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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 188585617

GI number: 188585617

Start: 1052786

End: 1054399

Strand: Direct

Name: cstA [H]

Synonym: Nther_0990

Alternate gene names: 188585617

Gene position: 1052786-1054399 (Clockwise)

Preceding gene: 188585616

Following gene: 188585618

Centisome position: 33.26

GC content: 38.97

Gene sequence:

>1614_bases
ATGGGTATTTTTGGCTATTTGATTGGTTCTTGGGCCGTGTTGTTAGTTGCACACAAGGCTTTAAAAAAGCCTGTAGAAGG
AATCGCCAAGGTTGACCCCACAGCAGAAACAATAGCTCACACTATGTATGATGGAGTAGATTATACTCCTCAGAACAAGT
ATGTGTTATTTGGACACCACTGGATGTCTATAGCTGGTACTACTGCGATTTTTGCTTCGATTACAGGCTTGATTTGGGGT
TGGCTGCCCTCATTAATTTGGATGCTAGTGGGTGTACACTTTGCTGGGGCAACTACTGATTATTTTGCGGGCATGTATGC
GGTTAAGAACCAGGGAAAGTCTATGGGCGAGCTAGCTTCTGAAAAAATTCACGAGAGAACTGGGACTTTATTAACAGTAC
TGTACTTTTTAGCTGGATTAATGGTAACCAGTATGTTTATTGAAGTTATGGCAGATACTGTGGTAGGTGTTCCCGAAGCA
GGTTTACCAATATTACTACTAATTCCCGTGGCCATGTTATTCGGAGTAACAATTAAAAAAGGGTTTCCTCTTGGACCGAC
TACAGCCGTTTTTGTAATACTGCTATTGATAGTTGTAGGTATAGGGGCTAATTTCCCTCTTAACCTGTCTGTGAATGCTT
GGATGGCTGTTTTTATATTTTATACACTTGGCGCTATTACCATACCCGTTTGGGTTTTGCTATCTCCCAGAGACTATCTA
AATACTGTGCTTGTTATCGGAGGATTAATTTTAGGAGCTTCAGCCATGTTAATCTTTAGACCAGAAGTACAGTTACCTAT
GTACACATCTTTTTTTACAGAACGTGGTCCCCTTTGGCCCATGATAATGGCAACAATCACGTGTGGAGCAGCTAGTGGAG
TGCATCAACTAATTGCATTCGGCACAACAGCCAGACAATTAGAAAAAGAAAAAGATGGCTATTTTGTTATGTTTGGTGGT
ATGCAAGGAGAAACTTTTATGGCAGTTGTTTCGGCAGCTATGATCATGACTTTTTTCTCATATGATGGGTTCATGGAAAG
TGCTTATCCCGATCCCGGAGGCGCGTTTTCTAACGCTTTAGCTAATGCTTTAGAATTATATGGTCTAGATCCCGTTTGGG
GAGGAACCATTGGCGCTTTAACATTTGGAGCATTATTATTAACAACATTGGATTCATGGGCGAGAAATGGTCGATACTTA
CTTCAAGAGCTCACCTGGAACTATTTTGGTAAAAGCAGAATAATTACAAGTATTGTGTTTATGATTATTGCAGTAATAGT
ACTTTTTTATACGCCGGTCATGGACCTTTGGTCAGGAATAGCGTTAGGTTCTATTACCTTACTTACAGTTCCTTTGAGTC
TTTTGATAATTGATCGACTTGAAAGTGGAGAGGTTTTTGACAGAAACTTCAAGATTTTTGTAGTAGCTCCGTTAATAGTT
ATATATCCATCGGCTTTAGCTGCAGTCATTTACGAATTATATCGTTTTGTAGTTGAACAAAATTGGCTCAGTTTTGTTTT
AATGGTCTTTATGGCATATGTAATTGTTAGTATGGCATATTACAGTATCTCTAAAATTTTAAGATTGCTTAAAGAGAGAA
AAGCAGAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTAATATAAATATCAATAAAAATGAAATGGAAATTGAAATGAAAGCGAGGTGGTACTAGAAGTAGTAAGACCATTCCAT
TTAAAAAGGGAGGTTTATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTTAAAAGAGAAATTAGCCCAAAAAGCAGTAAGAATTATTCTAAATTTAGCAAAATTATAGAAAAGGGTCCCTTAC
ATAGGACCCTTTCTATAATT

Product: carbon starvation protein CstA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 536

Protein sequence:

>537_residues
MGIFGYLIGSWAVLLVAHKALKKPVEGIAKVDPTAETIAHTMYDGVDYTPQNKYVLFGHHWMSIAGTTAIFASITGLIWG
WLPSLIWMLVGVHFAGATTDYFAGMYAVKNQGKSMGELASEKIHERTGTLLTVLYFLAGLMVTSMFIEVMADTVVGVPEA
GLPILLLIPVAMLFGVTIKKGFPLGPTTAVFVILLLIVVGIGANFPLNLSVNAWMAVFIFYTLGAITIPVWVLLSPRDYL
NTVLVIGGLILGASAMLIFRPEVQLPMYTSFFTERGPLWPMIMATITCGAASGVHQLIAFGTTARQLEKEKDGYFVMFGG
MQGETFMAVVSAAMIMTFFSYDGFMESAYPDPGGAFSNALANALELYGLDPVWGGTIGALTFGALLLTTLDSWARNGRYL
LQELTWNYFGKSRIITSIVFMIIAVIVLFYTPVMDLWSGIALGSITLLTVPLSLLIIDRLESGEVFDRNFKIFVVAPLIV
IYPSALAAVIYELYRFVVEQNWLSFVLMVFMAYVIVSMAYYSISKILRLLKERKAEI

Sequences:

>Translated_537_residues
MGIFGYLIGSWAVLLVAHKALKKPVEGIAKVDPTAETIAHTMYDGVDYTPQNKYVLFGHHWMSIAGTTAIFASITGLIWG
WLPSLIWMLVGVHFAGATTDYFAGMYAVKNQGKSMGELASEKIHERTGTLLTVLYFLAGLMVTSMFIEVMADTVVGVPEA
GLPILLLIPVAMLFGVTIKKGFPLGPTTAVFVILLLIVVGIGANFPLNLSVNAWMAVFIFYTLGAITIPVWVLLSPRDYL
NTVLVIGGLILGASAMLIFRPEVQLPMYTSFFTERGPLWPMIMATITCGAASGVHQLIAFGTTARQLEKEKDGYFVMFGG
MQGETFMAVVSAAMIMTFFSYDGFMESAYPDPGGAFSNALANALELYGLDPVWGGTIGALTFGALLLTTLDSWARNGRYL
LQELTWNYFGKSRIITSIVFMIIAVIVLFYTPVMDLWSGIALGSITLLTVPLSLLIIDRLESGEVFDRNFKIFVVAPLIV
IYPSALAAVIYELYRFVVEQNWLSFVLMVFMAYVIVSMAYYSISKILRLLKERKAEI
>Mature_536_residues
GIFGYLIGSWAVLLVAHKALKKPVEGIAKVDPTAETIAHTMYDGVDYTPQNKYVLFGHHWMSIAGTTAIFASITGLIWGW
LPSLIWMLVGVHFAGATTDYFAGMYAVKNQGKSMGELASEKIHERTGTLLTVLYFLAGLMVTSMFIEVMADTVVGVPEAG
LPILLLIPVAMLFGVTIKKGFPLGPTTAVFVILLLIVVGIGANFPLNLSVNAWMAVFIFYTLGAITIPVWVLLSPRDYLN
TVLVIGGLILGASAMLIFRPEVQLPMYTSFFTERGPLWPMIMATITCGAASGVHQLIAFGTTARQLEKEKDGYFVMFGGM
QGETFMAVVSAAMIMTFFSYDGFMESAYPDPGGAFSNALANALELYGLDPVWGGTIGALTFGALLLTTLDSWARNGRYLL
QELTWNYFGKSRIITSIVFMIIAVIVLFYTPVMDLWSGIALGSITLLTVPLSLLIIDRLESGEVFDRNFKIFVVAPLIVI
YPSALAAVIYELYRFVVEQNWLSFVLMVFMAYVIVSMAYYSISKILRLLKERKAEI

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=334, Percent_Identity=34.1317365269461, Blast_Score=176, Evalue=4e-45,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=348, Percent_Identity=31.3218390804598, Blast_Score=169, Evalue=3e-43,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58947; Mature: 58816

Theoretical pI: Translated: 6.17; Mature: 6.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGIFGYLIGSWAVLLVAHKALKKPVEGIAKVDPTAETIAHTMYDGVDYTPQNKYVLFGHH
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECH
WMSIAGTTAIFASITGLIWGWLPSLIWMLVGVHFAGATTDYFAGMYAVKNQGKSMGELAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
EKIHERTGTLLTVLYFLAGLMVTSMFIEVMADTVVGVPEAGLPILLLIPVAMLFGVTIKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GFPLGPTTAVFVILLLIVVGIGANFPLNLSVNAWMAVFIFYTLGAITIPVWVLLSPRDYL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHH
NTVLVIGGLILGASAMLIFRPEVQLPMYTSFFTERGPLWPMIMATITCGAASGVHQLIAF
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
GTTARQLEKEKDGYFVMFGGMQGETFMAVVSAAMIMTFFSYDGFMESAYPDPGGAFSNAL
CHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHH
ANALELYGLDPVWGGTIGALTFGALLLTTLDSWARNGRYLLQELTWNYFGKSRIITSIVF
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIIAVIVLFYTPVMDLWSGIALGSITLLTVPLSLLIIDRLESGEVFDRNFKIFVVAPLIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEEHHHHH
IYPSALAAVIYELYRFVVEQNWLSFVLMVFMAYVIVSMAYYSISKILRLLKERKAEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GIFGYLIGSWAVLLVAHKALKKPVEGIAKVDPTAETIAHTMYDGVDYTPQNKYVLFGHH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECH
WMSIAGTTAIFASITGLIWGWLPSLIWMLVGVHFAGATTDYFAGMYAVKNQGKSMGELAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
EKIHERTGTLLTVLYFLAGLMVTSMFIEVMADTVVGVPEAGLPILLLIPVAMLFGVTIKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GFPLGPTTAVFVILLLIVVGIGANFPLNLSVNAWMAVFIFYTLGAITIPVWVLLSPRDYL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHH
NTVLVIGGLILGASAMLIFRPEVQLPMYTSFFTERGPLWPMIMATITCGAASGVHQLIAF
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
GTTARQLEKEKDGYFVMFGGMQGETFMAVVSAAMIMTFFSYDGFMESAYPDPGGAFSNAL
CHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHH
ANALELYGLDPVWGGTIGALTFGALLLTTLDSWARNGRYLLQELTWNYFGKSRIITSIVF
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIIAVIVLFYTPVMDLWSGIALGSITLLTVPLSLLIIDRLESGEVFDRNFKIFVVAPLIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEEHHHHH
IYPSALAAVIYELYRFVVEQNWLSFVLMVFMAYVIVSMAYYSISKILRLLKERKAEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9537320 [H]