| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is 188584990
Identifier: 188584990
GI number: 188584990
Start: 362662
End: 364212
Strand: Direct
Name: 188584990
Synonym: Nther_0350
Alternate gene names: NA
Gene position: 362662-364212 (Clockwise)
Preceding gene: 188584989
Following gene: 188584993
Centisome position: 11.46
GC content: 30.43
Gene sequence:
>1551_bases ATGAGTGCCGTTAAAGCGTTACTATATTTGGAAAAAAGAAGTATAATTAATCGTATTAAAGAAGCTAAAAAATTTAAACT TCAAGTATTAGGAATGCTGTTGTTTGGAATAGCTGTTATTTTTTCTTTTGTTAGTTCAAACTATTCGCATTCTACTGATA TTTCTGAATGGTTTGTGATTTATAGCGAGGAACTAATATATTTGTTAATTATAATAACTATTGGACTAAATATCGCTATT GGAAGTAAGCGAATTCCGTTACAGGTCCCGTATGCTAGCAATCAATTGATTTTTGAAATCACCTCTTCTACCAAAATTAT TATTGGATACTTTTTTGGAAAGCAGTTATTGTTTAATGTTATAACAACACTTGTCGCTACATATGCTCTGATTATTTTTT TAACGGATGGAATTTTAACTACTGGGATGGTAATAACATGGCTTGGGCTGTTACTATTAAATATTTGGAGCCAAAGTCTT GCTTTACTAACCTATGGAATCAAAAAAAGGTTTAATATTAACATAGAACTGATTTTTATAATAATTGGAGTTTCTATAGG TTCCTATGTTTTAACTAAACTTATTATAGATGGTCCTACTAGTTTGATTGAAACATGGGGAGAACTAATCAATAATTTTC TTTGGCCTTTGGAATGGCTATTCAACTTGATAAGTTTTGGTTTCTTCACAAGACTAGACTTACCTTATATTGATATACTT CTAGGCATCATTCTCATAGGTTTGACAATTGTACTTGCTTTTAAATGTTTACCAAATTCTAGGGAACCTATTATAACAGC AATGTTATCTTCTCAACGTATTTCAGAATCTACCAATGATGAAATGGATATTCAGGAGGCTTTGATGACTATATCACGAC CGAATCCAGGACAGTTGATTTCCAGGTTAAATATTGGAACTGGTTTTTTAAGTGCTATTGTCTGGAAAGATTTAATATAT TGGGAGCGGTTAAAACTAAATGAACTGAAATTAGTTTTAATTGCTGTGACTGTTGTTAGTGGTGGATTAGGGTGGATCGT AGCTTATTTTAATCTATCTATGTGGCTAATATTATTACCTATCATTTATAGTAGTTGGAATGGAGGAAAGGCTGCTATAG AATTGAAGCGCTTATTAATTTACCAACTACCGACAAAAGGATGGAAGAAAATTCTATCAGTAAGTATTTTCCCTATTATT GAAAACATATTAAATCACATAATAGCGATAATTGTTTTCGGGACTTTTGTGTTTTTGGGATCAGGGAACTTAGAGTTTCA AAAATTGTTCAGCATTTTAATAGTGGGGATTGGTATGAACATTTTACTGACAATTCTTGGGTTAATTGTTAACTTAGCTA CTATTGACTTAATTGGTTTTTATAGAAAAATCATTCAATTACTAATTATGGCTTTACACTTCACAACCATTATTGCAATA GCTAATTTAGTATTATGGAATCCTTTAGTGATTAATTTGTTGATCGGTTTAATATTACTTTATTCTTTTGTTTTTCTTAT ATTCACTAGTAAGTGGTGTTTAAAACTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGACAATTAATTAGAGATCAAAGTAAGGAAAGCATAATGGCTGAACTTAAAAAGAAAGATTATTTATCAATCGAGGATCT CTTCTTGGAGGTAACTGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATTAAAACTAGAAATTAATAAGATATATACTATAAACTCTAACTACAAATATTTACTAACATTATAACTATATTAAA AAAGGATCAAGAAAAACACC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515
Protein sequence:
>516_residues MSAVKALLYLEKRSIINRIKEAKKFKLQVLGMLLFGIAVIFSFVSSNYSHSTDISEWFVIYSEELIYLLIIITIGLNIAI GSKRIPLQVPYASNQLIFEITSSTKIIIGYFFGKQLLFNVITTLVATYALIIFLTDGILTTGMVITWLGLLLLNIWSQSL ALLTYGIKKRFNINIELIFIIIGVSIGSYVLTKLIIDGPTSLIETWGELINNFLWPLEWLFNLISFGFFTRLDLPYIDIL LGIILIGLTIVLAFKCLPNSREPIITAMLSSQRISESTNDEMDIQEALMTISRPNPGQLISRLNIGTGFLSAIVWKDLIY WERLKLNELKLVLIAVTVVSGGLGWIVAYFNLSMWLILLPIIYSSWNGGKAAIELKRLLIYQLPTKGWKKILSVSIFPII ENILNHIIAIIVFGTFVFLGSGNLEFQKLFSILIVGIGMNILLTILGLIVNLATIDLIGFYRKIIQLLIMALHFTTIIAI ANLVLWNPLVINLLIGLILLYSFVFLIFTSKWCLKL
Sequences:
>Translated_516_residues MSAVKALLYLEKRSIINRIKEAKKFKLQVLGMLLFGIAVIFSFVSSNYSHSTDISEWFVIYSEELIYLLIIITIGLNIAI GSKRIPLQVPYASNQLIFEITSSTKIIIGYFFGKQLLFNVITTLVATYALIIFLTDGILTTGMVITWLGLLLLNIWSQSL ALLTYGIKKRFNINIELIFIIIGVSIGSYVLTKLIIDGPTSLIETWGELINNFLWPLEWLFNLISFGFFTRLDLPYIDIL LGIILIGLTIVLAFKCLPNSREPIITAMLSSQRISESTNDEMDIQEALMTISRPNPGQLISRLNIGTGFLSAIVWKDLIY WERLKLNELKLVLIAVTVVSGGLGWIVAYFNLSMWLILLPIIYSSWNGGKAAIELKRLLIYQLPTKGWKKILSVSIFPII ENILNHIIAIIVFGTFVFLGSGNLEFQKLFSILIVGIGMNILLTILGLIVNLATIDLIGFYRKIIQLLIMALHFTTIIAI ANLVLWNPLVINLLIGLILLYSFVFLIFTSKWCLKL >Mature_515_residues SAVKALLYLEKRSIINRIKEAKKFKLQVLGMLLFGIAVIFSFVSSNYSHSTDISEWFVIYSEELIYLLIIITIGLNIAIG SKRIPLQVPYASNQLIFEITSSTKIIIGYFFGKQLLFNVITTLVATYALIIFLTDGILTTGMVITWLGLLLLNIWSQSLA LLTYGIKKRFNINIELIFIIIGVSIGSYVLTKLIIDGPTSLIETWGELINNFLWPLEWLFNLISFGFFTRLDLPYIDILL GIILIGLTIVLAFKCLPNSREPIITAMLSSQRISESTNDEMDIQEALMTISRPNPGQLISRLNIGTGFLSAIVWKDLIYW ERLKLNELKLVLIAVTVVSGGLGWIVAYFNLSMWLILLPIIYSSWNGGKAAIELKRLLIYQLPTKGWKKILSVSIFPIIE NILNHIIAIIVFGTFVFLGSGNLEFQKLFSILIVGIGMNILLTILGLIVNLATIDLIGFYRKIIQLLIMALHFTTIIAIA NLVLWNPLVINLLIGLILLYSFVFLIFTSKWCLKL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58181; Mature: 58050
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSAVKALLYLEKRSIINRIKEAKKFKLQVLGMLLFGIAVIFSFVSSNYSHSTDISEWFVI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH YSEELIYLLIIITIGLNIAIGSKRIPLQVPYASNQLIFEITSSTKIIIGYFFGKQLLFNV HHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHH ITTLVATYALIIFLTDGILTTGMVITWLGLLLLNIWSQSLALLTYGIKKRFNINIELIFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE IIGVSIGSYVLTKLIIDGPTSLIETWGELINNFLWPLEWLFNLISFGFFTRLDLPYIDIL EHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH LGIILIGLTIVLAFKCLPNSREPIITAMLSSQRISESTNDEMDIQEALMTISRPNPGQLI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHH SRLNIGTGFLSAIVWKDLIYWERLKLNELKLVLIAVTVVSGGLGWIVAYFNLSMWLILLP HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYSSWNGGKAAIELKRLLIYQLPTKGWKKILSVSIFPIIENILNHIIAIIVFGTFVFLG HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SGNLEFQKLFSILIVGIGMNILLTILGLIVNLATIDLIGFYRKIIQLLIMALHFTTIIAI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANLVLWNPLVINLLIGLILLYSFVFLIFTSKWCLKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SAVKALLYLEKRSIINRIKEAKKFKLQVLGMLLFGIAVIFSFVSSNYSHSTDISEWFVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH YSEELIYLLIIITIGLNIAIGSKRIPLQVPYASNQLIFEITSSTKIIIGYFFGKQLLFNV HHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHH ITTLVATYALIIFLTDGILTTGMVITWLGLLLLNIWSQSLALLTYGIKKRFNINIELIFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE IIGVSIGSYVLTKLIIDGPTSLIETWGELINNFLWPLEWLFNLISFGFFTRLDLPYIDIL EHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH LGIILIGLTIVLAFKCLPNSREPIITAMLSSQRISESTNDEMDIQEALMTISRPNPGQLI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHH SRLNIGTGFLSAIVWKDLIYWERLKLNELKLVLIAVTVVSGGLGWIVAYFNLSMWLILLP HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYSSWNGGKAAIELKRLLIYQLPTKGWKKILSVSIFPIIENILNHIIAIIVFGTFVFLG HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SGNLEFQKLFSILIVGIGMNILLTILGLIVNLATIDLIGFYRKIIQLLIMALHFTTIIAI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANLVLWNPLVINLLIGLILLYSFVFLIFTSKWCLKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA