Definition Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome, complete genome.
Accession NC_010465
Length 4,689,441

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The map label for this gene is yjgN [H]

Identifier: 170025878

GI number: 170025878

Start: 4043980

End: 4045176

Strand: Direct

Name: yjgN [H]

Synonym: YPK_3663

Alternate gene names: 170025878

Gene position: 4043980-4045176 (Clockwise)

Preceding gene: 170025875

Following gene: 170025879

Centisome position: 86.24

GC content: 44.19

Gene sequence:

>1197_bases
ATGGCAGATAACGCCTCACAAAATAAATCGCTACATAGAATGGCCTTCAAAGGCGAAGGTGGCGAGTATTTCTCTATCTG
GTTAGTGAATTTATTACTAACGATAATTACACTGGGTGTTTATTCTGCCTGGGCTACCGTACGTCGTCGCCGTTACTTTT
ATGGCAATACTGAGCTAAACGGTGATCGTTTTGATTATCACGCAGAGCCAATCGAGATCCTTAAAGGGCGCTTGATGGTT
ATTGGTGGTGTGATTTTATTCTATATATTATTAGCAATTGCCCCAACACTTGGCCTTTTGGTTGCACTGGTGTTGCTGGC
ATTGATTCCATGGATTATTATCCGTAGCTGGCGCTACAATGCCATTATGACCAGCTATCGTGGTGTTCGTTTTAATTATC
ACTGCCAGACTGGACAGGCTTATTGGGCGTTACTGTTTTGCCCACTGCTGTTAATTCTGGGGCTCTATGCCGTTATGATC
GTCATGGCGATGTTTCTAGGTTCTGTTGCCAGCACCCCTTCTACGGCTATAACACTCATTGTTGTTTCTGCGATTCTTCT
GGTCCCGCTGCTGGCAGTGATCAATGGCATTGTGAGCACGTTGCAACACAGCCTGTACGTTAATAACCTCTCTTTTGGTA
ATTCATCTTTTATTAGTACGTTAAAAAAATCAGCATTTATTAAAATCGCCTTTTTCAGTGTGTTGATTTTTATCCCCTTC
TTTTTTGTTGCTATGATGTTCGCAGGTGCGTTTTTTGCCGATCTGTTCCAATCTGCCCTGAATGGTTCCATCGCCAACGA
AAATAAGACAGCTATGCTGATAATTCAGAATTTCAGCAACCTGCTATTCATGATGCTGATGTTGCTACTCGGCACCATGG
TTTCCAGCAGCTACCGCATCGTTGCCCAACGTAATTACCTGTTTAGTCAAACAACATTACAAGGTGACATCAAGCTACGT
TCTTCCATGAAACTCCTGTCTTATATGGGCCTGTTAATGACCAACAGCCTGATCACTGTGTGCTCATTGGGGCTTGCCAC
ACCAATTGCAGAAGTACGCCATGCACGCTATATGGCTAATGCAACTGAGATTGAAGGTGACTTGTCTTTACTGAATATCC
ACGCTCATCAGGACACAGCGAATAGCGCCCTCGCCGAAGAAGCAGTACAAGCACTCGATCTGGGCACTGGCTTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGATTATTATGTGGATATCGTCTATCTCCATAACACCTATTGTGAATAAAAATAGGAACATATAGGCAAATTATATT
ACCTATAGGATGAAAGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGCTATCAGTGTTTGAGTAACTATCAGTGTTTGAGTAGCTATCAGTGATCGTTGAAGGATATTATCAGTACCCAGGTC
GGGCCGCCCGCGAGGCGGCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF X [H]

Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 397

Protein sequence:

>398_residues
MADNASQNKSLHRMAFKGEGGEYFSIWLVNLLLTIITLGVYSAWATVRRRRYFYGNTELNGDRFDYHAEPIEILKGRLMV
IGGVILFYILLAIAPTLGLLVALVLLALIPWIIIRSWRYNAIMTSYRGVRFNYHCQTGQAYWALLFCPLLLILGLYAVMI
VMAMFLGSVASTPSTAITLIVVSAILLVPLLAVINGIVSTLQHSLYVNNLSFGNSSFISTLKKSAFIKIAFFSVLIFIPF
FFVAMMFAGAFFADLFQSALNGSIANENKTAMLIIQNFSNLLFMMLMLLLGTMVSSSYRIVAQRNYLFSQTTLQGDIKLR
SSMKLLSYMGLLMTNSLITVCSLGLATPIAEVRHARYMANATEIEGDLSLLNIHAHQDTANSALAEEAVQALDLGTGF

Sequences:

>Translated_398_residues
MADNASQNKSLHRMAFKGEGGEYFSIWLVNLLLTIITLGVYSAWATVRRRRYFYGNTELNGDRFDYHAEPIEILKGRLMV
IGGVILFYILLAIAPTLGLLVALVLLALIPWIIIRSWRYNAIMTSYRGVRFNYHCQTGQAYWALLFCPLLLILGLYAVMI
VMAMFLGSVASTPSTAITLIVVSAILLVPLLAVINGIVSTLQHSLYVNNLSFGNSSFISTLKKSAFIKIAFFSVLIFIPF
FFVAMMFAGAFFADLFQSALNGSIANENKTAMLIIQNFSNLLFMMLMLLLGTMVSSSYRIVAQRNYLFSQTTLQGDIKLR
SSMKLLSYMGLLMTNSLITVCSLGLATPIAEVRHARYMANATEIEGDLSLLNIHAHQDTANSALAEEAVQALDLGTGF
>Mature_397_residues
ADNASQNKSLHRMAFKGEGGEYFSIWLVNLLLTIITLGVYSAWATVRRRRYFYGNTELNGDRFDYHAEPIEILKGRLMVI
GGVILFYILLAIAPTLGLLVALVLLALIPWIIIRSWRYNAIMTSYRGVRFNYHCQTGQAYWALLFCPLLLILGLYAVMIV
MAMFLGSVASTPSTAITLIVVSAILLVPLLAVINGIVSTLQHSLYVNNLSFGNSSFISTLKKSAFIKIAFFSVLIFIPFF
FVAMMFAGAFFADLFQSALNGSIANENKTAMLIIQNFSNLLFMMLMLLLGTMVSSSYRIVAQRNYLFSQTTLQGDIKLRS
SMKLLSYMGLLMTNSLITVCSLGLATPIAEVRHARYMANATEIEGDLSLLNIHAHQDTANSALAEEAVQALDLGTGF

Specific function: Unknown

COG id: COG4269

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48995003, Length=362, Percent_Identity=32.0441988950276, Blast_Score=117, Evalue=1e-27,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010295 [H]

Pfam domain/function: PF05987 DUF898 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44083; Mature: 43952

Theoretical pI: Translated: 9.32; Mature: 9.32

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADNASQNKSLHRMAFKGEGGEYFSIWLVNLLLTIITLGVYSAWATVRRRRYFYGNTELN
CCCCCCCCCHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCC
GDRFDYHAEPIEILKGRLMVIGGVILFYILLAIAPTLGLLVALVLLALIPWIIIRSWRYN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
AIMTSYRGVRFNYHCQTGQAYWALLFCPLLLILGLYAVMIVMAMFLGSVASTPSTAITLI
HHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VVSAILLVPLLAVINGIVSTLQHSLYVNNLSFGNSSFISTLKKSAFIKIAFFSVLIFIPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVAMMFAGAFFADLFQSALNGSIANENKTAMLIIQNFSNLLFMMLMLLLGTMVSSSYRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
VAQRNYLFSQTTLQGDIKLRSSMKLLSYMGLLMTNSLITVCSLGLATPIAEVRHARYMAN
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ATEIEGDLSLLNIHAHQDTANSALAEEAVQALDLGTGF
CHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ADNASQNKSLHRMAFKGEGGEYFSIWLVNLLLTIITLGVYSAWATVRRRRYFYGNTELN
CCCCCCCCHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCC
GDRFDYHAEPIEILKGRLMVIGGVILFYILLAIAPTLGLLVALVLLALIPWIIIRSWRYN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
AIMTSYRGVRFNYHCQTGQAYWALLFCPLLLILGLYAVMIVMAMFLGSVASTPSTAITLI
HHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VVSAILLVPLLAVINGIVSTLQHSLYVNNLSFGNSSFISTLKKSAFIKIAFFSVLIFIPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVAMMFAGAFFADLFQSALNGSIANENKTAMLIIQNFSNLLFMMLMLLLGTMVSSSYRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
VAQRNYLFSQTTLQGDIKLRSSMKLLSYMGLLMTNSLITVCSLGLATPIAEVRHARYMAN
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ATEIEGDLSLLNIHAHQDTANSALAEEAVQALDLGTGF
CHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11677609; 8253666 [H]