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The map label for this gene is yvcS [H]

Identifier: 187932512

GI number: 187932512

Start: 3204108

End: 3206084

Strand: Reverse

Name: yvcS [H]

Synonym: CLL_A3096

Alternate gene names: 187932512

Gene position: 3206084-3204108 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187935618

Following gene: 187933638

Centisome position: 84.36

GC content: 23.62

Gene sequence:

>1977_bases
TTGAGTAATTCATTTTATTTTAAGTTAGCAAATACTAATTTAAAGAAAAATGGAAAAACATATTTTCCATATATTATAGC
ATCAATTTGTGCTGTAATTACATTTTATACTATGAAGTGTATTTCATTAAATGAAGGATTAAATGTGATGAGAGGTTCAG
ATCAATTAAAAATGATGCTTGAATTTACGTCAAATGTTATTTCTATATTTTCTATAATATTTTTATTTTATACTAATAAT
TTTTTAATAAAGCGTAGAACAAAAGAATTAGGTCTTTATAACATTCTTGGAATGGAAAAAAAGCATATATATAAAGTTAT
TTTTTTTGAAACAGTATTAGTATGGGGAATGAGTTTATTAATAGGACTCATAGGTGGAATTATAATAGGCAAATTATTAT
TTTTAATATTGCTCAATTTAATAAATTTTAAAGTAACATTAGCTTTTGCTATATCTGTGCCAGCAATAATTTCTACAATA
AAAATCTTTACATTAATTTTTATTGCAATATTAATTAAAAATTTTATACAAGTAAAAATTTCTAATCCAATAGAATTATT
AAAGGATGGAGAAAAAGGAGAAAAAGTACCTAAGACATCTAAAATATTAGCTATTTCAGGAGCGATTGAATTGATTTTAG
GTTATGGAATAGCAATTACAGTAAAATCTCCAATAGAGGCTCTTCAAGTGTTTTTCATTGCTGTGCTTTTAGTCATGGCA
GGAACATATAGCACCTTTAGTTCAGGAAGCATAGCAGTTTTAAATTTACTAAAAAAGAATAAAAAATTCTTTTATAAACC
TAATAATTTTATTTCAGTTTCAAGCATGATATATCGTATGAAACAAAATGCTATGGGACTTGCTAATATATGTATTCTTA
GTACAGCTGTAATATTAACAGTATCTACAACTGTATGTTTATATGTTGATCAAGAATCTAGCCTTAAAAATAAACATCCT
CAAGATATAAGTATATCTATAGACAATGGAGCAAATGAAAATGTAGAGAGCATTAATTATGTGATAAATGAAGAAGCAAA
ATATAATAATATAAATTTGGATAATAAGATTACGTTCAATTATATTGAAATGATAACAATAAAAAATGGTGCTGCTTTTG
AAGTTGCAGAAAAAGATATGTCTAATATAAGTAGATTATGTGGGTTAACTTTGTTAACATTAGAAAATTACAATCAAATT
GAAGGAAAAGATAGTTCTTTAGAAAATAATGAGGTGTTAATATTTTCACAGGAAGGAAATTTTAGTGAAGAATCTATAAA
CATTGGACAAAAAGAATATAAAATAAAAGATGAACTTAATAGTATGAAATTTATAAATAAACAAGATACGGCTATGATAA
AAGGTTATTATATTGTTGTAAAAAACAATGATATCTTAAAATCTATATATAAAGATATGACTAATGAAGATTTAGAAAAT
ACAAAGTATAGCATTTCTTTTGATGTTAATGGTGATAAAAATTATATTATGAATTTTTGTAGTGATATAAGTAGTAAAGT
TAATGAAATTTATAATGGAGAATTTACTAGCATTTATACTGATAGAGAAGATTTTTATACAATTAATGGAGGATTTTTAT
TTATAGGTGTATTTTTAGGCTTGTTATTTACAATGGCAACAGTTTTAATAATTTATTATAAACAAATTTCTGAAGGTTAT
GATGATAGTAAGAGATTTAATATAATGCAAAAGGTTGGTATGAGTAAAGAAGAAGTTAAAAACACTATAAGTAAACAAAT
ATTAATGGTGTTTTTCTTACCATTAATAACAGCTATAATTCATATGGCTTTTGCTTTTAAAGAAATGAAGAAAATGCTAG
CTTTATTTTCAATAAGCAATACAAAAATACTTTTACAATGTACAATTGGAACAATAATAGTTTTTACTATTGTATATATA
TTGGTTTACATGTTAACAGCTAAAACTTACTATAAAATTGTTGAACAAGAGGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACTTTTTCATCAAATTTATAGAGGCGCTATGAATAATGATGAGATGTATCAAAAGATTTCAGATAGTCTTACTGTTTT
AACAACAGGGGGTGCTGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAATGGGGGTGTGTTTTAAAGAATGGTGTTAATACATGAATAAAAAAGTGAGATGAGCAATTACAATGTCATTTTTCTA
ATTACATATATTAACATATA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 658; Mature: 657

Protein sequence:

>658_residues
MSNSFYFKLANTNLKKNGKTYFPYIIASICAVITFYTMKCISLNEGLNVMRGSDQLKMMLEFTSNVISIFSIIFLFYTNN
FLIKRRTKELGLYNILGMEKKHIYKVIFFETVLVWGMSLLIGLIGGIIIGKLLFLILLNLINFKVTLAFAISVPAIISTI
KIFTLIFIAILIKNFIQVKISNPIELLKDGEKGEKVPKTSKILAISGAIELILGYGIAITVKSPIEALQVFFIAVLLVMA
GTYSTFSSGSIAVLNLLKKNKKFFYKPNNFISVSSMIYRMKQNAMGLANICILSTAVILTVSTTVCLYVDQESSLKNKHP
QDISISIDNGANENVESINYVINEEAKYNNINLDNKITFNYIEMITIKNGAAFEVAEKDMSNISRLCGLTLLTLENYNQI
EGKDSSLENNEVLIFSQEGNFSEESINIGQKEYKIKDELNSMKFINKQDTAMIKGYYIVVKNNDILKSIYKDMTNEDLEN
TKYSISFDVNGDKNYIMNFCSDISSKVNEIYNGEFTSIYTDREDFYTINGGFLFIGVFLGLLFTMATVLIIYYKQISEGY
DDSKRFNIMQKVGMSKEEVKNTISKQILMVFFLPLITAIIHMAFAFKEMKKMLALFSISNTKILLQCTIGTIIVFTIVYI
LVYMLTAKTYYKIVEQED

Sequences:

>Translated_658_residues
MSNSFYFKLANTNLKKNGKTYFPYIIASICAVITFYTMKCISLNEGLNVMRGSDQLKMMLEFTSNVISIFSIIFLFYTNN
FLIKRRTKELGLYNILGMEKKHIYKVIFFETVLVWGMSLLIGLIGGIIIGKLLFLILLNLINFKVTLAFAISVPAIISTI
KIFTLIFIAILIKNFIQVKISNPIELLKDGEKGEKVPKTSKILAISGAIELILGYGIAITVKSPIEALQVFFIAVLLVMA
GTYSTFSSGSIAVLNLLKKNKKFFYKPNNFISVSSMIYRMKQNAMGLANICILSTAVILTVSTTVCLYVDQESSLKNKHP
QDISISIDNGANENVESINYVINEEAKYNNINLDNKITFNYIEMITIKNGAAFEVAEKDMSNISRLCGLTLLTLENYNQI
EGKDSSLENNEVLIFSQEGNFSEESINIGQKEYKIKDELNSMKFINKQDTAMIKGYYIVVKNNDILKSIYKDMTNEDLEN
TKYSISFDVNGDKNYIMNFCSDISSKVNEIYNGEFTSIYTDREDFYTINGGFLFIGVFLGLLFTMATVLIIYYKQISEGY
DDSKRFNIMQKVGMSKEEVKNTISKQILMVFFLPLITAIIHMAFAFKEMKKMLALFSISNTKILLQCTIGTIIVFTIVYI
LVYMLTAKTYYKIVEQED
>Mature_657_residues
SNSFYFKLANTNLKKNGKTYFPYIIASICAVITFYTMKCISLNEGLNVMRGSDQLKMMLEFTSNVISIFSIIFLFYTNNF
LIKRRTKELGLYNILGMEKKHIYKVIFFETVLVWGMSLLIGLIGGIIIGKLLFLILLNLINFKVTLAFAISVPAIISTIK
IFTLIFIAILIKNFIQVKISNPIELLKDGEKGEKVPKTSKILAISGAIELILGYGIAITVKSPIEALQVFFIAVLLVMAG
TYSTFSSGSIAVLNLLKKNKKFFYKPNNFISVSSMIYRMKQNAMGLANICILSTAVILTVSTTVCLYVDQESSLKNKHPQ
DISISIDNGANENVESINYVINEEAKYNNINLDNKITFNYIEMITIKNGAAFEVAEKDMSNISRLCGLTLLTLENYNQIE
GKDSSLENNEVLIFSQEGNFSEESINIGQKEYKIKDELNSMKFINKQDTAMIKGYYIVVKNNDILKSIYKDMTNEDLENT
KYSISFDVNGDKNYIMNFCSDISSKVNEIYNGEFTSIYTDREDFYTINGGFLFIGVFLGLLFTMATVLIIYYKQISEGYD
DSKRFNIMQKVGMSKEEVKNTISKQILMVFFLPLITAIIHMAFAFKEMKKMLALFSISNTKILLQCTIGTIIVFTIVYIL
VYMLTAKTYYKIVEQED

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74627; Mature: 74496

Theoretical pI: Translated: 8.76; Mature: 8.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNSFYFKLANTNLKKNGKTYFPYIIASICAVITFYTMKCISLNEGLNVMRGSDQLKMML
CCCCEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCHHHHHHH
EFTSNVISIFSIIFLFYTNNFLIKRRTKELGLYNILGMEKKHIYKVIFFETVLVWGMSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLIGGIIIGKLLFLILLNLINFKVTLAFAISVPAIISTIKIFTLIFIAILIKNFIQVKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
SNPIELLKDGEKGEKVPKTSKILAISGAIELILGYGIAITVKSPIEALQVFFIAVLLVMA
CCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GTYSTFSSGSIAVLNLLKKNKKFFYKPNNFISVSSMIYRMKQNAMGLANICILSTAVILT
CCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHE
VSTTVCLYVDQESSLKNKHPQDISISIDNGANENVESINYVINEEAKYNNINLDNKITFN
EEEEEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEE
YIEMITIKNGAAFEVAEKDMSNISRLCGLTLLTLENYNQIEGKDSSLENNEVLIFSQEGN
EEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
FSEESINIGQKEYKIKDELNSMKFINKQDTAMIKGYYIVVKNNDILKSIYKDMTNEDLEN
CCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCC
TKYSISFDVNGDKNYIMNFCSDISSKVNEIYNGEFTSIYTDREDFYTINGGFLFIGVFLG
CEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEECCCHHHHHHHHH
LLFTMATVLIIYYKQISEGYDDSKRFNIMQKVGMSKEEVKNTISKQILMVFFLPLITAII
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HMAFAFKEMKKMLALFSISNTKILLQCTIGTIIVFTIVYILVYMLTAKTYYKIVEQED
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNSFYFKLANTNLKKNGKTYFPYIIASICAVITFYTMKCISLNEGLNVMRGSDQLKMML
CCCEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCHHHHHHH
EFTSNVISIFSIIFLFYTNNFLIKRRTKELGLYNILGMEKKHIYKVIFFETVLVWGMSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLIGGIIIGKLLFLILLNLINFKVTLAFAISVPAIISTIKIFTLIFIAILIKNFIQVKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
SNPIELLKDGEKGEKVPKTSKILAISGAIELILGYGIAITVKSPIEALQVFFIAVLLVMA
CCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GTYSTFSSGSIAVLNLLKKNKKFFYKPNNFISVSSMIYRMKQNAMGLANICILSTAVILT
CCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHE
VSTTVCLYVDQESSLKNKHPQDISISIDNGANENVESINYVINEEAKYNNINLDNKITFN
EEEEEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEE
YIEMITIKNGAAFEVAEKDMSNISRLCGLTLLTLENYNQIEGKDSSLENNEVLIFSQEGN
EEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
FSEESINIGQKEYKIKDELNSMKFINKQDTAMIKGYYIVVKNNDILKSIYKDMTNEDLEN
CCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCC
TKYSISFDVNGDKNYIMNFCSDISSKVNEIYNGEFTSIYTDREDFYTINGGFLFIGVFLG
CEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEECCCHHHHHHHHH
LLFTMATVLIIYYKQISEGYDDSKRFNIMQKVGMSKEEVKNTISKQILMVFFLPLITAII
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HMAFAFKEMKKMLALFSISNTKILLQCTIGTIIVFTIVYILVYMLTAKTYYKIVEQED
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]