| Definition | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011134 |
| Length | 2,024,171 |
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The map label for this gene is 195977264
Identifier: 195977264
GI number: 195977264
Start: 125535
End: 127538
Strand: Direct
Name: 195977264
Synonym: Sez_0113
Alternate gene names: NA
Gene position: 125535-127538 (Clockwise)
Preceding gene: 195977263
Following gene: 195977265
Centisome position: 6.2
GC content: 42.71
Gene sequence:
>2004_bases ATGAAGAGACTGTTTATCATATTGTCTAATATACTAGTTAGCCTCTTTTTGGTTTGGGTATTTACGATCTGGTCAGATAC CTTTGTTTCTCATTATTATCCGTCTGTTGTTGTTTTAGATGCTTCGCCTAAGGCAAGCTATAATCAGGTTGAAGCAGGCT TAACCCGTCTAGCAAAGGAAACGGATAGCCTAATTGCAATGCAGCATCAGGAGCCAGGGCCAGAAGGCACACCTATTGTA ACCTATACCTTATTTGGCAAGGGAGAGCTACCGAATGGATTAGCTGAAAAGGTTATTGAGGAGCCATCAAGGCTTAGTGT GGAGAATAATTACTTTATTCTTAAAGGTGGCTTGACTGTAGAGCGGCTAAGAGACACATTAGCTGGGCTTGGTATGACCA AAATGACAATGCTGAAGCCTTCATTTTTAGGGACAGTGGTTCTGATTTTTAGTAGCGGTTCTCAGGCTTTGGGTCTTGTG ATATTCTGTCTAACCTTTGGAGCCCTGACCTTGATTGGTCATATTCGCGCCCTGAGAACAGCAGGTATCCGCTTGATTTC AGGTGAACGTCGTTGGCAAATCTTTCTTTATCCAATCAGGTCTGATGTGTGTTATTGCTGTTTAGGCCTAATATTTGGAT TTAGCCTAGCGGCTGTTATGGGGCAGTTTATGTCTTTTTCGCCGCTTGTTCTTTACCTGATTGGAATAGGTCTTGTTTGC TATAATCTTCTGCTGGTATTTATTGCCCTTTTCTTTGCAGGCTTATTTGCGATTGGGATTAAAAAAGTGCATTTGATGCA GGTGATTAAAGGTCAGATACCTGTCAGGGGGATCATCAGCCTGATTTTAATTGGTCAATTGTTGGCGGTGTTGGTTGTTT CCTTTGGGGCAAGCCGAACCCTTCTTTACGTTCAGGCTGAAAGACAGCAGGAGCGGGGGCAGGCTGTTTGGCGACAGGAG GATAAGCTGGTTACTCTTTTAATAGGTCGTGATGGCTTAGATATTGGAAATACTAAGGAAGCTATTGCCAAACAAAAGAC TTGGTTTCATGTTATGGATCAGGCTGTTTCAGAGCATGGAGCGATCCTGTCTCGTCATTACCTGGTCGAGCGCGACCTGC AATCAGGCCTCTCTATGTTAACAGCCTCTTCTAGCTGGAATGATTACAGCCCACAAGGAAATGTGCTGCTTGTAACGCCT CAATATGTGAAGCACCAAAAAGTTGAGGTGGCACCTGATATCAGTGAAAAAATCAATCAGCTCTCCCTTGGAGAATTTGT CCTTCTTTTACCAGAGCATTTGAAAGCACAGGCTGCACATTATCAATCGGTCTTTGAAGCAGCTGTAACTGGGCTTGCTT CCGGTGAGGGTCATCAGCCGATGACTGCTACTGTTTCCTGTACAAAGACAGGTCAGGAACGTTTTCTTTATAACACAACA CCGATATCCTATCAGCAATTTTTAAGGGATCCCATTATTGTTGTTTTGACGCCTAAGTCAACTGGCGAACAAGCCTATGC CTTTTGGGAGGTTGCTTTACAAAATTATTTCCTTTTCGATCAGTTGGCAGATACTCAAACGCTCATCAAGCAAAACGGTA TTGAGAACTGGGTAGGAGAGCTAAAAACTGGCTATCGCATTTATGAGACATTGTTGAACAATCTTCGTAGGGAGATTTGG TTGATGATTGCAGGAGCTATATTAGGGATAGCGACCTCTATGTTGATGTTTAACACAATGAACCTTCTCTACTTTGAAGA ATTTAGACGGGATATTTTCATTAAGCGCGTCTCTGGTCTTAGATTTTTTGAGCTGCATCGTCGTTATTTGCTGTCGCAGC TGCTTGTTTTCTTTGTTGGATTGGTGATTAGTGCCCTGTTAACACAGAATCCTCTTATGTGCCTGCTGGTTTTCTTCCTA TTTCTAAGGAATGCCATATTGCTGCTATATCGTCAAATGAGAATAGAAAATAAGATGTCGCTGCTGATTTTGAAAGGAGC TTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGGAGAGCACGTGACCTTTGATGCAGGGAAATAGGCAGGTCAGTGTGTGTTTATTAGGGGCGGAGAGACTCCGTCCCT TTTAAGGTAAGGAGTGGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATGATTCGACTAGAAAAGGTTAGTAAAGGCTTTGGTGATCGTGTTTTATTTTCTAATTTGTCAATGACCTTTGAGTCTG GAAAGGTTTATGCCCTTATT
Product: probable immunity protein
Products: NA
Alternate protein names: Immunity Protein; Bacteriocine Associated ABC Transporter Permease; Bacteriocin-Associated Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 667; Mature: 667
Protein sequence:
>667_residues MKRLFIILSNILVSLFLVWVFTIWSDTFVSHYYPSVVVLDASPKASYNQVEAGLTRLAKETDSLIAMQHQEPGPEGTPIV TYTLFGKGELPNGLAEKVIEEPSRLSVENNYFILKGGLTVERLRDTLAGLGMTKMTMLKPSFLGTVVLIFSSGSQALGLV IFCLTFGALTLIGHIRALRTAGIRLISGERRWQIFLYPIRSDVCYCCLGLIFGFSLAAVMGQFMSFSPLVLYLIGIGLVC YNLLLVFIALFFAGLFAIGIKKVHLMQVIKGQIPVRGIISLILIGQLLAVLVVSFGASRTLLYVQAERQQERGQAVWRQE DKLVTLLIGRDGLDIGNTKEAIAKQKTWFHVMDQAVSEHGAILSRHYLVERDLQSGLSMLTASSSWNDYSPQGNVLLVTP QYVKHQKVEVAPDISEKINQLSLGEFVLLLPEHLKAQAAHYQSVFEAAVTGLASGEGHQPMTATVSCTKTGQERFLYNTT PISYQQFLRDPIIVVLTPKSTGEQAYAFWEVALQNYFLFDQLADTQTLIKQNGIENWVGELKTGYRIYETLLNNLRREIW LMIAGAILGIATSMLMFNTMNLLYFEEFRRDIFIKRVSGLRFFELHRRYLLSQLLVFFVGLVISALLTQNPLMCLLVFFL FLRNAILLLYRQMRIENKMSLLILKGA
Sequences:
>Translated_667_residues MKRLFIILSNILVSLFLVWVFTIWSDTFVSHYYPSVVVLDASPKASYNQVEAGLTRLAKETDSLIAMQHQEPGPEGTPIV TYTLFGKGELPNGLAEKVIEEPSRLSVENNYFILKGGLTVERLRDTLAGLGMTKMTMLKPSFLGTVVLIFSSGSQALGLV IFCLTFGALTLIGHIRALRTAGIRLISGERRWQIFLYPIRSDVCYCCLGLIFGFSLAAVMGQFMSFSPLVLYLIGIGLVC YNLLLVFIALFFAGLFAIGIKKVHLMQVIKGQIPVRGIISLILIGQLLAVLVVSFGASRTLLYVQAERQQERGQAVWRQE DKLVTLLIGRDGLDIGNTKEAIAKQKTWFHVMDQAVSEHGAILSRHYLVERDLQSGLSMLTASSSWNDYSPQGNVLLVTP QYVKHQKVEVAPDISEKINQLSLGEFVLLLPEHLKAQAAHYQSVFEAAVTGLASGEGHQPMTATVSCTKTGQERFLYNTT PISYQQFLRDPIIVVLTPKSTGEQAYAFWEVALQNYFLFDQLADTQTLIKQNGIENWVGELKTGYRIYETLLNNLRREIW LMIAGAILGIATSMLMFNTMNLLYFEEFRRDIFIKRVSGLRFFELHRRYLLSQLLVFFVGLVISALLTQNPLMCLLVFFL FLRNAILLLYRQMRIENKMSLLILKGA >Mature_667_residues MKRLFIILSNILVSLFLVWVFTIWSDTFVSHYYPSVVVLDASPKASYNQVEAGLTRLAKETDSLIAMQHQEPGPEGTPIV TYTLFGKGELPNGLAEKVIEEPSRLSVENNYFILKGGLTVERLRDTLAGLGMTKMTMLKPSFLGTVVLIFSSGSQALGLV IFCLTFGALTLIGHIRALRTAGIRLISGERRWQIFLYPIRSDVCYCCLGLIFGFSLAAVMGQFMSFSPLVLYLIGIGLVC YNLLLVFIALFFAGLFAIGIKKVHLMQVIKGQIPVRGIISLILIGQLLAVLVVSFGASRTLLYVQAERQQERGQAVWRQE DKLVTLLIGRDGLDIGNTKEAIAKQKTWFHVMDQAVSEHGAILSRHYLVERDLQSGLSMLTASSSWNDYSPQGNVLLVTP QYVKHQKVEVAPDISEKINQLSLGEFVLLLPEHLKAQAAHYQSVFEAAVTGLASGEGHQPMTATVSCTKTGQERFLYNTT PISYQQFLRDPIIVVLTPKSTGEQAYAFWEVALQNYFLFDQLADTQTLIKQNGIENWVGELKTGYRIYETLLNNLRREIW LMIAGAILGIATSMLMFNTMNLLYFEEFRRDIFIKRVSGLRFFELHRRYLLSQLLVFFVGLVISALLTQNPLMCLLVFFL FLRNAILLLYRQMRIENKMSLLILKGA
Specific function: Unknown
COG id: COG4652
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74979; Mature: 74979
Theoretical pI: Translated: 9.11; Mature: 9.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRLFIILSNILVSLFLVWVFTIWSDTFVSHYYPSVVVLDASPKASYNQVEAGLTRLAKE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH TDSLIAMQHQEPGPEGTPIVTYTLFGKGELPNGLAEKVIEEPSRLSVENNYFILKGGLTV HHHHEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEEECCCCH ERLRDTLAGLGMTKMTMLKPSFLGTVVLIFSSGSQALGLVIFCLTFGALTLIGHIRALRT HHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGIRLISGERRWQIFLYPIRSDVCYCCLGLIFGFSLAAVMGQFMSFSPLVLYLIGIGLVC CCEEEEECCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH YNLLLVFIALFFAGLFAIGIKKVHLMQVIKGQIPVRGIISLILIGQLLAVLVVSFGASRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE LLYVQAERQQERGQAVWRQEDKLVTLLIGRDGLDIGNTKEAIAKQKTWFHVMDQAVSEHG EEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC AILSRHYLVERDLQSGLSMLTASSSWNDYSPQGNVLLVTPQYVKHQKVEVAPDISEKINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEECCCHHHHHHH LSLGEFVLLLPEHLKAQAAHYQSVFEAAVTGLASGEGHQPMTATVSCTKTGQERFLYNTT HCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEECCC PISYQQFLRDPIIVVLTPKSTGEQAYAFWEVALQNYFLFDQLADTQTLIKQNGIENWVGE CCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LKTGYRIYETLLNNLRREIWLMIAGAILGIATSMLMFNTMNLLYFEEFRRDIFIKRVSGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RFFELHRRYLLSQLLVFFVGLVISALLTQNPLMCLLVFFLFLRNAILLLYRQMRIENKMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE LLILKGA EEEEECC >Mature Secondary Structure MKRLFIILSNILVSLFLVWVFTIWSDTFVSHYYPSVVVLDASPKASYNQVEAGLTRLAKE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH TDSLIAMQHQEPGPEGTPIVTYTLFGKGELPNGLAEKVIEEPSRLSVENNYFILKGGLTV HHHHEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEEECCCCH ERLRDTLAGLGMTKMTMLKPSFLGTVVLIFSSGSQALGLVIFCLTFGALTLIGHIRALRT HHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGIRLISGERRWQIFLYPIRSDVCYCCLGLIFGFSLAAVMGQFMSFSPLVLYLIGIGLVC CCEEEEECCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH YNLLLVFIALFFAGLFAIGIKKVHLMQVIKGQIPVRGIISLILIGQLLAVLVVSFGASRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE LLYVQAERQQERGQAVWRQEDKLVTLLIGRDGLDIGNTKEAIAKQKTWFHVMDQAVSEHG EEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC AILSRHYLVERDLQSGLSMLTASSSWNDYSPQGNVLLVTPQYVKHQKVEVAPDISEKINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEECCCHHHHHHH LSLGEFVLLLPEHLKAQAAHYQSVFEAAVTGLASGEGHQPMTATVSCTKTGQERFLYNTT HCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEECCC PISYQQFLRDPIIVVLTPKSTGEQAYAFWEVALQNYFLFDQLADTQTLIKQNGIENWVGE CCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LKTGYRIYETLLNNLRREIWLMIAGAILGIATSMLMFNTMNLLYFEEFRRDIFIKRVSGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RFFELHRRYLLSQLLVFFVGLVISALLTQNPLMCLLVFFLFLRNAILLLYRQMRIENKMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE LLILKGA EEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA