Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 17230353

Identifier: 17230353

GI number: 17230353

Start: 3485859

End: 3487265

Strand: Direct

Name: 17230353

Synonym: alr2861

Alternate gene names: NA

Gene position: 3485859-3487265 (Clockwise)

Preceding gene: 17230352

Following gene: 17230354

Centisome position: 54.35

GC content: 24.38

Gene sequence:

>1407_bases
ATGATAAATACTAAAGAAAATATTCATGATTTTTTTATTAAAAGCAATATTATTGATATAAAAATACTTTGGAATATTTT
TGTTTACCTTATTTTATTAATATTTATCCTATTTTTATTTCCTTCCTTAACACCAATTATATTTATTGGTTTAGGCATTT
ATAGTTTGTTTGGCATCAATCAATCAATACAATCAATATTGATTGCTTTTTTAATCAAAAGCCTAAATTCTGGCTTATTC
AATAACATAGAAAATTTTGCTAAATTTCACTGGATTGTTTTATATGTTGCTAGTATTAAAATACTAGTTGTCTGTTTACA
TAAAAAAATAGTACCTAAAAAATTTTTAGTTCAAATATCCTCATGCTATTTAGTTTTATTTTCAATTTCATTATTTAGCT
TATATCCTGTTATTTCTTATTTGAAACTTGCGAATTTTATCTTTTTTTCTTTTTCCTTAGTTTCTGGAATTCATATTGTA
AAAAAAGACGTATCTTATTGGTTATCATGGTTATTTACTTTATATCTGTTTGTTTGTACTATAAGCTTATTTTTACTTGG
ATCTCCATTAGGTTATTTCACTAAAAATGGTTTATTTCAAGGTATTCTTGATCATCCCCAATTATTTGGTATATTTTGTT
CTCCTTTTATATCTTTATTAGTTTTCCAAATTAATATAAACAAAAGCAATATATTGATATTTTATGCAATTTTTATAGGG
ATATTTTCTATTTTTCATTCAGGAACTAGAACAGCTTTATTAGCTGTATTAGCATCGGTAATTACTTCAATCATTTTATT
TGCTATATTTAAACCTAATTTTTTACTCAGGTTGCAAATACATTGTAGAAAACAACAATTATTATATATATTTTCAATAA
TAATAATTATTTTAACCAGCTTGTCGCTATCTTTATTTAATTTAAATGAAACTTTACTATCTCCAGTTAATAATTTCTTG
AATAAGGGACGTTATTATGAATCTTTTGATAGACTTGCTGAAGATTCTAGAGGTAATGTTATAGAAAAATCACTAAACAA
TTTTTATAATTATCCTATTACAGGAATTGGTTTTGGTATACCTTCAGATTATGAAATGTTTGAAATTGGTGAGGGTATCG
AAGGTGTTCCTATTAGTGTACCTACGTTAAAAGGCTCACTACCATCAGCAATACTTGAAGAAACTGGAATTATTGGAACT
ATTGCTTTTATACTTTTCTTATTTTCTTCAATAAAATATTTTATTGATAATTCAAATATGTCAATATTGTCCTTATACTT
ATCATGTTTCTTTGTAAATCTTGGAGAGTTTAATATTTTTTCTTTTGGAGGAGCAGGTCAATACTTTTGGTTTTTTATTG
CAATTGCTTTTGCTTTTGCTTCATTAAATGAGAACTTTTCTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACATATTTATGCACAAATAAATGATTATGTATAAATGGGCAGATATATATTTCTTTGCTTTAATTAAGTTCTATAATAAC
TAGATGAGAACCAAATTCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTATTTTCGTTTACTTATCCTTGTAAAAATTTACTTCCTATGATGCAAGATTATCCTTTAGTCGCTATAGCTTGGTC
AGGGTTACCAATATATGCTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 468; Mature: 468

Protein sequence:

>468_residues
MINTKENIHDFFIKSNIIDIKILWNIFVYLILLIFILFLFPSLTPIIFIGLGIYSLFGINQSIQSILIAFLIKSLNSGLF
NNIENFAKFHWIVLYVASIKILVVCLHKKIVPKKFLVQISSCYLVLFSISLFSLYPVISYLKLANFIFFSFSLVSGIHIV
KKDVSYWLSWLFTLYLFVCTISLFLLGSPLGYFTKNGLFQGILDHPQLFGIFCSPFISLLVFQININKSNILIFYAIFIG
IFSIFHSGTRTALLAVLASVITSIILFAIFKPNFLLRLQIHCRKQQLLYIFSIIIIILTSLSLSLFNLNETLLSPVNNFL
NKGRYYESFDRLAEDSRGNVIEKSLNNFYNYPITGIGFGIPSDYEMFEIGEGIEGVPISVPTLKGSLPSAILEETGIIGT
IAFILFLFSSIKYFIDNSNMSILSLYLSCFFVNLGEFNIFSFGGAGQYFWFFIAIAFAFASLNENFSK

Sequences:

>Translated_468_residues
MINTKENIHDFFIKSNIIDIKILWNIFVYLILLIFILFLFPSLTPIIFIGLGIYSLFGINQSIQSILIAFLIKSLNSGLF
NNIENFAKFHWIVLYVASIKILVVCLHKKIVPKKFLVQISSCYLVLFSISLFSLYPVISYLKLANFIFFSFSLVSGIHIV
KKDVSYWLSWLFTLYLFVCTISLFLLGSPLGYFTKNGLFQGILDHPQLFGIFCSPFISLLVFQININKSNILIFYAIFIG
IFSIFHSGTRTALLAVLASVITSIILFAIFKPNFLLRLQIHCRKQQLLYIFSIIIIILTSLSLSLFNLNETLLSPVNNFL
NKGRYYESFDRLAEDSRGNVIEKSLNNFYNYPITGIGFGIPSDYEMFEIGEGIEGVPISVPTLKGSLPSAILEETGIIGT
IAFILFLFSSIKYFIDNSNMSILSLYLSCFFVNLGEFNIFSFGGAGQYFWFFIAIAFAFASLNENFSK
>Mature_468_residues
MINTKENIHDFFIKSNIIDIKILWNIFVYLILLIFILFLFPSLTPIIFIGLGIYSLFGINQSIQSILIAFLIKSLNSGLF
NNIENFAKFHWIVLYVASIKILVVCLHKKIVPKKFLVQISSCYLVLFSISLFSLYPVISYLKLANFIFFSFSLVSGIHIV
KKDVSYWLSWLFTLYLFVCTISLFLLGSPLGYFTKNGLFQGILDHPQLFGIFCSPFISLLVFQININKSNILIFYAIFIG
IFSIFHSGTRTALLAVLASVITSIILFAIFKPNFLLRLQIHCRKQQLLYIFSIIIIILTSLSLSLFNLNETLLSPVNNFL
NKGRYYESFDRLAEDSRGNVIEKSLNNFYNYPITGIGFGIPSDYEMFEIGEGIEGVPISVPTLKGSLPSAILEETGIIGT
IAFILFLFSSIKYFIDNSNMSILSLYLSCFFVNLGEFNIFSFGGAGQYFWFFIAIAFAFASLNENFSK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53203; Mature: 53203

Theoretical pI: Translated: 8.85; Mature: 8.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINTKENIHDFFIKSNIIDIKILWNIFVYLILLIFILFLFPSLTPIIFIGLGIYSLFGIN
CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QSIQSILIAFLIKSLNSGLFNNIENFAKFHWIVLYVASIKILVVCLHKKIVPKKFLVQIS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
SCYLVLFSISLFSLYPVISYLKLANFIFFSFSLVSGIHIVKKDVSYWLSWLFTLYLFVCT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLFLLGSPLGYFTKNGLFQGILDHPQLFGIFCSPFISLLVFQININKSNILIFYAIFIG
HHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
IFSIFHSGTRTALLAVLASVITSIILFAIFKPNFLLRLQIHCRKQQLLYIFSIIIIILTS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLSLFNLNETLLSPVNNFLNKGRYYESFDRLAEDSRGNVIEKSLNNFYNYPITGIGFGI
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCCC
PSDYEMFEIGEGIEGVPISVPTLKGSLPSAILEETGIIGTIAFILFLFSSIKYFIDNSNM
CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SILSLYLSCFFVNLGEFNIFSFGGAGQYFWFFIAIAFAFASLNENFSK
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MINTKENIHDFFIKSNIIDIKILWNIFVYLILLIFILFLFPSLTPIIFIGLGIYSLFGIN
CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QSIQSILIAFLIKSLNSGLFNNIENFAKFHWIVLYVASIKILVVCLHKKIVPKKFLVQIS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
SCYLVLFSISLFSLYPVISYLKLANFIFFSFSLVSGIHIVKKDVSYWLSWLFTLYLFVCT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLFLLGSPLGYFTKNGLFQGILDHPQLFGIFCSPFISLLVFQININKSNILIFYAIFIG
HHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
IFSIFHSGTRTALLAVLASVITSIILFAIFKPNFLLRLQIHCRKQQLLYIFSIIIIILTS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLSLFNLNETLLSPVNNFLNKGRYYESFDRLAEDSRGNVIEKSLNNFYNYPITGIGFGI
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCCC
PSDYEMFEIGEGIEGVPISVPTLKGSLPSAILEETGIIGTIAFILFLFSSIKYFIDNSNM
CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SILSLYLSCFFVNLGEFNIFSFGGAGQYFWFFIAIAFAFASLNENFSK
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA