| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294582
Identifier: 197294582
GI number: 197294582
Start: 538160
End: 538828
Strand: Direct
Name: 197294582
Synonym: PAa_0538
Alternate gene names: NA
Gene position: 538160-538828 (Clockwise)
Preceding gene: 197294581
Following gene: 197294583
Centisome position: 61.16
GC content: 23.17
Gene sequence:
>669_bases ATGTTAAATGATCAAAAAAAAACTTTACAAAAAATTATTATAACTTCGTTTTTATTATTTTTAACTTTTTCTTTGGAATT AATTTTTCGATATACTATTAATTTCGGAACTGCTTGCAACTATTCTTTTTTTAAAATTGAATTACTTTTTATTATTTTAA TTGGCTTTCTTTTTGGATTTAAATACAGTTTTTTTGCCAATTTAACATATCTTTTAATTCATTATTCCTTTGAGCGTTTT TTGATGGATTTTTTCTTACCAGAACATTCTCACAATCATGATCATCATGGATTGGAATTAAAAATTTTTCTTTATCGGTT TTTTTTGCCTTATCTTGCTTGTTGTTTATCTGGATTGTTTTATCAAAAAAAAAGAAATCAACTTTTTAAAAAATGGCCTT TAGTCATCACTTTAACAATCATTAGTATAGTTCAAATTTTTTCAAGTATTTTATTTATTGATTTACTAAAAAACGAGTTT TTTCAAGATCAAAACAGCAGTCTTTTGACGCGGTTTGTTTCTGATTGGAAATATTCTACAGGTCTTAATGTTGCTTATAG TTTTTTATCAGTTGTTATTAATAATCTTATAATTGGAGTTTTGCTTTATTTAATTAATTTACGTTTAAAAGACAAGTTAG AGGTTTTAGATAATTTGCAAACAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGATGCTACTAATGATGATTTTTTAAACTTATTAAAGGAAGGGTTTTTAGCAGAAAAACTTAGTTATTAGTTTTTTGCT AAAAATAAAGGAATATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTAAAATTTGTGAAGGTTTTTTTAATTGTTTTTTAAAACCTAATACTTATTTTGGAGATATTAAATAATTATTAAAAA TAAAATAATTTAAATTTAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 222; Mature: 222
Protein sequence:
>222_residues MLNDQKKTLQKIIITSFLLFLTFSLELIFRYTINFGTACNYSFFKIELLFIILIGFLFGFKYSFFANLTYLLIHYSFERF LMDFFLPEHSHNHDHHGLELKIFLYRFFLPYLACCLSGLFYQKKRNQLFKKWPLVITLTIISIVQIFSSILFIDLLKNEF FQDQNSSLLTRFVSDWKYSTGLNVAYSFLSVVINNLIIGVLLYLINLRLKDKLEVLDNLQTN
Sequences:
>Translated_222_residues MLNDQKKTLQKIIITSFLLFLTFSLELIFRYTINFGTACNYSFFKIELLFIILIGFLFGFKYSFFANLTYLLIHYSFERF LMDFFLPEHSHNHDHHGLELKIFLYRFFLPYLACCLSGLFYQKKRNQLFKKWPLVITLTIISIVQIFSSILFIDLLKNEF FQDQNSSLLTRFVSDWKYSTGLNVAYSFLSVVINNLIIGVLLYLINLRLKDKLEVLDNLQTN >Mature_222_residues MLNDQKKTLQKIIITSFLLFLTFSLELIFRYTINFGTACNYSFFKIELLFIILIGFLFGFKYSFFANLTYLLIHYSFERF LMDFFLPEHSHNHDHHGLELKIFLYRFFLPYLACCLSGLFYQKKRNQLFKKWPLVITLTIISIVQIFSSILFIDLLKNEF FQDQNSSLLTRFVSDWKYSTGLNVAYSFLSVVINNLIIGVLLYLINLRLKDKLEVLDNLQTN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 26396; Mature: 26396
Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNDQKKTLQKIIITSFLLFLTFSLELIFRYTINFGTACNYSFFKIELLFIILIGFLFGF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYSFFANLTYLLIHYSFERFLMDFFLPEHSHNHDHHGLELKIFLYRFFLPYLACCLSGLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQKKRNQLFKKWPLVITLTIISIVQIFSSILFIDLLKNEFFQDQNSSLLTRFVSDWKYST HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCC GLNVAYSFLSVVINNLIIGVLLYLINLRLKDKLEVLDNLQTN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MLNDQKKTLQKIIITSFLLFLTFSLELIFRYTINFGTACNYSFFKIELLFIILIGFLFGF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYSFFANLTYLLIHYSFERFLMDFFLPEHSHNHDHHGLELKIFLYRFFLPYLACCLSGLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQKKRNQLFKKWPLVITLTIISIVQIFSSILFIDLLKNEFFQDQNSSLLTRFVSDWKYST HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCC GLNVAYSFLSVVINNLIIGVLLYLINLRLKDKLEVLDNLQTN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA