| Definition | Streptococcus pyogenes MGAS8232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003485 |
| Length | 1,895,017 |
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The map label for this gene is 19746647
Identifier: 19746647
GI number: 19746647
Start: 1457190
End: 1459205
Strand: Reverse
Name: 19746647
Synonym: spyM18_1756
Alternate gene names: NA
Gene position: 1459205-1457190 (Counterclockwise)
Preceding gene: 19746648
Following gene: 19746646
Centisome position: 77.0
GC content: 43.11
Gene sequence:
>2016_bases ATGAGCAGAGACCCAACACTTTTAATAGACGAGTCAAATTTAACAATCGGCTCAGATGGACGTGCTTATTATACATTTAC GGCTGATGGTGACACAAAAAGCGTTAAAATAGCCAATAACAAATGTATCGGTACAACTCGCTTTAACCAGCTCATGATTG AGCGAGGAGATAAGCCAACTAATTACGTGGCGCCCGTGGTTGTCGAGGGGACAGGTAATCCGACTGGACTATTTAAAGAC CTCAAAGAGCTTAATTTAGAGCTGACAGATACTGCTAACTCTCAGCTCTGGGCAAAAATCAAGCTAAACAATCATGGTAT GTTACAGACATACTTTGATACGACTATTAAAAATGAGATTTTAACAACGGCTCAAGGTATCAGAGAGACTATATCTGATA CTGAGCGAGGACTTAAGTCCGAGTTTCTAAGGACAGTGCAAGGTCAGCGTATCCAGCTTAAGAGTTTGCTAGAGCAAAAG ACCGCTCAACTCGGCTTGACGGTCGATGGTCTAAAACTTGATTTAAACAAAGCAAACAAACAGACAGCTAGTTTACAGGC TAGTATCGATGGTTTGCGACAAGACTATCGAGATGCTGATAGGCAATTGTCTGCTAATTATCAGGCAGGGCTCAATGGTC TAAAAGCTCAACTAACCAATGATAAAATCGGTTTACAAGCTGAGATACAAGCAACCGCTCAAGGATTATCACAAAAGTAT GATAACGAGCTAAGACAGTTATCTGCTAAGATCACAACAACCTCAAGCGGCACGACCGAAGCCTACGAAAACAAGCTCGA GGGTTTACGTGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCAAGGCATGAGGACGGAGCTCGAGTCTCAAATCAGCGGACTAAGAGCTG TACAGCAGTCAACAGCTAGCCAAATCTCACAAGAGATACGTAACCGCGAAGGAGCTGTCAGTCGTGTGCAGCAGAACTTA GCTAGCTATCAGCGGCGATTACAATCCGCAGAGGGCAATTACAACAGTTTGAGAGAGACTGTAGCGGGTTATGAGCGCAG GATATCCAATCAGGATAACACTATCTCCTCTAACTTTACACAGCTAAAAAGCTTGATAAATCAGTCTGTGACCTTAGAAA AAATTCAGTCCCTCTTGAGGCTATCTGGTGACAGTATCATGCTTGCGATTAAAGACAAAATCCCGCAAAGTAAAATGTCT GGCAGCGATATTATCTCAGCGATTAACTTAAACTCCTACGGAGTAACAATCGCAGGTAAACACATCGCTCTCGATGGCAA TACGACTGTCAACGGCACCTTTACCACAAAGATAGCAGAGGCTATCAAAATCAGAGCTGATCAGATTATTGCAGGCACGA TTGACGCTGCTAAGATTAGAGTGATTAACCTTAACGCAAGTAGTATCGTTGGTTTAGACGCTAACTTTATCAAAGCTAAA ATTGGCTATGCTATCACTGATTTGCTCGAGGGCAAAGTCATCAAAGCTCGTAATGGCGCTATGCTTATCGACCTTAACAG CGCTAAGCTTGATTTTAACAGTAACGCGACCATCAACTTTAACAGCCGAGATAACGCTCTAGTGCGTAAAGACGGTACAC ACACTGCCTTTGTACACTTTAGTAATGCCACACCAAAAGGTTATACAGGTTCGGCACTATATGCCTCTATTGGTATCACC TCATCTGGTGATGGGGTCAACAGTGCGTCATCTGGACGTTTTGCGGGTATGCGTTGCTTTAGGCACGCTACAGGCTACAA CCACACTGCGGCAGTCGACCAGACAGAAATTTATGGTGATAGTGTACTTATTGCAGATGACTTTAACATCAATAGAGGCT TTAAGTTTAGACCAGACAAGACGAAAAAAATCCTTGATATGAACAACTTGTATGATGCTGTTGTTGCACTCGGACGTTGC TGGGGACATCTGAGGAATGCCGGGTGGGATACCGCTCGCAGCAATTTTATAACTGCTGTCACTAGAGAGTTGAGTAATTA CATTGATATTATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCCAATATCTGAAAAACATGCTGCGACTAAAGATTACGTAGATAAAGCAATTTCTGAGTTAAAAAAACTCATACCAAAA AAATAGATTAAGGAGGATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGGAGACAACATGGATTTAACACTAAAAAATAAAGACTTAAACACGTTTTATAGCGTACTTGACAAAATCAAAATCACT AATATGCGTGCCAACCGTGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Protein; Phage Hyaluronidase
Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 670
Protein sequence:
>671_residues MSRDPTLLIDESNLTIGSDGRAYYTFTADGDTKSVKIANNKCIGTTRFNQLMIERGDKPTNYVAPVVVEGTGNPTGLFKD LKELNLELTDTANSQLWAKIKLNNHGMLQTYFDTTIKNEILTTAQGIRETISDTERGLKSEFLRTVQGQRIQLKSLLEQK TAQLGLTVDGLKLDLNKANKQTASLQASIDGLRQDYRDADRQLSANYQAGLNGLKAQLTNDKIGLQAEIQATAQGLSQKY DNELRQLSAKITTTSSGTTEAYENKLEGLRAEFTRSNQGMRTELESQISGLRAVQQSTASQISQEIRNREGAVSRVQQNL ASYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFTQLKSLINQSVTLEKIQSLLRLSGDSIMLAIKDKIPQSKMS GSDIISAINLNSYGVTIAGKHIALDGNTTVNGTFTTKIAEAIKIRADQIIAGTIDAAKIRVINLNASSIVGLDANFIKAK IGYAITDLLEGKVIKARNGAMLIDLNSAKLDFNSNATINFNSRDNALVRKDGTHTAFVHFSNATPKGYTGSALYASIGIT SSGDGVNSASSGRFAGMRCFRHATGYNHTAAVDQTEIYGDSVLIADDFNINRGFKFRPDKTKKILDMNNLYDAVVALGRC WGHLRNAGWDTARSNFITAVTRELSNYIDII
Sequences:
>Translated_671_residues MSRDPTLLIDESNLTIGSDGRAYYTFTADGDTKSVKIANNKCIGTTRFNQLMIERGDKPTNYVAPVVVEGTGNPTGLFKD LKELNLELTDTANSQLWAKIKLNNHGMLQTYFDTTIKNEILTTAQGIRETISDTERGLKSEFLRTVQGQRIQLKSLLEQK TAQLGLTVDGLKLDLNKANKQTASLQASIDGLRQDYRDADRQLSANYQAGLNGLKAQLTNDKIGLQAEIQATAQGLSQKY DNELRQLSAKITTTSSGTTEAYENKLEGLRAEFTRSNQGMRTELESQISGLRAVQQSTASQISQEIRNREGAVSRVQQNL ASYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFTQLKSLINQSVTLEKIQSLLRLSGDSIMLAIKDKIPQSKMS GSDIISAINLNSYGVTIAGKHIALDGNTTVNGTFTTKIAEAIKIRADQIIAGTIDAAKIRVINLNASSIVGLDANFIKAK IGYAITDLLEGKVIKARNGAMLIDLNSAKLDFNSNATINFNSRDNALVRKDGTHTAFVHFSNATPKGYTGSALYASIGIT SSGDGVNSASSGRFAGMRCFRHATGYNHTAAVDQTEIYGDSVLIADDFNINRGFKFRPDKTKKILDMNNLYDAVVALGRC WGHLRNAGWDTARSNFITAVTRELSNYIDII >Mature_670_residues SRDPTLLIDESNLTIGSDGRAYYTFTADGDTKSVKIANNKCIGTTRFNQLMIERGDKPTNYVAPVVVEGTGNPTGLFKDL KELNLELTDTANSQLWAKIKLNNHGMLQTYFDTTIKNEILTTAQGIRETISDTERGLKSEFLRTVQGQRIQLKSLLEQKT AQLGLTVDGLKLDLNKANKQTASLQASIDGLRQDYRDADRQLSANYQAGLNGLKAQLTNDKIGLQAEIQATAQGLSQKYD NELRQLSAKITTTSSGTTEAYENKLEGLRAEFTRSNQGMRTELESQISGLRAVQQSTASQISQEIRNREGAVSRVQQNLA SYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFTQLKSLINQSVTLEKIQSLLRLSGDSIMLAIKDKIPQSKMSG SDIISAINLNSYGVTIAGKHIALDGNTTVNGTFTTKIAEAIKIRADQIIAGTIDAAKIRVINLNASSIVGLDANFIKAKI GYAITDLLEGKVIKARNGAMLIDLNSAKLDFNSNATINFNSRDNALVRKDGTHTAFVHFSNATPKGYTGSALYASIGITS SGDGVNSASSGRFAGMRCFRHATGYNHTAAVDQTEIYGDSVLIADDFNINRGFKFRPDKTKKILDMNNLYDAVVALGRCW GHLRNAGWDTARSNFITAVTRELSNYIDII
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73473; Mature: 73341
Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSRDPTLLIDESNLTIGSDGRAYYTFTADGDTKSVKIANNKCIGTTRFNQLMIERGDKPT CCCCCEEEEECCCEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEECHHHHHHHHHCCCCCC NYVAPVVVEGTGNPTGLFKDLKELNLELTDTANSQLWAKIKLNNHGMLQTYFDTTIKNEI CEECEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHH LTTAQGIRETISDTERGLKSEFLRTVQGQRIQLKSLLEQKTAQLGLTVDGLKLDLNKANK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEECCCCCC QTASLQASIDGLRQDYRDADRQLSANYQAGLNGLKAQLTNDKIGLQAEIQATAQGLSQKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH DNELRQLSAKITTTSSGTTEAYENKLEGLRAEFTRSNQGMRTELESQISGLRAVQQSTAS HHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QISQEIRNREGAVSRVQQNLASYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFT HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH QLKSLINQSVTLEKIQSLLRLSGDSIMLAIKDKIPQSKMSGSDIISAINLNSYGVTIAGK HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHEEEEECCCCEEEEECC HIALDGNTTVNGTFTTKIAEAIKIRADQIIAGTIDAAKIRVINLNASSIVGLDANFIKAK EEEECCCCEECCEEHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECEEEEEEEEECCCEEEECCCHHHHHH IGYAITDLLEGKVIKARNGAMLIDLNSAKLDFNSNATINFNSRDNALVRKDGTHTAFVHF HHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEECCCEEECCCCCEEEECCCCCEEEEECCCEEEEEEE SNATPKGYTGSALYASIGITSSGDGVNSASSGRFAGMRCFRHATGYNHTAAVDQTEIYGD CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCC SVLIADDFNINRGFKFRPDKTKKILDMNNLYDAVVALGRCWGHLRNAGWDTARSNFITAV EEEEEECCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH TRELSNYIDII HHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SRDPTLLIDESNLTIGSDGRAYYTFTADGDTKSVKIANNKCIGTTRFNQLMIERGDKPT CCCCEEEEECCCEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEECHHHHHHHHHCCCCCC NYVAPVVVEGTGNPTGLFKDLKELNLELTDTANSQLWAKIKLNNHGMLQTYFDTTIKNEI CEECEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHH LTTAQGIRETISDTERGLKSEFLRTVQGQRIQLKSLLEQKTAQLGLTVDGLKLDLNKANK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEECCCCCC QTASLQASIDGLRQDYRDADRQLSANYQAGLNGLKAQLTNDKIGLQAEIQATAQGLSQKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH DNELRQLSAKITTTSSGTTEAYENKLEGLRAEFTRSNQGMRTELESQISGLRAVQQSTAS HHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QISQEIRNREGAVSRVQQNLASYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFT HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH QLKSLINQSVTLEKIQSLLRLSGDSIMLAIKDKIPQSKMSGSDIISAINLNSYGVTIAGK HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHEEEEECCCCEEEEECC HIALDGNTTVNGTFTTKIAEAIKIRADQIIAGTIDAAKIRVINLNASSIVGLDANFIKAK EEEECCCCEECCEEHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECEEEEEEEEECCCEEEECCCHHHHHH IGYAITDLLEGKVIKARNGAMLIDLNSAKLDFNSNATINFNSRDNALVRKDGTHTAFVHF HHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEECCCEEECCCCCEEEECCCCCEEEEECCCEEEEEEE SNATPKGYTGSALYASIGITSSGDGVNSASSGRFAGMRCFRHATGYNHTAAVDQTEIYGD CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCC SVLIADDFNINRGFKFRPDKTKKILDMNNLYDAVVALGRCWGHLRNAGWDTARSNFITAV EEEEEECCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH TRELSNYIDII HHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA