| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is 170757707
Identifier: 170757707
GI number: 170757707
Start: 216799
End: 218448
Strand: Direct
Name: 170757707
Synonym: CLD_0602
Alternate gene names: NA
Gene position: 216799-218448 (Clockwise)
Preceding gene: 170756893
Following gene: 170757316
Centisome position: 5.48
GC content: 24.67
Gene sequence:
>1650_bases ATGCCAAGCATTTCAAATATAAATAATGTCTATAGTAATAACACAAAAAAAATATCTAGTAAAATTTCTTTTGAAATAGA TCAAATTTTTGCTGCAAAAGTAGTTGGTGAGGGAGTAAGCCCAGAGGAAGTAATATTAAAATTAATGGACGGGTGGCAAT TTAAAGCCTCTATTGAAGACTTAAAGGGAAATTTGCCTAATGGACTACTTAATTTTAAAGTTTTAGGATTTGAGGAAGGA AAGTTAATTTTAAAATTTTTAGAGGGTAACTTAGTAGAAGGGCAACAAAAAGAACAAAATCCTATAGAAGAGTTATTACT TAAAGAGAACATAAAATTAAATAAAGAGGACTATGTTTTATTAGAAAAAATGATAAAACATAATATACCTTTAACTAAGG ATAATATATTAAAGGTTGTAAATTTATCTAATTTTATGGGAAAACTAAAAAATAATCCTCAAGAAGGAGACTCATTTATA CAAAACTATATAAAGGGTAAAGGAATAGATTTACAAAGTGCCAAAGGTCAAGAGATAAATAATGTATTAAAGGGATTATT TAATGAATTACAAACTTTAACAGAAGAAGATTTATTTATTTTATTAGAAAATAACGTAGAGTTAACAGAAGAAAATGTAA AAGCCTTTAAAGAGGTTTTTAAAGAGTCTAGTGTTTATAATAAGGTAAATAATATAGATAAGGAACTAAATAAATCTAGC ATAGATAATAAACAGATAATAACTGAGAAAAATACATCTAATGGAGATACTTTAGTAAAGGAAAATCTACAATCAACAGA AATGGAAAGTGCTATAAATAATAAAAGCGAAAATGTTGTGAAAAATGAATTAATAAGTACTTTTAAAACACTTATGGCCA CAGGAAAAGAAGAAAATATAAGCATTGTAAGAGACTTAATATTAGAGGAAAAAGATATAAATGGAATATTAAAAAATTTT ACTAAAGAAGAGCAAGAAATGCTAGGATTAAAACCAAAAACTGAAGATACTGAAGCAACGGAGCAAAGTTTAACAGCGGA AACTACAAAAAACATTAAAACAAAGCCAATAGAGGTATTGGCTAATAAAGGACAAATGGATTCTTCAAGTATAAAAGAAC AAATAAATTCAAAAACAAATGAGATTAAAGATATAGTTAAAAATCTCATAGATACATTAAAAGATACCAATAATTCATCC TATGATAAAATAATAGGTACATTAAAAAATAATATAAATAATTTTAAAATGTTTAATACTATATCCAACGAATATTATTA TTTAGATTTACCTTTAAACTTTAAAGAAAATGAATGTGATTGTAAAATTATAATAAAAGATGAAAGGGGTAAGGGTAAGA AAATAGATTCTAGTAATGTAAAGATAGCTACATCTATATCTACAGCTAATATGGATATAGTAGATGCTTACATTACTCTT AAAAATAGCAATATGGAGATTAATATAAAAACCATAAAGGAATGGGTAAATTTATTAGATAAAGGGAAAAATAAACTTAT AGAAGATATGAGCAGTATGGGGTATAATATTTTTATAAAAGTAGAGGAAAAAGCAGAAATATTTAATATATCAAACTGTA GAGAATTTTTTAATGATAACAATTTAAATGCTATTGATATTAAAGCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAATATATGGATATATTAAACAGCTCTTTTGTAAAGTTCATTTAGTAAATATAGGTTTAGTACGATAATAAAGTAAGTT TTATAAGGGGTGATGATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAAGATTGGGTGGTTATTTTGAATGAAAGAAAAAAGGCTGCAGCTTTAAAATATGAGGAAAGTTACACATCCCCAGTG GTTACTGCTGCTGGCATGGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 548
Protein sequence:
>549_residues MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEG KLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFI QNYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNF TKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSS YDKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA
Sequences:
>Translated_549_residues MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEG KLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFI QNYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNF TKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSS YDKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA >Mature_548_residues PSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEGK LILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQ NYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSSI DNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNFT KEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSY DKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITLK NSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62299; Mature: 62168
Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIED CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH LKGNLPNGLLNFKVLGFEEGKLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVL HCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH LEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQNYIKGKGIDLQSAKGQEIN HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH NVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENI CCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SIVRDLILEEKDINGILKNFTKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH ANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSYDKIIGTLKNNINNFKMFNT HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEE ISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL ECCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEE KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDN ECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEECHHHHHHHHCCC NLNAIDIKA CCCEEEECC >Mature Secondary Structure PSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIED CCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH LKGNLPNGLLNFKVLGFEEGKLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVL HCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH LEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQNYIKGKGIDLQSAKGQEIN HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH NVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENI CCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SIVRDLILEEKDINGILKNFTKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH ANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSYDKIIGTLKNNINNFKMFNT HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEE ISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL ECCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEE KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDN ECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEECHHHHHHHHCCC NLNAIDIKA CCCEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA