEEEEECC
NEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF
CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHC
ENVISNYLTFIFCVLTFCSTYLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA