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The map label for this gene is 17227726

Identifier: 17227726

GI number: 17227726

Start: 245146

End: 246753

Strand: Direct

Name: 17227726

Synonym: alr0230

Alternate gene names: NA

Gene position: 245146-246753 (Clockwise)

Preceding gene: 17227725

Following gene: 17227730

Centisome position: 3.82

GC content: 33.96

Gene sequence:

>1608_bases
ATGCGGCATATAACACTCGTGCCGAGTTGGTTACGATTTTTAATGATTTTACTCTTAGTAATGTGTATATTATTTCGATT
TGTATATGTTGATAGGAAAGTATATTCTTTAGATGAAACCTATACTTCGTTAAGAATTTCTGGCTATACTTTAGCTGAGG
TAAAACAGCAGTTATTTAACGGTCAGGTAATCTCTAGCGAACAGTTTACAGAATTTCAAAGCCCTAATGGGAATAAAAAT
ATTAGTGATACTGTGATGTCTCTCGTGATTGAAAGCCCAGAAAAATCACCGTTATATTTTATAATAGCTAGGTTTTGGGT
AGAAACATTTGGCAATTCTGTAACTGTAATTAGATATTTATCAGCACTAATTAGTTTATTAGTTTTTCCGTGCCTTTATT
GGTTTTGCCGAGAGTTATTTAATGTGACTTTATCGCTTCCTAGTTTAGCGATCGCTCTCATGGCTAACTCACCCATGCAC
CTAGTATACGCCCAAGAAGGCAGAGAATATATCCTTTGGTTAGTCACTATCATACTTGCTAGCACTGCATTACTAAGAGC
GATACGTCTGCAATCCACACAAAAATCAGATCCCTTCACAACCTGGGGGGTTTATGTAATTACACTGGCATTGAGTTTGT
ATACTTGCTTGTGGACTATCTTTGTGGCGATCGCTCATGGTATTTATGTAGTATTAATTGCTAAACTACGCTTGACCGAA
ACTGTCAGATATTATTTGATAGCCACGATTTTTGCTTTTTTAGCATTTTTTCCTTGGTTATTGGTAGTTTTTGCTAAGTT
TTTCCAATTTGTCCTCTCATCAGATGGCACAAATAGTCAAGACCCGAATATCATACCCCTAATTCCTTTCTTACTCATAC
AGATGAGTAGAAGTTTTTTTGATTTAAATATTAGTTTAGACAATCCAATTAATTATTTAATATCAGCTATTTTTTTAATT
CTAACTGCATACGCTATTTATTTTTTATGTCGCACAACTAAATACCAAGTTTGGTTATTTATGATTACTTTAATTGTAGT
GCCTGCTTTGCCATTAATCATACCAAGTTTAGCTTCTGGTCGCATTAGTTCGGGTTACGAACCATATTTACTACCGTCTT
ATTTAGGTGTGCAAATTATTGTTGCCTACTTACTCGCCACACAAATGTATAACGGTAATGTATCACATCGAAGAATCTGG
CAAGTAATTATTGGACTTTTAATTATTTGTAGTTTAATTTCGTCTAGAGTGTATTACCAAGCAGACACTTGGTGGAGTAA
GGGCGTAAGTGACGGTAATCCTCAAATTGCTAGATTTATTAATCAAAAATATCGTCCATTATTAATTACTAATTTTTCTG
AGATTAATTATGGAAATGTTGTTTCTTTAAGTTATCTTTTACAACCGAAGGCAAGATTTCAATTAGTACAGGATCAAACT
GTGCCGATCATACCTAATGATTTTAGTGATATTTTCCTGCTCAACCCCACAAATGCTTGGCGATTACAAATAGCTAGAAA
GTATCAGTTGAAGCCAAATATTGTGTATGTAAATGACTATTATTTAGTTTGGAAATTAGTTCAACCTCCTTCAGACAGGA
ATTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCCAAATTATGTAGTGATCCTATAAATAATTGAGTACACTATGCAGAGGCTTCTATTGATTGGGTGCTTGTGAAATAAAT
AATTCTTGAGAAAAGTATGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTACACCTTCTAGTACTAATTCCTCGTGCTTGGTTCTTGTGGAATAATCTCTGTAACTACGCGATCGCCAGAATTTCCA
CCTTTAACTACTATATTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MRHITLVPSWLRFLMILLLVMCILFRFVYVDRKVYSLDETYTSLRISGYTLAEVKQQLFNGQVISSEQFTEFQSPNGNKN
ISDTVMSLVIESPEKSPLYFIIARFWVETFGNSVTVIRYLSALISLLVFPCLYWFCRELFNVTLSLPSLAIALMANSPMH
LVYAQEGREYILWLVTIILASTALLRAIRLQSTQKSDPFTTWGVYVITLALSLYTCLWTIFVAIAHGIYVVLIAKLRLTE
TVRYYLIATIFAFLAFFPWLLVVFAKFFQFVLSSDGTNSQDPNIIPLIPFLLIQMSRSFFDLNISLDNPINYLISAIFLI
LTAYAIYFLCRTTKYQVWLFMITLIVVPALPLIIPSLASGRISSGYEPYLLPSYLGVQIIVAYLLATQMYNGNVSHRRIW
QVIIGLLIICSLISSRVYYQADTWWSKGVSDGNPQIARFINQKYRPLLITNFSEINYGNVVSLSYLLQPKARFQLVQDQT
VPIIPNDFSDIFLLNPTNAWRLQIARKYQLKPNIVYVNDYYLVWKLVQPPSDRNF

Sequences:

>Translated_535_residues
MRHITLVPSWLRFLMILLLVMCILFRFVYVDRKVYSLDETYTSLRISGYTLAEVKQQLFNGQVISSEQFTEFQSPNGNKN
ISDTVMSLVIESPEKSPLYFIIARFWVETFGNSVTVIRYLSALISLLVFPCLYWFCRELFNVTLSLPSLAIALMANSPMH
LVYAQEGREYILWLVTIILASTALLRAIRLQSTQKSDPFTTWGVYVITLALSLYTCLWTIFVAIAHGIYVVLIAKLRLTE
TVRYYLIATIFAFLAFFPWLLVVFAKFFQFVLSSDGTNSQDPNIIPLIPFLLIQMSRSFFDLNISLDNPINYLISAIFLI
LTAYAIYFLCRTTKYQVWLFMITLIVVPALPLIIPSLASGRISSGYEPYLLPSYLGVQIIVAYLLATQMYNGNVSHRRIW
QVIIGLLIICSLISSRVYYQADTWWSKGVSDGNPQIARFINQKYRPLLITNFSEINYGNVVSLSYLLQPKARFQLVQDQT
VPIIPNDFSDIFLLNPTNAWRLQIARKYQLKPNIVYVNDYYLVWKLVQPPSDRNF
>Mature_535_residues
MRHITLVPSWLRFLMILLLVMCILFRFVYVDRKVYSLDETYTSLRISGYTLAEVKQQLFNGQVISSEQFTEFQSPNGNKN
ISDTVMSLVIESPEKSPLYFIIARFWVETFGNSVTVIRYLSALISLLVFPCLYWFCRELFNVTLSLPSLAIALMANSPMH
LVYAQEGREYILWLVTIILASTALLRAIRLQSTQKSDPFTTWGVYVITLALSLYTCLWTIFVAIAHGIYVVLIAKLRLTE
TVRYYLIATIFAFLAFFPWLLVVFAKFFQFVLSSDGTNSQDPNIIPLIPFLLIQMSRSFFDLNISLDNPINYLISAIFLI
LTAYAIYFLCRTTKYQVWLFMITLIVVPALPLIIPSLASGRISSGYEPYLLPSYLGVQIIVAYLLATQMYNGNVSHRRIW
QVIIGLLIICSLISSRVYYQADTWWSKGVSDGNPQIARFINQKYRPLLITNFSEINYGNVVSLSYLLQPKARFQLVQDQT
VPIIPNDFSDIFLLNPTNAWRLQIARKYQLKPNIVYVNDYYLVWKLVQPPSDRNF

Specific function: Unknown

COG id: COG5305

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61693; Mature: 61693

Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRHITLVPSWLRFLMILLLVMCILFRFVYVDRKVYSLDETYTSLRISGYTLAEVKQQLFN
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHC
GQVISSEQFTEFQSPNGNKNISDTVMSLVIESPEKSPLYFIIARFWVETFGNSVTVIRYL
CCEECCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SALISLLVFPCLYWFCRELFNVTLSLPSLAIALMANSPMHLVYAQEGREYILWLVTIILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
STALLRAIRLQSTQKSDPFTTWGVYVITLALSLYTCLWTIFVAIAHGIYVVLIAKLRLTE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVRYYLIATIFAFLAFFPWLLVVFAKFFQFVLSSDGTNSQDPNIIPLIPFLLIQMSRSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCE
DLNISLDNPINYLISAIFLILTAYAIYFLCRTTKYQVWLFMITLIVVPALPLIIPSLASG
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RISSGYEPYLLPSYLGVQIIVAYLLATQMYNGNVSHRRIWQVIIGLLIICSLISSRVYYQ
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
ADTWWSKGVSDGNPQIARFINQKYRPLLITNFSEINYGNVVSLSYLLQPKARFQLVQDQT
ECCHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHCCHHHHHHHCCCC
VPIIPNDFSDIFLLNPTNAWRLQIARKYQLKPNIVYVNDYYLVWKLVQPPSDRNF
CCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEEEECEEEEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRHITLVPSWLRFLMILLLVMCILFRFVYVDRKVYSLDETYTSLRISGYTLAEVKQQLFN
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHC
GQVISSEQFTEFQSPNGNKNISDTVMSLVIESPEKSPLYFIIARFWVETFGNSVTVIRYL
CCEECCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SALISLLVFPCLYWFCRELFNVTLSLPSLAIALMANSPMHLVYAQEGREYILWLVTIILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
STALLRAIRLQSTQKSDPFTTWGVYVITLALSLYTCLWTIFVAIAHGIYVVLIAKLRLTE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVRYYLIATIFAFLAFFPWLLVVFAKFFQFVLSSDGTNSQDPNIIPLIPFLLIQMSRSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCE
DLNISLDNPINYLISAIFLILTAYAIYFLCRTTKYQVWLFMITLIVVPALPLIIPSLASG
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RISSGYEPYLLPSYLGVQIIVAYLLATQMYNGNVSHRRIWQVIIGLLIICSLISSRVYYQ
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
ADTWWSKGVSDGNPQIARFINQKYRPLLITNFSEINYGNVVSLSYLLQPKARFQLVQDQT
ECCHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHCCHHHHHHHCCCC
VPIIPNDFSDIFLLNPTNAWRLQIARKYQLKPNIVYVNDYYLVWKLVQPPSDRNF
CCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEEEECEEEEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA