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The map label for this gene is 170756670

Identifier: 170756670

GI number: 170756670

Start: 3402675

End: 3404246

Strand: Reverse

Name: 170756670

Synonym: CLD_1400

Alternate gene names: NA

Gene position: 3404246-3402675 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755539

Following gene: 170757394

Centisome position: 86.0

GC content: 24.81

Gene sequence:

>1572_bases
ATGGGATCACTTAGTTACATAGTTAGAAAAAGTATAAAAAATTATTTTAAACAACTAAAGAATAAACCGGCTAAAGCTAT
ATTATATGTTCTTTTTATAGCCCTTTTAGTTTTTATCTTAATTGTATCTCCAGAATCAAGTGGTAATAAGAGGATAAAAG
ATGGTAAAGAATTTTTTAATGCTATAGTTACTATAGTAACTTTATATGCAGTATTTAGTGCTATTAATACAGGTACTAAA
AAAGGTAAAAGTTTTTTTAGATTAAGTGATGTGAATTTTTTGTTTACAGCTCCTATACCACCTCAAAGAGTATTGCTTTA
TGGATTCTTAAAAGAATTATATAAAAGTATGATGATGATAGTATTTCTTTTATTTCAAATACCTAATCTTTATAATTTAT
TTCCTATAAAGCAACACGGTGCCATACCTGTGGTAGTGGGTATATTCATGTTGATGTTTTCTTATTCAACTATAGCTGTA
CTAATTTATTCTATAGCTGCTAAGGAAGATAAATATAGAAATTTTATAAAAAATATTATTAATTTATTATTAGGATTATT
TGGAGCAGGTTTTTTATGGACGTTATTTAAAGTAAAATCTATAAAATTAGCTTTTATAACCTTTTTAGGGTTAGATATGT
TTTCCAAAATACCTTTTATAGGATGGAATATAAATATATTTAATGCCGCTATAGATGGTATAAATAAGCTATTCTTTATA
AACCTACTAGGGGTACTCTTGTTCATAATTTTTATAATATATATAGTGTATATTTTAAAAACAGATTATTATGAAGATGC
TATGTCAGTTACAGAGGTCAATGAAAGAAAGATAGAGAGAGCTAAAAAAGGTAAAGGAAATGTAGATTTAAATAAACCTA
TAAAAAGAAAAAATGTTATGGGAATATTAAAATCAAAGGGAGCAAAAAGTATATTTGAAAGACAAGTTTTAGAGTATAAA
AGAAGTGGATTTTTCTTTGTAGATAAGATGACTTTAGTAATGGGAATAAGCTCCTTAGTTTTTGGATTTTTTATGAATGA
TAAAAATGGCAGTATAAATACAGTAATGTATTTTGCAATATATATGTTATTGATATTTACATTTCAAGGCAAATGGGCTG
AAGAACTATCTAAGCCTTATATATATTTAATTCCAGAGAGTTCAGAAATTAAAGTTTTCTATGCTACCCTTACTAACCAT
ATTAAAAATTTTGTGGATGGTTTCGTATTATTTTTAATTTGTGGTATTATATTTAAAACTAATCCTATGGTTATATTGTT
AGCTACATTAACCTATGTAAGTTTTGGTGCAATATTTGTATATGTGGATTTAGTTTTAAGGAGATTTTTTGGTGGTAATA
TTAGTAAAGTTGTAGAAGCCACATTAAAATTTATTTTATTAATAATAGCAGTATCGCCAGGAATAATAATATCTATAGTA
ATTTCTTTTAAGTATAAAGGATTATTTGAAACAGTTTCTATGTATTTTGCTATGATTTTATATAATTGTCTTATTAGCTT
TATAGGAATATTATTATCTAAAGGTATATTTGAAAAAATAGAAATGAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAGAAGGGAATATAGTCTTTGCTAGAACCAAGCAAGAATTAATAGATAAAAATGAGTCCTTAGAAGAAATATTCTT
TGAAGTAACGGAGGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAATAGAGTATTTCAAAATAAAATATATTTAATTTTAACAAGGATAACAAAAAATACACGTTATAAACAAATTTATA
TGTTTATGATGTGTATTTTT

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 523; Mature: 522

Protein sequence:

>523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNIINLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSKIPFIGWNINIFNAAIDGINKLFFI
NLLGVLLFIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGISSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVSPGIIISIV
ISFKYKGLFETVSMYFAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK

Sequences:

>Translated_523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNIINLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSKIPFIGWNINIFNAAIDGINKLFFI
NLLGVLLFIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGISSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVSPGIIISIV
ISFKYKGLFETVSMYFAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK
>Mature_522_residues
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTKK
GKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVL
IYSIAAKEDKYRNFIKNIINLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSKIPFIGWNINIFNAAIDGINKLFFIN
LLGVLLFIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYKR
SGFFFVDKMTLVMGISSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHI
KNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVSPGIIISIVI
SFKYKGLFETVSMYFAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59720; Mature: 59589

Theoretical pI: Translated: 10.33; Mature: 10.33

Prosite motif: PS00327 BACTERIAL_OPSIN_RET

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
AIVTIVTLYAVFSAINTGTKKGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVLIYSIAAKEDKYRNFIKNII
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
NLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSKIPFIGWNINIFNAAIDGINKLFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHH
NLLGVLLFIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GILKSKGAKSIFERQVLEYKRSGFFFVDKMTLVMGISSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
YMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHIKNFVDGFVLFLICGIIFKT
HHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVSPGIIISIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
ISFKYKGLFETVSMYFAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA