| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 187935658
GI number: 187935658
Start: 2542627
End: 2544159
Strand: Reverse
Name: mviN [H]
Synonym: CLL_A2458
Alternate gene names: 187935658
Gene position: 2544159-2542627 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187934932
Following gene: 187934514
Centisome position: 66.95
GC content: 24.27
Gene sequence:
>1533_bases ATGAAGAAGAATGCTTTGTTAAAATCTACTTTAATAATAATGATAGTATCATGTATAAGTAGAATTATAGGTTTTGTTAG AGATATGCTTATTGCAAATAATTTTGGAGCTGGTATGTATACAGATGCATATAATATTGCTGTTACTGTACCAGAAACTA TATTTATGCTTATAGGCCTTGCAATCTCTACATCATTTTTACCAGTGCTAAGTAAGATAAAAGCAAAAAAAGGCAAGAAT GAAATGTATTATTTCGCCAATAATGTGATTAATATATTATTTATTATTTCAGTTATATTTTTTGCTATAACTAGTATTTT TTCAAAAGAAATAGTTATGGCTTTAGGAAAAGGGTTTGATACAGAAACAACGATTTTAGCAATTAGACTAACTAGAATCA CATTGATCAATTTATTATTTATGTCAATTAACGCATGCTTTACATCATTGTTACAAGTTAATGAAGATTTTGTTATACCA TCAATACTAGGTTTATTTTTTAATTTACCTATGATTGTGTATTTACTATTTTTTAGAAGTTATGATATTATTGGATTAAC TATAGCCAATGTTATAGGAAATTTTTTTAGAGTAGTAGTTCAAGTACCCTCGTTAGTATCACATGGGTATAAATATAGAT TTTTTGTTAACTTAAAAGATGAAGGGTTAAAAGCTATTTTACTATTAATAATTCCAGTTGTTATAGCAGCTGGCGCAAAT TCTTTAAATATGATAGTAGATAAAAGAATTGCATCATCATTAGAAATAGGATCTATTTCAGCATTGGGTTATGCAGAAAA ACTTATATTCTTTATAAATAGTACAATAACAACATCTATATCAAGTGTGGCATATCCTATGATGGCTAATGCTAGAAATG CAAAAAAAATAGATGAGTTTGTAGAGTTGTTAAAAAAATCTCTTATATATTTAGCTCTAATTTTAATACCTATTACAGTT GGAGTTATAATATTTAAAGAAGATATTGTTAGTATTATATATGAAAGAGGAAAATTCACAGAATATGCAGTAAAATTAAC AAGTTTAGCTTTACTTGGATATACAGTTGGAATATTCTTTACTGGAATGAGAGATATATTAAACTCTACTTTATTTTCTA TGGGAAAAACTAAGATTACAACTTTAAATGGAATTATGGGAGTAATTATAAATATATGTTTAAGCATAATATTATCAAAA ACTATGGGGATATCTGGAGTAGCATTAGCATCCTCAATAGCTATGATTATAACTTCTATTTTATTATTTATTAGTATTAC AAAATTGGAACGTAATTTTACTTATAAGGATTTATTTGTTAAAATATTCAAGATAATTATTAATTCGATTTTAATGGGTT TAATAATTATTACATTTATAAATCTTATAGATGAAAAAATACCCAAAATAATGATTATGATTTTAGGAACTATTATTGGT ATTATAAGTTATTTTATATTATGTAATTTATTTAATATAAAAGAGGTACAGGAGATAAAAAAATTATTTTTAAACAAAGT AAAGAAGAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGCTTTACAGGGTGACAAAGGAACCTTGGAGAATAACAAGACTTACTTCTATACCTAAATTTTTAATAAAAGTATTAAAG TACAATAAAAGGTGATAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGGAGGACATATGAAAATATTATTTATAGCTTGTTATTCTCCATTAATAAATAATTCAGCTGCCATAGAAACTTTGCAG TATTTAAACAAATTAAGTGA
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 510; Mature: 510
Protein sequence:
>510_residues MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK
Sequences:
>Translated_510_residues MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK >Mature_510_residues MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=507, Percent_Identity=23.6686390532544, Blast_Score=142, Evalue=5e-35,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56782; Mature: 56782
Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 4.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCEEEEEECHHHHHHHHHH AISTSFLPVLSKIKAKKGKNEMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIPSILGLFFNLPMIVYLLFFRS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VELLKKSLIYLALILIPITVGVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSKTMGISGVALASSIAMIITSI HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCEEEEEECHHHHHHHHHH AISTSFLPVLSKIKAKKGKNEMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIPSILGLFFNLPMIVYLLFFRS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VELLKKSLIYLALILIPITVGVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSKTMGISGVALASSIAMIITSI HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8200538; 11677609 [H]