| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is feoB
Identifier: 170754394
GI number: 170754394
Start: 1142528
End: 1144684
Strand: Direct
Name: feoB
Synonym: CLD_3532
Alternate gene names: 170754394
Gene position: 1142528-1144684 (Clockwise)
Preceding gene: 170754774
Following gene: 170757323
Centisome position: 28.86
GC content: 32.27
Gene sequence:
>2157_bases ATGGAAAATATAAGAATTGCTCTTGTAGGAAATCCCAATTGTGGTAAAACTACAATGTTTAATTATTTAACTGGTAGCTC ACAGTATGTAGGTAACTGGCCTGGAGTAACTGTAGAAAAAAAAGAAGGTAAATTAAAACAACATAAAGATGTAAAAGTCA TAGATTTACCTGGAATATATTCACTTTCACCATATACTTTAGAAGAAGTTATAACAAGAAACTATCTTATTACAGAAAAA CCAGAGGTTATTATAAATATAGTAGATGGTACAAACCTTGAAAGAAACTTATATTTATCAACTCAGGTAATGGAGCTTGG AATTCCTGTTATAATAGCTTTAAATATGATGGATATTGTTAGAAAAAATGGAGATATCATAGATAAGGACAAGTTAAGTA AATCTATGGGTTGTACTGTAGTTGAAACATCTGCTTTAAAAGGTGAGGGGTGTAAAGAATTAATTGATAAAGCAATAGAA TTAGCTAAATCACATAAAAATAATATAATTGAGCATGCTTTTTCAAATGATGTGGAGAAAGTATTGTCTGATATTGAGAA TGAAATTTATAATCAGGTTCAAAAAGAACATTTACGTTGGTTTGCTATAAAATTGTTTGAAAATGATGAAAAGGCAATTG AACAAGGAAATATTTCAAAGGTTTCAAAAGATAAAGTTAAAGCCATTGTGTCTAGTTGTGAAGATGAATTAGATGATGAT GGTGAAAGTATCATAACTAATGAACGTTATAATTACATAAGCAAAATAATTAGTAAATGCGTAGTTAAGAAAAATAAATC CAAGTTAACTACTTCAGATAAAATAGATAAAATAGTTACTAATAGAGTTTTAGGATTGCCTATATTTGCAGCTGTTATGT TCCTCGTTTATTATTTGTCTATTTCAACAATAGGAACTGGAGCTACAGATTGGGTAAATGACGTGCTGTTCGGTGATATT ATACCACCAGCAGTAGAGGGATTCCTTACATCTATAGGAACTGCTGCTTGGTTAAATTCTTTAATACTTGATGGTATTAT TGCTGGTGTAGGAGCTGTACTTGGATTCTTACCACAAATGATGGTATTATTTTTATGTCTTGCGATTTTAGAAGATTGTG GTTACATGTCACGTATAGCTTTCATAATGGATAGAATATTCCGTAAGTTTGGCCTTTCTGGTAAGTCATTTATTCCTATG CTTATAGGAACAGGTTGTGGAGTTCCAGGAATTATGGCATCAAGAACTATTGAAAATGAATCAGATAGAAAAATGACTAT TATTACTACTACGTTTATGCCTTGTTCTGCTAAATTACCAATAATAGCTTTAATTGCAGGAGCATTATTCCCAGGGGCAG CTTGGGTAGCACCTTCAGCATATTTTCTTGGAATCGGAGCTATTATATGTTCTGGAATAATCTTAAAGAAAACAAAAGCT TTTGCAGGTGAACCTGCTCCATTTGTTATGGAATTACCAAAATATCATGTGCCTGGTATAAAAGGTGTACTTATTCATAT GTGGGATAGAGCAAAGTCCTTTGTTAAAAAGGCAGGTACTATAATATTCCTTGCTTGTGGATTAATATGGTTCTTAGGTA GTTTCAATTGGTCATTAGCAATGGTAGAAACTCCAGATTCAATGTTAGCTTCAATGGGTAAAGCAATAGCTCCTATATTT AATCCATTAGGATGGGGAGATTGGAAAGCAGCAGTGGCAACTATTTCAGGATTAATTGCAAAAGAAAATGTAGTTGGTAC ATTCGGTATTTTATATGGAGCTGGAGAAGTAGCTGAAGATGGTGTAGAAATTTGGAAAACTCTACATGGATCATTTACAC AACTATCTGCATATTCATTCTTAATATTTAACTTGTTGTGTGCTCCATGTTTTGCAGCAATTGGTGCAATTAAACGTGAA ATGGGTAATAAGAAATGGACTTGGATAGCTGTTGGCTATCAAACTGGATTAGCCTATGGAGTAGCACTTACATTTTACCA ATTAGGATTACTTTTCACAGGAAAAGGATTTGGAATTGGAACATTAGTTGCTTTAGTATTATTAGCATGGTTCTTATATA TGTTATTTAGACCACAAAAAGATTTCTCTAATTCAACTAATATCAAAGGTGATAGGACAGAAAATATTAGCGCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAGTAAATATTAGAAATTATGAATTAACACTTCGTAAAGCTGATGCAGAAATGATAGAAGTAAAATAAAAAAATTATAT ACCTTTTAGGAGGAAATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CGCGTAAGGAGATAATAATTATGGCTACATTTATAATTGGTACATTAGTAATAGGATCCTTTGTTGTTGTTGGACACAAA GTTTATAAAGATAAGAAAAA
Product: ferrous iron transport protein B
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718
Protein sequence:
>718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGEGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHAFSNDVEKVLSDIENEIYNQVQKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKVSKDKVKAIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLAILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGAAWVAPSAYFLGIGAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGIKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTIIFLACGLIWFLGSFNWSLAMVETPDSMLASMGKAIAPIF NPLGWGDWKAAVATISGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLHGSFTQLSAYSFLIFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWIAVGYQTGLAYGVALTFYQLGLLFTGKGFGIGTLVALVLLAWFLYMLFRPQKDFSNSTNIKGDRTENISA
Sequences:
>Translated_718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGEGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHAFSNDVEKVLSDIENEIYNQVQKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKVSKDKVKAIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLAILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGAAWVAPSAYFLGIGAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGIKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTIIFLACGLIWFLGSFNWSLAMVETPDSMLASMGKAIAPIF NPLGWGDWKAAVATISGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLHGSFTQLSAYSFLIFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWIAVGYQTGLAYGVALTFYQLGLLFTGKGFGIGTLVALVLLAWFLYMLFRPQKDFSNSTNIKGDRTENISA >Mature_718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGEGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHAFSNDVEKVLSDIENEIYNQVQKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKVSKDKVKAIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLAILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGAAWVAPSAYFLGIGAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGIKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTIIFLACGLIWFLGSFNWSLAMVETPDSMLASMGKAIAPIF NPLGWGDWKAAVATISGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLHGSFTQLSAYSFLIFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWIAVGYQTGLAYGVALTFYQLGLLFTGKGFGIGTLVALVLLAWFLYMLFRPQKDFSNSTNIKGDRTENISA
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=758, Percent_Identity=35.0923482849604, Blast_Score=406, Evalue=1e-114,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78640; Mature: 78640
Theoretical pI: Translated: 7.78; Mature: 7.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIY CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHCCCCEEEECCCCC SLSPYTLEEVITRNYLITEKPEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIV CCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGEGCKELIDKAIELAKSHKNNIIEHAFSNDVEK HCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLSDIENEIYNQVQKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKVSKDKVKAIVSSCEDELDDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLS CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTIGTGATDWVNDVLFGDIIPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQM HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVLFLCLAILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPMLIGTGCGVPGIMASRTIENE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCC SDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGAAWVAPSAYFLGIGAIICSGIILKKTKA CCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH FAGEPAPFVMELPKYHVPGIKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTIIFLACGLIWFLGSFNWSLA HCCCCCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE MVETPDSMLASMGKAIAPIFNPLGWGDWKAAVATISGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAED EEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHH GVEIWKTLHGSFTQLSAYSFLIFNLLCAPCFAAIGAIKREMGNKKWTWIAVGYQTGLAYG HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHH VALTFYQLGLLFTGKGFGIGTLVALVLLAWFLYMLFRPQKDFSNSTNIKGDRTENISA HHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIY CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHCCCCEEEECCCCC SLSPYTLEEVITRNYLITEKPEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIV CCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGEGCKELIDKAIELAKSHKNNIIEHAFSNDVEK HCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLSDIENEIYNQVQKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKVSKDKVKAIVSSCEDELDDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLS CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTIGTGATDWVNDVLFGDIIPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQM HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVLFLCLAILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPMLIGTGCGVPGIMASRTIENE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCC SDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGAAWVAPSAYFLGIGAIICSGIILKKTKA CCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH FAGEPAPFVMELPKYHVPGIKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTIIFLACGLIWFLGSFNWSLA HCCCCCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE MVETPDSMLASMGKAIAPIFNPLGWGDWKAAVATISGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAED EEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHH GVEIWKTLHGSFTQLSAYSFLIFNLLCAPCFAAIGAIKREMGNKKWTWIAVGYQTGLAYG HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHH VALTFYQLGLLFTGKGFGIGTLVALVLLAWFLYMLFRPQKDFSNSTNIKGDRTENISA HHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]