Definition Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome chromosome I, complete sequence.
Accession NC_010602
Length 3,599,677

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The map label for this gene is 183221794

Identifier: 183221794

GI number: 183221794

Start: 2498177

End: 2500648

Strand: Direct

Name: 183221794

Synonym: LEPBI_I2425

Alternate gene names: NA

Gene position: 2498177-2500648 (Clockwise)

Preceding gene: 183221793

Following gene: 183221795

Centisome position: 69.4

GC content: 30.38

Gene sequence:

>2472_bases
ATGATTCATCTTTATTTTCATTTCATTTTTAGTTATTTTAAAAGCCATTTAGGTAAAGTTTTTTTAAATCTATTGAGTGT
CAGCCTTGGAATTGCATTATTTGTAAGCACCCAAATCAACGGATGGAAAGCTGAAAAAAGTTTAATTGATCAAACGATAG
GATTTAATTCAAGAAATTTTATCGGTCGCTACGTTTTCACCTCGAACTTAACTCCAAACAAACCGGAAAAGACAATTTTA
AAAAAAATTAATGACTCGTTACCAAACACGGTAATAGTAGAGCCGGAATTACAAACAAAAGGATACTTCAAAAATGAAGA
AAACCAGATCTTTAGTATCCCAACGATTGGAAAAGATCTAATTACCCAATTCAATTTCAATCTTCAAATTAAAAATAACG
ACCAATTCCCAAAATATATTTTTAGCAAAGCATTACTTTCGAAGCTAAATACAAATGGGTTTCCATTATTGTTTCATCTC
TGCAACAAACAAATCAGTATTAATCGAAGCGATATTCTTGAGATTTCAAAAGATGGGTTATTTGTTTTGATGGATATCGA
AAGGTTACAGAATATTTGTAACCTTAAGGATAATTTCACATCCATTAATCTGATTCAATCCCAAAATCATTCAACTATTT
TGTATGACCTTCCAAAAACAATGACCTTAGAAAATTGGTATTACGAATCCAATGAAGAGATCAAAGAAAGAGCAGGAATT
GCGCTTGGATCACTCAAAATTAATTTAACTATTATTTCGTTGGTTTCTGTTTTAATTTCCTTTTTTATGGTCTCAAATAT
CTATACTGGATTATTTATTTCGAGAAAAATTGAATTCGGAATTTTACTTTCCATAGGAGGGACAAAACTCAACAACTTTT
TCCTCTTCCTTATACTTTCCGTGTTCATGGGATTCATAGGTGGTTCAATCGGCGTCTATTTAGGAGTTACGATTTCGAAC
CAAAACTTAGTAAAAACTGTAAGTACTTTAACAGATACAATGCAAATTGAATCCTACAATGACTACCCTATTGAAATCAT
TTTATATGGAATTAGTCTGTCAATTTTCGGTTCAATCGTAAGTGCACTATTTAATGCGATAAAGGCATACAATATACTCC
CAATTGAGTTATTGCGCGATAGGGATCAGCTTACAACAAATTTCCCGTTTATTTTATCAAAACATGCAATCTTAGTAATT
TCACTGTTCCTAATTTTATTAGGATTTTTCATTGGGAATATTAAAATCGAAAAACAAATTTTGCCTGGATTAGCTGGAGT
AGGTTTTGTAATTTTTGGTTTTGTAACGTTAAATTATATCTTAATACCTTATATTATAAATGGAATTGAAAAATTAACTA
AAAATATAAATTTATCCCCAAGCTTCTATATGGGCATAAAAGAAGTTGGAATGGAATCATGGAAAAACGGACTGATTGTT
TCTACAATTATGTTATCAACTTCGCTTGTATTTACTCTATCCACCTTAACCTCAAGTTACCAAACATCGTTAAAACATTG
GATCGCAGATGAAAACAAATCAGACTTTTCATTGATCAATGAAGAAAAATTAAATTCTGGTGAACCCGGAGTTCCTATTG
ATTTATTCGAAACTTTAAAATCGAAAACCATTTTTTTAGATGTAGAACCATTTTATATTAATCCTAAACTCACTTTAAAT
GGAAAATTTTTCACATTACATGTATTAAATTTTCCGGAATCATTAGATAAGAATAGGATTCTCGTTTCCAAAAATTTATG
TTTTCTCGAAAAGATTTGTAAGGGTGATTCAATCACACTTACAACTGAAAAAAAAGGTCCAGTTACTTTGGAAATCCAAG
AAGAAAAAGAACATTTTTTTTCTGAAAGAGGGACAATTCTAATGGATTTTCAGCTATTTAAGCAGTTATATACTATTGAA
TTTCTGAATTCAATCCGACTGACTTTAAAAAAAGATAAAAATTACCATGATGGATATCATCTGATTCACAACATTTCCAA
AGAATATGGCCTAATTCACTTAGATCAGATTAAACTAGGAGAACTTTATTTACAAGGTATGGATCAAGTTTTTTCCGTTT
TAGATACTCTTAAAATCACGGCCATCGCGATATCAGTATTATCACTTATTACTTCGATTTTTTACTATGTAAAGGAAAAG
TCTAGAATTCTTGCTGGATTAAAAGCAATAGGAATGAGTCTCTCGCAGTTATACTTTTTACTTTTTTACCAAATTTTATT
TCTCGTAACAACTGGAATTACTTCCGGAATTGTAAATAGTTTAATTTTATCTCCCATTGTAGTCTATGGGATTAATAGAA
ACGCATTTGGGTGGGACTTGGCCTTTACATTCCCTGTTCACTTTGTAGCAAAACTCCCGATTATAATCCCTATATTCTCA
GCATTCATTACAATCATTCCATTTTATTTTGTATCTCGAATGAAAATTTCTAAAGAACTAAACTACGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGATTTAGGTATAACAGTATTGTTAGTCACCCATAACGAAGAAATTGGAAAATCAGGTGATATAAACTATCACATGCTA
GATGGAAAAATATCAATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTTACCAAAAAGATACCATTCCATATTTTTAGAACATGGCAGGAAGCATCAAAGTTTGTTTGGATCTCGCAGACATG
ATTCGAAAAGAGAATCTAGA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Integral Membrane Protein; Lipoprotein Releasing System LolE Permease Component

Number of amino acids: Translated: 823; Mature: 823

Protein sequence:

>823_residues
MIHLYFHFIFSYFKSHLGKVFLNLLSVSLGIALFVSTQINGWKAEKSLIDQTIGFNSRNFIGRYVFTSNLTPNKPEKTIL
KKINDSLPNTVIVEPELQTKGYFKNEENQIFSIPTIGKDLITQFNFNLQIKNNDQFPKYIFSKALLSKLNTNGFPLLFHL
CNKQISINRSDILEISKDGLFVLMDIERLQNICNLKDNFTSINLIQSQNHSTILYDLPKTMTLENWYYESNEEIKERAGI
ALGSLKINLTIISLVSVLISFFMVSNIYTGLFISRKIEFGILLSIGGTKLNNFFLFLILSVFMGFIGGSIGVYLGVTISN
QNLVKTVSTLTDTMQIESYNDYPIEIILYGISLSIFGSIVSALFNAIKAYNILPIELLRDRDQLTTNFPFILSKHAILVI
SLFLILLGFFIGNIKIEKQILPGLAGVGFVIFGFVTLNYILIPYIINGIEKLTKNINLSPSFYMGIKEVGMESWKNGLIV
STIMLSTSLVFTLSTLTSSYQTSLKHWIADENKSDFSLINEEKLNSGEPGVPIDLFETLKSKTIFLDVEPFYINPKLTLN
GKFFTLHVLNFPESLDKNRILVSKNLCFLEKICKGDSITLTTEKKGPVTLEIQEEKEHFFSERGTILMDFQLFKQLYTIE
FLNSIRLTLKKDKNYHDGYHLIHNISKEYGLIHLDQIKLGELYLQGMDQVFSVLDTLKITAIAISVLSLITSIFYYVKEK
SRILAGLKAIGMSLSQLYFLLFYQILFLVTTGITSGIVNSLILSPIVVYGINRNAFGWDLAFTFPVHFVAKLPIIIPIFS
AFITIIPFYFVSRMKISKELNYE

Sequences:

>Translated_823_residues
MIHLYFHFIFSYFKSHLGKVFLNLLSVSLGIALFVSTQINGWKAEKSLIDQTIGFNSRNFIGRYVFTSNLTPNKPEKTIL
KKINDSLPNTVIVEPELQTKGYFKNEENQIFSIPTIGKDLITQFNFNLQIKNNDQFPKYIFSKALLSKLNTNGFPLLFHL
CNKQISINRSDILEISKDGLFVLMDIERLQNICNLKDNFTSINLIQSQNHSTILYDLPKTMTLENWYYESNEEIKERAGI
ALGSLKINLTIISLVSVLISFFMVSNIYTGLFISRKIEFGILLSIGGTKLNNFFLFLILSVFMGFIGGSIGVYLGVTISN
QNLVKTVSTLTDTMQIESYNDYPIEIILYGISLSIFGSIVSALFNAIKAYNILPIELLRDRDQLTTNFPFILSKHAILVI
SLFLILLGFFIGNIKIEKQILPGLAGVGFVIFGFVTLNYILIPYIINGIEKLTKNINLSPSFYMGIKEVGMESWKNGLIV
STIMLSTSLVFTLSTLTSSYQTSLKHWIADENKSDFSLINEEKLNSGEPGVPIDLFETLKSKTIFLDVEPFYINPKLTLN
GKFFTLHVLNFPESLDKNRILVSKNLCFLEKICKGDSITLTTEKKGPVTLEIQEEKEHFFSERGTILMDFQLFKQLYTIE
FLNSIRLTLKKDKNYHDGYHLIHNISKEYGLIHLDQIKLGELYLQGMDQVFSVLDTLKITAIAISVLSLITSIFYYVKEK
SRILAGLKAIGMSLSQLYFLLFYQILFLVTTGITSGIVNSLILSPIVVYGINRNAFGWDLAFTFPVHFVAKLPIIIPIFS
AFITIIPFYFVSRMKISKELNYE
>Mature_823_residues
MIHLYFHFIFSYFKSHLGKVFLNLLSVSLGIALFVSTQINGWKAEKSLIDQTIGFNSRNFIGRYVFTSNLTPNKPEKTIL
KKINDSLPNTVIVEPELQTKGYFKNEENQIFSIPTIGKDLITQFNFNLQIKNNDQFPKYIFSKALLSKLNTNGFPLLFHL
CNKQISINRSDILEISKDGLFVLMDIERLQNICNLKDNFTSINLIQSQNHSTILYDLPKTMTLENWYYESNEEIKERAGI
ALGSLKINLTIISLVSVLISFFMVSNIYTGLFISRKIEFGILLSIGGTKLNNFFLFLILSVFMGFIGGSIGVYLGVTISN
QNLVKTVSTLTDTMQIESYNDYPIEIILYGISLSIFGSIVSALFNAIKAYNILPIELLRDRDQLTTNFPFILSKHAILVI
SLFLILLGFFIGNIKIEKQILPGLAGVGFVIFGFVTLNYILIPYIINGIEKLTKNINLSPSFYMGIKEVGMESWKNGLIV
STIMLSTSLVFTLSTLTSSYQTSLKHWIADENKSDFSLINEEKLNSGEPGVPIDLFETLKSKTIFLDVEPFYINPKLTLN
GKFFTLHVLNFPESLDKNRILVSKNLCFLEKICKGDSITLTTEKKGPVTLEIQEEKEHFFSERGTILMDFQLFKQLYTIE
FLNSIRLTLKKDKNYHDGYHLIHNISKEYGLIHLDQIKLGELYLQGMDQVFSVLDTLKITAIAISVLSLITSIFYYVKEK
SRILAGLKAIGMSLSQLYFLLFYQILFLVTTGITSGIVNSLILSPIVVYGINRNAFGWDLAFTFPVHFVAKLPIIIPIFS
AFITIIPFYFVSRMKISKELNYE

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93564; Mature: 93564

Theoretical pI: Translated: 8.89; Mature: 8.89

Prosite motif: PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIHLYFHFIFSYFKSHLGKVFLNLLSVSLGIALFVSTQINGWKAEKSLIDQTIGFNSRNF
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
IGRYVFTSNLTPNKPEKTILKKINDSLPNTVIVEPELQTKGYFKNEENQIFSIPTIGKDL
EEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHH
ITQFNFNLQIKNNDQFPKYIFSKALLSKLNTNGFPLLFHLCNKQISINRSDILEISKDGL
HHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHEECCCCE
FVLMDIERLQNICNLKDNFTSINLIQSQNHSTILYDLPKTMTLENWYYESNEEIKERAGI
EEEEEHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEECCEECCCHHHHHHCCE
ALGSLKINLTIISLVSVLISFFMVSNIYTGLFISRKIEFGILLSIGGTKLNNFFLFLILS
EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
VFMGFIGGSIGVYLGVTISNQNLVKTVSTLTDTMQIESYNDYPIEIILYGISLSIFGSIV
HHHHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHH
SALFNAIKAYNILPIELLRDRDQLTTNFPFILSKHAILVISLFLILLGFFIGNIKIEKQI
HHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHH
LPGLAGVGFVIFGFVTLNYILIPYIINGIEKLTKNINLSPSFYMGIKEVGMESWKNGLIV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHCCCEEH
STIMLSTSLVFTLSTLTSSYQTSLKHWIADENKSDFSLINEEKLNSGEPGVPIDLFETLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHC
SKTIFLDVEPFYINPKLTLNGKFFTLHVLNFPESLDKNRILVSKNLCFLEKICKGDSITL
CCEEEEEECCEEECCEEEECCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCEEE
TTEKKGPVTLEIQEEKEHFFSERGTILMDFQLFKQLYTIEFLNSIRLTLKKDKNYHDGYH
EECCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHH
LIHNISKEYGLIHLDQIKLGELYLQGMDQVFSVLDTLKITAIAISVLSLITSIFYYVKEK
HHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRILAGLKAIGMSLSQLYFLLFYQILFLVTTGITSGIVNSLILSPIVVYGINRNAFGWDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEE
AFTFPVHFVAKLPIIIPIFSAFITIIPFYFVSRMKISKELNYE
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIHLYFHFIFSYFKSHLGKVFLNLLSVSLGIALFVSTQINGWKAEKSLIDQTIGFNSRNF
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
IGRYVFTSNLTPNKPEKTILKKINDSLPNTVIVEPELQTKGYFKNEENQIFSIPTIGKDL
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FVLMDIERLQNICNLKDNFTSINLIQSQNHSTILYDLPKTMTLENWYYESNEEIKERAGI
EEEEEHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEECCEECCCHHHHHHCCE
ALGSLKINLTIISLVSVLISFFMVSNIYTGLFISRKIEFGILLSIGGTKLNNFFLFLILS
EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
VFMGFIGGSIGVYLGVTISNQNLVKTVSTLTDTMQIESYNDYPIEIILYGISLSIFGSIV
HHHHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHH
SALFNAIKAYNILPIELLRDRDQLTTNFPFILSKHAILVISLFLILLGFFIGNIKIEKQI
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEE
AFTFPVHFVAKLPIIIPIFSAFITIIPFYFVSRMKISKELNYE
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA