| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is 170757142
Identifier: 170757142
GI number: 170757142
Start: 534467
End: 536233
Strand: Direct
Name: 170757142
Synonym: CLD_0322
Alternate gene names: NA
Gene position: 534467-536233 (Clockwise)
Preceding gene: 170755089
Following gene: 170755767
Centisome position: 13.5
GC content: 32.2
Gene sequence:
>1767_bases ATGAAAAAAAATAGGGGAGTTTTATTAACTTTTTCATTTGTTTTAATGATCTTATTATTTAATAACATGTCAGTATTAGC GGCAGATTTAGACCCAAAAGTTGTAGCAGAAAATGCTAGTAGATTGGGAATATGGACTATTTTACCGCCAGTAATAGCTA TTGTATTAGCCTTTATTACAAAAAATGTAGTTATTTCTTTAGCACTAGGTGTTTTTAGTGGAAGCTTTTTATTACAGCTA AATGGAAACAACGTATTCGGTGCTAGTTTCAAAGCTTTTTTAGATTTTATAAATAGAATACTAAATTCCCTTGCAGATCC TTGGAATGCAGGAATAATACTTCAATGTATGGTTATAGGTGGTCTTATAGCAGTAATTTCTAAAATGGGTGGGGCTAAAG CTGTTGCGGAATCTTTAGCTAAAAAAGCTAAAACCCCAAAGAGTGCCCAAATTATAACTTGGTTTTTAGGTTTATTAGTT TTCTTTGACGATTATGCTAATGCCCTTATAGTAGGACCTATAATGAGACCTGTTGCAGATAAAATGAAAATATCAAGGGA AAAATTAGCTTTTATAATAGATGGTACAGCGGCACCAATAGCTGGTATAGCAGTTATATCTACATGGATAGGATATGAAA TAAGTTTAATAAAAGATGCTTATGCAGGTATTGGTCAAAGTGTAAATGCTTATGGATTATTTTTATCAACTATACCTTAT AGGTTTTATAATATATTAATATTAGCATTTATAGTTTTAATAGCTTTAATGGGAAGAGATTTTGGACCAATGCTTAAGGC TGAAAGAAGAGCAAGAACTACAGGTAAGCTTTTATCTGATACAGCAAAGCCAATGGTTTCTGAAGAAAGTACAGAACTTG AACCAAGGGAAGGGATAAAATTAAATATTTGGAATGCAATAATCCCAATAGCAATATTAATAATTGGAGCCTTTGCAGGT TTTTATTATAATGGGTATCAAGCTATAATGGGTGGAGAAGATAAGGCCTTAATACAAATGCTACAAACTTCACCTGCATC CTTTGATGCTTTAAGGGAAACTTTTAGTGCATCAGATGCTAGTGTAGTTTTATTTCAATCCGCGTTACTTGCAAGTATAG TAGCAATAATAATGGGAGCTTCACAAAAGATTTTTAAAGTAGGAGAAGCTATAGATGTTTGGATTACAGGGATGAAATCT TTAATTATAACAGCAGTTATATTACTTCTTGCTTGGTCTTTAAGTGCAGTTATAAAAGAACTTGGAACAGCTACTTTCTT AGTTTCAATTTTATCTAACTCTATACCAAAATTTTTATTACCAAGCATAATATTTATATTGGGATCTGTTATATCTTTTG CTACAGGATCAGCTTACGGAACAATGGGTATATTAATGCCTTTAACAATTCCATTAGCTTATGCTATATCACCGGATCCA ACTTATGTAGTAATAAGCGTAAGTGCGGTTTTGACAGGAGCAATATTTGGAGATCATTGTTCTCCAATATCAGACACAAC TATAATGTCTTCTATGGGATCCGCTTGTGATCATTTGGATCATACCTCAACACAAATGGTATATGCTTTAACTGTAGCAG CATGTACAATATTATTTGGGTATATTCCAGCAGGCTTAGGATTACCAATATATATAGTTTTACCATTATCAATAGGGTTA GTTGCATTATTAATTAGATTTGTAGGTAAGCCAAATGATATACCAGAAGAAGAAAGTTTAGAAGAAGTTTTAGAAATGGA TGCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAGGCTTTTTTGTTTTTGATGATGGTTTTCCTCCCCATATTCACTTAAATTTTAAAGCTTATACGGCTTGAAATTTAT AAATAGAGGAGGAGATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAGGAAAGTGCTTAGCACTTTCCTTATTGTTCTTCTCTAGGTTCTTCATCTCTATCTCTTCCATAGAATGAAATTGC ATATAAACCTGCTATACCTA
Product: Na+/H+ antiporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 588; Mature: 588
Protein sequence:
>588_residues MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL NGNNVFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYAGIGQSVNAYGLFLSTIPY RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA
Sequences:
>Translated_588_residues MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL NGNNVFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYAGIGQSVNAYGLFLSTIPY RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA >Mature_588_residues MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL NGNNVFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYAGIGQSVNAYGLFLSTIPY RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA
Specific function: Unknown
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62919; Mature: 62919
Theoretical pI: Translated: 5.87; Mature: 5.87
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNVFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYAGIGQSVNAYGLFLSTIPY HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE LNIWNAIIPIAILIIGAFAGFYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDA EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCC SVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA HHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNVFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYAGIGQSVNAYGLFLSTIPY HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE LNIWNAIIPIAILIIGAFAGFYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDA EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCC SVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA HHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]