Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is 18310606

Identifier: 18310606

GI number: 18310606

Start: 1893868

End: 1895793

Strand: Direct

Name: 18310606

Synonym: CPE1624

Alternate gene names: NA

Gene position: 1893868-1895793 (Clockwise)

Preceding gene: 18310605

Following gene: 18310630

Centisome position: 62.47

GC content: 24.77

Gene sequence:

>1926_bases
ATGATTGATAAAGTTATAAAGAAATACAATTTAGATGTGGATTCTATGAAACGTGAAGGTACAATTGCCTGTTTAACATT
TTTAGCCTCTTGGATATTCTTTGGAATTAATAATGCAATCTTAGCATATCCAATAGCTTTAACCTCCTCAATTCTTTTAA
AAGAAAATTTTAAAATAAATCCTTTAGAAAAAACTATACGACTTTTATTTTTATATTGTTTTATAGTTGTTCTATCTTTT
TTAGCATCAAACCATTTTTTATTAGGAATTATAATAAACTTTTTCACCATATTTTTCATAGCTTATAAGCTCTCAGTTGC
CTACACTCCTTTATTATACAAACCATTCTTAATGTTATATGTATTTACTTATTTTTATAAGGTAGACTTTCAAGGCTTAC
CTAGAAGATTATTATCTATTTTCTTTGGCTTTAGTTTAATAATAATCTTTCACTTATTTTTAAACAAGCTAAGTTATAAA
TCCTTAATAAAAGATAGTATAAATAAATCTCTATTTTTATTGGAAAGCCAAGTAGATAACCTTATTTTTAAAAGTTATAA
TTCAGATTTGCAGCAATCTATCTCTAAAGAACTTACTACTATTTGTTATAATCTTTATACTACAAGAAAAAGAAAAATTT
TAACTAATAACTTAGGTAGTATTCAATTTAAAATATATATAATATTAGAAAACTTAAACTTAGATCTATATAATCTAAAT
AAGCTCTACTCAAAGCTTAATTACAATAGTGCCCTAATTAAATCATTTTTAAAGGAATTAAAAAAATCTATAAATATTTT
AAGATTATATTTAAATGATGAGATTTCTTATTATGAAATAGATAAACAACTGTATAGATTAAATAGGTTTCATGAAGATT
TACCTGATCAGTTCACTTTTTTTCATGACTTATCTATTTCAGTAACCAATCTTTATTTGTATTTAGCTGACATGACTACT
CTTGAAGAGGGTGAAGGATACAAAAGCTATGATTTATGGAAAAATACAGATAAAAACCAATTTAAATTTAGAGATTCTCT
ACATTTTGGTACAATAAAATTTAATTTTGCCCTAAGAATTTCTTTAACCTTAAGTCTTGTGTTACTTCTTAGCTATCTAT
TTGATTTTACTAAAATGAGTTGGCTTGGAATAACTATAATGTCAATAATGCAACCTTATTATGAAGAGACTTTAAATAAA
AGTAAAGACAGATTAAAGGGTAATCTTTTAGCTATTTTTCTTGTAATTATTATTTTAAACTTGTTTCAAAGCCAAGTTGT
GCATATTATTGTATTAGTTTGTAGCCTGTATCTAACCTATGGATTTAAAAGCTATTATAAGCTCTCTCTCTTTACTGCCA
TCTCTGCTATTTGCATGGCATCTCTTAGCTATGGAGTTAATACCTTAGCTATTTTTAGAGTTTTTTATTTAGCTTTAGGT
ATATTAATAACCTTCTTAGCTAATAAATTTTTATTTCCTTATAACTTAGATCAAGGTCTAAAGGAATTAAGCCTTAAATT
AATAAAATATGTAAATATATTAGCAGAAGATCTAATAAAAAATCCTTCAAAAAATGAAGAGGAAATAATAAATTTAACCA
TCCATATAAAGCTCATGTGTAACAAGCTTACACTTAGAAATATTCAAAAAAAAGATAAGGATATAAACAGGTTAATACTC
TTAACTGAAAATCTTACTGCTTCTTTAAGCTATTATACTCTTTTAAAAAAAGATTTAGGATTGGTATGTGGAATAAATAA
AGATGAGTTAATTAAGCTTCAAAGTAAATTGCAATATTCCCTTAAAGAAAAGGTGCCATTAATAGATATAATAAACCTAT
TAGATTCAACAGTTGATTCCCTTATTAATTGTCCTTACTCTAGAAAAGTAATTTATAACCCTGCCTCTAATGGGTTTATA
TATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAAAAGGTATTTTGATAAATGCCTTTTTTTAATTTCAAACATAAATTTATATATTAAGTGGAATAATAGATTTATTATA
TATTAATTTAGGTGATGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAAGCTTATTTCTTAAGTAACTATCTCATTATAAGAACACTTAGAATAAAATTTATAATGAGATAAAAAACTTATTTA
TGTGATTAAATTATAAGTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 641; Mature: 641

Protein sequence:

>641_residues
MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF
LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK
SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN
KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT
LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK
SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG
ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL
LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI
Y

Sequences:

>Translated_641_residues
MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF
LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK
SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN
KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT
LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK
SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG
ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL
LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI
Y
>Mature_641_residues
MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKINPLEKTIRLLFLYCFIVVLSF
LASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLYVFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYK
SLIKDSINKSLFLLESQVDNLIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN
KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTFFHDLSISVTNLYLYLADMTT
LEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRISLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNK
SKDRLKGNLLAIFLVIIILNLFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG
ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMCNKLTLRNIQKKDKDINRLIL
LTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYSLKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFI
Y

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74797; Mature: 74797

Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKIN
CHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PLEKTIRLLFLYCFIVVLSFLASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYKSLIKDSINKSLFLLESQVDN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEHHH
KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEE
FHDLSISVTNLYLYLADMTTLEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRI
HHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEH
SLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNKSKDRLKGNLLAIFLVIIILN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMC
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEEEEEEEE
NKLTLRNIQKKDKDINRLILLTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYS
CHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
LKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFIY
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIDKVIKKYNLDVDSMKREGTIACLTFLASWIFFGINNAILAYPIALTSSILLKENFKIN
CHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PLEKTIRLLFLYCFIVVLSFLASNHFLLGIIINFFTIFFIAYKLSVAYTPLLYKPFLMLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFTYFYKVDFQGLPRRLLSIFFGFSLIIIFHLFLNKLSYKSLIKDSINKSLFLLESQVDN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LIFKSYNSDLQQSISKELTTICYNLYTTRKRKILTNNLGSIQFKIYIILENLNLDLYNLN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEHHH
KLYSKLNYNSALIKSFLKELKKSINILRLYLNDEISYYEIDKQLYRLNRFHEDLPDQFTF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEE
FHDLSISVTNLYLYLADMTTLEEGEGYKSYDLWKNTDKNQFKFRDSLHFGTIKFNFALRI
HHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEH
SLTLSLVLLLSYLFDFTKMSWLGITIMSIMQPYYEETLNKSKDRLKGNLLAIFLVIIILN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFQSQVVHIIVLVCSLYLTYGFKSYYKLSLFTAISAICMASLSYGVNTLAIFRVFYLALG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
ILITFLANKFLFPYNLDQGLKELSLKLIKYVNILAEDLIKNPSKNEEEIINLTIHIKLMC
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEEEEEEEE
NKLTLRNIQKKDKDINRLILLTENLTASLSYYTLLKKDLGLVCGINKDELIKLQSKLQYS
CHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
LKEKVPLIDIINLLDSTVDSLINCPYSRKVIYNPASNGFIY
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA