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The map label for this gene is 17231906

Identifier: 17231906

GI number: 17231906

Start: 5291811

End: 5293892

Strand: Reverse

Name: 17231906

Synonym: all4414

Alternate gene names: NA

Gene position: 5293892-5291811 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17231907

Following gene: 17231905

Centisome position: 82.54

GC content: 38.95

Gene sequence:

>2082_bases
GTGGTTAATCAAGTAGCAACTGATAAATTTATTCAGGATTTAGAACGTGTTGCTCAAGTGCGTTCTAAGATTGCGGTCTG
TTTACAAAAATTATCTGACACAATTAATCAAGCAGAATTAGCTGGGGACACATCATCAGGTAAGTTAAGTTTAGAAAGAG
ATTTAGAAGATATTTCTGTAGCAAGTAAGAACCTGAAAAAAGGAGTATTTCGCTTATTGGTTTTAGGCGATATGAAGCGG
GGTAAGAGTACATTTCTTAATGCTTTGATTGGAGAAAATTTATTACCTAGTGATGTTAATCCTTGCACAGCAGTATTAAC
AGTGTTACGCTACGGGGCAGAAAAAAAAGTTACAATTCACTTTAATGATGGCAAAAGCCCACAAACCTTAGATTTTCAAA
GCTTTAAATATAAATACACTATTGATCCGGCGGAAGCAAAGAAGTTAGAACAAGAGAAAAAACAAGCTTTTCCTGACGTT
GATTATGCAGTTGTAGAATATCCTCTGACTTTACTAGAAAAGGGGATTGAAATTGTTGATAGTCCTGGGTTAAATGACAC
GGAAGCACGAAACGAATTATCTTTGGGATATGTCAATAACTGTCATGCAATTTTATTTGTTATGCGAGCTTCCCAACCTT
GTACTTTAGGGGAGCGTCGTTATTTAGAAAACTACATTAAAGGTCGGGGGTTATCTGTTTTCTTTTTAATTAATGCTTGG
GATCAGGTGAAGGAATCATTGATTGATCCTGATGATGTAGATGAGTTAAAAGCGTCAGAAGATAGACTACGACAAGTATT
TAAGGCGAACTTGACAGAATATTGTTATGTAGATGGTCAAAATATTTATGATGAGAGGGTGTTTGAACTGTCATCAATTC
AAGCACTGCGGCGACGGTTGAAGGATTCCCAAGCGGATTTAACTGGAACCGGCTTTCCTGAGTTTATGGGTTCTCTAAAT
ACATTTCTTACCAGAGAACGGGCGATCGCAGAACTACGACAAGCCAGAACATTAGCAAGACAAGCTGTCAACCATACCCG
CGAAGCAATTGGGAGACGCTTACCATTACTAGACCAAGATGTGGATGAATTAAAGAAACGGATTGATTCTGTTGAACCGG
AGTTTACCAAACTCAATCATATTCGTGACCAATTTCAAAAGGAAATTTTCACTACTAGGGATACCCAAGCGCGCAAAGTC
TCAGAATCTTTCCGCAGCTATGTTTTAAATTTGGGTAATACTTTTGAAACTGATTTTTTACGCTATCAACCAGAGTTAAA
TCTGTTAGATTTTCTGAGTAATGGTAAGCGGGAAGCGTTTAATACTGCACTACAAAAAGCCTTTGAGCAATACATTACTG
ATAAATTTGCGGCTTGGACTTTGACAGCCGAAAAAGATATCAATGTGGCTTTTAAAGAACTTTCCCGCAGTGCATTCCAA
TATGGTGCATCTTACAGCCAAGTTACAGACCAAATAACCGAAAAACTTACGGGACAAAAAGTTACGGTTAATCCTACAAC
CACCACAGAAGATGATAAATCTCCTAGTTGGGCAAAATGGGCGATGGGATTGTTATCTTTGTCTCGCGGAAATTTGGCGG
GTGTGGCGTTAGCTGGTGCTGGCTTTGATTGGAAAAATATTTTGTTAAATTACTTTACTGTGGTTGGGATTGGGGGAATC
ATTACGGCCGTTACAGGGGTATTTCTCGGCCCTATCGGATTTGCTTTACTTGGTTTGGGTGTAGGCTTTTTACAAGCAGA
CCAAGCGCGGAAGGAGTTGGTGAAAACTGCGAAGAAGGAGTTAGTTAAATATCTCCCACAGGTAGCACATGAACAATCGC
AAACTGTATATGATGCGGTGAAGGAATGTTTTGATGCTTATGAAAGGGAAGTGAGTAAACGGATTAATGACGATATTACT
GCTCGGAAGTCGGAGTTAGATAATTTACTGAAGCAGAAGGAAACACGGGAAATTAATCGGGAAGGTGAGTTGAAAAGGTT
TAAGAGTTTGCAGGAGGATGTGATTGCTCAGTTGCAAAATATTGAGGCTGCTTATAGTAATTTGTTGGCTTATTATGGCT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTAGCCGGGTTGATTATTATTGCAACTCTGGGGTGGGTATCTTACCAGCTATTTTTTGTATCTCGAAAAAAATAATTC
TTAACTAAGGTGTAATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGGTTTTTTTAACGCGGAGGGGCGCTGAGGTTGGCGCAGAGGGGCGCAGAGATGTAAGAGGAGAGGGGAGTTTTTTC
TTCTCTCTTTGTTTTTATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF6 [H]

Number of amino acids: Translated: 693; Mature: 693

Protein sequence:

>693_residues
MVNQVATDKFIQDLERVAQVRSKIAVCLQKLSDTINQAELAGDTSSGKLSLERDLEDISVASKNLKKGVFRLLVLGDMKR
GKSTFLNALIGENLLPSDVNPCTAVLTVLRYGAEKKVTIHFNDGKSPQTLDFQSFKYKYTIDPAEAKKLEQEKKQAFPDV
DYAVVEYPLTLLEKGIEIVDSPGLNDTEARNELSLGYVNNCHAILFVMRASQPCTLGERRYLENYIKGRGLSVFFLINAW
DQVKESLIDPDDVDELKASEDRLRQVFKANLTEYCYVDGQNIYDERVFELSSIQALRRRLKDSQADLTGTGFPEFMGSLN
TFLTRERAIAELRQARTLARQAVNHTREAIGRRLPLLDQDVDELKKRIDSVEPEFTKLNHIRDQFQKEIFTTRDTQARKV
SESFRSYVLNLGNTFETDFLRYQPELNLLDFLSNGKREAFNTALQKAFEQYITDKFAAWTLTAEKDINVAFKELSRSAFQ
YGASYSQVTDQITEKLTGQKVTVNPTTTTEDDKSPSWAKWAMGLLSLSRGNLAGVALAGAGFDWKNILLNYFTVVGIGGI
ITAVTGVFLGPIGFALLGLGVGFLQADQARKELVKTAKKELVKYLPQVAHEQSQTVYDAVKECFDAYEREVSKRINDDIT
ARKSELDNLLKQKETREINREGELKRFKSLQEDVIAQLQNIEAAYSNLLAYYG

Sequences:

>Translated_693_residues
MVNQVATDKFIQDLERVAQVRSKIAVCLQKLSDTINQAELAGDTSSGKLSLERDLEDISVASKNLKKGVFRLLVLGDMKR
GKSTFLNALIGENLLPSDVNPCTAVLTVLRYGAEKKVTIHFNDGKSPQTLDFQSFKYKYTIDPAEAKKLEQEKKQAFPDV
DYAVVEYPLTLLEKGIEIVDSPGLNDTEARNELSLGYVNNCHAILFVMRASQPCTLGERRYLENYIKGRGLSVFFLINAW
DQVKESLIDPDDVDELKASEDRLRQVFKANLTEYCYVDGQNIYDERVFELSSIQALRRRLKDSQADLTGTGFPEFMGSLN
TFLTRERAIAELRQARTLARQAVNHTREAIGRRLPLLDQDVDELKKRIDSVEPEFTKLNHIRDQFQKEIFTTRDTQARKV
SESFRSYVLNLGNTFETDFLRYQPELNLLDFLSNGKREAFNTALQKAFEQYITDKFAAWTLTAEKDINVAFKELSRSAFQ
YGASYSQVTDQITEKLTGQKVTVNPTTTTEDDKSPSWAKWAMGLLSLSRGNLAGVALAGAGFDWKNILLNYFTVVGIGGI
ITAVTGVFLGPIGFALLGLGVGFLQADQARKELVKTAKKELVKYLPQVAHEQSQTVYDAVKECFDAYEREVSKRINDDIT
ARKSELDNLLKQKETREINREGELKRFKSLQEDVIAQLQNIEAAYSNLLAYYG
>Mature_693_residues
MVNQVATDKFIQDLERVAQVRSKIAVCLQKLSDTINQAELAGDTSSGKLSLERDLEDISVASKNLKKGVFRLLVLGDMKR
GKSTFLNALIGENLLPSDVNPCTAVLTVLRYGAEKKVTIHFNDGKSPQTLDFQSFKYKYTIDPAEAKKLEQEKKQAFPDV
DYAVVEYPLTLLEKGIEIVDSPGLNDTEARNELSLGYVNNCHAILFVMRASQPCTLGERRYLENYIKGRGLSVFFLINAW
DQVKESLIDPDDVDELKASEDRLRQVFKANLTEYCYVDGQNIYDERVFELSSIQALRRRLKDSQADLTGTGFPEFMGSLN
TFLTRERAIAELRQARTLARQAVNHTREAIGRRLPLLDQDVDELKKRIDSVEPEFTKLNHIRDQFQKEIFTTRDTQARKV
SESFRSYVLNLGNTFETDFLRYQPELNLLDFLSNGKREAFNTALQKAFEQYITDKFAAWTLTAEKDINVAFKELSRSAFQ
YGASYSQVTDQITEKLTGQKVTVNPTTTTEDDKSPSWAKWAMGLLSLSRGNLAGVALAGAGFDWKNILLNYFTVVGIGGI
ITAVTGVFLGPIGFALLGLGVGFLQADQARKELVKTAKKELVKYLPQVAHEQSQTVYDAVKECFDAYEREVSKRINDDIT
ARKSELDNLLKQKETREINREGELKRFKSLQEDVIAQLQNIEAAYSNLLAYYG

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG148 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001401 [H]

Pfam domain/function: PF00350 Dynamin_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78284; Mature: 78284

Theoretical pI: Translated: 5.75; Mature: 5.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVNQVATDKFIQDLERVAQVRSKIAVCLQKLSDTINQAELAGDTSSGKLSLERDLEDISV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
ASKNLKKGVFRLLVLGDMKRGKSTFLNALIGENLLPSDVNPCTAVLTVLRYGAEKKVTIH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
FNDGKSPQTLDFQSFKYKYTIDPAEAKKLEQEKKQAFPDVDYAVVEYPLTLLEKGIEIVD
ECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEC
SPGLNDTEARNELSLGYVNNCHAILFVMRASQPCTLGERRYLENYIKGRGLSVFFLINAW
CCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCH
DQVKESLIDPDDVDELKASEDRLRQVFKANLTEYCYVDGQNIYDERVFELSSIQALRRRL
HHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDSQADLTGTGFPEFMGSLNTFLTRERAIAELRQARTLARQAVNHTREAIGRRLPLLDQD
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
VDELKKRIDSVEPEFTKLNHIRDQFQKEIFTTRDTQARKVSESFRSYVLNLGNTFETDFL
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
RYQPELNLLDFLSNGKREAFNTALQKAFEQYITDKFAAWTLTAEKDINVAFKELSRSAFQ
HCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
YGASYSQVTDQITEKLTGQKVTVNPTTTTEDDKSPSWAKWAMGLLSLSRGNLAGVALAGA
HCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC
GFDWKNILLNYFTVVGIGGIITAVTGVFLGPIGFALLGLGVGFLQADQARKELVKTAKKE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVKYLPQVAHEQSQTVYDAVKECFDAYEREVSKRINDDITARKSELDNLLKQKETREINR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EGELKRFKSLQEDVIAQLQNIEAAYSNLLAYYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVNQVATDKFIQDLERVAQVRSKIAVCLQKLSDTINQAELAGDTSSGKLSLERDLEDISV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
ASKNLKKGVFRLLVLGDMKRGKSTFLNALIGENLLPSDVNPCTAVLTVLRYGAEKKVTIH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
FNDGKSPQTLDFQSFKYKYTIDPAEAKKLEQEKKQAFPDVDYAVVEYPLTLLEKGIEIVD
ECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEC
SPGLNDTEARNELSLGYVNNCHAILFVMRASQPCTLGERRYLENYIKGRGLSVFFLINAW
CCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCH
DQVKESLIDPDDVDELKASEDRLRQVFKANLTEYCYVDGQNIYDERVFELSSIQALRRRL
HHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDSQADLTGTGFPEFMGSLNTFLTRERAIAELRQARTLARQAVNHTREAIGRRLPLLDQD
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
VDELKKRIDSVEPEFTKLNHIRDQFQKEIFTTRDTQARKVSESFRSYVLNLGNTFETDFL
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
RYQPELNLLDFLSNGKREAFNTALQKAFEQYITDKFAAWTLTAEKDINVAFKELSRSAFQ
HCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
YGASYSQVTDQITEKLTGQKVTVNPTTTTEDDKSPSWAKWAMGLLSLSRGNLAGVALAGA
HCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC
GFDWKNILLNYFTVVGIGGIITAVTGVFLGPIGFALLGLGVGFLQADQARKELVKTAKKE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVKYLPQVAHEQSQTVYDAVKECFDAYEREVSKRINDDITARKSELDNLLKQKETREINR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EGELKRFKSLQEDVIAQLQNIEAAYSNLLAYYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8920183 [H]