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The map label for this gene is betT [C]

Identifier: 188585238

GI number: 188585238

Start: 624022

End: 625776

Strand: Direct

Name: betT [C]

Synonym: Nther_0600

Alternate gene names: 188585238

Gene position: 624022-625776 (Clockwise)

Preceding gene: 188585237

Following gene: 188585243

Centisome position: 19.71

GC content: 37.83

Gene sequence:

>1755_bases
ATGGAAAAAATTGAGGTTAGTAAAAAAGAACTCGAAAAAAAGTTATTCGACAGAAACTACACAAAGTACGGTCTTGACTT
AAATCCAGTTGTTTCCTTTGGAAGTGGAATTTTTATTATCTTGTTTTCACTGTATGCTCTGTTGGATCTCGATAGAGCCA
ATCAAGTTTTTCAATTTGTTAACGAAACAATTGTAACTCGATTTGATTGGGTATTTATTATGTCAAGTAATTTTTTTATC
TTAGTTTGTCTATATCTGGCCTTTTCCAAGCTTGGTAATGTTAAAATAGGTGGCCTTAACAGTGAACCGGAATTTTCTAA
TTTTGCTTGGTATTCAATGCTTATTTCAGCAGGTATGGGAATAGGATTGATGTTTTGGGCTGTAGGTGAACCTCTCCATC
ATTTCATGGAAGCCCCGCCAATCTTCACAAGTACCAGTGCTGATAAAGCAGCCCTTGCTACTACTTTCTTTCATTGGGGA
TTGCATCCCTGGGGGGTCTATGCCTTATTAGCTTTAGCTCTAGCTTTTTTTGCATATAATAGGAAGCTGCCTTTATCACT
TAGGTCGGTATTCTATCCTCTATTTAAAGAAAAAGTGTACGGTACCCTGGGAGATGTAATTGACACCTTTGCCGTGTTAT
CGACATTGTTTGGACTAGCTACTTCTTTGGGACTAGGAATCAAGCAAATCAATAGTGGTCTCGATTACTTATTCGGAATA
GGTTTTAATGTACAAATGCAGGTAACTTTAATAGCCATTATCACTTTATTGGCTACTATATCTGTAATTTCAGGGATTCA
CAAAGGTGTCAGGTTTTTGTCAGAACTTAACATAAGACTAGCCTTTATATTTATGATTGCAATATTTTTATTAGGACCGA
CTACTTATATTCTGCGTTTATTTTCAAACTCTGTAGGCCTATATTTCAGTAATATTGTAGAATATGCTTCCTTTATTAAC
ATTGATGGGGGAAGCTGGCAGGGAGATTGGTCTATATTTTATTTGGCCTGGTGGATTTCCTGGTCCCCCTTTGTTGGAAT
GTTCATTGCTAGAATTTCTCGCGGAAGAACTATCAGAGAATTTATCTTAGGTGTTTTGATTGTTCCTTCCCTGCTGTCTT
TCTTCTGGTTGTCTGTTTTTGGGGGTACTTCCATTTTTTTAGATGGACAAGCAGGTGGAGCTTTATTTGAGACAGTACAA
GACGATTATCCTGTGGCTTTATTTGAAATGATCGATTTACTACCAATGCCATTTTTGGCTGGAGCACTGCGGGTATTAAT
GTTTATTTTAGTGATAGCGCTAGTATCATCTTATTTTGTCACATCTTCTGATTCGGGCTCATTGGTAGTAGACAAAATTA
CATCTAGCGGCAAAATCAACACACCTAAAAAACAAAGAGTTTTTTGGGCCTGTCTGGAGGGACTAGTTGCTGCTACACTG
TTACTGATCGGTGGTGAAAAGGCGCTGGATACTCTACAGACGGCCGTTATCAGTGCTGGACTACCCTTGGCTTTTATTTT
GACAGTTATGGCCATTTCATTAATTAAAGGAATCACCGTTACCCATAAAAAGCAGAAAAAGATCAGGGATAAAAGAAAAT
TTGAAGAACTCTTTGAAGATCTTGAAGAAGAACGGGAACAGGATCAGGAGCAAGGGGAAGGACAGCATACGAGTGAAACT
GAAACAGCAGTTAAAAAAACAGATCATCAAGCTGAACCAGAAGTATCACCTAATGTTACACCACCACAAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGACATCCCATAACCTTTAAAATATAATCCCAAATGTACTTAACAAAGGCGATGGTGGCAACTATTTCCAAAACAAAAA
AGAAGGGGTTTGAGATTTGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAAGATAAAAAGTTAAAACCAAAAGGTTCTAGAACATTGGTGATTATAAATTCCTGAATAACCAATATGATATCAGTGA
CATTAGGTATAGGAGCTCCA

Product: choline/carnitine/betaine transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 584; Mature: 584

Protein sequence:

>584_residues
MEKIEVSKKELEKKLFDRNYTKYGLDLNPVVSFGSGIFIILFSLYALLDLDRANQVFQFVNETIVTRFDWVFIMSSNFFI
LVCLYLAFSKLGNVKIGGLNSEPEFSNFAWYSMLISAGMGIGLMFWAVGEPLHHFMEAPPIFTSTSADKAALATTFFHWG
LHPWGVYALLALALAFFAYNRKLPLSLRSVFYPLFKEKVYGTLGDVIDTFAVLSTLFGLATSLGLGIKQINSGLDYLFGI
GFNVQMQVTLIAIITLLATISVISGIHKGVRFLSELNIRLAFIFMIAIFLLGPTTYILRLFSNSVGLYFSNIVEYASFIN
IDGGSWQGDWSIFYLAWWISWSPFVGMFIARISRGRTIREFILGVLIVPSLLSFFWLSVFGGTSIFLDGQAGGALFETVQ
DDYPVALFEMIDLLPMPFLAGALRVLMFILVIALVSSYFVTSSDSGSLVVDKITSSGKINTPKKQRVFWACLEGLVAATL
LLIGGEKALDTLQTAVISAGLPLAFILTVMAISLIKGITVTHKKQKKIRDKRKFEELFEDLEEEREQDQEQGEGQHTSET
ETAVKKTDHQAEPEVSPNVTPPQD

Sequences:

>Translated_584_residues
MEKIEVSKKELEKKLFDRNYTKYGLDLNPVVSFGSGIFIILFSLYALLDLDRANQVFQFVNETIVTRFDWVFIMSSNFFI
LVCLYLAFSKLGNVKIGGLNSEPEFSNFAWYSMLISAGMGIGLMFWAVGEPLHHFMEAPPIFTSTSADKAALATTFFHWG
LHPWGVYALLALALAFFAYNRKLPLSLRSVFYPLFKEKVYGTLGDVIDTFAVLSTLFGLATSLGLGIKQINSGLDYLFGI
GFNVQMQVTLIAIITLLATISVISGIHKGVRFLSELNIRLAFIFMIAIFLLGPTTYILRLFSNSVGLYFSNIVEYASFIN
IDGGSWQGDWSIFYLAWWISWSPFVGMFIARISRGRTIREFILGVLIVPSLLSFFWLSVFGGTSIFLDGQAGGALFETVQ
DDYPVALFEMIDLLPMPFLAGALRVLMFILVIALVSSYFVTSSDSGSLVVDKITSSGKINTPKKQRVFWACLEGLVAATL
LLIGGEKALDTLQTAVISAGLPLAFILTVMAISLIKGITVTHKKQKKIRDKRKFEELFEDLEEEREQDQEQGEGQHTSET
ETAVKKTDHQAEPEVSPNVTPPQD
>Mature_584_residues
MEKIEVSKKELEKKLFDRNYTKYGLDLNPVVSFGSGIFIILFSLYALLDLDRANQVFQFVNETIVTRFDWVFIMSSNFFI
LVCLYLAFSKLGNVKIGGLNSEPEFSNFAWYSMLISAGMGIGLMFWAVGEPLHHFMEAPPIFTSTSADKAALATTFFHWG
LHPWGVYALLALALAFFAYNRKLPLSLRSVFYPLFKEKVYGTLGDVIDTFAVLSTLFGLATSLGLGIKQINSGLDYLFGI
GFNVQMQVTLIAIITLLATISVISGIHKGVRFLSELNIRLAFIFMIAIFLLGPTTYILRLFSNSVGLYFSNIVEYASFIN
IDGGSWQGDWSIFYLAWWISWSPFVGMFIARISRGRTIREFILGVLIVPSLLSFFWLSVFGGTSIFLDGQAGGALFETVQ
DDYPVALFEMIDLLPMPFLAGALRVLMFILVIALVSSYFVTSSDSGSLVVDKITSSGKINTPKKQRVFWACLEGLVAATL
LLIGGEKALDTLQTAVISAGLPLAFILTVMAISLIKGITVTHKKQKKIRDKRKFEELFEDLEEEREQDQEQGEGQHTSET
ETAVKKTDHQAEPEVSPNVTPPQD

Specific function: High-Affinity Uptake Of Choline Driven By A Proton- Motive Force. [C]

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=567, Percent_Identity=34.0388007054674, Blast_Score=333, Evalue=2e-92,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=501, Percent_Identity=29.1417165668663, Blast_Score=198, Evalue=6e-52,
Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=445, Percent_Identity=28.0898876404494, Blast_Score=164, Evalue=1e-41,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65090; Mature: 65090

Theoretical pI: Translated: 5.70; Mature: 5.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]