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The map label for this gene is citS [H]

Identifier: 197294786

GI number: 197294786

Start: 785343

End: 786809

Strand: Reverse

Name: citS [H]

Synonym: PAa_0768

Alternate gene names: 197294786

Gene position: 786809-785343 (Counterclockwise)

Preceding gene: 197294787

Following gene: 197294770

Centisome position: 89.41

GC content: 30.81

Gene sequence:

>1467_bases
ATGAATGCTTCTCCAACATCGCCAGAAAAGAAAAATAACAAAAAAACCATTTTAGGATTTAGTCTTCCTGTTTTTGGCTT
AATTATTTTACTTGTTTTAATACAACTTTTGGGCCTTAAATGGTTAGGACGGGGAAAAGATAATTTTCACCCTTCCACCC
ATCCCTTAATAACTCCTTTATTAATTGCACTGCTTTTAGCTGCCTTTTTACAAACTATTGGCAAAAACATTCCTATTTTA
AAAGATATTGGTGGTGGAGCCATTCTATGCATTATTGTGCCTTCTATTTTGTTTACGGTTCCTATATTTAAAAATGCACC
TCTTTTAAGAGAAATGCAAAAAAAAATATCTTTAAGTTTTCAAAATTTAAGTGGTGGCGGCGAAAACAAAATTGGTTTTA
CTTCTTTTTTTGTTTCAGTTTTAATTATAGGTAGTTTTTTGGGAATGGATAAAAAATTATTAAAAAATTCTTTCAAAAAA
TTTATCCCTTTAATTTTGATTTCGTTAATAACTGGTGTTTTAGTGGTGGGCATTTTAGGATATTTTTTGCAACCCATCAA
AGGCATTAAGGACTCTGTCGCTCTCAGTCCTAAAGAAAATATTCTTAACGCCATCTTTTATATTTTTGCTCCTTTAGCGA
GTGGCGGAATTACAGCAGGAATCATTCCTTTAAGTAGTTCTTATAGCTTAGCGTCTTCTGGAAATGCTACAGATTTTGAA
GCAATGAAAAGCCATATTTTCCCTGCTTTACTTTTGGGAGGTATTTTTAGTATTTTAGTATCTGGTATTATTAAAAAACT
TTTTCAAAAAAGCAAATTAAGTGGCAATGGTAAATTAGAAATCAAAACTTCTTTGTCTCAAACTCAAGCAAAACCAACTC
CAAAAACGGAACCAAATTTTGATTCAAATAAATTTATTACTGGGGTTATCGCTATTTTTAGTATATATATTTTTAGCGTT
ATGCTGCGTGATTTGGCTGTTTTGCGTTTTCCTCAAATTAAAAAATATCTTCCTGACACTATTGTTTTTATTGTTTTTGT
CGTTATTTTAATTAAATTATTTAATTTGATTTCACAAGATTATATTAATTGTATTGTTAAAACATCTCAATTGATTACTA
AAAACTTAACTTCTACTTTATTAGTCATTTTAGGTTCTACATTGCAAATTGCAAAAGCATGGAAACATTTACAAAATGTT
AATTTTATTATTACTTGTTTTGTATGTGTGATTGTAGTTGCTTTGGTGGCTGGATATTTAGGAAAAAAATTAGGTTATTA
TCCTTTGGAAGCCTCTGTTACTGCAGGTCTTTGCACCAATAGTATTGGAGGAGCAGGAAATATTGCTATTTTATCAGCTT
CTGATTTGATGGGATTAATGCCATTCGCTCAAATAGCTACTCGTGTTGGAGGCGCTTTTGTTGTGGTGGTTGCAAGTATT
GCTTATCCTTTATTATGGACTGTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACGAAGAAAATATTTTACCAAGTAGCTTCAATAAAGAAGTAGTAAAACAAATTTCTTTGGCGGTAAAAGAAGCTGCTCAA
AAAACTGGAGTAATTCGTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATACTATACAACTTTTTTCTTTTTAAAAATTCTGTAAGATCGACTTTTTAGTCGGTCTTTTTTTTATTTTTGAAGAAT
AAAACTAATTTTCTCATTTG

Product: Putative malate/citrate symporter

Products: NA

Alternate protein names: Citrate carrier protein; Citrate transporter [H]

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MNASPTSPEKKNNKKTILGFSLPVFGLIILLVLIQLLGLKWLGRGKDNFHPSTHPLITPLLIALLLAAFLQTIGKNIPIL
KDIGGGAILCIIVPSILFTVPIFKNAPLLREMQKKISLSFQNLSGGGENKIGFTSFFVSVLIIGSFLGMDKKLLKNSFKK
FIPLILISLITGVLVVGILGYFLQPIKGIKDSVALSPKENILNAIFYIFAPLASGGITAGIIPLSSSYSLASSGNATDFE
AMKSHIFPALLLGGIFSILVSGIIKKLFQKSKLSGNGKLEIKTSLSQTQAKPTPKTEPNFDSNKFITGVIAIFSIYIFSV
MLRDLAVLRFPQIKKYLPDTIVFIVFVVILIKLFNLISQDYINCIVKTSQLITKNLTSTLLVILGSTLQIAKAWKHLQNV
NFIITCFVCVIVVALVAGYLGKKLGYYPLEASVTAGLCTNSIGGAGNIAILSASDLMGLMPFAQIATRVGGAFVVVVASI
AYPLLWTV

Sequences:

>Translated_488_residues
MNASPTSPEKKNNKKTILGFSLPVFGLIILLVLIQLLGLKWLGRGKDNFHPSTHPLITPLLIALLLAAFLQTIGKNIPIL
KDIGGGAILCIIVPSILFTVPIFKNAPLLREMQKKISLSFQNLSGGGENKIGFTSFFVSVLIIGSFLGMDKKLLKNSFKK
FIPLILISLITGVLVVGILGYFLQPIKGIKDSVALSPKENILNAIFYIFAPLASGGITAGIIPLSSSYSLASSGNATDFE
AMKSHIFPALLLGGIFSILVSGIIKKLFQKSKLSGNGKLEIKTSLSQTQAKPTPKTEPNFDSNKFITGVIAIFSIYIFSV
MLRDLAVLRFPQIKKYLPDTIVFIVFVVILIKLFNLISQDYINCIVKTSQLITKNLTSTLLVILGSTLQIAKAWKHLQNV
NFIITCFVCVIVVALVAGYLGKKLGYYPLEASVTAGLCTNSIGGAGNIAILSASDLMGLMPFAQIATRVGGAFVVVVASI
AYPLLWTV
>Mature_488_residues
MNASPTSPEKKNNKKTILGFSLPVFGLIILLVLIQLLGLKWLGRGKDNFHPSTHPLITPLLIALLLAAFLQTIGKNIPIL
KDIGGGAILCIIVPSILFTVPIFKNAPLLREMQKKISLSFQNLSGGGENKIGFTSFFVSVLIIGSFLGMDKKLLKNSFKK
FIPLILISLITGVLVVGILGYFLQPIKGIKDSVALSPKENILNAIFYIFAPLASGGITAGIIPLSSSYSLASSGNATDFE
AMKSHIFPALLLGGIFSILVSGIIKKLFQKSKLSGNGKLEIKTSLSQTQAKPTPKTEPNFDSNKFITGVIAIFSIYIFSV
MLRDLAVLRFPQIKKYLPDTIVFIVFVVILIKLFNLISQDYINCIVKTSQLITKNLTSTLLVILGSTLQIAKAWKHLQNV
NFIITCFVCVIVVALVAGYLGKKLGYYPLEASVTAGLCTNSIGGAGNIAILSASDLMGLMPFAQIATRVGGAFVVVVASI
AYPLLWTV

Specific function: Uptake of citrate across the boundary membrane with the concomitant uptake of a sodium ion (symport system) [H]

COG id: COG3493

COG function: function code C; Na+/citrate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:citrate (SCF) symporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004679
- InterPro:   IPR018025
- InterPro:   IPR002208 [H]

Pfam domain/function: PF03390 2HCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52577; Mature: 52577

Theoretical pI: Translated: 10.49; Mature: 10.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNASPTSPEKKNNKKTILGFSLPVFGLIILLVLIQLLGLKWLGRGKDNFHPSTHPLITPL
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
LIALLLAAFLQTIGKNIPILKDIGGGAILCIIVPSILFTVPIFKNAPLLREMQKKISLSF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
QNLSGGGENKIGFTSFFVSVLIIGSFLGMDKKLLKNSFKKFIPLILISLITGVLVVGILG
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLQPIKGIKDSVALSPKENILNAIFYIFAPLASGGITAGIIPLSSSYSLASSGNATDFE
HHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH
AMKSHIFPALLLGGIFSILVSGIIKKLFQKSKLSGNGKLEIKTSLSQTQAKPTPKTEPNF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHCCCCCCCCCCCC
DSNKFITGVIAIFSIYIFSVMLRDLAVLRFPQIKKYLPDTIVFIVFVVILIKLFNLISQD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YINCIVKTSQLITKNLTSTLLVILGSTLQIAKAWKHLQNVNFIITCFVCVIVVALVAGYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKKLGYYPLEASVTAGLCTNSIGGAGNIAILSASDLMGLMPFAQIATRVGGAFVVVVASI
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
AYPLLWTV
HHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNASPTSPEKKNNKKTILGFSLPVFGLIILLVLIQLLGLKWLGRGKDNFHPSTHPLITPL
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
LIALLLAAFLQTIGKNIPILKDIGGGAILCIIVPSILFTVPIFKNAPLLREMQKKISLSF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
QNLSGGGENKIGFTSFFVSVLIIGSFLGMDKKLLKNSFKKFIPLILISLITGVLVVGILG
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLQPIKGIKDSVALSPKENILNAIFYIFAPLASGGITAGIIPLSSSYSLASSGNATDFE
HHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH
AMKSHIFPALLLGGIFSILVSGIIKKLFQKSKLSGNGKLEIKTSLSQTQAKPTPKTEPNF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHCCCCCCCCCCCC
DSNKFITGVIAIFSIYIFSVMLRDLAVLRFPQIKKYLPDTIVFIVFVVILIKLFNLISQD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YINCIVKTSQLITKNLTSTLLVILGSTLQIAKAWKHLQNVNFIITCFVCVIVVALVAGYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKKLGYYPLEASVTAGLCTNSIGGAGNIAILSASDLMGLMPFAQIATRVGGAFVVVVASI
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
AYPLLWTV
HHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2120190 [H]