| Definition | Clostridium perfringens str. 13, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003366 |
| Length | 3,031,430 |
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The map label for this gene is bceB [H]
Identifier: 18309833
GI number: 18309833
Start: 1040120
End: 1042174
Strand: Direct
Name: bceB [H]
Synonym: CPE0851
Alternate gene names: 18309833
Gene position: 1040120-1042174 (Clockwise)
Preceding gene: 18309832
Following gene: 18309834
Centisome position: 34.31
GC content: 25.64
Gene sequence:
>2055_bases ATGACAGGGATGTATTTTAAGATTGCTTTAAACAATGTTAGAAAGAGCTTTAAAGATTATTCAATATATTTTCTAACATT AACTCTTGGAGTATGTATATTCTATGCATTTAACTCCATAGGAGATCAAAAAGCCTTTTTAGAACTTGGAAAAAGACAGG CTGAGTATATAAAAGTATTACAAGGGTTAATATCTGGAATATCTGTATTTATATCTTGTGTTTTAGGTGGATTAATTCTT TATGCAAATAACTTTTTAGTTAAAAAGCGTAAAAAAGAATTAGGTATATATATGACCCTTGGTATGGGAAAAAATAAAAT TTCAAAAATACTTACATATGAAACAGCACTAGTAGGAATTATATCATTAGTTGTAGGCTTAGGAGTAGGTATAATAGTTT CTCAAGGAATATCTGCCTTTGCATCTAAATTATTTGAAGTATCTCTAAGTAATTATAAATTTTTATTATCAACTGATGCT ATTTTAAAAACTGTTTTATACTTTGGTATAATTTTTATCTTAGTTATGATTTTTAATACTTTTGTAATTTCAAAGTATAA ACTTATAGATATGTTAACAGCTGCTAAGAAAAATGAGGATATAAAAATAAAAAATCCTATATTAACAGCAATAATATTCT TTATATCTTTAGGATTATTAGGAGTTGCGTATAAATTAGTAATTAAAGTTGGATTAAATCCTACAGATAGAATGTTCTTA GTATCAATAGTATTAGGAATTTTAGGAACATTACTTTTATTCTTTAGTTTAGCAGGATTTGTTTTATATGTTTTACAAAG AAATAAGAATGTTTACTTAAAAGGATTAAATATTTTTGTATTAAGACAAATGAATAGCAAGATAAATACTAACTTTTTAT CAATGACAGTAATATGTCTTATGTTATTCTTAACAATAAGTACATTAGCAACTGGTTTAAGTTTTAAAAATGCTTTAGAA AAAGGATTAGAGAATACAACTCCCTTTGATGCATCTGCTACTTATTACATTGATGAGGATAGTAAAATAAAAACTGCTGA AGAATCAATAAAAGAGTTAGGATTTAAATTTAATCCAGAGGATAAAATTGTTTCATATAATGAATATAAATTAGAAAAAA CTAATTTAGAAAGCTTATTAAATAAAAATGCAGAAGGTAAAAATATAAAAGATATAGTAGAAGCAATGACTTATAAGGGA ACAAATGCCATAAGTATAAGTTCATATAATGATATAAGAACTTTAAGTGGTGAAAAACCAGTAAGTTTAGCCAATAACGA AGTATTAATTTCATCTAACTTAGGTGAAGTAGAGAATACTTTAAAAAATATTCTTAAAAACAATGAGAAAATAGAAATTG ATGGTAAGGAATATAAGATTGCCAATAATGCCTTAATTGGAGAGGGGAAAGTTATAAAAGAGGCATTTGAAAGTACTGGA ATGACAAATAACTTTTTCACTTTAATAGTGCCAGATAATATTGTTTCTAATTTAAAGCCTATTGCAAATAAAATTAATAT AAACTTTCCTAAAAATTCAAATGAGGAAGAAAGAGTACAAAAATTATTCAATGAATATAGAGATGGAATTGTGGATTTAG ATAAATATGGTTTTGTAAATGGATATACAAGGGAACGTATATATGAAGAGAATAATGGAATGACAAATATAGTATTATTC ATAGGAATATACTTAGGAATAATATTCTTAATTTCAAGTACTGCTGTCCTTGCTCTTCAACAATTATCAGAAGCTAGTGA TAGTATTGATAGATATAAATCCTTAAGAAGAATTGGTGTATCTCAAAAGATGATAAATAAATCAATATTTACACAGGTAA GTATTTATTTTGGATTACCATTAGTTGTAGCTTTAGTTCACTCAGTAGTAGCAATAAAGGTTGTAAATGGATTCCTAACT ATGTTTAATAAGCCAGATATAGGAGCTTCATCCTTAGTAACTACCTTAATAATGGTAATTGTCTATGGTGGATATTTCTA TGCAACATATGCTGGATATAAATCAACAGTAAAAAATGCTTTAAAGCAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAAAAGATGGAAAAATATTTAATGAATTAGTAAGAGGAACAGATTCAAGAAAGGAATTTTTTGATAGAATTATTGAGGT TATAACACTTCTTGGAGGTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAATAAAAATAGTTAAGGAGCTTGAATTTAATCAAGCTCCTTAAATTATATTCTATTTAAAATATAATTTATATTTAC CCTATTATTCATATTAAACT
Product: ABC transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 684; Mature: 683
Protein sequence:
>684_residues MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLIL YANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDA ILKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALE KGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKG TNAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLF IGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLT MFNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK
Sequences:
>Translated_684_residues MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLIL YANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDA ILKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALE KGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKG TNAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLF IGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLT MFNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK >Mature_683_residues TGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLILY ANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAI LKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFLV SIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALEK GLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGT NAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTGM TNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLFI GIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTM FNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76267; Mature: 76136
Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVL CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGLISGISVFISCVLGGLILYANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAILKTVLYFGIIFILVMIFNT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHH MLFLTISTLATGLSFKNALEKGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC DKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGTNAISISSYNDIRTLSGEKP CCEECCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCC VSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG CEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCEECCCHHHHHHHHHCC MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVN CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCCC GYTRERIYEENNGMTNIVLFIGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGV CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH SQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTMFNKPDIGASSLVTTLIMVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVL CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGLISGISVFISCVLGGLILYANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAILKTVLYFGIIFILVMIFNT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHH MLFLTISTLATGLSFKNALEKGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC DKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGTNAISISSYNDIRTLSGEKP CCEECCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCC VSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG CEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCEECCCHHHHHHHHHCC MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVN CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCCC GYTRERIYEENNGMTNIVLFIGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGV CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH SQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTMFNKPDIGASSLVTTLIMVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]