| Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010981 |
| Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is gudP [C]
Identifier: 190571139
GI number: 190571139
Start: 804980
End: 806176
Strand: Direct
Name: gudP [C]
Synonym: WPa_0737
Alternate gene names: 190571139
Gene position: 804980-806176 (Clockwise)
Preceding gene: 190571138
Following gene: 190571140
Centisome position: 54.3
GC content: 33.42
Gene sequence:
>1197_bases ATGGAAAATAAAGCTTGGTTCATTTGGCTGATCAGCAACTTAATTGTTATATTCAGCAATATGCAGATAATCTACACCTT TATAAGTGTGAATCTTGAAAAAGAACTTGGGCTCACGATTGCGCAAGTTGCACTAGCTAATTCAGCATATACTTGGACTT TTGCTATCTCACAATTTTTTAGTGGGGCAATGTTTAATGTTTTTTCCAGCAAAAAAATTTATTTTTTCTCGTTGTCAATC ATGCTCTTTGGTTTTTTTGTCCTTATCAAGAGTGACAATTTTGCCCATTTAATTTTATCTCAATTTTTGATCGCAATTGG AGCATCGTTTGGTTTTGTTGGCGCTGCTCATGTAAGTAGCACATATTTTCCCCTTACTCAATTTGGACTGATGTTCTCAC TAGTGCAGACAATTTCAAGTCTTTCTGCTTTGATGATTCAAATGTGCTTCTCTAGCTTGCTTGCCGAAGGTGCAGATTGG AAAAATCTTATTGTATGCGTAATATTATTTGGCGTATCGATATTCGTACTTATGTTTTTTTATCCGAAAGGACTTTCAAA AAAAAATTTGGGGGAATACACAATAAAGAGCTCTATAAAAACAGTAATATGTTCTGTACTAACAGTGCTAAAATTAAGAG ATATCTGGATAACCTCAATAGTGGGTGCTATTACTTTTGGAACATTTTTAGCGCTTAATATGCTGTGGGCACCAAGGTTA CTAAGCAACTTAGAACTCAATACAATGGAGTTAGGTGTGGCAACTGCAATATTGTGGCTTGGTCTTGCAGTTGGTGCTCC AATTGCAGATCTAATCTCAAATCTATTTAAAAATAGAAGGCACGTAATCTCTGCTTTTGCCACATTGCAAAGTATTTCAG CTATTATTTTACTATGCGGTAATTTAACAGTTCATATTATATACTTTTGTATGTTAATGTTTGGTTTTTTTGCAGGAGGA CATATGCTTAATTTTACTGTTGGTAGTGAGATTGTTGAGCAGAAGTATATTAGCACATCATCATCCATTATCAATGGATT TATGTTTGTTATGAGTGGAATTTTAGTGTCAATTTTAGCACTTTTTTCAGATCATCAAATGGCGCTTTTCACAATATTTG CAATGTTAACATTTGCTAGTATTTTTAATTATGCTACAAAAGAAACATACTATAAAAATAAAGTAGCTGAATCTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTTCATAGCTTTTATATCATACTATAATTGCAACTGTTTTAACAATAATCAGAGCCTAAAAGAGGTTTATTATCAATG GACTATTTATAAAAAATCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTCGATTGTTATATTATATTAACATACTGTAATAAATTATGACAACAAAAGACACAACAGTAACTAAGGCAACAATAGCT GAATGTATAAACCAGGAAAT
Product: major facilitator family transporter
Products: NA
Alternate protein names: Facilitator Superfamily Transporter; Facilitator Family Transporter Transporter; Sugar Transporter; Facilitator Protein; Facilitator Transporter; Facilitator Superfamily Sugar Transporter; Sugar Phosphate Permease; Facilitator Membrane Proteins; Transporter MFS Superfamily
Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 398
Protein sequence:
>398_residues MENKAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAISQFFSGAMFNVFSSKKIYFFSLSI MLFGFFVLIKSDNFAHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHVSSTYFPLTQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMCFSSLLAEGADW KNLIVCVILFGVSIFVLMFFYPKGLSKKNLGEYTIKSSIKTVICSVLTVLKLRDIWITSIVGAITFGTFLALNMLWAPRL LSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFATLQSISAIILLCGNLTVHIIYFCMLMFGFFAGG HMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILALFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES
Sequences:
>Translated_398_residues MENKAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAISQFFSGAMFNVFSSKKIYFFSLSI MLFGFFVLIKSDNFAHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHVSSTYFPLTQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMCFSSLLAEGADW KNLIVCVILFGVSIFVLMFFYPKGLSKKNLGEYTIKSSIKTVICSVLTVLKLRDIWITSIVGAITFGTFLALNMLWAPRL LSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFATLQSISAIILLCGNLTVHIIYFCMLMFGFFAGG HMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILALFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES >Mature_398_residues MENKAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAISQFFSGAMFNVFSSKKIYFFSLSI MLFGFFVLIKSDNFAHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHVSSTYFPLTQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMCFSSLLAEGADW KNLIVCVILFGVSIFVLMFFYPKGLSKKNLGEYTIKSSIKTVICSVLTVLKLRDIWITSIVGAITFGTFLALNMLWAPRL LSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFATLQSISAIILLCGNLTVHIIYFCMLMFGFFAGG HMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILALFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES
Specific function: Uptake Of D-Glucarate. [C]
COG id: COG0477
COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily
Gene ontology:
Cell location: Integral Membrane Protein [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44226; Mature: 44226
Theoretical pI: Translated: 8.88; Mature: 8.88
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 4.3 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 4.3 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENKAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAISQFF CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH SGAMFNVFSSKKIYFFSLSIMLFGFFVLIKSDNFAHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHVSS CCHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCC TYFPLTQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMCFSSLLAEGADWKNLIVCVILFGVSIFVLMFF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPKGLSKKNLGEYTIKSSIKTVICSVLTVLKLRDIWITSIVGAITFGTFLALNMLWAPRL HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFATLQSISAIILLCG HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLTVHIIYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MENKAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAISQFF CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH SGAMFNVFSSKKIYFFSLSIMLFGFFVLIKSDNFAHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHVSS CCHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCC TYFPLTQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMCFSSLLAEGADWKNLIVCVILFGVSIFVLMFF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPKGLSKKNLGEYTIKSSIKTVICSVLTVLKLRDIWITSIVGAITFGTFLALNMLWAPRL HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFATLQSISAIILLCG HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLTVHIIYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA