Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is cstA [C]

Identifier: 18309725

GI number: 18309725

Start: 921005

End: 922456

Strand: Direct

Name: cstA [C]

Synonym: CPE0743

Alternate gene names: 18309725

Gene position: 921005-922456 (Clockwise)

Preceding gene: 18309724

Following gene: 18309726

Centisome position: 30.38

GC content: 32.78

Gene sequence:

>1452_bases
ATGATATCATTTTTATTATCATTAGTATTATTAATTGTGGGCTACTTTACTTATGGAAAATTTGTAGACAAGACCTTTGG
TACAAATGATTCAATTGAAACACCTGCTGAGTCTATGGCAGATGGAGTAGACTATGTACCAATGAGTTGGCCAAGAATTT
TTTTAATTCAGTTTCTTAATATTGCTGGGCTTGGACCTATATTTGGAGCCATAGCTGGAGCGTTATGGGGACCTGTAGCA
TTTTTATGGATAGTTTTTGGATGTATATTCGCAGGGGCTGTTCATGACTATTTCACAGGAGTTTTATCTATAAGAAATAA
AGGGGTATCAGTTGCTGAACTTGTAGGTAAATATCTTGGAGAAATACCAAGAAAAATAATGGTTATATTTTCTGTAGTAT
TATTAATTTTAGTTGGGGTAGTTTTCTTAACAGGCCCAGCAGATCTTTTAAAAACTTTAACAGGAATAGACAGAGATATA
TTTATAGTTATTATAGTAGTATATTATATAGCTGCCACTGTTTTACCAGTAGATAAGGTTATAGGAAAAATTTATCCTAT
ATTTGGACTTTGTCTTTTAATAATGGCTGTAGGAATAGGTGCTGGAATTGTAATTGAAGGATATAATATTCCAGAAATTC
AATTAGCAAACTTCCATCCAGAAGGAACACCAATATTCCCATTCTTATTTATAACAATAGCTTGTGGAGCTATATCTGGA
TTCCATGCTACACAATCACCTATTATGGCTAGATGTGTAAAAAAAGAATCAGAGGCAAGAAAAGTATTCTATGGTGCAAT
GATTGCAGAGGGAGTTATAGCCTTAGTTTGGGCAGCTGCAGCTATGTCCTTCTTTGGTGATACAAATGGATTACAAGAAA
TTTTAAAAGCTGGAGGACCAGCCACTGTAGTTAATACTATTTCTAATACAGTAATGGGAAAAGTAGGTGCCGTATTAGCA
ATATTAGGGGTAGTAGCTTGTCCTATATCTTCAGGAGATACAGCTTTCAGAAGTGCTAGACTTACAATTGCTGATGCTTT
TAAACTTAAACAAGATAAGGTTATTGATAGATTTAAAATAGCCATACCACTATTTGTTGTGGGTATAGCATTAACTTTTA
TTGATTTCGGCATAATATGGAGATATTTCTCATGGTCAAATCAAACTTTAGCAATGATAATGCTTTGGGCAGCATCTGCT
TATATGTTAAAAGCTCATAATAATTATTGGATAACCTTAGTGCCAGCAGTTTTCATGTCAGCAGTTACTTGTTCATATAT
ATTACAAGCTCCTGAAGGATTTAGATTAAATGCAACATTTTCTAATATAGCAGGTGTGGTATTTGCCTTAGTTCTTTTTG
GAATTTTCATTAAGTACTGTAAAAAAGAAAATAATGAAAATTGTGAGATTGTAGAAATTGAGGAAGTAAAAGAAGTGATT
AAAAATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGGCGATTTTATGGTAAAAAAGAATTATGAATACGTTTTCTAAAAGGGGTATAATTAAATTGTAACAATTAATTCAAT
TAACGAAGGGGATGAGAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAGCAAATAGTTAATAATAAAACTAAGAGGGGATTATGAAAAAACTCATAATTCCCTCTATTATTTTAAATTTATATT
AGAATTATATAAATAAATAT

Product: carbon starvation protein CstA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MISFLLSLVLLIVGYFTYGKFVDKTFGTNDSIETPAESMADGVDYVPMSWPRIFLIQFLNIAGLGPIFGAIAGALWGPVA
FLWIVFGCIFAGAVHDYFTGVLSIRNKGVSVAELVGKYLGEIPRKIMVIFSVVLLILVGVVFLTGPADLLKTLTGIDRDI
FIVIIVVYYIAATVLPVDKVIGKIYPIFGLCLLIMAVGIGAGIVIEGYNIPEIQLANFHPEGTPIFPFLFITIACGAISG
FHATQSPIMARCVKKESEARKVFYGAMIAEGVIALVWAAAAMSFFGDTNGLQEILKAGGPATVVNTISNTVMGKVGAVLA
ILGVVACPISSGDTAFRSARLTIADAFKLKQDKVIDRFKIAIPLFVVGIALTFIDFGIIWRYFSWSNQTLAMIMLWAASA
YMLKAHNNYWITLVPAVFMSAVTCSYILQAPEGFRLNATFSNIAGVVFALVLFGIFIKYCKKENNENCEIVEIEEVKEVI
KNK

Sequences:

>Translated_483_residues
MISFLLSLVLLIVGYFTYGKFVDKTFGTNDSIETPAESMADGVDYVPMSWPRIFLIQFLNIAGLGPIFGAIAGALWGPVA
FLWIVFGCIFAGAVHDYFTGVLSIRNKGVSVAELVGKYLGEIPRKIMVIFSVVLLILVGVVFLTGPADLLKTLTGIDRDI
FIVIIVVYYIAATVLPVDKVIGKIYPIFGLCLLIMAVGIGAGIVIEGYNIPEIQLANFHPEGTPIFPFLFITIACGAISG
FHATQSPIMARCVKKESEARKVFYGAMIAEGVIALVWAAAAMSFFGDTNGLQEILKAGGPATVVNTISNTVMGKVGAVLA
ILGVVACPISSGDTAFRSARLTIADAFKLKQDKVIDRFKIAIPLFVVGIALTFIDFGIIWRYFSWSNQTLAMIMLWAASA
YMLKAHNNYWITLVPAVFMSAVTCSYILQAPEGFRLNATFSNIAGVVFALVLFGIFIKYCKKENNENCEIVEIEEVKEVI
KNK
>Mature_483_residues
MISFLLSLVLLIVGYFTYGKFVDKTFGTNDSIETPAESMADGVDYVPMSWPRIFLIQFLNIAGLGPIFGAIAGALWGPVA
FLWIVFGCIFAGAVHDYFTGVLSIRNKGVSVAELVGKYLGEIPRKIMVIFSVVLLILVGVVFLTGPADLLKTLTGIDRDI
FIVIIVVYYIAATVLPVDKVIGKIYPIFGLCLLIMAVGIGAGIVIEGYNIPEIQLANFHPEGTPIFPFLFITIACGAISG
FHATQSPIMARCVKKESEARKVFYGAMIAEGVIALVWAAAAMSFFGDTNGLQEILKAGGPATVVNTISNTVMGKVGAVLA
ILGVVACPISSGDTAFRSARLTIADAFKLKQDKVIDRFKIAIPLFVVGIALTFIDFGIIWRYFSWSNQTLAMIMLWAASA
YMLKAHNNYWITLVPAVFMSAVTCSYILQAPEGFRLNATFSNIAGVVFALVLFGIFIKYCKKENNENCEIVEIEEVKEVI
KNK

Specific function: Unknown

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=345, Percent_Identity=27.536231884058, Blast_Score=92, Evalue=7e-20,
Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=550, Percent_Identity=24.9090909090909, Blast_Score=91, Evalue=2e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52467; Mature: 52467

Theoretical pI: Translated: 7.69; Mature: 7.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCC
>Mature Secondary Structure
MISFLLSLVLLIVGYFTYGKFVDKTFGTNDSIETPAESMADGVDYVPMSWPRIFLIQFLN
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
IAGLGPIFGAIAGALWGPVAFLWIVFGCIFAGAVHDYFTGVLSIRNKGVSVAELVGKYLG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
EIPRKIMVIFSVVLLILVGVVFLTGPADLLKTLTGIDRDIFIVIIVVYYIAATVLPVDKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGKIYPIFGLCLLIMAVGIGAGIVIEGYNIPEIQLANFHPEGTPIFPFLFITIACGAISG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
FHATQSPIMARCVKKESEARKVFYGAMIAEGVIALVWAAAAMSFFGDTNGLQEILKAGGP
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC
ATVVNTISNTVMGKVGAVLAILGVVACPISSGDTAFRSARLTIADAFKLKQDKVIDRFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIPLFVVGIALTFIDFGIIWRYFSWSNQTLAMIMLWAASAYMLKAHNNYWITLVPAVFMS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEHHHHHHHH
AVTCSYILQAPEGFRLNATFSNIAGVVFALVLFGIFIKYCKKENNENCEIVEIEEVKEVI
HHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHH
KNK
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]