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The map label for this gene is 18977726

Identifier: 18977726

GI number: 18977726

Start: 1271810

End: 1273066

Strand: Direct

Name: 18977726

Synonym: PF1354

Alternate gene names: NA

Gene position: 1271810-1273066 (Clockwise)

Preceding gene: 18977722

Following gene: 18977727

Centisome position: 66.65

GC content: 35.48

Gene sequence:

>1257_bases
ATGACTGAGAGTTTAAAGCTTAAACTTATTAAGAATGCAGCTTGGCTTTTTAGTGCTGATGTTATTTCAAAGTTATTAGC
TTATGGTGTAATAGTTATCTTGAGTAGAACTCTTGGTCCTGAAGGATTAGGGCAGTACTCTTTTATCTTCTACTATGTTG
GGCTTCTTAGCATATTTTCCGACTTTGGGGTGAGCTATTATTTCATGAGGGAGGTTGCTAGGGATAGGAATAAAGCTGAA
GAACTTTTGCCAGATATTTTGGGTCTTAAAATTGTTCTTGCTTTGGTTAATTTTGGTGTTATAGCTGTTTTAACGGTTTT
CCTTCCAAAGCCTATATGGATGAAAGTCCTGATATTATTAGTTGGAGCTGAAGCTGTTCTTATGTGGGTTTCCTATGTGT
TTGTAAATCTTATGTATGCCCACGAGGTCACGAAGTACGAAGCCATAGCGAGAACGATTGAAAGAGTTTGGGCATTTTTT
GTTGGGGGAGCTGTTCTTTACCTTTATAAGTCTTTGTCGCCCTTTATAATTGCTCTTCTTGTTGGTTATACGATAAGAGA
ATCCCTTAGAGTAAAATGGGGGAGTAATTTCATTAAAAACGTTAAGATATACTTTAGGCCAAAAATGTGGATTTTTCTTT
TGAAAAAGAGTTATCCATTTTGGCTAATTGGTATCTTTACTATGATTTACTATCGTACTGATATGGTAATGCTTAGCTTG
ATGAAGGGAGATTATGAAACTGGAATCTATAGAGTGGCCTATACTTTAATTGAGGTCTCTCTATTTGTGCCGAATATTGT
TGTCTCTACAACGATGCCTTCAATGGCCAGGTTATGGAAAGAAGATAGAAGAACCCTAAATACTCTCCTGAAAAGGAGTA
TACAGATGCTTGTAGGATTGGGAGTTTTAGCTTTGGCAGGATATTATATTTTTGCTCGTTTGGGAATTCTTATTATATTT
GGCAAAAAGTTTCTTACAAGTGTTCCAGTACTTAGAATTCTTGCTTTTGCAGTACCTTTTATGTTTTTAAGTTCTCTTTT
TGGGAGCTTTTTAAATGCAACCGGGAATGAATTAGTATTTACTAAAATAACAGGTTTAACGGCTTTATTAAATGTTCTAC
TTAATTATGTTCTGATTCTAAACTATGGTGCTGAAGGAGCAGCCATAGCAACAGTGTGCACACAAGGGCTTGCAGTTCTC
TTTTCGATTTTCTCTGTAAAAAATACTTTTAAGCAAGAAAGTTATCAAGTGTTCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAACATTAAGAGTTAGTTTCTGGAGCACTTAGCTAAACTTATTGAGCTTGATTAGCCTTGCATTAAGTTTTTAATCTCTC
CTCCTCATTAGGTAGTTGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTGGTTTGATGAGAGTTTCGGTTGTTGGCTCTGGTTATGTTGGGCTTGTCACAGGGATAGGTTTTGTCAAGCTTGGGAA
TAGCGTTATCTTCGTTGATG

Product: putative oligosaccharide transporter

Products: NA

Alternate protein names: Lipopolysaccharide O-Side Chain Biosynthesis Protein; Oligosaccharide Transporter; Polysaccharide Biosynthesis Family Protein; Capsular Polysaccharide Biosynthesis Protein; O-Antigen And Teichoic Acid Export Protein; LPS Biosynthesis Related Polysaccharide Transporter; O-Antigen Transporter Related Protein; Lipopolysaccharide Biosynthesis Protein; Heteropolysaccharide Repeat-Containing Protein; Lipopolysaccharide/O-Antigen Transporter; MatE Family; O-Antigen Flippase

Number of amino acids: Translated: 418; Mature: 417

Protein sequence:

>418_residues
MTESLKLKLIKNAAWLFSADVISKLLAYGVIVILSRTLGPEGLGQYSFIFYYVGLLSIFSDFGVSYYFMREVARDRNKAE
ELLPDILGLKIVLALVNFGVIAVLTVFLPKPIWMKVLILLVGAEAVLMWVSYVFVNLMYAHEVTKYEAIARTIERVWAFF
VGGAVLYLYKSLSPFIIALLVGYTIRESLRVKWGSNFIKNVKIYFRPKMWIFLLKKSYPFWLIGIFTMIYYRTDMVMLSL
MKGDYETGIYRVAYTLIEVSLFVPNIVVSTTMPSMARLWKEDRRTLNTLLKRSIQMLVGLGVLALAGYYIFARLGILIIF
GKKFLTSVPVLRILAFAVPFMFLSSLFGSFLNATGNELVFTKITGLTALLNVLLNYVLILNYGAEGAAIATVCTQGLAVL
FSIFSVKNTFKQESYQVF

Sequences:

>Translated_418_residues
MTESLKLKLIKNAAWLFSADVISKLLAYGVIVILSRTLGPEGLGQYSFIFYYVGLLSIFSDFGVSYYFMREVARDRNKAE
ELLPDILGLKIVLALVNFGVIAVLTVFLPKPIWMKVLILLVGAEAVLMWVSYVFVNLMYAHEVTKYEAIARTIERVWAFF
VGGAVLYLYKSLSPFIIALLVGYTIRESLRVKWGSNFIKNVKIYFRPKMWIFLLKKSYPFWLIGIFTMIYYRTDMVMLSL
MKGDYETGIYRVAYTLIEVSLFVPNIVVSTTMPSMARLWKEDRRTLNTLLKRSIQMLVGLGVLALAGYYIFARLGILIIF
GKKFLTSVPVLRILAFAVPFMFLSSLFGSFLNATGNELVFTKITGLTALLNVLLNYVLILNYGAEGAAIATVCTQGLAVL
FSIFSVKNTFKQESYQVF
>Mature_417_residues
TESLKLKLIKNAAWLFSADVISKLLAYGVIVILSRTLGPEGLGQYSFIFYYVGLLSIFSDFGVSYYFMREVARDRNKAEE
LLPDILGLKIVLALVNFGVIAVLTVFLPKPIWMKVLILLVGAEAVLMWVSYVFVNLMYAHEVTKYEAIARTIERVWAFFV
GGAVLYLYKSLSPFIIALLVGYTIRESLRVKWGSNFIKNVKIYFRPKMWIFLLKKSYPFWLIGIFTMIYYRTDMVMLSLM
KGDYETGIYRVAYTLIEVSLFVPNIVVSTTMPSMARLWKEDRRTLNTLLKRSIQMLVGLGVLALAGYYIFARLGILIIFG
KKFLTSVPVLRILAFAVPFMFLSSLFGSFLNATGNELVFTKITGLTALLNVLLNYVLILNYGAEGAAIATVCTQGLAVLF
SIFSVKNTFKQESYQVF

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47388; Mature: 47256

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TESLKLKLIKNAAWLFSADVISKLLAYGVIVILSRTLGPEGLGQYSFIFYYVGLLSIFS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DFGVSYYFMREVARDRNKAEELLPDILGLKIVLALVNFGVIAVLTVFLPKPIWMKVLILL
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
VGAEAVLMWVSYVFVNLMYAHEVTKYEAIARTIERVWAFFVGGAVLYLYKSLSPFIIALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGYTIRESLRVKWGSNFIKNVKIYFRPKMWIFLLKKSYPFWLIGIFTMIYYRTDMVMLSL
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEEEEECHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MKGDYETGIYRVAYTLIEVSLFVPNIVVSTTMPSMARLWKEDRRTLNTLLKRSIQMLVGL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVLALAGYYIFARLGILIIFGKKFLTSVPVLRILAFAVPFMFLSSLFGSFLNATGNELVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
TKITGLTALLNVLLNYVLILNYGAEGAAIATVCTQGLAVLFSIFSVKNTFKQESYQVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA