| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is 17230349
Identifier: 17230349
GI number: 17230349
Start: 3481174
End: 3482637
Strand: Direct
Name: 17230349
Synonym: alr2857
Alternate gene names: NA
Gene position: 3481174-3482637 (Clockwise)
Preceding gene: 17230348
Following gene: 17230350
Centisome position: 54.28
GC content: 33.4
Gene sequence:
>1464_bases ATGCTTAGACACGGATTTTATAATCTTGTAGGAAATTCTACTCGCCTATTAGTGAGTATTGTTTCTACTCCTATTCTAAT TCGTTCCCTTGGAATTGAAAACTATGGATTATGGACGCTTGTTTCAAGTACATTGGTAGTTGTGAGTTTAGCAGAAGGTG GATTATCTGCATCAACTACATTTTTTACATCGAGAGATTTAGGGCGTGGTCACAAAGATGACCTTCTGACAACTTTAACG ATGATCGGTGGGGCTATGTTTGTTTTAGCGACACTGATATTTACCATCCTATTTTTTATTTCACCTATTGTTGCAGCTTC ATTTCCAAACTTGAGTGATGCACAGCGTTTAATAATTACACCAACACTGAAGTGGGGTGGTGTAGCTATTTGGTGTCGCA TGGTACAAGGTGTCTTTGGTGGTACAGAGCAAGCCTATGAGAAGTATGCTTTGAATAATTTACTTAATACTCTGCAAGGT GTATTTGCAAATATTGGAATGATGATTCTAGCTTGGCAGGGTGCGAGTATAATTGTTCTAATGGAATGGCAGGTTTTCGT TGGTGTTATAACTCTTGGGTGTCATGCTTGGTTAACTCTGACGCTACTCAAAATAACTGATCACAGAATTAGAATATCTT GGAATTGGGCGAAGGTATTAGAGATTATTCGATATAGTTGTTCAGTTTGGATTACCTCTATTGGTAATGTTCTATTTAGT CAGTTTGATAAAATTATCGTTGGGGCATTACTAGGTTCAAAATTGTTAGGAGTATATTCGGCAATTACTAGTGTTTGTTC TCAAATAAACAATTTTTCAGCAACTGTTGTACAACCCATATTACCTAAGTTATCAACTATAGCATCTCAGGATAATTTCA ATAGTGACGCTTTAAAAATTAAAATAAAGCAAGCTTATCAGATGAATGCAGGAATTGCATTTGGTCTTGGTGGGATGCTT TTAGTAATTTCCCCAATTTTTAGTAAATTTATTTTTAAGCAAGATTATTCAGAGATATATTTATTAGCATTTAAGATTGG AATCATTATTTACACTTTATATTCAATCAGTGGTTCGGCGTACTATATTTTGCTGGGTATAGGTCTAAGTGGTTCATTGA TGAAAGTTATACTTTCTTGTAGCCTCTTTTCATTACTTATGATTTATGTTGGAGCATCTTTCTATGGACTACTGGGTGCT ATTGTCGGAAATTCTGGTTTTATTGTAACCCAGGCTTTAAATTTTATTCTTTTTAAAAAATTCGGTTTGAAGCTAAAAGA ATATTTGAAATGGATTGAAAAATATCTAATAATTTTTATTTTGATAAGTCTCCTGGAAATTTACTTGGGAAATTATTTAT CAATATGGCTAAGATTTGGAATACTGGCTTTTCAAGTTGTTTTCTTAGGAAAAAATTTTCTTCAAGAACAGAAATTATCA ATCAATAAAATGCTGAAGGTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAATCCGCTAGTACATCAAGCTTTTATGCTACTTATAAAATTAAGTAGCCTTGAAAGTTTGAGTTACTAAATAATGCTT CCTTTTCATCAGATAATCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTACATTTTTGTTAGAGGAATACTAATGACTTATCTGAAAAAAATTGCATTATGGGTACACTCTATTCACGCACATGCTT ACTCATCCTACAAAGTTCGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 487; Mature: 487
Protein sequence:
>487_residues MLRHGFYNLVGNSTRLLVSIVSTPILIRSLGIENYGLWTLVSSTLVVVSLAEGGLSASTTFFTSRDLGRGHKDDLLTTLT MIGGAMFVLATLIFTILFFISPIVAASFPNLSDAQRLIITPTLKWGGVAIWCRMVQGVFGGTEQAYEKYALNNLLNTLQG VFANIGMMILAWQGASIIVLMEWQVFVGVITLGCHAWLTLTLLKITDHRIRISWNWAKVLEIIRYSCSVWITSIGNVLFS QFDKIIVGALLGSKLLGVYSAITSVCSQINNFSATVVQPILPKLSTIASQDNFNSDALKIKIKQAYQMNAGIAFGLGGML LVISPIFSKFIFKQDYSEIYLLAFKIGIIIYTLYSISGSAYYILLGIGLSGSLMKVILSCSLFSLLMIYVGASFYGLLGA IVGNSGFIVTQALNFILFKKFGLKLKEYLKWIEKYLIIFILISLLEIYLGNYLSIWLRFGILAFQVVFLGKNFLQEQKLS INKMLKV
Sequences:
>Translated_487_residues MLRHGFYNLVGNSTRLLVSIVSTPILIRSLGIENYGLWTLVSSTLVVVSLAEGGLSASTTFFTSRDLGRGHKDDLLTTLT MIGGAMFVLATLIFTILFFISPIVAASFPNLSDAQRLIITPTLKWGGVAIWCRMVQGVFGGTEQAYEKYALNNLLNTLQG VFANIGMMILAWQGASIIVLMEWQVFVGVITLGCHAWLTLTLLKITDHRIRISWNWAKVLEIIRYSCSVWITSIGNVLFS QFDKIIVGALLGSKLLGVYSAITSVCSQINNFSATVVQPILPKLSTIASQDNFNSDALKIKIKQAYQMNAGIAFGLGGML LVISPIFSKFIFKQDYSEIYLLAFKIGIIIYTLYSISGSAYYILLGIGLSGSLMKVILSCSLFSLLMIYVGASFYGLLGA IVGNSGFIVTQALNFILFKKFGLKLKEYLKWIEKYLIIFILISLLEIYLGNYLSIWLRFGILAFQVVFLGKNFLQEQKLS INKMLKV >Mature_487_residues MLRHGFYNLVGNSTRLLVSIVSTPILIRSLGIENYGLWTLVSSTLVVVSLAEGGLSASTTFFTSRDLGRGHKDDLLTTLT MIGGAMFVLATLIFTILFFISPIVAASFPNLSDAQRLIITPTLKWGGVAIWCRMVQGVFGGTEQAYEKYALNNLLNTLQG VFANIGMMILAWQGASIIVLMEWQVFVGVITLGCHAWLTLTLLKITDHRIRISWNWAKVLEIIRYSCSVWITSIGNVLFS QFDKIIVGALLGSKLLGVYSAITSVCSQINNFSATVVQPILPKLSTIASQDNFNSDALKIKIKQAYQMNAGIAFGLGGML LVISPIFSKFIFKQDYSEIYLLAFKIGIIIYTLYSISGSAYYILLGIGLSGSLMKVILSCSLFSLLMIYVGASFYGLLGA IVGNSGFIVTQALNFILFKKFGLKLKEYLKWIEKYLIIFILISLLEIYLGNYLSIWLRFGILAFQVVFLGKNFLQEQKLS INKMLKV
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53926; Mature: 53926
Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRHGFYNLVGNSTRLLVSIVSTPILIRSLGIENYGLWTLVSSTLVVVSLAEGGLSASTT CCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCEE FFTSRDLGRGHKDDLLTTLTMIGGAMFVLATLIFTILFFISPIVAASFPNLSDAQRLIIT EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE PTLKWGGVAIWCRMVQGVFGGTEQAYEKYALNNLLNTLQGVFANIGMMILAWQGASIIVL ECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEE MEWQVFVGVITLGCHAWLTLTLLKITDHRIRISWNWAKVLEIIRYSCSVWITSIGNVLFS EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFDKIIVGALLGSKLLGVYSAITSVCSQINNFSATVVQPILPKLSTIASQDNFNSDALKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE KIKQAYQMNAGIAFGLGGMLLVISPIFSKFIFKQDYSEIYLLAFKIGIIIYTLYSISGSA EEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE YYILLGIGLSGSLMKVILSCSLFSLLMIYVGASFYGLLGAIVGNSGFIVTQALNFILFKK EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH FGLKLKEYLKWIEKYLIIFILISLLEIYLGNYLSIWLRFGILAFQVVFLGKNFLQEQKLS HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INKMLKV HHHHHCC >Mature Secondary Structure MLRHGFYNLVGNSTRLLVSIVSTPILIRSLGIENYGLWTLVSSTLVVVSLAEGGLSASTT CCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCEE FFTSRDLGRGHKDDLLTTLTMIGGAMFVLATLIFTILFFISPIVAASFPNLSDAQRLIIT EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE PTLKWGGVAIWCRMVQGVFGGTEQAYEKYALNNLLNTLQGVFANIGMMILAWQGASIIVL ECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEE MEWQVFVGVITLGCHAWLTLTLLKITDHRIRISWNWAKVLEIIRYSCSVWITSIGNVLFS EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFDKIIVGALLGSKLLGVYSAITSVCSQINNFSATVVQPILPKLSTIASQDNFNSDALKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE KIKQAYQMNAGIAFGLGGMLLVISPIFSKFIFKQDYSEIYLLAFKIGIIIYTLYSISGSA EEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE YYILLGIGLSGSLMKVILSCSLFSLLMIYVGASFYGLLGAIVGNSGFIVTQALNFILFKK EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH FGLKLKEYLKWIEKYLIIFILISLLEIYLGNYLSIWLRFGILAFQVVFLGKNFLQEQKLS HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INKMLKV HHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA