Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is bceB [H]

Identifier: 18309833

GI number: 18309833

Start: 1040120

End: 1042174

Strand: Direct

Name: bceB [H]

Synonym: CPE0851

Alternate gene names: 18309833

Gene position: 1040120-1042174 (Clockwise)

Preceding gene: 18309832

Following gene: 18309834

Centisome position: 34.31

GC content: 25.64

Gene sequence:

>2055_bases
ATGACAGGGATGTATTTTAAGATTGCTTTAAACAATGTTAGAAAGAGCTTTAAAGATTATTCAATATATTTTCTAACATT
AACTCTTGGAGTATGTATATTCTATGCATTTAACTCCATAGGAGATCAAAAAGCCTTTTTAGAACTTGGAAAAAGACAGG
CTGAGTATATAAAAGTATTACAAGGGTTAATATCTGGAATATCTGTATTTATATCTTGTGTTTTAGGTGGATTAATTCTT
TATGCAAATAACTTTTTAGTTAAAAAGCGTAAAAAAGAATTAGGTATATATATGACCCTTGGTATGGGAAAAAATAAAAT
TTCAAAAATACTTACATATGAAACAGCACTAGTAGGAATTATATCATTAGTTGTAGGCTTAGGAGTAGGTATAATAGTTT
CTCAAGGAATATCTGCCTTTGCATCTAAATTATTTGAAGTATCTCTAAGTAATTATAAATTTTTATTATCAACTGATGCT
ATTTTAAAAACTGTTTTATACTTTGGTATAATTTTTATCTTAGTTATGATTTTTAATACTTTTGTAATTTCAAAGTATAA
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TTATATCTTTAGGATTATTAGGAGTTGCGTATAAATTAGTAATTAAAGTTGGATTAAATCCTACAGATAGAATGTTCTTA
GTATCAATAGTATTAGGAATTTTAGGAACATTACTTTTATTCTTTAGTTTAGCAGGATTTGTTTTATATGTTTTACAAAG
AAATAAGAATGTTTACTTAAAAGGATTAAATATTTTTGTATTAAGACAAATGAATAGCAAGATAAATACTAACTTTTTAT
CAATGACAGTAATATGTCTTATGTTATTCTTAACAATAAGTACATTAGCAACTGGTTTAAGTTTTAAAAATGCTTTAGAA
AAAGGATTAGAGAATACAACTCCCTTTGATGCATCTGCTACTTATTACATTGATGAGGATAGTAAAATAAAAACTGCTGA
AGAATCAATAAAAGAGTTAGGATTTAAATTTAATCCAGAGGATAAAATTGTTTCATATAATGAATATAAATTAGAAAAAA
CTAATTTAGAAAGCTTATTAAATAAAAATGCAGAAGGTAAAAATATAAAAGATATAGTAGAAGCAATGACTTATAAGGGA
ACAAATGCCATAAGTATAAGTTCATATAATGATATAAGAACTTTAAGTGGTGAAAAACCAGTAAGTTTAGCCAATAACGA
AGTATTAATTTCATCTAACTTAGGTGAAGTAGAGAATACTTTAAAAAATATTCTTAAAAACAATGAGAAAATAGAAATTG
ATGGTAAGGAATATAAGATTGCCAATAATGCCTTAATTGGAGAGGGGAAAGTTATAAAAGAGGCATTTGAAAGTACTGGA
ATGACAAATAACTTTTTCACTTTAATAGTGCCAGATAATATTGTTTCTAATTTAAAGCCTATTGCAAATAAAATTAATAT
AAACTTTCCTAAAAATTCAAATGAGGAAGAAAGAGTACAAAAATTATTCAATGAATATAGAGATGGAATTGTGGATTTAG
ATAAATATGGTTTTGTAAATGGATATACAAGGGAACGTATATATGAAGAGAATAATGGAATGACAAATATAGTATTATTC
ATAGGAATATACTTAGGAATAATATTCTTAATTTCAAGTACTGCTGTCCTTGCTCTTCAACAATTATCAGAAGCTAGTGA
TAGTATTGATAGATATAAATCCTTAAGAAGAATTGGTGTATCTCAAAAGATGATAAATAAATCAATATTTACACAGGTAA
GTATTTATTTTGGATTACCATTAGTTGTAGCTTTAGTTCACTCAGTAGTAGCAATAAAGGTTGTAAATGGATTCCTAACT
ATGTTTAATAAGCCAGATATAGGAGCTTCATCCTTAGTAACTACCTTAATAATGGTAATTGTCTATGGTGGATATTTCTA
TGCAACATATGCTGGATATAAATCAACAGTAAAAAATGCTTTAAAGCAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAGATGGAAAAATATTTAATGAATTAGTAAGAGGAACAGATTCAAGAAAGGAATTTTTTGATAGAATTATTGAGGT
TATAACACTTCTTGGAGGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAATAAAAATAGTTAAGGAGCTTGAATTTAATCAAGCTCCTTAAATTATATTCTATTTAAAATATAATTTATATTTAC
CCTATTATTCATATTAAACT

Product: ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 684; Mature: 683

Protein sequence:

>684_residues
MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLIL
YANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDA
ILKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL
VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALE
KGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKG
TNAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG
MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLF
IGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLT
MFNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK

Sequences:

>Translated_684_residues
MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLIL
YANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDA
ILKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL
VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALE
KGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKG
TNAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG
MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLF
IGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLT
MFNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK
>Mature_683_residues
TGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVLQGLISGISVFISCVLGGLILY
ANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGIISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAI
LKTVLYFGIIFILVMIFNTFVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFLV
SIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICLMLFLTISTLATGLSFKNALEK
GLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPEDKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGT
NAISISSYNDIRTLSGEKPVSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTGM
TNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVNGYTRERIYEENNGMTNIVLFI
GIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGVSQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTM
FNKPDIGASSLVTTLIMVIVYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76267; Mature: 76136

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVL
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGLISGISVFISCVLGGLILYANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAILKTVLYFGIIFILVMIFNT
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHH
MLFLTISTLATGLSFKNALEKGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGTNAISISSYNDIRTLSGEKP
CCEECCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCC
VSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG
CEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCEECCCHHHHHHHHHCC
MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVN
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCCC
GYTRERIYEENNGMTNIVLFIGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGV
CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
SQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTMFNKPDIGASSLVTTLIMVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TGMYFKIALNNVRKSFKDYSIYFLTLTLGVCIFYAFNSIGDQKAFLELGKRQAEYIKVL
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGLISGISVFISCVLGGLILYANNFLVKKRKKELGIYMTLGMGKNKISKILTYETALVGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVVGLGVGIIVSQGISAFASKLFEVSLSNYKFLLSTDAILKTVLYFGIIFILVMIFNT
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVISKYKLIDMLTAAKKNEDIKIKNPILTAIIFFISLGLLGVAYKLVIKVGLNPTDRMFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
VSIVLGILGTLLLFFSLAGFVLYVLQRNKNVYLKGLNIFVLRQMNSKINTNFLSMTVICL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHH
MLFLTISTLATGLSFKNALEKGLENTTPFDASATYYIDEDSKIKTAEESIKELGFKFNPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKIVSYNEYKLEKTNLESLLNKNAEGKNIKDIVEAMTYKGTNAISISSYNDIRTLSGEKP
CCEECCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCC
VSLANNEVLISSNLGEVENTLKNILKNNEKIEIDGKEYKIANNALIGEGKVIKEAFESTG
CEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCEECCCHHHHHHHHHCC
MTNNFFTLIVPDNIVSNLKPIANKININFPKNSNEEERVQKLFNEYRDGIVDLDKYGFVN
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCCC
GYTRERIYEENNGMTNIVLFIGIYLGIIFLISSTAVLALQQLSEASDSIDRYKSLRRIGV
CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
SQKMINKSIFTQVSIYFGLPLVVALVHSVVAIKVVNGFLTMFNKPDIGASSLVTTLIMVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VYGGYFYATYAGYKSTVKNALKQK
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]