Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is 18311071

Identifier: 18311071

GI number: 18311071

Start: 2397146

End: 2397823

Strand: Direct

Name: 18311071

Synonym: CPE2089

Alternate gene names: NA

Gene position: 2397146-2397823 (Clockwise)

Preceding gene: 18311061

Following gene: 18311072

Centisome position: 79.08

GC content: 23.45

Gene sequence:

>678_bases
ATGAGTGAATTTTTTAATCTTGAAAAACTACTTACTTTTTTTAATTATATCTTTTGGTTTTTTATGCTTAATATATTTTT
CTCTATATTAAATATACCTGTAATCTTGTTCTTCTTATTTGTAGGACTTAGTAATATAACAACATATTTACCTTTATTTT
TAGTTTCTCTAATTCCTTTTGGAGCAAGTTTTACAGCACTGCTTTACTGCATGAGAAAATTAGTGAAATATAAAGATTTA
GATTTATTTAGTGACTTTATTAAGGGTTTAAAATATAATTGGAAACAATCTACCTTAATGTGGTGTGGAGAATTATTTTT
AATATTCCTTTTAAGCTTTAACTTAAGAATATTTTCAACTGTTTACTATAGTTTACCTCTTACTTGTGTATTTATAGTAT
TAATGGTCTTAACACTATTAACTACAACATATATTTTTGTATTAATATCAAGATTTTCTATGAGTTCAATGGATATTTTA
AGAGCTAGTGTAATTTTAACTTTTACTAAACCAGTAGTTTCTATTGGAAATATAGTTATATTTTTATTTTCACTTATGCT
ATTCGAAATTAGTCCTGGAACAACAGTAATTTTTATGGCAAGCATAGTATCTTATTTAATAATGTTTTTAAATAAAAATC
TTTTAGAAAGTTTAGAAACCAAGAGTTCACAAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAATTTCATGCATATTTAAATTGTTTTTACCCTCTACTTATTTTAAACTATAATTACAAATTAGTTAAACCATTACAT
TATTTTATGGAGTGATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATGTTATATCAAAATAACTTTTAATTAAACTTACAAATAGTATTAAGAAATCTCTAGTAATTTCCTAACACATTTG
TAAGTTTTATTATTAGCTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 225; Mature: 224

Protein sequence:

>225_residues
MSEFFNLEKLLTFFNYIFWFFMLNIFFSILNIPVILFFLFVGLSNITTYLPLFLVSLIPFGASFTALLYCMRKLVKYKDL
DLFSDFIKGLKYNWKQSTLMWCGELFLIFLLSFNLRIFSTVYYSLPLTCVFIVLMVLTLLTTTYIFVLISRFSMSSMDIL
RASVILTFTKPVVSIGNIVIFLFSLMLFEISPGTTVIFMASIVSYLIMFLNKNLLESLETKSSQA

Sequences:

>Translated_225_residues
MSEFFNLEKLLTFFNYIFWFFMLNIFFSILNIPVILFFLFVGLSNITTYLPLFLVSLIPFGASFTALLYCMRKLVKYKDL
DLFSDFIKGLKYNWKQSTLMWCGELFLIFLLSFNLRIFSTVYYSLPLTCVFIVLMVLTLLTTTYIFVLISRFSMSSMDIL
RASVILTFTKPVVSIGNIVIFLFSLMLFEISPGTTVIFMASIVSYLIMFLNKNLLESLETKSSQA
>Mature_224_residues
SEFFNLEKLLTFFNYIFWFFMLNIFFSILNIPVILFFLFVGLSNITTYLPLFLVSLIPFGASFTALLYCMRKLVKYKDLD
LFSDFIKGLKYNWKQSTLMWCGELFLIFLLSFNLRIFSTVYYSLPLTCVFIVLMVLTLLTTTYIFVLISRFSMSSMDILR
ASVILTFTKPVVSIGNIVIFLFSLMLFEISPGTTVIFMASIVSYLIMFLNKNLLESLETKSSQA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 26138; Mature: 26007

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSEFFNLEKLLTFFNYIFWFFMLNIFFSILNIPVILFFLFVGLSNITTYLPLFLVSLIPF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GASFTALLYCMRKLVKYKDLDLFSDFIKGLKYNWKQSTLMWCGELFLIFLLSFNLRIFST
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYYSLPLTCVFIVLMVLTLLTTTYIFVLISRFSMSSMDILRASVILTFTKPVVSIGNIVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLFSLMLFEISPGTTVIFMASIVSYLIMFLNKNLLESLETKSSQA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SEFFNLEKLLTFFNYIFWFFMLNIFFSILNIPVILFFLFVGLSNITTYLPLFLVSLIPF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GASFTALLYCMRKLVKYKDLDLFSDFIKGLKYNWKQSTLMWCGELFLIFLLSFNLRIFST
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYYSLPLTCVFIVLMVLTLLTTTYIFVLISRFSMSSMDILRASVILTFTKPVVSIGNIVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLFSLMLFEISPGTTVIFMASIVSYLIMFLNKNLLESLETKSSQA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA