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The map label for this gene is ywqD [H]

Identifier: 17230325

GI number: 17230325

Start: 3449820

End: 3452135

Strand: Direct

Name: ywqD [H]

Synonym: alr2833

Alternate gene names: 17230325

Gene position: 3449820-3452135 (Clockwise)

Preceding gene: 17230324

Following gene: 17230326

Centisome position: 53.79

GC content: 42.14

Gene sequence:

>2316_bases
GTGGAAAATATCACTTATCGCTCAACCCTCATTACTGATTACTCAACATTCATTTATTTTATTAGCGTCTCGAATACAAG
GATCATCAAAGTGGTTCAAACTAATCTAAGTACAAATATAAACAGCGCTGATTCAGAACCCAGTTACGGCAAAATCTTTT
CAGTTTTTCTGCGTAGGTCTCCTTGGTTCTTAACGGCATTTTTAACAACAATTGCCCTAGCAGCCCTGATGACTGCAAGA
ACCAAGCCTACTTACAAAAGCACAATGCAACTGTTAGTAGAACCTAACTATCAAGGTAAGAGAGAGGGTGGTACTCCAGA
GACTCAGTTTCTCGAACCCGATATACAAATAGATACTGCTACACAACTGAACTTGATGCAAAGTTCAGGACTAATTCACA
AAGCAGTTGACAAATTGAAATCAGAATATCCAAATATTACTGTAGCTGATATTAAAAATGCCTTAGTCTTAAATCAAGTT
AGGACAAAAGAGGATAATGTCGCTACGAAAATTTTTCAAGTAGATTATACTTCTGGCGACCCTGAAGAGACTCAAAAAGT
TCTCAGTGCTATCAGGCAAGTCTATGTGGAATATAACAAACAGCAGCAAGACAACCGACTCAAAAAAGGTCTGCAAGTTA
TTAGAGAACAGTTGAGCAAAGCCAGTGAAGAAGTGAATGCGGCTGAAGCCAACTTGCAAAGATTTCGCAGAAACCAAAAT
CTAATTAACCCAGAAGAGCAAGCAAAAGCTCTAGAAGTTGCTTTAAATACTATTGAGCAAGAACGTCGTACTACTCGTTC
TACATACGAAGAGGCTTTAGCAAAACAAAAATCTTTAGAGGAGCAATTAAATCGTTCTCCCAAAAATGCTTTAGTTACTT
CTCGTTTGAGTCAGTCCGTCCGCTATCAAGGCTTACTCAATGAAATTCAAAAAACAGAACTGTTATTAGCTCAAGAGCGT
TTACGCTTCACCGATGAAACCCCCAGTGTCCAGAAGCTGAAAGAACAGTTGCAGAGCCAAAAAGAATTATTGCAACAGGA
AGTAGGTAGGACTCTAGGTGTTAAATCTGCTAATGCCTTCCGTGGAGCAGAACCGCTTTTAGAACAGGGACAGTTTGGTG
AAATTGATCTAACTCTGGCTAGTCAGTTAGTAGAAACCCAGACAACGATAGTTTCATTGACTGCCCGTGATCAAACTCTG
GCACAGAAAGAAAATCAATTACGCCTGGAAATTAAACGTTTCCCGCCCCTGTTAGCTTATTACAATCGGATACAACCACA
GTTGCAATTCAGTCGTGAGCGACTAGAGCAGTTATTACGGGCAGAACAACAACTACGGCAAGAACTGGCTAAAGGCGGAT
TTAACTGGGAAGTGGTGGAAGAACCCCAGTTAGGGATGAAACTAGGCCCAAATCTCCAACAGAATTTGATGTTGGGTGCA
GTTGTTGGGTTAATGCTGGGAGGTATTGCTGCCTTTATTCGAGAAGCTGCTGATGATTCTGTTCACACCACAGCTGAGTT
GGAAAAACAAGTAGCTTTACCTTTATTAGGAAGCACCCCGAAATTGCCCCCGGCGAAGAGCAGAGAATCAGTGATCAAGT
TGCCTTTTGGCAAGCCTGAGGTTTTAGGGCCTTGGACTGTAGAGGTGCTACAATCTTCCATCCGTTGGGAATCGTTGGAT
CTGATTTACAAAAATATCGAGTTGTTAAACTCGGTATCTAGCTTGAAGTCATTGATGATTACCTCACCTCTGCTGGATAG
AGGTAAATCTGGTTTGGCGTTGGGTTTGGCAATGAGTGCAGCCCGGTTACACAAACGGGTGCTACTGATTGATGCAAATT
TGCGAGATCCTAGCCTCCATGAACATCTCAATCTTCCCAACGACCAAGGGCTATCAACGTTGTTAGCCAGTGAAATTACT
TTACCCGAACAGATTGGTATTCATAACGTAGGTTCAGCCTACATCGATATTTTGACGGCTGGCCCCTCGCCTAGTGACTC
AGCAAATCTCTTGAGTTCTCCACGGATGAAACAGTTAATGGCAGCATTTGAAGAGAACTACGATTTGGTGATTATTGATG
CGCCACCAGTGATAGGTCTAGTAGATGCTTTGTTGACAGCATCATCTTGTAGAAGTGTGGTGATGGTAGCTAGTCTGGGA
AAAGTGACTCGCAATCAAATCGCTCAAGCTACAGCCATGTTGAGCAAGTTAAACCTCATCGGTGTTGTGGCTAATGGGGT
TTCTAACTCTGATAGCACCTATGTACCTTATGCGCGGGAATACCGTTTTGCTTTGCAACAAGCAGTAGAAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAATAATTTTTCTGAGCCAGTTTTCTTTAGTAAAGTTGAGCGAGTTATTACTCAAACTTGTAGCCTCAATTAAATCAGT
AACTAGCTAAAAAGTGCTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAGTGGGGGGAGAATGTGATCCCCATACCCTAATATTTTTTGTGTGCGATCGCCTCTTGCGGGGTGCGATCGCACACAT
CTTTTTATTCAGCAAATAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 771; Mature: 771

Protein sequence:

>771_residues
MENITYRSTLITDYSTFIYFISVSNTRIIKVVQTNLSTNINSADSEPSYGKIFSVFLRRSPWFLTAFLTTIALAALMTAR
TKPTYKSTMQLLVEPNYQGKREGGTPETQFLEPDIQIDTATQLNLMQSSGLIHKAVDKLKSEYPNITVADIKNALVLNQV
RTKEDNVATKIFQVDYTSGDPEETQKVLSAIRQVYVEYNKQQQDNRLKKGLQVIREQLSKASEEVNAAEANLQRFRRNQN
LINPEEQAKALEVALNTIEQERRTTRSTYEEALAKQKSLEEQLNRSPKNALVTSRLSQSVRYQGLLNEIQKTELLLAQER
LRFTDETPSVQKLKEQLQSQKELLQQEVGRTLGVKSANAFRGAEPLLEQGQFGEIDLTLASQLVETQTTIVSLTARDQTL
AQKENQLRLEIKRFPPLLAYYNRIQPQLQFSRERLEQLLRAEQQLRQELAKGGFNWEVVEEPQLGMKLGPNLQQNLMLGA
VVGLMLGGIAAFIREAADDSVHTTAELEKQVALPLLGSTPKLPPAKSRESVIKLPFGKPEVLGPWTVEVLQSSIRWESLD
LIYKNIELLNSVSSLKSLMITSPLLDRGKSGLALGLAMSAARLHKRVLLIDANLRDPSLHEHLNLPNDQGLSTLLASEIT
LPEQIGIHNVGSAYIDILTAGPSPSDSANLLSSPRMKQLMAAFEENYDLVIIDAPPVIGLVDALLTASSCRSVVMVASLG
KVTRNQIAQATAMLSKLNLIGVVANGVSNSDSTYVPYAREYRFALQQAVEK

Sequences:

>Translated_771_residues
MENITYRSTLITDYSTFIYFISVSNTRIIKVVQTNLSTNINSADSEPSYGKIFSVFLRRSPWFLTAFLTTIALAALMTAR
TKPTYKSTMQLLVEPNYQGKREGGTPETQFLEPDIQIDTATQLNLMQSSGLIHKAVDKLKSEYPNITVADIKNALVLNQV
RTKEDNVATKIFQVDYTSGDPEETQKVLSAIRQVYVEYNKQQQDNRLKKGLQVIREQLSKASEEVNAAEANLQRFRRNQN
LINPEEQAKALEVALNTIEQERRTTRSTYEEALAKQKSLEEQLNRSPKNALVTSRLSQSVRYQGLLNEIQKTELLLAQER
LRFTDETPSVQKLKEQLQSQKELLQQEVGRTLGVKSANAFRGAEPLLEQGQFGEIDLTLASQLVETQTTIVSLTARDQTL
AQKENQLRLEIKRFPPLLAYYNRIQPQLQFSRERLEQLLRAEQQLRQELAKGGFNWEVVEEPQLGMKLGPNLQQNLMLGA
VVGLMLGGIAAFIREAADDSVHTTAELEKQVALPLLGSTPKLPPAKSRESVIKLPFGKPEVLGPWTVEVLQSSIRWESLD
LIYKNIELLNSVSSLKSLMITSPLLDRGKSGLALGLAMSAARLHKRVLLIDANLRDPSLHEHLNLPNDQGLSTLLASEIT
LPEQIGIHNVGSAYIDILTAGPSPSDSANLLSSPRMKQLMAAFEENYDLVIIDAPPVIGLVDALLTASSCRSVVMVASLG
KVTRNQIAQATAMLSKLNLIGVVANGVSNSDSTYVPYAREYRFALQQAVEK
>Mature_771_residues
MENITYRSTLITDYSTFIYFISVSNTRIIKVVQTNLSTNINSADSEPSYGKIFSVFLRRSPWFLTAFLTTIALAALMTAR
TKPTYKSTMQLLVEPNYQGKREGGTPETQFLEPDIQIDTATQLNLMQSSGLIHKAVDKLKSEYPNITVADIKNALVLNQV
RTKEDNVATKIFQVDYTSGDPEETQKVLSAIRQVYVEYNKQQQDNRLKKGLQVIREQLSKASEEVNAAEANLQRFRRNQN
LINPEEQAKALEVALNTIEQERRTTRSTYEEALAKQKSLEEQLNRSPKNALVTSRLSQSVRYQGLLNEIQKTELLLAQER
LRFTDETPSVQKLKEQLQSQKELLQQEVGRTLGVKSANAFRGAEPLLEQGQFGEIDLTLASQLVETQTTIVSLTARDQTL
AQKENQLRLEIKRFPPLLAYYNRIQPQLQFSRERLEQLLRAEQQLRQELAKGGFNWEVVEEPQLGMKLGPNLQQNLMLGA
VVGLMLGGIAAFIREAADDSVHTTAELEKQVALPLLGSTPKLPPAKSRESVIKLPFGKPEVLGPWTVEVLQSSIRWESLD
LIYKNIELLNSVSSLKSLMITSPLLDRGKSGLALGLAMSAARLHKRVLLIDANLRDPSLHEHLNLPNDQGLSTLLASEIT
LPEQIGIHNVGSAYIDILTAGPSPSDSANLLSSPRMKQLMAAFEENYDLVIIDAPPVIGLVDALLTASSCRSVVMVASLG
KVTRNQIAQATAMLSKLNLIGVVANGVSNSDSTYVPYAREYRFALQQAVEK

Specific function: May be involved in the regulation of capsular polysaccharide biosynthesis. Autophosphorylates in vitro. Phosphorylates and activates in vitro two UDP-glucose dehydrogenases, YwqF and TuaD, as well as the DNA-binding proteins Ssb and SsbB [H]

COG id: COG3206

COG function: function code M; Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CpsD/CapB family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787216, Length=385, Percent_Identity=25.974025974026, Blast_Score=103, Evalue=3e-23,
Organism=Escherichia coli, GI87082032, Length=400, Percent_Identity=24.75, Blast_Score=89, Evalue=8e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002586
- InterPro:   IPR005702 [H]

Pfam domain/function: PF01656 CbiA [H]

EC number: =2.7.10.2 [H]

Molecular weight: Translated: 85952; Mature: 85952

Theoretical pI: Translated: 7.71; Mature: 7.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENITYRSTLITDYSTFIYFISVSNTRIIKVVQTNLSTNINSADSEPSYGKIFSVFLRRS
CCCCEEHHHHHHHHEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC
PWFLTAFLTTIALAALMTARTKPTYKSTMQLLVEPNYQGKREGGTPETQFLEPDIQIDTA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCEEECH
TQLNLMQSSGLIHKAVDKLKSEYPNITVADIKNALVLNQVRTKEDNVATKIFQVDYTSGD
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCC
PEETQKVLSAIRQVYVEYNKQQQDNRLKKGLQVIREQLSKASEEVNAAEANLQRFRRNQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LINPEEQAKALEVALNTIEQERRTTRSTYEEALAKQKSLEEQLNRSPKNALVTSRLSQSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
RYQGLLNEIQKTELLLAQERLRFTDETPSVQKLKEQLQSQKELLQQEVGRTLGVKSANAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
RGAEPLLEQGQFGEIDLTLASQLVETQTTIVSLTARDQTLAQKENQLRLEIKRFPPLLAY
CCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHCCCHHEEEHHHCCHHHHH
YNRIQPQLQFSRERLEQLLRAEQQLRQELAKGGFNWEVVEEPQLGMKLGPNLQQNLMLGA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
VVGLMLGGIAAFIREAADDSVHTTAELEKQVALPLLGSTPKLPPAKSRESVIKLPFGKPE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCC
VLGPWTVEVLQSSIRWESLDLIYKNIELLNSVSSLKSLMITSPLLDRGKSGLALGLAMSA
CCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ARLHKRVLLIDANLRDPSLHEHLNLPNDQGLSTLLASEITLPEQIGIHNVGSAYIDILTA
HHHHCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHEEEEEC
GPSPSDSANLLSSPRMKQLMAAFEENYDLVIIDAPPVIGLVDALLTASSCRSVVMVASLG
CCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVTRNQIAQATAMLSKLNLIGVVANGVSNSDSTYVPYAREYRFALQQAVEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MENITYRSTLITDYSTFIYFISVSNTRIIKVVQTNLSTNINSADSEPSYGKIFSVFLRRS
CCCCEEHHHHHHHHEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC
PWFLTAFLTTIALAALMTARTKPTYKSTMQLLVEPNYQGKREGGTPETQFLEPDIQIDTA
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PEETQKVLSAIRQVYVEYNKQQQDNRLKKGLQVIREQLSKASEEVNAAEANLQRFRRNQN
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LINPEEQAKALEVALNTIEQERRTTRSTYEEALAKQKSLEEQLNRSPKNALVTSRLSQSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
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YNRIQPQLQFSRERLEQLLRAEQQLRQELAKGGFNWEVVEEPQLGMKLGPNLQQNLMLGA
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VVGLMLGGIAAFIREAADDSVHTTAELEKQVALPLLGSTPKLPPAKSRESVIKLPFGKPE
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HHHHCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHEEEEEC
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CCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVTRNQIAQATAMLSKLNLIGVVANGVSNSDSTYVPYAREYRFALQQAVEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9353933; 9384377 [H]