| Definition | Borrelia duttonii Ly, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011229 |
| Length | 931,674 |
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The map label for this gene is 203284270
Identifier: 203284270
GI number: 203284270
Start: 378458
End: 379486
Strand: Reverse
Name: 203284270
Synonym: BDU_352
Alternate gene names: NA
Gene position: 379486-378458 (Counterclockwise)
Preceding gene: 203284271
Following gene: 203284269
Centisome position: 40.73
GC content: 23.62
Gene sequence:
>1029_bases TTGAAGAAGCCAAAGAAAAGATTAGAGAAGTTCTCTCTGGGGGGCAGTCTTAGATTAGATTGTTTATCACTTGTAGGAAC ATATATGTTAAATATTGTAAGGTTTATATCCTTAATATCTTGTAGATTTATTTTTATGTTTTTTCTCTTTTCGTTTGTTT TTGTTTGTACATCTTACTTGAAGTACACATTCCTACATGTAGATCTTTCTGTTTTAAGTTTTGAACTTTATTATGATGCT TATCTTTATGCTTTTCCTTTATCTTTAGTTGTTACTTTTATGAGAATTGCTTATCCTTTTAGTATGACTACATTCAGAGT TTCTGGGATTTTATATATTGTTGTCTTTATTTTTATATTGTTTTTGTCTTATTTTGGATTTTTAGCTTCTGTTAATTTTA ATACTATCTTTTTTGATTTACATAACAGGGATGAGAAGATAATTAAAGATGATACTGTGCATTTTTTTGATGATCAAATA GTTTTTTATAGTAATGATATTAAATCATTTGGGTTTAAAGGTGTTTTAAAAATTACAGATAATGAGTTTGATGATGAGGA TTTTAAATCTTTTTCATATAATTCAGGATTTTCTGAATCTGATGTGGCGAATTTTAATGAAAATGCATTTTTTACTCAAA AGCTTTATAGTAATTTAGTTGGTTATATTTTTAATGATTTAGACATTTTTAATAATTTTTTACTTTCTTTAGAATCTTTT GGTTTGATATTGAATATATTTGGATTTGTTTTGCTTTTATTTTCGTTTTCTTATATTTTTAATTTTATATTTCTCAATAG TTTGTCTTTATTCCTTTATCCTATTTTTGTCATACTGTTTTTTAAAGTTTATAATATTTATGCAATTGAATTTCCGGAGA GTTTAGATTTAATTATGGGTGAAAATGTAATATCTAATTATCTTACTTTCATTTTTTGTGTACTTACATTTTGTTCTACT TATTTGATTGGTTTTCTTTTTAAATATATTAAAGTGAATGAAGGATTTGATAATAATACGTTACATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATCTATGCAAAAAGAGTTGCCTTTTTATGAAAAGAGAATTTTAAATGATTTTGAATTAATTTTACAACATGAGATTAG TTTAGCTTTGCAAATTAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATTTGTTAGATATGAAAAAAGAATTGTTTACATTTTTAAGTAATTTTATTGTTTTTCTATTTTTATTTGTTGCTTTG GTTTTTTGTTATACATATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 342; Mature: 342
Protein sequence:
>342_residues MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH
Sequences:
>Translated_342_residues MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH >Mature_342_residues MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYLKYTFLHVDLSVLSFELYYDA YLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFILFLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQI VFYSNDIKSFGFKGVLKITDNEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMGENVISNYLTFIFCVLTFCST YLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 40223; Mature: 40223
Theoretical pI: Translated: 4.81; Mature: 4.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYL CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYTFLHVDLSVLSFELYYDAYLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQIVFYSNDIKSFGFKGVLKITD HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCEEEECCEEEEEECCHHHCCCCEEEEECC NEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHC ENVISNYLTFIFCVLTFCSTYLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKKPKKRLEKFSLGGSLRLDCLSLVGTYMLNIVRFISLISCRFIFMFFLFSFVFVCTSYL CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYTFLHVDLSVLSFELYYDAYLYAFPLSLVVTFMRIAYPFSMTTFRVSGILYIVVFIFIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSYFGFLASVNFNTIFFDLHNRDEKIIKDDTVHFFDDQIVFYSNDIKSFGFKGVLKITD HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCEEEECCEEEEEECCHHHCCCCEEEEECC NEFDDEDFKSFSYNSGFSESDVANFNENAFFTQKLYSNLVGYIFNDLDIFNNFLLSLESF CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLILNIFGFVLLLFSFSYIFNFIFLNSLSLFLYPIFVILFFKVYNIYAIEFPESLDLIMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHC ENVISNYLTFIFCVLTFCSTYLIGFLFKYIKVNEGFDNNTLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA