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The map label for this gene is yvcS [H]

Identifier: 19746831

GI number: 19746831

Start: 1649144

End: 1651051

Strand: Reverse

Name: yvcS [H]

Synonym: spyM18_1980

Alternate gene names: 19746831

Gene position: 1651051-1649144 (Counterclockwise)

Preceding gene: 19746832

Following gene: 19746830

Centisome position: 87.13

GC content: 30.45

Gene sequence:

>1908_bases
ATGATTTGGTCAATTACAAAATCTAACATTAAAAAAAATTTTTCGTTATATCGTATCTATTTTCTAGCTACGATTGGTTT
ATTAAGTATTTTTATAGCTTTTCTAAATTTTATCTCAGATAAAATCATTACAGAAAAAATTGGGGATAGTGGTCAAGCTT
TAGTTATCGCTAATGGGTCATTGATTTTTTTGATTGTATTTTTGGTGGTATTCTTAATTTACTTCAATAATTTCTTTGTA
AAAAAACGTAGTCAAGAGCTTGGAGTCTTAGCAATACTAGGGTTTTCAAAAAGAGAATTAACAAAATTACTAACTTTAGA
AAATCTTGTTATTCTAGTTCTGAGTTACTTGGTAAGTTTATTGCTGGGACCGACTTTATATTTTTTAGCTGTACTGGCAA
TTACTCATCTATTGAATTTAACAATGGAAGTTCAGTGGTTTATTACAGTTAATGAGATTATAGAGTCTTTAGGAATATTA
GTCGTAGTTTTTCTGATTAATGTCATCACAAATGGACTTATCATTAGTAAACAGTCTTTGATTGAATTTGTTAATTTCTC
AAGAAAGGCTGAGAAAAAAATTAAGATAAGAAAAGTCAGAGCTATTATTGCTATCACTGCATTGCTATTGTCATATATTT
TATGTTTGGCGACAGTGTTTTCATCCACACGAAATATGCTATTAAGCATAGGGATGGTACCGGTTTCTCTATTGATAATT
GTCTTAGTTGTTTTAGGAACAGTGTTCACCATCAGATATGGATTGGCTTTTGTAGTTTCGTTATTAAAAGGAAATAAAAA
AAGGTTATACCGTCCTCTGTCTAATATCATCTATCCCAAATTTAACTATCGTATTGCAACAAAAAATAAATTATTAACAG
TCTTAGGAGGTCTTTTAACAGTAACCGTTTCAGTTGCCGGAATGATGGTAATGCTCTATGCTTATTCTCTTAATGGGATA
GAGAGGTTGACTCCATCTGCCATAGAATATAATGTTAAATCAGAAAACGGTCAAGTCAATGTTACAACTATTTTAGAGAA
CGACCAAGTGAGCTTGGTTGATGTTGACCTATTGAGATTGAACACTAACCCAGAAGTAACTATCACAGAATCTGGGCAAA
CAATTCCTTATTTTGATATAATTAATTACAGTGATTATAAAGAGTTAATGAAAGCTCAAGGGAGAATAAATTCTATTGAA
GGTAGTAAGTCACTCCCATTGTTAATAAATTATTATCCAACAGAAATTAGCCTTGGAAAAACCTTTAATTTAGGAAATGC
ATATGATGTTACTGTAAAACAAGTATCAACGCATAATGTTTTTAGTTTTTCTACAAGTGTCACGACCTTGGTTGTTTCTG
ATAAATTATATGCTAAACTTAGTTCTTGTTTTCCAGAGAAAGAAATGACAATTAGGACTTTTAATGGAAATTCGATTAGG
TCAAGTGAAGCATTTTACAATCAGTTTAGTATGGTTCCTGATGTTATCAGTAGTTATAGTAAGGAATACACAGTAAAGAC
TGCTAATATTGCGACTTATATCTTTATAACTTTCCTATCCATACTCTTTATTATTTGTACAGGTAGTATTCTGTACTTTA
CAAGCCTCATCGAAATCATGGAAAATAAAGAAGAATATGGCTATCTAAGTAAGCTAGGTTATAGTAAAAAAATGATTCAT
CGGATTCTTCGATATGAAACAGGTATACTTTTCCTTATTCCTGTATTCATTGGGATTGTAAATGGTGGTATGTTGCTTAT
TTACTATAAATATTTATTCATGGATACATTGGTAGCAGGCAATATCATAATGTTATCTTTATTGCTTTGTCTGCTTTTCT
TCTTGATAATATATGGCACATTTTATGTATTGACATTGCGGTCAGTGACATCCATAATCAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCAAAGATGGGAAACTTCACATGGAGATTGATAAAAAAGATTGTGGAGAGTCGTTTTACGATGTAATTAGTCAAGCTTT
ATCCGATAGAGGAGAGTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAAAAATCTTTTAACTTTAACGATTAAGTAAATAATATGATAAGAATAAAAAACATAACAAAGAGTAAGTTCTTTGG
GACTGCAATAATCTTGTTGC

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 635

Protein sequence:

>635_residues
MIWSITKSNIKKNFSLYRIYFLATIGLLSIFIAFLNFISDKIITEKIGDSGQALVIANGSLIFLIVFLVVFLIYFNNFFV
KKRSQELGVLAILGFSKRELTKLLTLENLVILVLSYLVSLLLGPTLYFLAVLAITHLLNLTMEVQWFITVNEIIESLGIL
VVVFLINVITNGLIISKQSLIEFVNFSRKAEKKIKIRKVRAIIAITALLLSYILCLATVFSSTRNMLLSIGMVPVSLLII
VLVVLGTVFTIRYGLAFVVSLLKGNKKRLYRPLSNIIYPKFNYRIATKNKLLTVLGGLLTVTVSVAGMMVMLYAYSLNGI
ERLTPSAIEYNVKSENGQVNVTTILENDQVSLVDVDLLRLNTNPEVTITESGQTIPYFDIINYSDYKELMKAQGRINSIE
GSKSLPLLINYYPTEISLGKTFNLGNAYDVTVKQVSTHNVFSFSTSVTTLVVSDKLYAKLSSCFPEKEMTIRTFNGNSIR
SSEAFYNQFSMVPDVISSYSKEYTVKTANIATYIFITFLSILFIICTGSILYFTSLIEIMENKEEYGYLSKLGYSKKMIH
RILRYETGILFLIPVFIGIVNGGMLLIYYKYLFMDTLVAGNIIMLSLLLCLLFFLIIYGTFYVLTLRSVTSIIKN

Sequences:

>Translated_635_residues
MIWSITKSNIKKNFSLYRIYFLATIGLLSIFIAFLNFISDKIITEKIGDSGQALVIANGSLIFLIVFLVVFLIYFNNFFV
KKRSQELGVLAILGFSKRELTKLLTLENLVILVLSYLVSLLLGPTLYFLAVLAITHLLNLTMEVQWFITVNEIIESLGIL
VVVFLINVITNGLIISKQSLIEFVNFSRKAEKKIKIRKVRAIIAITALLLSYILCLATVFSSTRNMLLSIGMVPVSLLII
VLVVLGTVFTIRYGLAFVVSLLKGNKKRLYRPLSNIIYPKFNYRIATKNKLLTVLGGLLTVTVSVAGMMVMLYAYSLNGI
ERLTPSAIEYNVKSENGQVNVTTILENDQVSLVDVDLLRLNTNPEVTITESGQTIPYFDIINYSDYKELMKAQGRINSIE
GSKSLPLLINYYPTEISLGKTFNLGNAYDVTVKQVSTHNVFSFSTSVTTLVVSDKLYAKLSSCFPEKEMTIRTFNGNSIR
SSEAFYNQFSMVPDVISSYSKEYTVKTANIATYIFITFLSILFIICTGSILYFTSLIEIMENKEEYGYLSKLGYSKKMIH
RILRYETGILFLIPVFIGIVNGGMLLIYYKYLFMDTLVAGNIIMLSLLLCLLFFLIIYGTFYVLTLRSVTSIIKN
>Mature_635_residues
MIWSITKSNIKKNFSLYRIYFLATIGLLSIFIAFLNFISDKIITEKIGDSGQALVIANGSLIFLIVFLVVFLIYFNNFFV
KKRSQELGVLAILGFSKRELTKLLTLENLVILVLSYLVSLLLGPTLYFLAVLAITHLLNLTMEVQWFITVNEIIESLGIL
VVVFLINVITNGLIISKQSLIEFVNFSRKAEKKIKIRKVRAIIAITALLLSYILCLATVFSSTRNMLLSIGMVPVSLLII
VLVVLGTVFTIRYGLAFVVSLLKGNKKRLYRPLSNIIYPKFNYRIATKNKLLTVLGGLLTVTVSVAGMMVMLYAYSLNGI
ERLTPSAIEYNVKSENGQVNVTTILENDQVSLVDVDLLRLNTNPEVTITESGQTIPYFDIINYSDYKELMKAQGRINSIE
GSKSLPLLINYYPTEISLGKTFNLGNAYDVTVKQVSTHNVFSFSTSVTTLVVSDKLYAKLSSCFPEKEMTIRTFNGNSIR
SSEAFYNQFSMVPDVISSYSKEYTVKTANIATYIFITFLSILFIICTGSILYFTSLIEIMENKEEYGYLSKLGYSKKMIH
RILRYETGILFLIPVFIGIVNGGMLLIYYKYLFMDTLVAGNIIMLSLLLCLLFFLIIYGTFYVLTLRSVTSIIKN

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71576; Mature: 71576

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIWSITKSNIKKNFSLYRIYFLATIGLLSIFIAFLNFISDKIITEKIGDSGQALVIANGS
CEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCH
LIFLIVFLVVFLIYFNNFFVKKRSQELGVLAILGFSKRELTKLLTLENLVILVLSYLVSL
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGPTLYFLAVLAITHLLNLTMEVQWFITVNEIIESLGILVVVFLINVITNGLIISKQSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHH
IEFVNFSRKAEKKIKIRKVRAIIAITALLLSYILCLATVFSSTRNMLLSIGMVPVSLLII
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLVVLGTVFTIRYGLAFVVSLLKGNKKRLYRPLSNIIYPKFNYRIATKNKLLTVLGGLLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH
VTVSVAGMMVMLYAYSLNGIERLTPSAIEYNVKSENGQVNVTTILENDQVSLVDVDLLRL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHEEEEECCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEE
NTNPEVTITESGQTIPYFDIINYSDYKELMKAQGRINSIEGSKSLPLLINYYPTEISLGK
CCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCEEECCC
TFNLGNAYDVTVKQVSTHNVFSFSTSVTTLVVSDKLYAKLSSCFPEKEMTIRTFNGNSIR
EECCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCC
SSEAFYNQFSMVPDVISSYSKEYTVKTANIATYIFITFLSILFIICTGSILYFTSLIEIM
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
ENKEEYGYLSKLGYSKKMIHRILRYETGILFLIPVFIGIVNGGMLLIYYKYLFMDTLVAG
HCCHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIMLSLLLCLLFFLIIYGTFYVLTLRSVTSIIKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIWSITKSNIKKNFSLYRIYFLATIGLLSIFIAFLNFISDKIITEKIGDSGQALVIANGS
CEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCH
LIFLIVFLVVFLIYFNNFFVKKRSQELGVLAILGFSKRELTKLLTLENLVILVLSYLVSL
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGPTLYFLAVLAITHLLNLTMEVQWFITVNEIIESLGILVVVFLINVITNGLIISKQSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHH
IEFVNFSRKAEKKIKIRKVRAIIAITALLLSYILCLATVFSSTRNMLLSIGMVPVSLLII
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLVVLGTVFTIRYGLAFVVSLLKGNKKRLYRPLSNIIYPKFNYRIATKNKLLTVLGGLLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH
VTVSVAGMMVMLYAYSLNGIERLTPSAIEYNVKSENGQVNVTTILENDQVSLVDVDLLRL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHEEEEECCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEE
NTNPEVTITESGQTIPYFDIINYSDYKELMKAQGRINSIEGSKSLPLLINYYPTEISLGK
CCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCEEECCC
TFNLGNAYDVTVKQVSTHNVFSFSTSVTTLVVSDKLYAKLSSCFPEKEMTIRTFNGNSIR
EECCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCC
SSEAFYNQFSMVPDVISSYSKEYTVKTANIATYIFITFLSILFIICTGSILYFTSLIEIM
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
ENKEEYGYLSKLGYSKKMIHRILRYETGILFLIPVFIGIVNGGMLLIYYKYLFMDTLVAG
HCCHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIMLSLLLCLLFFLIIYGTFYVLTLRSVTSIIKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]