Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 170756889

Identifier: 170756889

GI number: 170756889

Start: 2856647

End: 2858077

Strand: Reverse

Name: 170756889

Synonym: CLD_1887

Alternate gene names: NA

Gene position: 2858077-2856647 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755592

Following gene: 170756459

Centisome position: 72.21

GC content: 19.29

Gene sequence:

>1431_bases
ATGTTAACAAAATTTAAAAATATATTTAAAAACAATAAGTTTAATGTGATTTTCAAATATTCTTTTATTAAGTATATTGC
ATTAGTAATAGGTTTTTTAAAAGAAATAGTAAATGCTAGGGCTTTGGGGCCAGAGTTATTAGGTGTTTTAGGAAATTTAT
TGTTAATATTAAATTATTTATCCTATGCTAATTTAGGGATTTTATATTCTATGAATAGAGAATATGTACTTTATAAGGAT
AAAGATGAAATAAAGGCTAGACAGGTTGTTTATACTTCTTTTACAAGCTTATTTATACTTTCTATTTTTTTTATACTATG
TGGTTTTTTATCAAAATTATTTATTTTTAAGGATGTTACAGGAGAATATTTGATATATATTTTTTTAATTGCTATTTTCC
AACAGTTTAAAATGTTTTTTATTAATTATTTTAGATTAGTTGACAATTTTACAAAAATTAATATTATTGAATTGATTAAT
AATGCAGGAACGTTTTTATTAATAATGTTATTTATAAAGGATTATAAAATAAATGCAGTATTGTATTCTATGATTATTTG
TGGATTTATAACTTTAATATATGGCATTATTAATTGTGAAAAGCTAAAAATTAATATAAATTACAATATATTAAAAGATT
TAATTTATGTAGGAATACCTTTATTGATTTATAATTTAGGATTTTATATTTTAACAACAGTGGATAGAATAATGATTTTA
AAATATTTAAACTATGAAGAATTAGGTTATTATACATTTTCAAATCAAATAGTTAGTGCAACATTAGTTTTTATAACATC
TATTTTATTCTTATATTACCCCAAAGCTATAAAAATACTAAATATAAATGAAAATTTTAATGTAAAAAAGGTTTATAATA
GCATAGAAAATTATACAAAATATGTGGAATTATTAGGGGTTTTATTGTGTATAGTAGGCGTAATTTTTATAAAGCCTTTT
GTAAATATTGTTGTACCTAATTATGAAGCTAGTATAAATATTTATAGAGTATTAGTACTAGGTGCAATAGCCTCACAAGT
TTCATATTTTGCAAATGTTTTTATAGTGTCAAATAAGAAACAAATGTATTTAATTTTTCTTCAATTTTTAACTATAATAT
TATCCATAATATTAAATTACATATTTTTAAAATTAGGTTTTAAGGTTATGGGCGTATCTATAGCTACTATGATTACTAAT
ATAATATATTCTGCAATGCAGTATTTAATCTTCTTAAAAATATTAAATCAGAGAAAAGGTTATTTTAATATAATGTTAAA
AACTTATTATAAATTTATTTTATTTGTAATTATATTATTAATTATAAGTACTTTGAAAATAAATTATTACATATATATAA
TGATTTTGTTGGCATCTGTATTTATGTTATATAAAAAAGATATTAATGATGTTGTCAAAAAGTATATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATATAATTTACAAAAGGGGCTCATAAAAACTATAAATTATTATAAAGACAATATATAGGATAATGCTTATTTAAAAG
TATTACATAAGGTGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAATGGGATAAGTTTACTAAATAATAATATATTATTAATATAAGAGTAAAAAGAGTATGTTAAAATGATATAATATTT
CTGTTAATCATATTATGATA

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476

Protein sequence:

>476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDVTGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKDYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIENYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKGYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI

Sequences:

>Translated_476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDVTGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKDYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIENYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKGYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
>Mature_476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDVTGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKDYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIENYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKGYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55753; Mature: 55753

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYVLYKDKDEIKARQVVYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDVT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKDYKINAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIENYTK
HHCCHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYVLYKDKDEIKARQVVYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDVT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKDYKINAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIENYTK
HHCCHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA