| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is norM
Identifier: 197294675
GI number: 197294675
Start: 629135
End: 630658
Strand: Direct
Name: norM
Synonym: PAa_0633
Alternate gene names: NA
Gene position: 629135-630658 (Clockwise)
Preceding gene: 197294670
Following gene: 197294685
Centisome position: 71.5
GC content: 27.69
Gene sequence:
>1524_bases ATGACACAAAAAGAAAATAAAATATTCAACAAAAAAGAAAAATTAAATAAATTAATTTTAGAGGGGAATCTATTAAAATC TTTATTAGTCGTTTCTTTTCCTATTATTGTTTTTAATATTTTTAAAGTTTTATTCAGTAATATCGATTCTTTGTTTTCTA TTGGAAGCCCCAATTCGAGTGAAATGGGTAATTTTATTCAAATTTCAAAATCCATTCAAGCTATTATTGATTCAATTGGG GTATCTTTGGGCATTGCAGGAGTCACTTTAATGGTTTCAGAAATTGCTAAAACCAAAGATATCTACAATCCCAAAGCTCG TCAAATAGCATCTTTGACTTTCGTTTTATTAATCTCGATCAGTGTTTTATTGTTTTTTATAATGTTTTTGATGGCGCCAG TTGTTTGTAATATTATAGGGTTAAAAGGCGATTTGATAAAAAATTTTATTTCGGCTTTTAGATTAAAAATGTTGGGAGTT ATTTTGTTAGCTATCAATGTTTTTTTCTTAGGAACTGAAAGAATTTCGGGAAAAATCAAAAAAGTCTTAATTTTGAATTG CATTATGATGGGTTTAAAAATTGGGTTAAGTTTTTTAATTTTTCACGGATTAGGTTGCAAAACTGCGTTAGGACTGGAAA TAGCTTCTGTTTTGGCTCATGGTTCTATTACAATAGTGGCTTTTTTTACCCTTTTAAATAAAAAAAATCCTTTTTGTTTA AATATTCGAGATTTTAGTTGGAAAAATGTCTTAAAAAATAAAAAAATAATTAAAACTATTTTTAAATTCGGGTTTACTTT AATGTTGGGTAAAATTTTGTATGAATTTGGCAGATTATTAACTTTATATATGATCAAAAGCAGTACTAATGCTCCTTTTT TAGGTTTTCAAGGTTTTGGCGAAGGCACTTTAAAAAACATGGGGGTTGCCGATGGGGCAATTAATTTATTTGTTCAGATA GCTTTTTCTTTGAAAGAAGGAGAATTAATGATTGTTTCTGAAAATCTAGGCAATAAAAACCCTAAAAGAGCAATTAAAAC TTTAATTATTACTTCCATATCTGCTTTTCTTATTTTTGGTTTGACATACTTAATTTGCGCCCCGACAAAATATAAAGGAT TGGGTTATGGAGATCAAATATACTTATTTTTTAAAAATTTAGGTAAAAATGGAAACGATATTGACAAAACCATCCCGCCT GGTTTTTCAGAATTTTTAATAGGAGCCATTTTAACAACTGGACTTATCACAACTCAATTAGAAGTTATCTCCACTTTTTT AATTGCTTCCAAACAACCAAAATATGATTTGTTTTTAAATTTTGGACGTGTTTTTCTTTTTAGAATTCCTTTTCTTTATT TATTTAGGCATTACTGGTTAAAACCTGGCCACACTTGGGAATATCATGTTTATAGTTTTGCTAATTTCTCTTCTAATTTG ATTATGTTAATTTTTATGCTTTTTTTATGCCTACGTGTTATTTTTAAAATGAAAAAGAGGGACATTGCAATCACAAAAAA ATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGCTACATATTTTTAAACTATTTTGGGTTTATCTGTGTTATACTTTAAAAGTAGTTAATATGAAAAAATATAGTTAAATA AAGTAGCAGGAATTAAATCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATTTTATCATCTATATTTGACTTAAGTTTTTAACTTCTCATCATGCACTACAAAAAAATTAAATATAATGAGATGATG AAATAATTTAAAGACACTTT
Product: Na+-driven multidrug efflux pump
Products: NA
Alternate protein names: Na+ Driven Multidrug Efflux Pump
Number of amino acids: Translated: 507; Mature: 506
Protein sequence:
>507_residues MTQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIG VSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGV ILLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQI AFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPP GFSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK
Sequences:
>Translated_507_residues MTQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIG VSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGV ILLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQI AFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPP GFSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK >Mature_506_residues TQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIGV SLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGVI LLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCLN IRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQIA FSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPPG FSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNLI MLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK
Specific function: Unknown
COG id: COG0534
COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56902; Mature: 56770
Theoretical pI: Translated: 10.54; Mature: 10.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCC EMGNFIQISKSIQAIIDSIGVSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGVILLAINVFFLGTERISGKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH KVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEE NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFG EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCC EGTLKNMGVADGAINLFVQIAFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFG CCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPPGFSEFLIGAILTTGLITTQL HHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCH IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCC >Mature Secondary Structure TQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCC EMGNFIQISKSIQAIIDSIGVSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGVILLAINVFFLGTERISGKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH KVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEE NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFG EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCC EGTLKNMGVADGAINLFVQIAFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFG CCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPPGFSEFLIGAILTTGLITTQL HHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCH IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA