Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 170761883

Identifier: 170761883

GI number: 170761883

Start: 555594

End: 558371

Strand: Reverse

Name: 170761883

Synonym: UPA3_0499

Alternate gene names: NA

Gene position: 558371-555594 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170761859

Following gene: 170762043

Centisome position: 74.28

GC content: 21.67

Gene sequence:

>2778_bases
TTGGAAAATAATAAAAAGATTTACGATTTAGTTCTTGATAAGGATTTGATTACTAATCGTGAATATAAATTATTTAAAGC
TCAAATTACTGATTCAAAAGATACTAATACAGTGTTTAATGATTTAAGTATTAATGGTGTTAGTCATAAATTTGGTATTA
ATCCTTATAATACAAATTTATCTATCGATTATTCTAATTGGGTAACAAATTTAACTGAGAATAGTGCTACTATAAATGTA
AAAGTTAATTCAACTGATCAAGTTTTTGAAAATAATCAAATTGTTGAAGCTACATTTGTATCTACATCAAATCCATCAGA
AATTAAAAAAATTGATGGTGTATTAAGTGAAGTAAGTGCAAATAAAAATAGTGCTAAAATTAAATGAAATTTAACTGATT
TAAAACCAGAAACAGAATATAGATTCACATCAGCTAAATTTAAAAATAAGCCAGATTTAGCTAAATGAATGTTAACAATA
AATAAAAATAATGTAATATATGGAGGTAATCTAGATACTAAATTCAAAACATTAGTTGATAAACTAAAATTATTGAAATT
AGAATCAAATAATGATATTTATTACAATATACAAGAAAATGCTGTTAATCCTAATAGAGTGATAGGAACAATAAAAGCAG
AATTTTCAAGAATTAATTCTAATTACATTAACAAAAAAATTAAATTAGTATATGAAGATAACAATCATCAAGAATGAGAA
ACTAATGAACTAACTTTATCAAACAATAAAACTAGTTATAATTTTGATATTAGTAAACTAACTCCTAATAGAAAATATTC
TTTCAAAAAGATTTTAATTTCAAATAATAATATCTTTGAAGAATTGCTAAATTCAAATAATATTGCTGATTCATTTATAT
ATCATCATGCACCAACTGCAGTAACATTTAAAACAGAAGGCGATGAAAATCAATTGTGAAAATCAAATATTGGCATAACT
ACTGCTAAATTTAGATTAGGTTTAGAATCATTAGATAAAATTTTAGAAAATGGCGATAAGATAGTTGTAACTTTTGCTAA
TAAAAAATATCCAAACAATCAAGATAAAATGAAAGTTTATACAATGTCAATCATTGATTCAAGAAATGATGGATTATACG
CAAATATTAAACATGATTTAGTAAATCTTGATGAAGGAAGTGAATATTACATAAAAGAAATAAGAATGATTAAAAAACCA
AACAAAGCTTATGAAGATGTAAATGGTAATAAAATTATTTCACCAATTAATGATGCACAAAGAAGAACGTTAGAGAATAC
TAATTTTAAAACAAATTGAGCAATATATAATGCAAAAAAATACGGAAATTGGGATCAACCAACAATTAATAGTGCAAAGT
ATGCTTTTGAAATTACAACTACTAATGATGGAACAATGTTAAATACAAATTCTAAATTCCAATTGGTATTTAAAAAAGTT
AGTGATAGTACCAAGACATTTATACAAACAATTAATTTAGTAAGAAAAGATAATAAATGGATTCTTGAAGGAGAAATATC
TAATTTAGAGCCAAATACAGAATACATTTTATCTACAATAAAATTATCAAGACCAACAGGCAATGATCTATTTGATACAG
AATTAAACACAAACATTAACATTATTGAACAAAATCAAAATAAAATTTTAACTAAAGGTATTGATCCATATATCGAATCA
ATTACTTATGAAAAAACTAATGATTTAAGAAGAAGAATTATTAAATTAAAAATTAAGGATATAAAAGATTACAATGATGG
TGATAGATTAGTATTAGAGTATAGATACAATAATTCAACTTCTAAAAAAGAAGTAAGCTTAACTTTAAATAAAAATCAAG
AAGATTATAGCGTTAATATTGAAAATTTAACTTATAATCGTGAATATACTTTAAAAAATATTATTAAAATAAATCATAAT
ACTAATAATATTACTTCAATAGATATTAGTAAATTAAATGATAAAACATTTGTTGTTGAACCAAGTGTGACAAAATTAAC
TAATTTTAAAAATATTACAAATTTTGATGAAAAAAAACAAATTTGATCAAGAATAATGGAATTTAATATTACTAATGATG
ATGAGTGATTTTCTCAATCATTATTAAATTCATATAAAATTCGTGCTATTGTGGAAAATTTATCAACCAATAAAATTGAT
GATAATCCAATAATTAAAATTGTAAATGACAATGGTAAACCTAAATTACAAATTCATATTAACAATATTAATATAAATGA
TCAAAATAATGAATATAAATTAAGAATTGTAAAATTTGAAAATAAACCAAATTCTTACCTATATAAAAACATAAATAATG
ATTGAGATAATATTTTTTATGATACTAATAAAAATGGTTCAGTTATATACAAAAGTTCTAATACAAGTAATTATGCTGGA
ATAGTAGATATTACGAATGTTGATCATAACATTTATACTACAAATAATACAAGTTATACTTATGTTAGTTTTAGTGGAAG
TGTTAGAAAACTTATTTTTAATAATATGAATAATCAAAATGATTCTATTTTTGGTGAAGTTATGTACAAAAATTTAGATA
ATGGTCAAATTTATAATACAACAGTTGGAATAATTGAAAATAATGTTAACAAAAATTATAATACTCCTGGCCAATTTCAA
CTACTTTTAGATAAAATGCCAAAATCTTCAAGATATCAATTTTATGGTATTAAATATTGAAGAGCAAATGATAAAAAAGA
TAATGCAAAAATTGCATTAGTCCCAAATGATAAAAAAACAAAAATAATTTGATTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAACCGTTTCTGGTGTTAATGATAATTATGCTGGTAGAAAAATTAAATTAGCTTATAAGGATAATAATGAGCAAATTG
TTTGAACAAAAGAAGTTACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATTATTCAAAAATAAACATTAGAAAAAATCATAAATTAAATTGTCTACCTTTTATAAAAAGAAGGTAGACTTTTAGTT
ATAAATTATAAAATCTGTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925

Protein sequence:

>925_residues
MENNKKIYDLVLDKDLITNREYKLFKAQITDSKDTNTVFNDLSINGVSHKFGINPYNTNLSIDYSNWVTNLTENSATINV
KVNSTDQVFENNQIVEATFVSTSNPSEIKKIDGVLSEVSANKNSAKIKWNLTDLKPETEYRFTSAKFKNKPDLAKWMLTI
NKNNVIYGGNLDTKFKTLVDKLKLLKLESNNDIYYNIQENAVNPNRVIGTIKAEFSRINSNYINKKIKLVYEDNNHQEWE
TNELTLSNNKTSYNFDISKLTPNRKYSFKKILISNNNIFEELLNSNNIADSFIYHHAPTAVTFKTEGDENQLWKSNIGIT
TAKFRLGLESLDKILENGDKIVVTFANKKYPNNQDKMKVYTMSIIDSRNDGLYANIKHDLVNLDEGSEYYIKEIRMIKKP
NKAYEDVNGNKIISPINDAQRRTLENTNFKTNWAIYNAKKYGNWDQPTINSAKYAFEITTTNDGTMLNTNSKFQLVFKKV
SDSTKTFIQTINLVRKDNKWILEGEISNLEPNTEYILSTIKLSRPTGNDLFDTELNTNINIIEQNQNKILTKGIDPYIES
ITYEKTNDLRRRIIKLKIKDIKDYNDGDRLVLEYRYNNSTSKKEVSLTLNKNQEDYSVNIENLTYNREYTLKNIIKINHN
TNNITSIDISKLNDKTFVVEPSVTKLTNFKNITNFDEKKQIWSRIMEFNITNDDEWFSQSLLNSYKIRAIVENLSTNKID
DNPIIKIVNDNGKPKLQIHINNININDQNNEYKLRIVKFENKPNSYLYKNINNDWDNIFYDTNKNGSVIYKSSNTSNYAG
IVDITNVDHNIYTTNNTSYTYVSFSGSVRKLIFNNMNNQNDSIFGEVMYKNLDNGQIYNTTVGIIENNVNKNYNTPGQFQ
LLLDKMPKSSRYQFYGIKYWRANDKKDNAKIALVPNDKKTKIIWL

Sequences:

>Translated_925_residues
MENNKKIYDLVLDKDLITNREYKLFKAQITDSKDTNTVFNDLSINGVSHKFGINPYNTNLSIDYSNWVTNLTENSATINV
KVNSTDQVFENNQIVEATFVSTSNPSEIKKIDGVLSEVSANKNSAKIK*NLTDLKPETEYRFTSAKFKNKPDLAK*MLTI
NKNNVIYGGNLDTKFKTLVDKLKLLKLESNNDIYYNIQENAVNPNRVIGTIKAEFSRINSNYINKKIKLVYEDNNHQE*E
TNELTLSNNKTSYNFDISKLTPNRKYSFKKILISNNNIFEELLNSNNIADSFIYHHAPTAVTFKTEGDENQL*KSNIGIT
TAKFRLGLESLDKILENGDKIVVTFANKKYPNNQDKMKVYTMSIIDSRNDGLYANIKHDLVNLDEGSEYYIKEIRMIKKP
NKAYEDVNGNKIISPINDAQRRTLENTNFKTN*AIYNAKKYGNWDQPTINSAKYAFEITTTNDGTMLNTNSKFQLVFKKV
SDSTKTFIQTINLVRKDNKWILEGEISNLEPNTEYILSTIKLSRPTGNDLFDTELNTNINIIEQNQNKILTKGIDPYIES
ITYEKTNDLRRRIIKLKIKDIKDYNDGDRLVLEYRYNNSTSKKEVSLTLNKNQEDYSVNIENLTYNREYTLKNIIKINHN
TNNITSIDISKLNDKTFVVEPSVTKLTNFKNITNFDEKKQI*SRIMEFNITNDDE*FSQSLLNSYKIRAIVENLSTNKID
DNPIIKIVNDNGKPKLQIHINNININDQNNEYKLRIVKFENKPNSYLYKNINND*DNIFYDTNKNGSVIYKSSNTSNYAG
IVDITNVDHNIYTTNNTSYTYVSFSGSVRKLIFNNMNNQNDSIFGEVMYKNLDNGQIYNTTVGIIENNVNKNYNTPGQFQ
LLLDKMPKSSRYQFYGIKY*RANDKKDNAKIALVPNDKKTKII*L
>Mature_925_residues
MENNKKIYDLVLDKDLITNREYKLFKAQITDSKDTNTVFNDLSINGVSHKFGINPYNTNLSIDYSNWVTNLTENSATINV
KVNSTDQVFENNQIVEATFVSTSNPSEIKKIDGVLSEVSANKNSAKIK*NLTDLKPETEYRFTSAKFKNKPDLAK*MLTI
NKNNVIYGGNLDTKFKTLVDKLKLLKLESNNDIYYNIQENAVNPNRVIGTIKAEFSRINSNYINKKIKLVYEDNNHQE*E
TNELTLSNNKTSYNFDISKLTPNRKYSFKKILISNNNIFEELLNSNNIADSFIYHHAPTAVTFKTEGDENQL*KSNIGIT
TAKFRLGLESLDKILENGDKIVVTFANKKYPNNQDKMKVYTMSIIDSRNDGLYANIKHDLVNLDEGSEYYIKEIRMIKKP
NKAYEDVNGNKIISPINDAQRRTLENTNFKTN*AIYNAKKYGNWDQPTINSAKYAFEITTTNDGTMLNTNSKFQLVFKKV
SDSTKTFIQTINLVRKDNKWILEGEISNLEPNTEYILSTIKLSRPTGNDLFDTELNTNINIIEQNQNKILTKGIDPYIES
ITYEKTNDLRRRIIKLKIKDIKDYNDGDRLVLEYRYNNSTSKKEVSLTLNKNQEDYSVNIENLTYNREYTLKNIIKINHN
TNNITSIDISKLNDKTFVVEPSVTKLTNFKNITNFDEKKQI*SRIMEFNITNDDE*FSQSLLNSYKIRAIVENLSTNKID
DNPIIKIVNDNGKPKLQIHINNININDQNNEYKLRIVKFENKPNSYLYKNINND*DNIFYDTNKNGSVIYKSSNTSNYAG
IVDITNVDHNIYTTNNTSYTYVSFSGSVRKLIFNNMNNQNDSIFGEVMYKNLDNGQIYNTTVGIIENNVNKNYNTPGQFQ
LLLDKMPKSSRYQFYGIKY*RANDKKDNAKIALVPNDKKTKII*L

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105314; Mature: 105314

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENNKKIYDLVLDKDLITNREYKLFKAQITDSKDTNTVFNDLSINGVSHKFGINPYNTNL
CCCCCEEEEEEECCHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECEEECCCCEECCCCCCCCEE
SIDYSNWVTNLTENSATINVKVNSTDQVFENNQIVEATFVSTSNPSEIKKIDGVLSEVSA
EEEEHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
NKNSAKIKNLTDLKPETEYRFTSAKFKNKPDLAKMLTINKNNVIYGGNLDTKFKTLVDKL
CCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHE
KLLKLESNNDIYYNIQENAVNPNRVIGTIKAEFSRINSNYINKKIKLVYEDNNHQEETNE
EEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHEEEEEEHHHHHHCCHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCE
LTLSNNKTSYNFDISKLTPNRKYSFKKILISNNNIFEELLNSNNIADSFIYHHAPTAVTF
EEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHEEECCCEEEEE
KTEGDENQLKSNIGITTAKFRLGLESLDKILENGDKIVVTFANKKYPNNQDKMKVYTMSI
EECCCHHHHHHCCCEEEEHEECCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEE
IDSRNDGLYANIKHDLVNLDEGSEYYIKEIRMIKKPNKAYEDVNGNKIISPINDAQRRTL
EECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHH
ENTNFKTNAIYNAKKYGNWDQPTINSAKYAFEITTTNDGTMLNTNSKFQLVFKKVSDSTK
CCCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEECCCHHH
TFIQTINLVRKDNKWILEGEISNLEPNTEYILSTIKLSRPTGNDLFDTELNTNINIIEQN
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
QNKILTKGIDPYIESITYEKTNDLRRRIIKLKIKDIKDYNDGDRLVLEYRYNNSTSKKEV
CCEEEECCCCHHHHHEECCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEE
SLTLNKNQEDYSVNIENLTYNREYTLKNIIKINHNTNNITSIDISKLNDKTFVVEPSVTK
EEEECCCCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCHHH
LTNFKNITNFDEKKQISRIMEFNITNDDEFSQSLLNSYKIRAIVENLSTNKIDDNPIIKI
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEEE
VNDNGKPKLQIHINNININDQNNEYKLRIVKFENKPNSYLYKNINNDDNIFYDTNKNGSV
ECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEE
IYKSSNTSNYAGIVDITNVDHNIYTTNNTSYTYVSFSGSVRKLIFNNMNNQNDSIFGEVM
EEECCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEEECCCEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEH
YKNLDNGQIYNTTVGIIENNVNKNYNTPGQFQLLLDKMPKSSRYQFYGIKYRANDKKDNA
EECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
KIALVPNDKKTKIIL
EEEEEECCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure
MENNKKIYDLVLDKDLITNREYKLFKAQITDSKDTNTVFNDLSINGVSHKFGINPYNTNL
CCCCCEEEEEEECCHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECEEECCCCEECCCCCCCCEE
SIDYSNWVTNLTENSATINVKVNSTDQVFENNQIVEATFVSTSNPSEIKKIDGVLSEVSA
EEEEHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
NKNSAKIKNLTDLKPETEYRFTSAKFKNKPDLAKMLTINKNNVIYGGNLDTKFKTLVDKL
CCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHE
KLLKLESNNDIYYNIQENAVNPNRVIGTIKAEFSRINSNYINKKIKLVYEDNNHQEETNE
EEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHEEEEEEHHHHHHCCHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCE
LTLSNNKTSYNFDISKLTPNRKYSFKKILISNNNIFEELLNSNNIADSFIYHHAPTAVTF
EEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHEEECCCEEEEE
KTEGDENQLKSNIGITTAKFRLGLESLDKILENGDKIVVTFANKKYPNNQDKMKVYTMSI
EECCCHHHHHHCCCEEEEHEECCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEE
IDSRNDGLYANIKHDLVNLDEGSEYYIKEIRMIKKPNKAYEDVNGNKIISPINDAQRRTL
EECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHH
ENTNFKTNAIYNAKKYGNWDQPTINSAKYAFEITTTNDGTMLNTNSKFQLVFKKVSDSTK
CCCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEECCCHHH
TFIQTINLVRKDNKWILEGEISNLEPNTEYILSTIKLSRPTGNDLFDTELNTNINIIEQN
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
QNKILTKGIDPYIESITYEKTNDLRRRIIKLKIKDIKDYNDGDRLVLEYRYNNSTSKKEV
CCEEEECCCCHHHHHEECCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEE
SLTLNKNQEDYSVNIENLTYNREYTLKNIIKINHNTNNITSIDISKLNDKTFVVEPSVTK
EEEECCCCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCHHH
LTNFKNITNFDEKKQISRIMEFNITNDDEFSQSLLNSYKIRAIVENLSTNKIDDNPIIKI
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEEE
VNDNGKPKLQIHINNININDQNNEYKLRIVKFENKPNSYLYKNINNDDNIFYDTNKNGSV
ECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEE
IYKSSNTSNYAGIVDITNVDHNIYTTNNTSYTYVSFSGSVRKLIFNNMNNQNDSIFGEVM
EEECCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEEECCCEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEH
YKNLDNGQIYNTTVGIIENNVNKNYNTPGQFQLLLDKMPKSSRYQFYGIKYRANDKKDNA
EECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
KIALVPNDKKTKIIL
EEEEEECCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA