Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

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The map label for this gene is 187934054

Identifier: 187934054

GI number: 187934054

Start: 60692

End: 62047

Strand: Reverse

Name: 187934054

Synonym: CLL_A0060

Alternate gene names: NA

Gene position: 62047-60692 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187935260

Following gene: 187934459

Centisome position: 1.63

GC content: 28.76

Gene sequence:

>1356_bases
ATGAATAAAAATACAGAAGTAAATATAAATTTAAATATGTCCTCATTATTGAAGTTTATAGTTCCATCGCTTATAGGAAT
TTTATTATTTATGACTCCAATAATGATAAACGGACAATTCACAATTCCAATAGCTTTCTTATCAAATTTAGTTGTAGATA
CATTAGAAAGCGTTTTACCACTTATCGCTCTTATATTAATATCAATTTCTGCCATTGGTAGTATTTTAATAAAAATTTTT
AAAACTGAAAATAAAGTTTTAAATTCATTGTTTAACATTAGTTATTCTTGGTTAAGTGCTAGAATAATAGGTATGATAAT
AGTTATAATGACTTATTTTAAAGTAGGACCTGAATTTATCTGGTCTGATAGTACTGGTGGAATGATCTTATTTAGTCTTC
TTCCATTATTAACTGCCGTATTCTTATTTGCAGGTTTATTTTTGCCATTATTACTTAACCATGGTTTATTAGAATTTGTA
GGTGCTTTATTTACTAAAGTAATGAGACCTTTATTTAAACTTCCTGGTCGTTCTTCAATAGATTGTATTACTTCTTGGTT
AGGTGATGGAACTATTGGAATATTATTAACTAGTAAACAATATGAAGAAGGCTTTTATACAAAAAAAGAAGCTTCTGTTA
TAGGTACTTCATTTTCAGCAGTCTCTATAACATTTAGTTTAATGGTTATAACTCAAGTTGGACTTTCACATATGTTTGTT
CCATTCTATTTAACAGTTACTTTTGCTGGTATAGTTGCAGCTATAGTGCTTCCAAGAGTAAGACCATTATCTAAAAAGCC
TGATACATATATTGATGGTAGAGAATTAGAAAAAAATGTAGATCTTATTCCTAACGGATATACTCCATTTACATGGGGAT
TAAAAAATGCTATTGATAAAGCTGAAGATAATTTTAGCTTTCACTCATTTGTTGAAGATGGTCTAAAGAATGTAATAGAT
ATGTGGATGGGCGTATTACCAGTAGTTATGTCTATGGGCGGAATTGCCCTTATGATTGCTGAATATACTCATATTTTCAC
AATGCTTGGATTACCTTTTATACCATTACTAAAGTTATTACAAGTTCCTGAAGCTGTTGCAGCTTCTAAAACATTAGTTG
TTGGTTTTGCAGATATGTTCATACCATCCGTATTAGCTACAAGTATTCAAAATGAAATGACTAGATTTATAATAGCGTGT
ACATCGGTAACACAATTAATATATATGTCAGAAGTAGGTGGATTACTTCTAGGTTCAAAAATACCAGTTTCATTTAAAGA
GTTAGTTATAATATTCCTAGAAAGAACTATCATAACATTGCCTATAATAGTATTAATAGCAAATTTATTGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAATTAAACTTTTATTTTGAATTAGCACTATCTTTTTTGGCTTTTCTATATTAAAATAATAATTGTTGTATATTTA
TAAAGAAAAAGGGGATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATGTGTTAATATCTGCATAAGTAAAGTGGACTGAGTAATTGAACTTAGGAATGCTAAAATGAGTATAGTCCCATTTTA
GCTTGCTCCCAATATAAAAT

Product: membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MNKNTEVNINLNMSSLLKFIVPSLIGILLFMTPIMINGQFTIPIAFLSNLVVDTLESVLPLIALILISISAIGSILIKIF
KTENKVLNSLFNISYSWLSARIIGMIIVIMTYFKVGPEFIWSDSTGGMILFSLLPLLTAVFLFAGLFLPLLLNHGLLEFV
GALFTKVMRPLFKLPGRSSIDCITSWLGDGTIGILLTSKQYEEGFYTKKEASVIGTSFSAVSITFSLMVITQVGLSHMFV
PFYLTVTFAGIVAAIVLPRVRPLSKKPDTYIDGRELEKNVDLIPNGYTPFTWGLKNAIDKAEDNFSFHSFVEDGLKNVID
MWMGVLPVVMSMGGIALMIAEYTHIFTMLGLPFIPLLKLLQVPEAVAASKTLVVGFADMFIPSVLATSIQNEMTRFIIAC
TSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSFKELVIIFLERTIITLPIIVLIANLLF

Sequences:

>Translated_451_residues
MNKNTEVNINLNMSSLLKFIVPSLIGILLFMTPIMINGQFTIPIAFLSNLVVDTLESVLPLIALILISISAIGSILIKIF
KTENKVLNSLFNISYSWLSARIIGMIIVIMTYFKVGPEFIWSDSTGGMILFSLLPLLTAVFLFAGLFLPLLLNHGLLEFV
GALFTKVMRPLFKLPGRSSIDCITSWLGDGTIGILLTSKQYEEGFYTKKEASVIGTSFSAVSITFSLMVITQVGLSHMFV
PFYLTVTFAGIVAAIVLPRVRPLSKKPDTYIDGRELEKNVDLIPNGYTPFTWGLKNAIDKAEDNFSFHSFVEDGLKNVID
MWMGVLPVVMSMGGIALMIAEYTHIFTMLGLPFIPLLKLLQVPEAVAASKTLVVGFADMFIPSVLATSIQNEMTRFIIAC
TSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSFKELVIIFLERTIITLPIIVLIANLLF
>Mature_451_residues
MNKNTEVNINLNMSSLLKFIVPSLIGILLFMTPIMINGQFTIPIAFLSNLVVDTLESVLPLIALILISISAIGSILIKIF
KTENKVLNSLFNISYSWLSARIIGMIIVIMTYFKVGPEFIWSDSTGGMILFSLLPLLTAVFLFAGLFLPLLLNHGLLEFV
GALFTKVMRPLFKLPGRSSIDCITSWLGDGTIGILLTSKQYEEGFYTKKEASVIGTSFSAVSITFSLMVITQVGLSHMFV
PFYLTVTFAGIVAAIVLPRVRPLSKKPDTYIDGRELEKNVDLIPNGYTPFTWGLKNAIDKAEDNFSFHSFVEDGLKNVID
MWMGVLPVVMSMGGIALMIAEYTHIFTMLGLPFIPLLKLLQVPEAVAASKTLVVGFADMFIPSVLATSIQNEMTRFIIAC
TSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSFKELVIIFLERTIITLPIIVLIANLLF

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49677; Mature: 49677

Theoretical pI: Translated: 6.95; Mature: 6.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKNTEVNINLNMSSLLKFIVPSLIGILLFMTPIMINGQFTIPIAFLSNLVVDTLESVLP
CCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALILISISAIGSILIKIFKTENKVLNSLFNISYSWLSARIIGMIIVIMTYFKVGPEFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
WSDSTGGMILFSLLPLLTAVFLFAGLFLPLLLNHGLLEFVGALFTKVMRPLFKLPGRSSI
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
DCITSWLGDGTIGILLTSKQYEEGFYTKKEASVIGTSFSAVSITFSLMVITQVGLSHMFV
HHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFYLTVTFAGIVAAIVLPRVRPLSKKPDTYIDGRELEKNVDLIPNGYTPFTWGLKNAIDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AEDNFSFHSFVEDGLKNVIDMWMGVLPVVMSMGGIALMIAEYTHIFTMLGLPFIPLLKLL
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
QVPEAVAASKTLVVGFADMFIPSVLATSIQNEMTRFIIACTSVTQLIYMSEVGGLLLGSK
HCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCC
IPVSFKELVIIFLERTIITLPIIVLIANLLF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MNKNTEVNINLNMSSLLKFIVPSLIGILLFMTPIMINGQFTIPIAFLSNLVVDTLESVLP
CCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALILISISAIGSILIKIFKTENKVLNSLFNISYSWLSARIIGMIIVIMTYFKVGPEFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
WSDSTGGMILFSLLPLLTAVFLFAGLFLPLLLNHGLLEFVGALFTKVMRPLFKLPGRSSI
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
DCITSWLGDGTIGILLTSKQYEEGFYTKKEASVIGTSFSAVSITFSLMVITQVGLSHMFV
HHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFYLTVTFAGIVAAIVLPRVRPLSKKPDTYIDGRELEKNVDLIPNGYTPFTWGLKNAIDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AEDNFSFHSFVEDGLKNVIDMWMGVLPVVMSMGGIALMIAEYTHIFTMLGLPFIPLLKLL
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
QVPEAVAASKTLVVGFADMFIPSVLATSIQNEMTRFIIACTSVTQLIYMSEVGGLLLGSK
HCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCC
IPVSFKELVIIFLERTIITLPIIVLIANLLF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA