| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is ntpJ [H]
Identifier: 187934370
GI number: 187934370
Start: 2569600
End: 2570949
Strand: Reverse
Name: ntpJ [H]
Synonym: CLL_A2476
Alternate gene names: 187934370
Gene position: 2570949-2569600 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187933830
Following gene: 187933826
Centisome position: 67.65
GC content: 27.93
Gene sequence:
>1350_bases ATGGGAAAAGTTCTGACAAAAAAATCAAGACTTAATGCAGTTCAAGTATTAGCGATAGGTTTTGCTATAGTTGCTTTAAT AGGAGCACTTATATTAACTTTACCTATTTCTTCTGCAAGTGGTGAAAGCACAAATTTTATAGATGCTATTTTTACATCTA CATCAGCAGTGTGTGTTACTGGTTTAATTACATTAGATACAGGAACGTATTGGAGTACTTTTGGTCAAGTTATAATTATA ATTTTAATAGAAATTGGTGGTATGGGATTTATGTCTTTTACTACATTTATTGCAATACTATTAGGAAAAAAGATAACTTT AAGAGATAGATTATTAATGCAGGAAGCTATGAATACTTTTAATATTGAAGGTTTAGTAAGAATGGTTCAATACGTTTTTG CATTAACATTTTCAGTTCAGTTTTTTGGAGCTCTATTATTATCAACTCAGTTCATACCACAGTTTGGATTTTCAAAGGGA TTATTTTATAGTATATTTCATTCTATTTCAGCATTTTGTAATGCTGGTTTTGATTTATTTGGAAATTTTACTAGTTTAAC TGGTTATTCTAGTAATGTAGTAGTAATATTAAGCATAAGTGCTTTAATAATAATTGGTGGTTTAGGTTTTACAGTATGGC TTGAAATATATAATTATAATAAAAGTTCTAAAAGATTATCGCTTAATTGTAAGGTGGTATTATTAATTACTATATTTTTA ATTATTTTTGGATTTATATGTATATTTATATTTGAATATAATAATATTCAAACTATAGGTGGAATGTCTTTTAAAGATAA AATATTAAATTCATTTTTTGCATCTGTATCGCCAAGAACAGCAGGTTTCAATAGTATGTCTACTGATGATATGACTATGT CAGGTAAATTAATTACTATAATATTAATGTTTATAGGAGGATCATCAGGATCAACAGCAGGTGGTTTAAAAACTGCTACA TTTGGTGTTCTAATCTTAACAGTAATTTCTGTTTTGAAAGGAAGAGAAGATACTGAAGCATTTGAAAAGAGATTTTCAAA AGATTTAGTATATAAAGCCTTTACTTTATTCTTTATTGCAATGATGCTTGTTATAGTAGTGACAATGATTCTTACTATAG TGGAACCAAATCAATCTTTTATAAATTTACTTTATGAAGCAACTTCAGCTTTTGGTACAGTAGGGTTAACTACTGGAGTA ACGCAGCAATTATCATTTGCAGGAAAGATTGTAATAATGCTCACTATGTATTGTGGTAGGGTTGGTCCATTAACAGTAAT TTTAGCATTATTAAATAGGAAGAAAAAGAAGGGATATAGATATCCAGAAGGTAAGATATTGATAGGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATATTAAAATTATTTAGATATATTTACTTTACATAAAATTTATATTAAATAGGTAAAATAAAATGAAGTAATTTTAAAT TAACCTTTTGAGGTGAGTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGTGACTTAGTTTTGGTAAATAAACAATTTGTAGTAATTGGGTTAGGGCGATTTGGTGCTTCTGTTGCTAAGACTTTAT ATGACTTAGGAAATGATGTT
Product: potassium uptake protein, TrkH family
Products: NA
Alternate protein names: Na(+)-translocating ATPase subunit J [H]
Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 448
Protein sequence:
>449_residues MGKVLTKKSRLNAVQVLAIGFAIVALIGALILTLPISSASGESTNFIDAIFTSTSAVCVTGLITLDTGTYWSTFGQVIII ILIEIGGMGFMSFTTFIAILLGKKITLRDRLLMQEAMNTFNIEGLVRMVQYVFALTFSVQFFGALLLSTQFIPQFGFSKG LFYSIFHSISAFCNAGFDLFGNFTSLTGYSSNVVVILSISALIIIGGLGFTVWLEIYNYNKSSKRLSLNCKVVLLITIFL IIFGFICIFIFEYNNIQTIGGMSFKDKILNSFFASVSPRTAGFNSMSTDDMTMSGKLITIILMFIGGSSGSTAGGLKTAT FGVLILTVISVLKGREDTEAFEKRFSKDLVYKAFTLFFIAMMLVIVVTMILTIVEPNQSFINLLYEATSAFGTVGLTTGV TQQLSFAGKIVIMLTMYCGRVGPLTVILALLNRKKKKGYRYPEGKILIG
Sequences:
>Translated_449_residues MGKVLTKKSRLNAVQVLAIGFAIVALIGALILTLPISSASGESTNFIDAIFTSTSAVCVTGLITLDTGTYWSTFGQVIII ILIEIGGMGFMSFTTFIAILLGKKITLRDRLLMQEAMNTFNIEGLVRMVQYVFALTFSVQFFGALLLSTQFIPQFGFSKG LFYSIFHSISAFCNAGFDLFGNFTSLTGYSSNVVVILSISALIIIGGLGFTVWLEIYNYNKSSKRLSLNCKVVLLITIFL IIFGFICIFIFEYNNIQTIGGMSFKDKILNSFFASVSPRTAGFNSMSTDDMTMSGKLITIILMFIGGSSGSTAGGLKTAT FGVLILTVISVLKGREDTEAFEKRFSKDLVYKAFTLFFIAMMLVIVVTMILTIVEPNQSFINLLYEATSAFGTVGLTTGV TQQLSFAGKIVIMLTMYCGRVGPLTVILALLNRKKKKGYRYPEGKILIG >Mature_448_residues GKVLTKKSRLNAVQVLAIGFAIVALIGALILTLPISSASGESTNFIDAIFTSTSAVCVTGLITLDTGTYWSTFGQVIIII LIEIGGMGFMSFTTFIAILLGKKITLRDRLLMQEAMNTFNIEGLVRMVQYVFALTFSVQFFGALLLSTQFIPQFGFSKGL FYSIFHSISAFCNAGFDLFGNFTSLTGYSSNVVVILSISALIIIGGLGFTVWLEIYNYNKSSKRLSLNCKVVLLITIFLI IFGFICIFIFEYNNIQTIGGMSFKDKILNSFFASVSPRTAGFNSMSTDDMTMSGKLITIILMFIGGSSGSTAGGLKTATF GVLILTVISVLKGREDTEAFEKRFSKDLVYKAFTLFFIAMMLVIVVTMILTIVEPNQSFINLLYEATSAFGTVGLTTGVT QQLSFAGKIVIMLTMYCGRVGPLTVILALLNRKKKKGYRYPEGKILIG
Specific function: Involved in ATP-driven sodium extrusion [H]
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 - InterPro: IPR004772 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: =3.6.3.14 [H]
Molecular weight: Translated: 48984; Mature: 48853
Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGKVLTKKSRLNAVQVLAIGFAIVALIGALILTLPISSASGESTNFIDAIFTSTSAVCVT CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHE GLITLDTGTYWSTFGQVIIIILIEIGGMGFMSFTTFIAILLGKKITLRDRLLMQEAMNTF EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHC NIEGLVRMVQYVFALTFSVQFFGALLLSTQFIPQFGFSKGLFYSIFHSISAFCNAGFDLF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GNFTSLTGYSSNVVVILSISALIIIGGLGFTVWLEIYNYNKSSKRLSLNCKVVLLITIFL CCCHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCHHEEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH IIFGFICIFIFEYNNIQTIGGMSFKDKILNSFFASVSPRTAGFNSMSTDDMTMSGKLITI HHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHH ILMFIGGSSGSTAGGLKTATFGVLILTVISVLKGREDTEAFEKRFSKDLVYKAFTLFFIA HHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MMLVIVVTMILTIVEPNQSFINLLYEATSAFGTVGLTTGVTQQLSFAGKIVIMLTMYCGR HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VGPLTVILALLNRKKKKGYRYPEGKILIG CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECC >Mature Secondary Structure GKVLTKKSRLNAVQVLAIGFAIVALIGALILTLPISSASGESTNFIDAIFTSTSAVCVT CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHE GLITLDTGTYWSTFGQVIIIILIEIGGMGFMSFTTFIAILLGKKITLRDRLLMQEAMNTF EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHC NIEGLVRMVQYVFALTFSVQFFGALLLSTQFIPQFGFSKGLFYSIFHSISAFCNAGFDLF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GNFTSLTGYSSNVVVILSISALIIIGGLGFTVWLEIYNYNKSSKRLSLNCKVVLLITIFL CCCHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCHHEEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH IIFGFICIFIFEYNNIQTIGGMSFKDKILNSFFASVSPRTAGFNSMSTDDMTMSGKLITI HHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHH ILMFIGGSSGSTAGGLKTATFGVLILTVISVLKGREDTEAFEKRFSKDLVYKAFTLFFIA HHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MMLVIVVTMILTIVEPNQSFINLLYEATSAFGTVGLTTGVTQQLSFAGKIVIMLTMYCGR HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VGPLTVILALLNRKKKKGYRYPEGKILIG CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8157629 [H]