Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is 170757707

Identifier: 170757707

GI number: 170757707

Start: 216799

End: 218448

Strand: Direct

Name: 170757707

Synonym: CLD_0602

Alternate gene names: NA

Gene position: 216799-218448 (Clockwise)

Preceding gene: 170756893

Following gene: 170757316

Centisome position: 5.48

GC content: 24.67

Gene sequence:

>1650_bases
ATGCCAAGCATTTCAAATATAAATAATGTCTATAGTAATAACACAAAAAAAATATCTAGTAAAATTTCTTTTGAAATAGA
TCAAATTTTTGCTGCAAAAGTAGTTGGTGAGGGAGTAAGCCCAGAGGAAGTAATATTAAAATTAATGGACGGGTGGCAAT
TTAAAGCCTCTATTGAAGACTTAAAGGGAAATTTGCCTAATGGACTACTTAATTTTAAAGTTTTAGGATTTGAGGAAGGA
AAGTTAATTTTAAAATTTTTAGAGGGTAACTTAGTAGAAGGGCAACAAAAAGAACAAAATCCTATAGAAGAGTTATTACT
TAAAGAGAACATAAAATTAAATAAAGAGGACTATGTTTTATTAGAAAAAATGATAAAACATAATATACCTTTAACTAAGG
ATAATATATTAAAGGTTGTAAATTTATCTAATTTTATGGGAAAACTAAAAAATAATCCTCAAGAAGGAGACTCATTTATA
CAAAACTATATAAAGGGTAAAGGAATAGATTTACAAAGTGCCAAAGGTCAAGAGATAAATAATGTATTAAAGGGATTATT
TAATGAATTACAAACTTTAACAGAAGAAGATTTATTTATTTTATTAGAAAATAACGTAGAGTTAACAGAAGAAAATGTAA
AAGCCTTTAAAGAGGTTTTTAAAGAGTCTAGTGTTTATAATAAGGTAAATAATATAGATAAGGAACTAAATAAATCTAGC
ATAGATAATAAACAGATAATAACTGAGAAAAATACATCTAATGGAGATACTTTAGTAAAGGAAAATCTACAATCAACAGA
AATGGAAAGTGCTATAAATAATAAAAGCGAAAATGTTGTGAAAAATGAATTAATAAGTACTTTTAAAACACTTATGGCCA
CAGGAAAAGAAGAAAATATAAGCATTGTAAGAGACTTAATATTAGAGGAAAAAGATATAAATGGAATATTAAAAAATTTT
ACTAAAGAAGAGCAAGAAATGCTAGGATTAAAACCAAAAACTGAAGATACTGAAGCAACGGAGCAAAGTTTAACAGCGGA
AACTACAAAAAACATTAAAACAAAGCCAATAGAGGTATTGGCTAATAAAGGACAAATGGATTCTTCAAGTATAAAAGAAC
AAATAAATTCAAAAACAAATGAGATTAAAGATATAGTTAAAAATCTCATAGATACATTAAAAGATACCAATAATTCATCC
TATGATAAAATAATAGGTACATTAAAAAATAATATAAATAATTTTAAAATGTTTAATACTATATCCAACGAATATTATTA
TTTAGATTTACCTTTAAACTTTAAAGAAAATGAATGTGATTGTAAAATTATAATAAAAGATGAAAGGGGTAAGGGTAAGA
AAATAGATTCTAGTAATGTAAAGATAGCTACATCTATATCTACAGCTAATATGGATATAGTAGATGCTTACATTACTCTT
AAAAATAGCAATATGGAGATTAATATAAAAACCATAAAGGAATGGGTAAATTTATTAGATAAAGGGAAAAATAAACTTAT
AGAAGATATGAGCAGTATGGGGTATAATATTTTTATAAAAGTAGAGGAAAAAGCAGAAATATTTAATATATCAAACTGTA
GAGAATTTTTTAATGATAACAATTTAAATGCTATTGATATTAAAGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATATATGGATATATTAAACAGCTCTTTTGTAAAGTTCATTTAGTAAATATAGGTTTAGTACGATAATAAAGTAAGTT
TTATAAGGGGTGATGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAGATTGGGTGGTTATTTTGAATGAAAGAAAAAAGGCTGCAGCTTTAAAATATGAGGAAAGTTACACATCCCCAGTG
GTTACTGCTGCTGGCATGGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 548

Protein sequence:

>549_residues
MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEG
KLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFI
QNYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS
IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNF
TKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSS
YDKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL
KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA

Sequences:

>Translated_549_residues
MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEG
KLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFI
QNYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS
IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNF
TKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSS
YDKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL
KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA
>Mature_548_residues
PSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIEDLKGNLPNGLLNFKVLGFEEGK
LILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVLLEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQ
NYIKGKGIDLQSAKGQEINNVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSSI
DNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENISIVRDLILEEKDINGILKNFT
KEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVLANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSY
DKIIGTLKNNINNFKMFNTISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITLK
NSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDNNLNAIDIKA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62299; Mature: 62168

Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIED
CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH
LKGNLPNGLLNFKVLGFEEGKLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVL
HCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
LEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQNYIKGKGIDLQSAKGQEIN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
NVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENI
CCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
SIVRDLILEEKDINGILKNFTKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
ANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSYDKIIGTLKNNINNFKMFNT
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEE
ISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL
ECCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEE
KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDN
ECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEECHHHHHHHHCCC
NLNAIDIKA
CCCEEEECC
>Mature Secondary Structure 
PSISNINNVYSNNTKKISSKISFEIDQIFAAKVVGEGVSPEEVILKLMDGWQFKASIED
CCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH
LKGNLPNGLLNFKVLGFEEGKLILKFLEGNLVEGQQKEQNPIEELLLKENIKLNKEDYVL
HCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
LEKMIKHNIPLTKDNILKVVNLSNFMGKLKNNPQEGDSFIQNYIKGKGIDLQSAKGQEIN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
NVLKGLFNELQTLTEEDLFILLENNVELTEENVKAFKEVFKESSVYNKVNNIDKELNKSS
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
IDNKQIITEKNTSNGDTLVKENLQSTEMESAINNKSENVVKNELISTFKTLMATGKEENI
CCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
SIVRDLILEEKDINGILKNFTKEEQEMLGLKPKTEDTEATEQSLTAETTKNIKTKPIEVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
ANKGQMDSSSIKEQINSKTNEIKDIVKNLIDTLKDTNNSSYDKIIGTLKNNINNFKMFNT
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEE
ISNEYYYLDLPLNFKENECDCKIIIKDERGKGKKIDSSNVKIATSISTANMDIVDAYITL
ECCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEE
KNSNMEINIKTIKEWVNLLDKGKNKLIEDMSSMGYNIFIKVEEKAEIFNISNCREFFNDN
ECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEECHHHHHHHHCCC
NLNAIDIKA
CCCEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA