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The map label for this gene is trkB [H]

Identifier: 18310873

GI number: 18310873

Start: 2172569

End: 2173909

Strand: Reverse

Name: trkB [H]

Synonym: CPE1891

Alternate gene names: 18310873

Gene position: 2173909-2172569 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18310874

Following gene: 18310872

Centisome position: 71.71

GC content: 29.98

Gene sequence:

>1341_bases
ATGTACATTAAACTGACAAAAAAGATAAAATTTAGTGCCGTTCAGATTTTAGCTTTAGGTTTTTCTATGGTTATTTTATT
AGGTGCTATAATATTAAGTCTTCCAATATCATCTAAAAGTGGTGAGTTTACTCCTTTTTTAGATAGTTTATTTACTTCAA
CTTCAGCTGTATGTGTTACGGGACTTATAACATTAAATACAGCGGCACATTGGAACTATTTTGGGAAAACTGTCATAATA
ATCTTAATACAAATAGGTGGATTGGGATTCATGTCCTTTACAACTTTATTTGCCTTAATGGTTAAGAAAAAAATAACCTT
AAGGGAAAGACTTCTTATACAAGAAGCTATGAATACCTTTGGAATACAGGGGTTAGTTAGAATGATTAGATATATCTTAG
CATTTACATTTTCAGTAGAAATGTTAGGTGCACTATTATTATCTACTCAATTTATACCCAAGTTTGGATTCTTAAAAGGA
ATATACTATAGTATTTGGTATTCTATATCAGCTTTTTGTAATGCAGGATTTGATTTATTTGGAGATAATCTAGTTGGATA
TGCTAACAATAAAACCGTAATATTAACAATTGCAGCCTTAATAGTAATTGGTGGTTTAGGATTTACTGTTTGGTCAGAAT
TATATAATTATAAGGGGTATAAGAAATTATCTTTACACTCTAAAGTTGTAATAATGATAACAGCTATCCTTTTAATTGGG
GGAGCTATCCTTATGTTCATATTTGAATATAATAATCCTAATACTCTTAAATATATGAGTTTTGGAGATAAATTAACTAA
TGCATTCTTTGCTTCTGCAACCACAAGGACTGCTGGATTTAACTCTGTTTCTACTGCGGATATGACTTTAGCTGGAAAAT
TCTTAACTATATTATTAATGTTTGTAGGTGGATCACCAGGGTCAACAGCAGGGGGAATTAAAACTGCTACCTTTGGTATA
GTAGTACTTACTCTAATCTCTATAATAAGAGGAAGAGAAGATACTGAAGTATTTAAAAAGAGAATTTCAAAAGAATTAGT
GTATAAGGCTTTTGCTGTTTTATTTATAGGTTTTGGTATAGTGGTACTTGGAACATTAATTTTAGCAGTAACAGAACCAG
GATTTTCATTAGAATATATTCTATATGAAGTTACATCAGCTTTTGCTACAGTTGGATTAACTCTTGGATTAACTCCATAT
CTTTCAGTAATAGGAAAAATAATAATAATAATAACTATGTATTTAGGAAGAGTGGGCCCTATGACTGTTGTTCTAGCTTT
AGCTAATAGAAAGAAACCAAGTGCATACAAATACCCAGAAGATAAAATATTAATAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTCTAAAAATAAGACAACTTTACATATATAAATTAAAAATAAGATATAATAAAATTAAAGGAAAAATATAATATTAG
TTTAAGTTGGGGGTTTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGTTAGGAGTGTAAGGCTTATGTCAAGTAAACAATTCGTTATTATAGGATTAGGAAGATTTGGATCATCAGTAGCTA
AAACTTTATATGCTTTAGGT

Product: potassium uptake protein, TrkH family

Products: NA

Alternate protein names: Na(+)-translocating ATPase subunit J [H]

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 446

Protein sequence:

>446_residues
MYIKLTKKIKFSAVQILALGFSMVILLGAIILSLPISSKSGEFTPFLDSLFTSTSAVCVTGLITLNTAAHWNYFGKTVII
ILIQIGGLGFMSFTTLFALMVKKKITLRERLLIQEAMNTFGIQGLVRMIRYILAFTFSVEMLGALLLSTQFIPKFGFLKG
IYYSIWYSISAFCNAGFDLFGDNLVGYANNKTVILTIAALIVIGGLGFTVWSELYNYKGYKKLSLHSKVVIMITAILLIG
GAILMFIFEYNNPNTLKYMSFGDKLTNAFFASATTRTAGFNSVSTADMTLAGKFLTILLMFVGGSPGSTAGGIKTATFGI
VVLTLISIIRGREDTEVFKKRISKELVYKAFAVLFIGFGIVVLGTLILAVTEPGFSLEYILYEVTSAFATVGLTLGLTPY
LSVIGKIIIIITMYLGRVGPMTVVLALANRKKPSAYKYPEDKILIG

Sequences:

>Translated_446_residues
MYIKLTKKIKFSAVQILALGFSMVILLGAIILSLPISSKSGEFTPFLDSLFTSTSAVCVTGLITLNTAAHWNYFGKTVII
ILIQIGGLGFMSFTTLFALMVKKKITLRERLLIQEAMNTFGIQGLVRMIRYILAFTFSVEMLGALLLSTQFIPKFGFLKG
IYYSIWYSISAFCNAGFDLFGDNLVGYANNKTVILTIAALIVIGGLGFTVWSELYNYKGYKKLSLHSKVVIMITAILLIG
GAILMFIFEYNNPNTLKYMSFGDKLTNAFFASATTRTAGFNSVSTADMTLAGKFLTILLMFVGGSPGSTAGGIKTATFGI
VVLTLISIIRGREDTEVFKKRISKELVYKAFAVLFIGFGIVVLGTLILAVTEPGFSLEYILYEVTSAFATVGLTLGLTPY
LSVIGKIIIIITMYLGRVGPMTVVLALANRKKPSAYKYPEDKILIG
>Mature_446_residues
MYIKLTKKIKFSAVQILALGFSMVILLGAIILSLPISSKSGEFTPFLDSLFTSTSAVCVTGLITLNTAAHWNYFGKTVII
ILIQIGGLGFMSFTTLFALMVKKKITLRERLLIQEAMNTFGIQGLVRMIRYILAFTFSVEMLGALLLSTQFIPKFGFLKG
IYYSIWYSISAFCNAGFDLFGDNLVGYANNKTVILTIAALIVIGGLGFTVWSELYNYKGYKKLSLHSKVVIMITAILLIG
GAILMFIFEYNNPNTLKYMSFGDKLTNAFFASATTRTAGFNSVSTADMTLAGKFLTILLMFVGGSPGSTAGGIKTATFGI
VVLTLISIIRGREDTEVFKKRISKELVYKAFAVLFIGFGIVVLGTLILAVTEPGFSLEYILYEVTSAFATVGLTLGLTPY
LSVIGKIIIIITMYLGRVGPMTVVLALANRKKPSAYKYPEDKILIG

Specific function: Involved in ATP-driven sodium extrusion [H]

COG id: COG0168

COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003445
- InterPro:   IPR004772 [H]

Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]

EC number: =3.6.3.14 [H]

Molecular weight: Translated: 48690; Mature: 48690

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYIKLTKKIKFSAVQILALGFSMVILLGAIILSLPISSKSGEFTPFLDSLFTSTSAVCVT
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHH
GLITLNTAAHWNYFGKTVIIILIQIGGLGFMSFTTLFALMVKKKITLRERLLIQEAMNTF
HHHHCCCHHHHHHHHHEEEHEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIQGLVRMIRYILAFTFSVEMLGALLLSTQFIPKFGFLKGIYYSIWYSISAFCNAGFDLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHC
GDNLVGYANNKTVILTIAALIVIGGLGFTVWSELYNYKGYKKLSLHSKVVIMITAILLIG
CCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
GAILMFIFEYNNPNTLKYMSFGDKLTNAFFASATTRTAGFNSVSTADMTLAGKFLTILLM
HHHHHHEEEECCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FVGGSPGSTAGGIKTATFGIVVLTLISIIRGREDTEVFKKRISKELVYKAFAVLFIGFGI
HHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLGTLILAVTEPGFSLEYILYEVTSAFATVGLTLGLTPYLSVIGKIIIIITMYLGRVGP
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
MTVVLALANRKKPSAYKYPEDKILIG
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MYIKLTKKIKFSAVQILALGFSMVILLGAIILSLPISSKSGEFTPFLDSLFTSTSAVCVT
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHH
GLITLNTAAHWNYFGKTVIIILIQIGGLGFMSFTTLFALMVKKKITLRERLLIQEAMNTF
HHHHCCCHHHHHHHHHEEEHEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIQGLVRMIRYILAFTFSVEMLGALLLSTQFIPKFGFLKGIYYSIWYSISAFCNAGFDLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHC
GDNLVGYANNKTVILTIAALIVIGGLGFTVWSELYNYKGYKKLSLHSKVVIMITAILLIG
CCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
GAILMFIFEYNNPNTLKYMSFGDKLTNAFFASATTRTAGFNSVSTADMTLAGKFLTILLM
HHHHHHEEEECCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FVGGSPGSTAGGIKTATFGIVVLTLISIIRGREDTEVFKKRISKELVYKAFAVLFIGFGI
HHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLGTLILAVTEPGFSLEYILYEVTSAFATVGLTLGLTPYLSVIGKIIIIITMYLGRVGP
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
MTVVLALANRKKPSAYKYPEDKILIG
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8157629 [H]