Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 187935658

GI number: 187935658

Start: 2542627

End: 2544159

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: CLL_A2458

Alternate gene names: 187935658

Gene position: 2544159-2542627 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187934932

Following gene: 187934514

Centisome position: 66.95

GC content: 24.27

Gene sequence:

>1533_bases
ATGAAGAAGAATGCTTTGTTAAAATCTACTTTAATAATAATGATAGTATCATGTATAAGTAGAATTATAGGTTTTGTTAG
AGATATGCTTATTGCAAATAATTTTGGAGCTGGTATGTATACAGATGCATATAATATTGCTGTTACTGTACCAGAAACTA
TATTTATGCTTATAGGCCTTGCAATCTCTACATCATTTTTACCAGTGCTAAGTAAGATAAAAGCAAAAAAAGGCAAGAAT
GAAATGTATTATTTCGCCAATAATGTGATTAATATATTATTTATTATTTCAGTTATATTTTTTGCTATAACTAGTATTTT
TTCAAAAGAAATAGTTATGGCTTTAGGAAAAGGGTTTGATACAGAAACAACGATTTTAGCAATTAGACTAACTAGAATCA
CATTGATCAATTTATTATTTATGTCAATTAACGCATGCTTTACATCATTGTTACAAGTTAATGAAGATTTTGTTATACCA
TCAATACTAGGTTTATTTTTTAATTTACCTATGATTGTGTATTTACTATTTTTTAGAAGTTATGATATTATTGGATTAAC
TATAGCCAATGTTATAGGAAATTTTTTTAGAGTAGTAGTTCAAGTACCCTCGTTAGTATCACATGGGTATAAATATAGAT
TTTTTGTTAACTTAAAAGATGAAGGGTTAAAAGCTATTTTACTATTAATAATTCCAGTTGTTATAGCAGCTGGCGCAAAT
TCTTTAAATATGATAGTAGATAAAAGAATTGCATCATCATTAGAAATAGGATCTATTTCAGCATTGGGTTATGCAGAAAA
ACTTATATTCTTTATAAATAGTACAATAACAACATCTATATCAAGTGTGGCATATCCTATGATGGCTAATGCTAGAAATG
CAAAAAAAATAGATGAGTTTGTAGAGTTGTTAAAAAAATCTCTTATATATTTAGCTCTAATTTTAATACCTATTACAGTT
GGAGTTATAATATTTAAAGAAGATATTGTTAGTATTATATATGAAAGAGGAAAATTCACAGAATATGCAGTAAAATTAAC
AAGTTTAGCTTTACTTGGATATACAGTTGGAATATTCTTTACTGGAATGAGAGATATATTAAACTCTACTTTATTTTCTA
TGGGAAAAACTAAGATTACAACTTTAAATGGAATTATGGGAGTAATTATAAATATATGTTTAAGCATAATATTATCAAAA
ACTATGGGGATATCTGGAGTAGCATTAGCATCCTCAATAGCTATGATTATAACTTCTATTTTATTATTTATTAGTATTAC
AAAATTGGAACGTAATTTTACTTATAAGGATTTATTTGTTAAAATATTCAAGATAATTATTAATTCGATTTTAATGGGTT
TAATAATTATTACATTTATAAATCTTATAGATGAAAAAATACCCAAAATAATGATTATGATTTTAGGAACTATTATTGGT
ATTATAAGTTATTTTATATTATGTAATTTATTTAATATAAAAGAGGTACAGGAGATAAAAAAATTATTTTTAAACAAAGT
AAAGAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCTTTACAGGGTGACAAAGGAACCTTGGAGAATAACAAGACTTACTTCTATACCTAAATTTTTAATAAAAGTATTAAAG
TACAATAAAAGGTGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGAGGACATATGAAAATATTATTTATAGCTTGTTATTCTCCATTAATAAATAATTCAGCTGCCATAGAAACTTTGCAG
TATTTAAACAAATTAAGTGA

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 510; Mature: 510

Protein sequence:

>510_residues
MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN
EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP
SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN
SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV
GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK
TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG
IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK

Sequences:

>Translated_510_residues
MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN
EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP
SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN
SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV
GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK
TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG
IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK
>Mature_510_residues
MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGLAISTSFLPVLSKIKAKKGKN
EMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFDTETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIP
SILGLFFNLPMIVYLLFFRSYDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN
SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEFVELLKKSLIYLALILIPITV
GVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFFTGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSK
TMGISGVALASSIAMIITSILLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG
IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=507, Percent_Identity=23.6686390532544, Blast_Score=142, Evalue=5e-35,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56782; Mature: 56782

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCEEEEEECHHHHHHHHHH
AISTSFLPVLSKIKAKKGKNEMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIPSILGLFFNLPMIVYLLFFRS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
YDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VELLKKSLIYLALILIPITVGVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSKTMGISGVALASSIAMIITSI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKNALLKSTLIIMIVSCISRIIGFVRDMLIANNFGAGMYTDAYNIAVTVPETIFMLIGL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCEEEEEECHHHHHHHHHH
AISTSFLPVLSKIKAKKGKNEMYYFANNVINILFIISVIFFAITSIFSKEIVMALGKGFD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TETTILAIRLTRITLINLLFMSINACFTSLLQVNEDFVIPSILGLFFNLPMIVYLLFFRS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
YDIIGLTIANVIGNFFRVVVQVPSLVSHGYKYRFFVNLKDEGLKAILLLIIPVVIAAGAN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SLNMIVDKRIASSLEIGSISALGYAEKLIFFINSTITTSISSVAYPMMANARNAKKIDEF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VELLKKSLIYLALILIPITVGVIIFKEDIVSIIYERGKFTEYAVKLTSLALLGYTVGIFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGMRDILNSTLFSMGKTKITTLNGIMGVIINICLSIILSKTMGISGVALASSIAMIITSI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLFISITKLERNFTYKDLFVKIFKIIINSILMGLIIITFINLIDEKIPKIMIMILGTIIG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IISYFILCNLFNIKEVQEIKKLFLNKVKKK
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]