Definition Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome.
Accession NC_010544
Length 879,959

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The map label for this gene is norM

Identifier: 197294675

GI number: 197294675

Start: 629135

End: 630658

Strand: Direct

Name: norM

Synonym: PAa_0633

Alternate gene names: NA

Gene position: 629135-630658 (Clockwise)

Preceding gene: 197294670

Following gene: 197294685

Centisome position: 71.5

GC content: 27.69

Gene sequence:

>1524_bases
ATGACACAAAAAGAAAATAAAATATTCAACAAAAAAGAAAAATTAAATAAATTAATTTTAGAGGGGAATCTATTAAAATC
TTTATTAGTCGTTTCTTTTCCTATTATTGTTTTTAATATTTTTAAAGTTTTATTCAGTAATATCGATTCTTTGTTTTCTA
TTGGAAGCCCCAATTCGAGTGAAATGGGTAATTTTATTCAAATTTCAAAATCCATTCAAGCTATTATTGATTCAATTGGG
GTATCTTTGGGCATTGCAGGAGTCACTTTAATGGTTTCAGAAATTGCTAAAACCAAAGATATCTACAATCCCAAAGCTCG
TCAAATAGCATCTTTGACTTTCGTTTTATTAATCTCGATCAGTGTTTTATTGTTTTTTATAATGTTTTTGATGGCGCCAG
TTGTTTGTAATATTATAGGGTTAAAAGGCGATTTGATAAAAAATTTTATTTCGGCTTTTAGATTAAAAATGTTGGGAGTT
ATTTTGTTAGCTATCAATGTTTTTTTCTTAGGAACTGAAAGAATTTCGGGAAAAATCAAAAAAGTCTTAATTTTGAATTG
CATTATGATGGGTTTAAAAATTGGGTTAAGTTTTTTAATTTTTCACGGATTAGGTTGCAAAACTGCGTTAGGACTGGAAA
TAGCTTCTGTTTTGGCTCATGGTTCTATTACAATAGTGGCTTTTTTTACCCTTTTAAATAAAAAAAATCCTTTTTGTTTA
AATATTCGAGATTTTAGTTGGAAAAATGTCTTAAAAAATAAAAAAATAATTAAAACTATTTTTAAATTCGGGTTTACTTT
AATGTTGGGTAAAATTTTGTATGAATTTGGCAGATTATTAACTTTATATATGATCAAAAGCAGTACTAATGCTCCTTTTT
TAGGTTTTCAAGGTTTTGGCGAAGGCACTTTAAAAAACATGGGGGTTGCCGATGGGGCAATTAATTTATTTGTTCAGATA
GCTTTTTCTTTGAAAGAAGGAGAATTAATGATTGTTTCTGAAAATCTAGGCAATAAAAACCCTAAAAGAGCAATTAAAAC
TTTAATTATTACTTCCATATCTGCTTTTCTTATTTTTGGTTTGACATACTTAATTTGCGCCCCGACAAAATATAAAGGAT
TGGGTTATGGAGATCAAATATACTTATTTTTTAAAAATTTAGGTAAAAATGGAAACGATATTGACAAAACCATCCCGCCT
GGTTTTTCAGAATTTTTAATAGGAGCCATTTTAACAACTGGACTTATCACAACTCAATTAGAAGTTATCTCCACTTTTTT
AATTGCTTCCAAACAACCAAAATATGATTTGTTTTTAAATTTTGGACGTGTTTTTCTTTTTAGAATTCCTTTTCTTTATT
TATTTAGGCATTACTGGTTAAAACCTGGCCACACTTGGGAATATCATGTTTATAGTTTTGCTAATTTCTCTTCTAATTTG
ATTATGTTAATTTTTATGCTTTTTTTATGCCTACGTGTTATTTTTAAAATGAAAAAGAGGGACATTGCAATCACAAAAAA
ATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTACATATTTTTAAACTATTTTGGGTTTATCTGTGTTATACTTTAAAAGTAGTTAATATGAAAAAATATAGTTAAATA
AAGTAGCAGGAATTAAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTATCATCTATATTTGACTTAAGTTTTTAACTTCTCATCATGCACTACAAAAAAATTAAATATAATGAGATGATG
AAATAATTTAAAGACACTTT

Product: Na+-driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: Na+ Driven Multidrug Efflux Pump

Number of amino acids: Translated: 507; Mature: 506

Protein sequence:

>507_residues
MTQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIG
VSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGV
ILLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL
NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQI
AFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPP
GFSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL
IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK

Sequences:

>Translated_507_residues
MTQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIG
VSLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGV
ILLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCL
NIRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQI
AFSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPP
GFSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNL
IMLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK
>Mature_506_residues
TQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSSEMGNFIQISKSIQAIIDSIGV
SLGIAGVTLMVSEIAKTKDIYNPKARQIASLTFVLLISISVLLFFIMFLMAPVVCNIIGLKGDLIKNFISAFRLKMLGVI
LLAINVFFLGTERISGKIKKVLILNCIMMGLKIGLSFLIFHGLGCKTALGLEIASVLAHGSITIVAFFTLLNKKNPFCLN
IRDFSWKNVLKNKKIIKTIFKFGFTLMLGKILYEFGRLLTLYMIKSSTNAPFLGFQGFGEGTLKNMGVADGAINLFVQIA
FSLKEGELMIVSENLGNKNPKRAIKTLIITSISAFLIFGLTYLICAPTKYKGLGYGDQIYLFFKNLGKNGNDIDKTIPPG
FSEFLIGAILTTGLITTQLEVISTFLIASKQPKYDLFLNFGRVFLFRIPFLYLFRHYWLKPGHTWEYHVYSFANFSSNLI
MLIFMLFLCLRVIFKMKKRDIAITKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56902; Mature: 56770

Theoretical pI: Translated: 10.54; Mature: 10.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCC
>Mature Secondary Structure 
TQKENKIFNKKEKLNKLILEGNLLKSLLVVSFPIIVFNIFKVLFSNIDSLFSIGSPNSS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCC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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA