| Definition | Clostridium perfringens str. 13, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003366 |
| Length | 3,031,430 |
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The map label for this gene is 18310606
Identifier: 18310606
GI number: 18310606
Start: 1893868
End: 1895793
Strand: Direct
Name: 18310606
Synonym: CPE1624
Alternate gene names: NA
Gene position: 1893868-1895793 (Clockwise)
Preceding gene: 18310605
Following gene: 18310630
Centisome position: 62.47
GC content: 24.77
Gene sequence:
>1926_bases ATGATTGATAAAGTTATAAAGAAATACAATTTAGATGTGGATTCTATGAAACGTGAAGGTACAATTGCCTGTTTAACATT TTTAGCCTCTTGGATATTCTTTGGAATTAATAATGCAATCTTAGCATATCCAATAGCTTTAACCTCCTCAATTCTTTTAA AAGAAAATTTTAAAATAAATCCTTTAGAAAAAACTATACGACTTTTATTTTTATATTGTTTTATAGTTGTTCTATCTTTT TTAGCATCAAACCATTTTTTATTAGGAATTATAATAAACTTTTTCACCATATTTTTCATAGCTTATAAGCTCTCAGTTGC CTACACTCCTTTATTATACAAACCATTCTTAATGTTATATGTATTTACTTATTTTTATAAGGTAGACTTTCAAGGCTTAC CTAGAAGATTATTATCTATTTTCTTTGGCTTTAGTTTAATAATAATCTTTCACTTATTTTTAAACAAGCTAAGTTATAAA TCCTTAATAAAAGATAGTATAAATAAATCTCTATTTTTATTGGAAAGCCAAGTAGATAACCTTATTTTTAAAAGTTATAA TTCAGATTTGCAGCAATCTATCTCTAAAGAACTTACTACTATTTGTTATAATCTTTATACTACAAGAAAAAGAAAAATTT TAACTAATAACTTAGGTAGTATTCAATTTAAAATATATATAATATTAGAAAACTTAAACTTAGATCTATATAATCTAAAT AAGCTCTACTCAAAGCTTAATTACAATAGTGCCCTAATTAAATCATTTTTAAAGGAATTAAAAAAATCTATAAATATTTT AAGATTATATTTAAATGATGAGATTTCTTATTATGAAATAGATAAACAACTGTATAGATTAAATAGGTTTCATGAAGATT TACCTGATCAGTTCACTTTTTTTCATGACTTATCTATTTCAGTAACCAATCTTTATTTGTATTTAGCTGACATGACTACT CTTGAAGAGGGTGAAGGATACAAAAGCTATGATTTATGGAAAAATACAGATAAAAACCAATTTAAATTTAGAGATTCTCT ACATTTTGGTACAATAAAATTTAATTTTGCCCTAAGAATTTCTTTAACCTTAAGTCTTGTGTTACTTCTTAGCTATCTAT TTGATTTTACTAAAATGAGTTGGCTTGGAATAACTATAATGTCAATAATGCAACCTTATTATGAAGAGACTTTAAATAAA AGTAAAGACAGATTAAAGGGTAATCTTTTAGCTATTTTTCTTGTAATTATTATTTTAAACTTGTTTCAAAGCCAAGTTGT GCATATTATTGTATTAGTTTGTAGCCTGTATCTAACCTATGGATTTAAAAGCTATTATAAGCTCTCTCTCTTTACTGCCA TCTCTGCTATTTGCATGGCATCTCTTAGCTATGGAGTTAATACCTTAGCTATTTTTAGAGTTTTTTATTTAGCTTTAGGT ATATTAATAACCTTCTTAGCTAATAAATTTTTATTTCCTTATAACTTAGATCAAGGTCTAAAGGAATTAAGCCTTAAATT AATAAAATATGTAAATATATTAGCAGAAGATCTAATAAAAAATCCTTCAAAAAATGAAGAGGAAATAATAAATTTAACCA TCCATATAAAGCTCATGTGTAACAAGCTTACACTTAGAAATATTCAAAAAAAAGATAAGGATATAAACAGGTTAATACTC TTAACTGAAAATCTTACTGCTTCTTTAAGCTATTATACTCTTTTAAAAAAAGATTTAGGATTGGTATGTGGAATAAATAA AGATGAGTTAATTAAGCTTCAAAGTAAATTGCAATATTCCCTTAAAGAAAAGGTGCCATTAATAGATATAATAAACCTAT TAGATTCAACAGTTGATTCCCTTATTAATTGTCCTTACTCTAGAAAAGTAATTTATAACCCTGCCTCTAATGGGTTTATA TATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAAAGGTATTTTGATAAATGCCTTTTTTTAATTTCAAACATAAATTTATATATTAAGTGGAATAATAGATTTATTATA TATTAATTTAGGTGATGTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAGCTTATTTCTTAAGTAACTATCTCATTATAAGAACACTTAGAATAAAATTTATAATGAGATAAAAAACTTATTTA TGTGATTAAATTATAAGTGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 641; Mature: 641
Protein sequence:
>641_residues MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI Y
Sequences:
>Translated_641_residues MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI Y >Mature_641_residues MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI Y
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74797; Mature: 74797
Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKIN CHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PLEKTIRLLFLYCFIVVLSFLASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYKSLIKDSINKSLFLLESQVDN HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEHHH KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTF HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEE FHDLSISVTNLYLYLADMTTLEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRI HHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEH SLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNKSKDRLKGNLLAIFLVIIILN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMC HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEEEEEEEE NKLTLRNIQKKDKDINRLILLTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYS CHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHH LKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFIY HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKIN CHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PLEKTIRLLFLYCFIVVLSFLASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYKSLIKDSINKSLFLLESQVDN HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEHHH KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTF HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEE FHDLSISVTNLYLYLADMTTLEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRI HHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEH SLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNKSKDRLKGNLLAIFLVIIILN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMC HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEEEEEEEE NKLTLRNIQKKDKDINRLILLTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYS CHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHH LKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFIY HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA