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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 170755092

GI number: 170755092

Start: 1230137

End: 1231504

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: CLD_3457

Alternate gene names: 170755092

Gene position: 1230137-1231504 (Clockwise)

Preceding gene: 170757617

Following gene: 170755837

Centisome position: 31.08

GC content: 28.22

Gene sequence:

>1368_bases
ATGGATAGACAAAAACAATTAGGAGAAGAAAGTGTAAAAAAATTATTATTAAAATTTTCTGCACCAGCCATTATGGGAAT
GATAGTTAATGCTTTATATAATATTATAGATAGAATGTATATAGGGCATATAAAGGATGTAGGATCCTTAGCAATTACAG
GAGTAGGATTAACATTGCCTATAATGACAGTGTTAATGGCTTTTAGTATGCTAATAGGTATAGGATCAGCTTCTATTATA
TCTATAAGATTAGGACAGAAAAGAAAAAATGATGCAGAAAAAATATTAGGAAATGCGTTTACTTTACTTTGTATTATTAT
GATTTCCATAACTATAATAGGATTAATATTTGTGGATCCTCTTTTAAATATTTTTGGAGCTAGCGCTAAAACCTTTTATT
ATGCTAAAGAATATGTAGTTATTATTTTAATAGGTTCTATAACCAATGCTCTGGGATTCGGTTTAAATAATTCAATTAGA
GCTGAGGGAAATCCTAAAATGGCAATGGTAACCATGCTTTTAGGAGCTGTATTAAACTTAATTTTAGATCCTATATTTAT
ATTTAGCTTTAATATGGGAATAAAAGGAGCGGCTATAGCTACTGTTATATCTCAGACAGCTAATACTATATGGGTACTTA
GATATTTTACTGGTAAAAAAAGTACTTTAAAGCTTAAAAGAGAAAATTTTAAGGTTGAAAAAACTATATTTTTAGAAATA
ATATCTATAGGCATGGCTCCTTTTGCATTACAATTAGCAGCTAGTATAATAACAGTTATTTCAAACAATGCATTGAAAAA
TACAGGAGGAGATTTAGCAATAGGGGCAATGACTGTTATAAATAGTGTGTCTTTAATGGTTTTAATGCCTATATTTGGTA
TAAACCAAGGTGCTCAACCTATAATAGGTTATAATTATGGAGCAGAGCAATATAAAAGAGTTAAAGATACTTTAAAAATA
GCAATATTTTCTGCCACTATGGTAGTTACAGTAGGGTTTTTACTTGTACAGATATTCCCACAATATATTATAAAAATATT
TAATAATGATCCTAAACTTATGGAAATAGGAATTAGTGGCTTAAGAATAGTTTTATGTATGTTACCTGTAATTGGATTCC
AAATTGTTAGTTCAAATTATTTCCAAGCTATAGGGAAAGCTAAAGTATCTGTGTTTTTAAGTTTGTTAAGACAAGTAATA
ATTTTAATACCATTACTTTTGATATTACCAAATCATTTTGGTCTTACAGGAGTCTGGATGTGTGCACCTATATCAGATGG
GATTTCTTCTATAGTTACTGCTATATTTATTTACAGGGAAATAAATAAGTTAGGTAGGGAAAAATCTTATAAAGTAAAAT
TTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTACGGAAAAAGAAAAAAAGGAACTTATGAAATTATTAGAAAAAGCTTCCTTGAATTGTCACAATTATAAAGCTAAA
TAATAGATTGGAGGAATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTATTTTATATTAGTGTTATAAATTTTTAAATACTATTTAGAACTTATAATTAAAGCTTAGAGATAATTTTGATTAG
TTATTTCTAAGCTTTTTATA

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 455

Protein sequence:

>455_residues
MDRQKQLGEESVKKLLLKFSAPAIMGMIVNALYNIIDRMYIGHIKDVGSLAITGVGLTLPIMTVLMAFSMLIGIGSASII
SIRLGQKRKNDAEKILGNAFTLLCIIMISITIIGLIFVDPLLNIFGASAKTFYYAKEYVVIILIGSITNALGFGLNNSIR
AEGNPKMAMVTMLLGAVLNLILDPIFIFSFNMGIKGAAIATVISQTANTIWVLRYFTGKKSTLKLKRENFKVEKTIFLEI
ISIGMAPFALQLAASIITVISNNALKNTGGDLAIGAMTVINSVSLMVLMPIFGINQGAQPIIGYNYGAEQYKRVKDTLKI
AIFSATMVVTVGFLLVQIFPQYIIKIFNNDPKLMEIGISGLRIVLCMLPVIGFQIVSSNYFQAIGKAKVSVFLSLLRQVI
ILIPLLLILPNHFGLTGVWMCAPISDGISSIVTAIFIYREINKLGREKSYKVKFN

Sequences:

>Translated_455_residues
MDRQKQLGEESVKKLLLKFSAPAIMGMIVNALYNIIDRMYIGHIKDVGSLAITGVGLTLPIMTVLMAFSMLIGIGSASII
SIRLGQKRKNDAEKILGNAFTLLCIIMISITIIGLIFVDPLLNIFGASAKTFYYAKEYVVIILIGSITNALGFGLNNSIR
AEGNPKMAMVTMLLGAVLNLILDPIFIFSFNMGIKGAAIATVISQTANTIWVLRYFTGKKSTLKLKRENFKVEKTIFLEI
ISIGMAPFALQLAASIITVISNNALKNTGGDLAIGAMTVINSVSLMVLMPIFGINQGAQPIIGYNYGAEQYKRVKDTLKI
AIFSATMVVTVGFLLVQIFPQYIIKIFNNDPKLMEIGISGLRIVLCMLPVIGFQIVSSNYFQAIGKAKVSVFLSLLRQVI
ILIPLLLILPNHFGLTGVWMCAPISDGISSIVTAIFIYREINKLGREKSYKVKFN
>Mature_455_residues
MDRQKQLGEESVKKLLLKFSAPAIMGMIVNALYNIIDRMYIGHIKDVGSLAITGVGLTLPIMTVLMAFSMLIGIGSASII
SIRLGQKRKNDAEKILGNAFTLLCIIMISITIIGLIFVDPLLNIFGASAKTFYYAKEYVVIILIGSITNALGFGLNNSIR
AEGNPKMAMVTMLLGAVLNLILDPIFIFSFNMGIKGAAIATVISQTANTIWVLRYFTGKKSTLKLKRENFKVEKTIFLEI
ISIGMAPFALQLAASIITVISNNALKNTGGDLAIGAMTVINSVSLMVLMPIFGINQGAQPIIGYNYGAEQYKRVKDTLKI
AIFSATMVVTVGFLLVQIFPQYIIKIFNNDPKLMEIGISGLRIVLCMLPVIGFQIVSSNYFQAIGKAKVSVFLSLLRQVI
ILIPLLLILPNHFGLTGVWMCAPISDGISSIVTAIFIYREINKLGREKSYKVKFN

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49740; Mature: 49740

Theoretical pI: Translated: 10.34; Mature: 10.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
5.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDRQKQLGEESVKKLLLKFSAPAIMGMIVNALYNIIDRMYIGHIKDVGSLAITGVGLTLP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCHHHHH
IMTVLMAFSMLIGIGSASIISIRLGQKRKNDAEKILGNAFTLLCIIMISITIIGLIFVDP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNIFGASAKTFYYAKEYVVIILIGSITNALGFGLNNSIRAEGNPKMAMVTMLLGAVLNL
HHHHHCCCCHHEEEEECEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILDPIFIFSFNMGIKGAAIATVISQTANTIWVLRYFTGKKSTLKLKRENFKVEKTIFLEI
HHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHCCCHHHHHHHHH
ISIGMAPFALQLAASIITVISNNALKNTGGDLAIGAMTVINSVSLMVLMPIFGINQGAQP
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
IIGYNYGAEQYKRVKDTLKIAIFSATMVVTVGFLLVQIFPQYIIKIFNNDPKLMEIGISG
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHH
LRIVLCMLPVIGFQIVSSNYFQAIGKAKVSVFLSLLRQVIILIPLLLILPNHFGLTGVWM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE
CAPISDGISSIVTAIFIYREINKLGREKSYKVKFN
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC
>Mature Secondary Structure
MDRQKQLGEESVKKLLLKFSAPAIMGMIVNALYNIIDRMYIGHIKDVGSLAITGVGLTLP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCHHHHH
IMTVLMAFSMLIGIGSASIISIRLGQKRKNDAEKILGNAFTLLCIIMISITIIGLIFVDP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNIFGASAKTFYYAKEYVVIILIGSITNALGFGLNNSIRAEGNPKMAMVTMLLGAVLNL
HHHHHCCCCHHEEEEECEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILDPIFIFSFNMGIKGAAIATVISQTANTIWVLRYFTGKKSTLKLKRENFKVEKTIFLEI
HHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHCCCHHHHHHHHH
ISIGMAPFALQLAASIITVISNNALKNTGGDLAIGAMTVINSVSLMVLMPIFGINQGAQP
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
IIGYNYGAEQYKRVKDTLKIAIFSATMVVTVGFLLVQIFPQYIIKIFNNDPKLMEIGISG
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHH
LRIVLCMLPVIGFQIVSSNYFQAIGKAKVSVFLSLLRQVIILIPLLLILPNHFGLTGVWM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE
CAPISDGISSIVTAIFIYREINKLGREKSYKVKFN
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA