Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is lolE [C]

Identifier: 170754946

GI number: 170754946

Start: 706660

End: 709128

Strand: Direct

Name: lolE [C]

Synonym: CLD_0167

Alternate gene names: 170754946

Gene position: 706660-709128 (Clockwise)

Preceding gene: 170757481

Following gene: 170755948

Centisome position: 17.85

GC content: 24.34

Gene sequence:

>2469_bases
ATGAGGTTGTTTTTTAAAGTTGCATTTAACAGTATAAGAAAAAATAAGATTAGATATATGTTATTAACTTGTACCTTAAT
TTTATCTACAATTATTATGTTATCTACATCTATAATAAAAGATTCTGCAATTAAAATCAGAGAAGATCAGCTAAGAAAAA
CAACTTTAAATAGCCAACTGGTAATAACAACTGCAGATGAAAAAGATCCTTTTTTCAATCCTAAAGATATTATAAATTCT
ATCAAGGATATAGATGGAATAAGTCATATTGTGCCTAGAATAGGGGGTATGGCAAAGGACGCTAAAACTTTAAAAGATAT
AAATATTATTGGGGTTGATCTTAATAAACAGAAAGCAGCATTCCCAATAGAGTTGATAGATAAATATAAGGTTAAAGATA
AAGAAAATGAGATTATAATTAATGAAAAGTATGCAAAGGAAAATTCTTTAAAAGTAGGAGCTAAGATAAAACTATTAATT
GGAACTAAGAATAAAGAGTTTATTATAAGTGGAATATCAAAAAATACAGGGGTATTTGATCCTAGTATGAATACTGCAAT
GATTAGTATTGATAATGCCCAGTACCTTTTAGACCAAAAGGATAATGCTTATTCAATTGGAATAACAATAAAAAATTTAG
ATGATATAAATAATATGATTGAGAAAATAAAGCCTAAAGTATCATCAAAATTTATAATCCAACAACGATATGATATGGAT
TATTTTAAATCCTATGTAGGAACTATAGATATGGCATTAAAGATAATTGGTGTGTTGTCTATATTTATAACATTGTTTCT
AACTTATTCAACATTTTCACTTATAATTTATGAAAGGTTGCATCAAATTGGTATATTGAGAAGTTTAGGTATATCAAAGA
AGGATATTAAAGTAAGTGTTATAGTAGAAAACTTACTTATAGTATTAACTTCAATAGTTATAGGGAGTATATTAACTATT
CCTTTCGTAAGGATAATTTTAAACTATATAGTGCAGGATGGATATTTTACTTTAGATTTGAGAAAATTTTTATTCATTGA
TTTAATAATTGTGATTTTTAGTGTACTAGTAATATTAGTTTCTTTAAGGAAGATATTAAATATGTCTGTCATAAATCTTT
TAAAAGGTATTGGGAAAAAATATTATACAAATAAAATAGGGAAAATATTTAAATTTTCTTTTGGAGTTGTGTTATTAATT
GTATCCATAGTTATTTTAATTAGTGAATATAAAAGGGAAAATGGAACATTAGCATTAATTTTAGGGGCTCTTTTCTTTAT
TATTTCTTTTGTATTTTTAGCAAAACTACTACTTATAATGTTTAATTGGATTTACCAAAAAATATTTTCTATATTTAAAG
GTTCGGTTAGCATTCTGTTTAAAGAGCTTGTAATGCAATTTTCTAATATAGTAGATATAGTAATAATTACATCAATAATT
ATTTGTTCAATTTATGTAAGTGTTACACTTAAAAATATGATAAACAATGGGGTAATGAATGTATACGGTAATGCAGATTT
AATGTTAAGTATTGATGGCACAGTAGAGGAAGATTTTACAAATAAAATAAAGAATATAAAATATATCAAAAACTCTCTAC
TACAATCAAGAACAACAGAGGTCATAAAAGATACAAAGGTGGATATTGCAGGAATAGATGGAGCTCAGTATAAGAAAGAT
TTTTCAACAGAAATTATTAAAAAAGGTGAAAATAATATATTTGATAAACTTGATGATGGAAAAAACATTATAATAACAAC
AACATTTAGTAAGAATACTGGCATTAATTTAAATGATTCGTTAAAAATTAATGAAGTGAATTATAAGGTAATTGGAGTTG
TTAGTAGTTTTGAGAATATGGGAAAAGTATTATTCGTATCCAAAGATAACTTCAATAAGGACATAAAGGTAAAGGATAAG
GAGTTATGTCTTATAAAAGTTAATAATAAACAAATAAAGTCTACAATAAATGAAATAGAAAAATTGTTTAAAGACAAAAA
TGAAAATAAATATTCTATACAGGAATTAACTGTTCTTAATGAAGAAAACAATAATAATAACAAAAAAACATTTACCATAG
TAAATGTCTTAATATGTATCTCAACAATTATATGCATAATTAGTATGAGCAACAATGTTACTATAAATCTTTTATCTAGA
AAAAAAGTATATGCGACTAAAGGAGCTTTAGGCATATCTAAAGGTTATTTGAGTAAATGTATTTTATTCGAAGCTATAGT
CTTAGGTTCTTATAGTGGAATATTTGGATTAGGGTTAGGCGTTACATTAAGTAATTATATTAATAAAATCTTATCTTATT
ACATTGGAGATATGGTCTTTATTAAGGATTACAAAATAATGGTGATTTTAGTTCTGATTTCTATAGGTATTACTGTTATT
AGCTATATTTATCCTATGAGAAAAATATATAGAATAAATATAATAGATGAAATAAAGTCAGATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTATATAATTTCGGATGCTTTTGAACACAATGAGAGAATAGTTAAATTTTTAAAGAGAGTAGGAGTATCTAAATATAAA
ACACGAATGGTGAGAAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGGTGATTGATTATGAGTATATTAAAAGGTATTAATATTAAAAAGAAAATTAATATAGGAGATAATTCCTATGATATA
TTAAAGGGTATTAATTTAGG

Product: putative ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Lipoprotein Releasing System Transmembrane Protein LolE

Number of amino acids: Translated: 822; Mature: 822

Protein sequence:

>822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEKDPFFNPKDIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDAKTLKDINIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINEKYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDDINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLTSIVIGSILTI
PFVRIILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKFSFGVVLLI
VSIVILISEYKRENGTLALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVSILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKNMINNGVMNVYGNADLMLSIDGTVEEDFTNKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGAQYKKD
FSTEIIKKGENNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFVSKDNFNKDIKVKDK
ELCLIKVNNKQIKSTINEIEKLFKDKNENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Sequences:

>Translated_822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEKDPFFNPKDIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDAKTLKDINIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINEKYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDDINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLTSIVIGSILTI
PFVRIILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKFSFGVVLLI
VSIVILISEYKRENGTLALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVSILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKNMINNGVMNVYGNADLMLSIDGTVEEDFTNKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGAQYKKD
FSTEIIKKGENNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFVSKDNFNKDIKVKDK
ELCLIKVNNKQIKSTINEIEKLFKDKNENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
>Mature_822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEKDPFFNPKDIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDAKTLKDINIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINEKYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDDINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLTSIVIGSILTI
PFVRIILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKFSFGVVLLI
VSIVILISEYKRENGTLALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVSILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKNMINNGVMNVYGNADLMLSIDGTVEEDFTNKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGAQYKKD
FSTEIIKKGENNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFVSKDNFNKDIKVKDK
ELCLIKVNNKQIKSTINEIEKLFKDKNENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Specific function: Part Of An ATP-Dependent Transport System Lolcde Responsible For The Release Of Lipoproteins Targeted To The Outer Membrane From The Inner Membrane. Such A Release Is Dependent Of The Sorting-Signal (Absence Of An Asp At Position 2 Of The Mature Lipoprot

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93079; Mature: 93079

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
VITTADEKDPFFNPKDIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDAKTLKDINIIGVDLNKQKAA
EEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCC
FPIELIDKYKVKDKENEIIINEKYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFD
CCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
PSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDDINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
CCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHH
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHH
IVENLLIVLTSIVIGSILTIPFVRIILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKFSFGVVLLIVSIVILISEYKRENGTLALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVSILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICSIYVSVTLKNMINNGVMNVYGNADLMLSIDGTVEEDFTNKIKNIKYIKNSLLQSRTTE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIKDTKVDIAGIDGAQYKKDFSTEIIKKGENNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDS
HHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
LKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFVSKDNFNKDIKVKDKELCLIKVNNKQIKSTINEIE
EEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHH
KLFKDKNENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
HHHHCCCCCCEEHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECC
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
IKDYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
VITTADEKDPFFNPKDIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDAKTLKDINIIGVDLNKQKAA
EEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCC
FPIELIDKYKVKDKENEIIINEKYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFD
CCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
PSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDDINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
CCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHH
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHH
IVENLLIVLTSIVIGSILTIPFVRIILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKFSFGVVLLIVSIVILISEYKRENGTLALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVSILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICSIYVSVTLKNMINNGVMNVYGNADLMLSIDGTVEEDFTNKIKNIKYIKNSLLQSRTTE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIKDTKVDIAGIDGAQYKKDFSTEIIKKGENNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDS
HHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
LKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFVSKDNFNKDIKVKDKELCLIKVNNKQIKSTINEIE
EEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHH
KLFKDKNENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
HHHHCCCCCCEEHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECC
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
IKDYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA