| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010503 |
| Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761957
Identifier: 170761957
GI number: 170761957
Start: 360032
End: 364681
Strand: Direct
Name: 170761957
Synonym: UPA3_0332
Alternate gene names: NA
Gene position: 360032-364681 (Clockwise)
Preceding gene: 170762161
Following gene: 170762445
Centisome position: 47.9
GC content: 23.63
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTTAAAAAATATTTAGAATGTTATGATATAATTTAACCAATAAGTAAAATGTGAATGAAATGACGACCTTAGGGTTG TCATTTCTTATTTATATGAA
Product: efflux ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1549; Mature: 1549
Protein sequence:
>1549_residues MFVSIFSFSMLTNLSKTLTRSYTNLVNRQKLHDITVNESYIEDQKDIKQAQFNKLLEELKVFYAQKGLNFDWTRSNSLIV NSTKDDITYKIVQYSTSKTINTFDKQTSERLIKNSFSDIDLYGILNNAKVDVIDLIKTKTLNASFVINNLKELDNKQKSN LVKLAKVDNYDVSISQQARLYLLKNIVYGAWPSKTNNLYKKFKKAYEYSLEDKNYDPLIGNIKLNNKANFDILEAKEIST QFILMLYPSKKGISINGNVNTIVKGHRITFSFEPAGIPIPVYFDVKSAYALVGLGAFLSNHNKQKYPMYLWQKALVDHEE QQSFEKWFNSLDEKYIIHIDNTPYLILDSGITPDFMYPIISFTSVIPNPKKEGLVYVNLNGYARIYDAFRSNPIENNLQI RITNQKHQSVDISILKKIVKNLNDQIKKDAIMNWPTSLDAAYLKDDTNNHITPSPLRLVFINKITNTIQTFSVLITLFIL ILTIFVIVIIINRFLAQNKINIGISIANGVPRWKIILSFAFIGLIPCVIGGLCGYLTAYFTQNLAINIFSGYWLIPTVLE NFNFGALITVIIFPFLLFFILIVGLGYWSIRKPPIDLMRGTETFKISKIVYVIKFPFKYISGFNKYLITLSFSSITRIII FSIMIALSFGSIMFLTGTRGKIKQTIDATLQTKKYRYGIDLITPTDQGGQYISLSTNQIGSTLNDNDNHELTQKYESSDY KDFINSPLFKNLQNLKLIGAKDDQRRIYDLNYIANAFQVKQFLDFNFGIGDVNSGSSSNPWSITKSLIPENNLQILNETY KKWCSKLINDHSIFSKQLIEKGVNELAYDILNIRNSYDPNEYFNYFTFKSIVDTYLKRFNKSFLDQHVTYEILVRVHNNL FNYKNIYGKLVFKNNQWIINFKDNNFPIDDQNFVSAIYYKKPNEQNYDLKKYIFKNDDLIYDEVYFERNSKQNYHKLTYQ TFSSYFRARFLKFDPEGDFDYYLPLKYFNATIVRKELLENAINNEILFKNDENKIIKKINFKSDNDIVVTKINDLTYQVK NIINQQIYLYSPKPIKRSYRIDPAKATNAIKTGLSIKLDNDFINLVLLTHPSINPSYADVWSGITFNMVGFDYLTKNDKT QLNEFDEPYIWIDAQINKINNQKYEEAKNPKIIGIIKNSKLVHLLSNKKQINNLLFNKNDEQVAIINRVAAKYYNLKIGD HFSFVANNQTNRYTKDYIKKQITLKVVGIIDTYQGIEIYTGIKNAAEILGMHSSPYADKSLYDEYDGAFNGIFTNKNNPA MLTRIISIYSPSGLYPISETWKKDAPTINLIKNILSDKYTTYELNNKWDPKSLVLNSRLSLTKALGYKNFDELKLDARNI YDDNHNYLGLRDEQAQAEWVIDKLISIYGRDTYSSTLNNVEVVDVLFAVLETASKTIQTVEIVVIFLILFIIILVLVLIS INSLSDTLKVAKLLKNIGYSDLKNAKLFLMAFLPSLIIGSIISIPLVIVVMQVFSEIIFNSLNVLLTTSFIWWHFLIILL IVAIIFLLMWAIAIWILRRSNIADASKRN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 175521; Mature: 175521
Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFVSIFSFSMLTNLSKTLTRSYTNLVNRQKLHDITVNESYIEDQKDIKQAQFNKLLEELK CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFYAQKGLNFDTRSNSLIVNSTKDDITYKIVQYSTSKTINTFDKQTSERLIKNSFSDIDL HHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE YGILNNAKVDVIDLIKTKTLNASFVINNLKELDNKQKSNLVKLAKVDNYDVSISQQARLY EEEECCCCEEHEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEEEEECCCCEEECHHHHHH LLKNIVYGAPSKTNNLYKKFKKAYEYSLEDKNYDPLIGNIKLNNKANFDILEAKEISTQF HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEHHHCCCEE ILMLYPSKKGISINGNVNTIVKGHRITFSFEPAGIPIPVYFDVKSAYALVGLGAFLSNHN EEEEECCCCCEEECCCEEEEEECEEEEEEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCC KQKYPMYLQKALVDHEEQQSFEKFNSLDEKYIIHIDNTPYLILDSGITPDFMYPIISFTS CCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH VIPNPKKEGLVYVNLNGYARIYDAFRSNPIENNLQIRITNQKHQSVDISILKKIVKNLND HCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH QIKKDAIMNPTSLDAAYLKDDTNNHITPSPLRLVFINKITNTIQTFSVLITLFILILTIF 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PDB accession: NA
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Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]