Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is spoIIIAE [H]

Identifier: 170755569

GI number: 170755569

Start: 2017881

End: 2019044

Strand: Reverse

Name: spoIIIAE [H]

Synonym: CLD_2746

Alternate gene names: 170755569

Gene position: 2019044-2017881 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170756713

Following gene: 170757553

Centisome position: 51.01

GC content: 28.01

Gene sequence:

>1164_bases
ATGAAAAAAAGTTTAATGACTATTTTATTAACGTTTTTATTTGTGATCATTTTATGTTTCAATGTACAAGCCGCACCTAG
CCAGCATAATGAAATAAAAGAAGATAATAAAGAAATAGAGAAACTATATGATTATATATCAAATATGAAAAATCAATATG
AGATTTTAAAGGATATAGATGCAAAAGATTATGTAAAAAATTTTATGGAAAAAGGAGAAAGCCAAATTTCTGTAAACAAA
GCAGCAAAAGCTATAACTACATATGTATTTAAAGAAATAGCGGCTTCCTTAAAATTAATTGCTCTTCTAATTATGGTGGC
TATAATATGTGCTTTGCTGAATAATTTACAAAAGGCCTTTAGTAATGAAACTCTATCTGATATAGCTTATTTTGCCTGTT
ATGCATTAATAATAATAATATTAGCTAGAAGTTTTTATTTAGGTGTTAATATAGCTAGAGATACTATAAACAAGATGACA
GATTTTATGATGGCTTTAATACCAATTTTAGTAATGCTTATAGCTTCTATAGGAGGTATTGTAGAAGCTACTATGTTAGA
TCCTATAATAATAGGAACTATAAATATAAGTGCTAATATATTTTCAAAATTTATAATTCCATTAATATGTATGACCTTTG
TTTTGCAGTTTGTAGATAATCTATCAGAGGATTATAAAATAAATAAACTAACAAAATTATTGAATCAAGTAGCTCTTTGG
ACTCAAGGAATTGTAATGACTGTATTCGTGGGAGTAGTTACTATAAGAGGTATAACTTCTAAAGCTATGGATCAGGTTAC
TGTTAAAACAGCAAAATATGCTGTGGATAATTTTGTACCAGTGGTAGGCAAATGTTTATCTGATGCTATTTCTACTGTAG
CTGGTTATTCATTACTTTTAAAAAATTCTATAAGTAGTTTAGGACTTATTGTAATAGTGGCCATGCTTTTAGTGCCTGTT
ATAAAGCTTTTAATAATGGCTTTTATGTATAAGATGGCAGCAGCTTTAATAGAGCCTATAAGTGATAGTAGACTTGTAAA
TTCTATAGGAGCAGCAGGAGACTCATTAATACTTATATTATCTTGTTTGATATGTGTATCTGTAATGTTTTTTATAATGA
TAGCTATAATGGCTTCTGCAGGAAAGGTTTTTATGGGCACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAGTAGAATTTGCTGGTAAGATACTAATACTTGGACTTGCCATACCTATACTTATGGCAGTGCTTCAATCTATTTTA
AAGATTATGTAGGTGAGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAATATAACTTTATAAAGGGGTGATTATATTTTGCTCCAATGGTTAAAAGAGTGGATAACTAATATAGCTGTAGCA
GTATTTTTTATAACTGCCAT

Product: stage III sporulation protein AE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 387; Mature: 387

Protein sequence:

>387_residues
MKKSLMTILLTFLFVIILCFNVQAAPSQHNEIKEDNKEIEKLYDYISNMKNQYEILKDIDAKDYVKNFMEKGESQISVNK
AAKAITTYVFKEIAASLKLIALLIMVAIICALLNNLQKAFSNETLSDIAYFACYALIIIILARSFYLGVNIARDTINKMT
DFMMALIPILVMLIASIGGIVEATMLDPIIIGTINISANIFSKFIIPLICMTFVLQFVDNLSEDYKINKLTKLLNQVALW
TQGIVMTVFVGVVTIRGITSKAMDQVTVKTAKYAVDNFVPVVGKCLSDAISTVAGYSLLLKNSISSLGLIVIVAMLLVPV
IKLLIMAFMYKMAAALIEPISDSRLVNSIGAAGDSLILILSCLICVSVMFFIMIAIMASAGKVFMGT

Sequences:

>Translated_387_residues
MKKSLMTILLTFLFVIILCFNVQAAPSQHNEIKEDNKEIEKLYDYISNMKNQYEILKDIDAKDYVKNFMEKGESQISVNK
AAKAITTYVFKEIAASLKLIALLIMVAIICALLNNLQKAFSNETLSDIAYFACYALIIIILARSFYLGVNIARDTINKMT
DFMMALIPILVMLIASIGGIVEATMLDPIIIGTINISANIFSKFIIPLICMTFVLQFVDNLSEDYKINKLTKLLNQVALW
TQGIVMTVFVGVVTIRGITSKAMDQVTVKTAKYAVDNFVPVVGKCLSDAISTVAGYSLLLKNSISSLGLIVIVAMLLVPV
IKLLIMAFMYKMAAALIEPISDSRLVNSIGAAGDSLILILSCLICVSVMFFIMIAIMASAGKVFMGT
>Mature_387_residues
MKKSLMTILLTFLFVIILCFNVQAAPSQHNEIKEDNKEIEKLYDYISNMKNQYEILKDIDAKDYVKNFMEKGESQISVNK
AAKAITTYVFKEIAASLKLIALLIMVAIICALLNNLQKAFSNETLSDIAYFACYALIIIILARSFYLGVNIARDTINKMT
DFMMALIPILVMLIASIGGIVEATMLDPIIIGTINISANIFSKFIIPLICMTFVLQFVDNLSEDYKINKLTKLLNQVALW
TQGIVMTVFVGVVTIRGITSKAMDQVTVKTAKYAVDNFVPVVGKCLSDAISTVAGYSLLLKNSISSLGLIVIVAMLLVPV
IKLLIMAFMYKMAAALIEPISDSRLVNSIGAAGDSLILILSCLICVSVMFFIMIAIMASAGKVFMGT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014194 [H]

Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42539; Mature: 42539

Theoretical pI: Translated: 8.43; Mature: 8.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
5.4 %Met     (Translated Protein)
7.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
5.4 %Met     (Mature Protein)
7.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKSLMTILLTFLFVIILCFNVQAAPSQHNEIKEDNKEIEKLYDYISNMKNQYEILKDID
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AKDYVKNFMEKGESQISVNKAAKAITTYVFKEIAASLKLIALLIMVAIICALLNNLQKAF
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNETLSDIAYFACYALIIIILARSFYLGVNIARDTINKMTDFMMALIPILVMLIASIGGI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEATMLDPIIIGTINISANIFSKFIIPLICMTFVLQFVDNLSEDYKINKLTKLLNQVALW
HHHHHHCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
TQGIVMTVFVGVVTIRGITSKAMDQVTVKTAKYAVDNFVPVVGKCLSDAISTVAGYSLLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNSISSLGLIVIVAMLLVPVIKLLIMAFMYKMAAALIEPISDSRLVNSIGAAGDSLILIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
SCLICVSVMFFIMIAIMASAGKVFMGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKSLMTILLTFLFVIILCFNVQAAPSQHNEIKEDNKEIEKLYDYISNMKNQYEILKDID
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AKDYVKNFMEKGESQISVNKAAKAITTYVFKEIAASLKLIALLIMVAIICALLNNLQKAF
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNETLSDIAYFACYALIIIILARSFYLGVNIARDTINKMTDFMMALIPILVMLIASIGGI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEATMLDPIIIGTINISANIFSKFIIPLICMTFVLQFVDNLSEDYKINKLTKLLNQVALW
HHHHHHCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
TQGIVMTVFVGVVTIRGITSKAMDQVTVKTAKYAVDNFVPVVGKCLSDAISTVAGYSLLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNSISSLGLIVIVAMLLVPVIKLLIMAFMYKMAAALIEPISDSRLVNSIGAAGDSLILIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
SCLICVSVMFFIMIAIMASAGKVFMGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]