Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 17230333

Identifier: 17230333

GI number: 17230333

Start: 3461549

End: 3462973

Strand: Direct

Name: 17230333

Synonym: alr2841

Alternate gene names: NA

Gene position: 3461549-3462973 (Clockwise)

Preceding gene: 17230332

Following gene: 17230343

Centisome position: 53.97

GC content: 41.47

Gene sequence:

>1425_bases
GTGAATCATATTCTTACAGATAGTTCTTCTACCACAGACTTGGGTTTTGGCAAACAACCACTGTTGGCTTGGCTAGCAAT
ATTATCTCTAGTCTTGTTTTCAGCCGTGTGTATTTTTGGTGGTGCAGCTGGCATTCTCCGTACAGCTTATGTAATTCTGT
CCTTCGCTGTCGGTGCTTTCTTATATGTGCGATACCCCGTACTTTATACAGGTTTTGCGTGGTGGATCTGGTTTGTTACA
CCATTTGTAGCTCGTGTAGTTGATTATAAAAGTGGTTGGGACCCCACACGTTTTATGTTGGTGTCACAATACTTGGTGAC
ACTATTAACATTACATACCTTCCTCAAAGAGCTACCAAAATCCTTGCGCCAAGGTAGTTTACCCTTTGTTCTGGCTTTTC
TAGGTGTGTTTTATGGCTTTCTCATAGGCATGATTAAAACATCACCCTTCACGGCGGCGAGGGGGCTTCTAGATTGGTTA
ACGCCAATCACCTTTGCTTTTTATCTATTTGTCCACTGGCGTGATTATCCCTTGTATCGCCGCACTATTGAGCGCACCTT
TACCTGGGGTGTTTTGGTGACAGGAATCTATGGAATTGTGCAGTTTCTTAACCCTCCTGAATGGGATTTATTTTGGTTAA
CCAGTACAAAATTAACTAGCATGGGTGATCCTGAACCTCTGAAACTGCGTATTTGGAGTACAATGGCATCCCCCGCACCT
TATGCAGCCATGATGATGGCTGGCTTGTTGTTATTATTTACCAATAAAAGTTTTATTCGCCTTCCTGCTTCGGCGGCTGG
TTATTTGGCTTTCCTACTGACAACAGTACGCACCTTGTGGGCAGGATGGTTAATAGCTTTTCTAACTTTTTTAACTTCAC
TAAAGACACGTTTACAACTACGCCTATTTATTACTATTTTGATTATGGCGTTATGTGTCATTCCTTTAACACAAATAGAG
CAATTTTCTAAACCCATCACCACTCGCTTTGAGACATTTTCTAATCTTGAGGATGATGATAGTGCGAGGGTCAGACAGAA
AATCTATGAAGATGGTCTTAATAGTGCTTTAACTAATGCTTTGGGTAATGGAGTAGGCAACACTTTTATTGTGAATGAAA
AAGGCGTATTAGAACCGATTGTAGTCGATAGTGGCATTCTGGATATGTTTTTCACATTGGGTTGGTTTGGTGGTGTATTC
TACTTACTGGCATTATTTATGGTGTTTAGCCAAGCATTCCAATATTCAGAGTATAGTTTTGACTCTTTCATGGCTGCCGC
TAGAGCTATTAGTCTGGGTATGTTATCAACATTATTGGGTAATAGTGGGATGTTGGGGATGCCGGGTATGGTTCTTTGGA
GCTTTGTAGCTATGGCTATGGCGGGGCATAAATATCACGCACAGCAAAGAATTAGGCATCACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCAGCTTGGTATGGTCGCTGGCGCGGTTGGCGAACCTGGCAAAGTTCAATTCGCTTTGCTCAAATTAAAAATTAAAAAT
TAAAAAGTTGGGAGTAGGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGTTCACCAACCAAAAATTGCTAGGCTAAGGCAAGCAGGGGGAGAAAGCGATTTTTTTGCTGCTATTAACCTAGCAAAG
TTGACTTGCCATACTAATAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474

Protein sequence:

>474_residues
MNHILTDSSSTTDLGFGKQPLLAWLAILSLVLFSAVCIFGGAAGILRTAYVILSFAVGAFLYVRYPVLYTGFAWWIWFVT
PFVARVVDYKSGWDPTRFMLVSQYLVTLLTLHTFLKELPKSLRQGSLPFVLAFLGVFYGFLIGMIKTSPFTAARGLLDWL
TPITFAFYLFVHWRDYPLYRRTIERTFTWGVLVTGIYGIVQFLNPPEWDLFWLTSTKLTSMGDPEPLKLRIWSTMASPAP
YAAMMMAGLLLLFTNKSFIRLPASAAGYLAFLLTTVRTLWAGWLIAFLTFLTSLKTRLQLRLFITILIMALCVIPLTQIE
QFSKPITTRFETFSNLEDDDSARVRQKIYEDGLNSALTNALGNGVGNTFIVNEKGVLEPIVVDSGILDMFFTLGWFGGVF
YLLALFMVFSQAFQYSEYSFDSFMAAARAISLGMLSTLLGNSGMLGMPGMVLWSFVAMAMAGHKYHAQQRIRHH

Sequences:

>Translated_474_residues
MNHILTDSSSTTDLGFGKQPLLAWLAILSLVLFSAVCIFGGAAGILRTAYVILSFAVGAFLYVRYPVLYTGFAWWIWFVT
PFVARVVDYKSGWDPTRFMLVSQYLVTLLTLHTFLKELPKSLRQGSLPFVLAFLGVFYGFLIGMIKTSPFTAARGLLDWL
TPITFAFYLFVHWRDYPLYRRTIERTFTWGVLVTGIYGIVQFLNPPEWDLFWLTSTKLTSMGDPEPLKLRIWSTMASPAP
YAAMMMAGLLLLFTNKSFIRLPASAAGYLAFLLTTVRTLWAGWLIAFLTFLTSLKTRLQLRLFITILIMALCVIPLTQIE
QFSKPITTRFETFSNLEDDDSARVRQKIYEDGLNSALTNALGNGVGNTFIVNEKGVLEPIVVDSGILDMFFTLGWFGGVF
YLLALFMVFSQAFQYSEYSFDSFMAAARAISLGMLSTLLGNSGMLGMPGMVLWSFVAMAMAGHKYHAQQRIRHH
>Mature_474_residues
MNHILTDSSSTTDLGFGKQPLLAWLAILSLVLFSAVCIFGGAAGILRTAYVILSFAVGAFLYVRYPVLYTGFAWWIWFVT
PFVARVVDYKSGWDPTRFMLVSQYLVTLLTLHTFLKELPKSLRQGSLPFVLAFLGVFYGFLIGMIKTSPFTAARGLLDWL
TPITFAFYLFVHWRDYPLYRRTIERTFTWGVLVTGIYGIVQFLNPPEWDLFWLTSTKLTSMGDPEPLKLRIWSTMASPAP
YAAMMMAGLLLLFTNKSFIRLPASAAGYLAFLLTTVRTLWAGWLIAFLTFLTSLKTRLQLRLFITILIMALCVIPLTQIE
QFSKPITTRFETFSNLEDDDSARVRQKIYEDGLNSALTNALGNGVGNTFIVNEKGVLEPIVVDSGILDMFFTLGWFGGVF
YLLALFMVFSQAFQYSEYSFDSFMAAARAISLGMLSTLLGNSGMLGMPGMVLWSFVAMAMAGHKYHAQQRIRHH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53399; Mature: 53399

Theoretical pI: Translated: 9.61; Mature: 9.61

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNHILTDSSSTTDLGFGKQPLLAWLAILSLVLFSAVCIFGGAAGILRTAYVILSFAVGAF
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVRYPVLYTGFAWWIWFVTPFVARVVDYKSGWDPTRFMLVSQYLVTLLTLHTFLKELPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRQGSLPFVLAFLGVFYGFLIGMIKTSPFTAARGLLDWLTPITFAFYLFVHWRDYPLYR
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RTIERTFTWGVLVTGIYGIVQFLNPPEWDLFWLTSTKLTSMGDPEPLKLRIWSTMASPAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCH
YAAMMMAGLLLLFTNKSFIRLPASAAGYLAFLLTTVRTLWAGWLIAFLTFLTSLKTRLQL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLFITILIMALCVIPLTQIEQFSKPITTRFETFSNLEDDDSARVRQKIYEDGLNSALTNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGNGVGNTFIVNEKGVLEPIVVDSGILDMFFTLGWFGGVFYLLALFMVFSQAFQYSEYSF
HCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
DSFMAAARAISLGMLSTLLGNSGMLGMPGMVLWSFVAMAMAGHKYHAQQRIRHH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNHILTDSSSTTDLGFGKQPLLAWLAILSLVLFSAVCIFGGAAGILRTAYVILSFAVGAF
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVRYPVLYTGFAWWIWFVTPFVARVVDYKSGWDPTRFMLVSQYLVTLLTLHTFLKELPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRQGSLPFVLAFLGVFYGFLIGMIKTSPFTAARGLLDWLTPITFAFYLFVHWRDYPLYR
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RTIERTFTWGVLVTGIYGIVQFLNPPEWDLFWLTSTKLTSMGDPEPLKLRIWSTMASPAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCH
YAAMMMAGLLLLFTNKSFIRLPASAAGYLAFLLTTVRTLWAGWLIAFLTFLTSLKTRLQL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLFITILIMALCVIPLTQIEQFSKPITTRFETFSNLEDDDSARVRQKIYEDGLNSALTNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGNGVGNTFIVNEKGVLEPIVVDSGILDMFFTLGWFGGVFYLLALFMVFSQAFQYSEYSF
HCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
DSFMAAARAISLGMLSTLLGNSGMLGMPGMVLWSFVAMAMAGHKYHAQQRIRHH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA